extended Colour element with additional optional attributes for graduated colour
[jalview.git] / src / jalview / schemabinding / version2 / ThresholdLine.java
index 85854c1..467f3e0 100755 (executable)
@@ -1,25 +1,29 @@
 /*\r
- * This class was automatically generated with \r
- * <a href="http://www.castor.org">Castor 0.9.6</a>, using an XML\r
- * Schema.\r
- * $Id$\r
+ * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.4.1)\r
+ * Copyright (C) 2009 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
+ * \r
+ * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
+ * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
+ * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
+ * of the License, or (at your option) any later version.\r
+ * \r
+ * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
+ * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
+ * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
+ * GNU General Public License for more details.\r
+ * \r
+ * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
+ * along with this program; if not, write to the Free Software\r
+ * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  */\r
-\r
 package jalview.schemabinding.version2;\r
 \r
   //---------------------------------/\r
  //- Imported classes and packages -/\r
 //---------------------------------/\r
 \r
-import java.io.IOException;\r
-import java.io.Reader;\r
-import java.io.Serializable;\r
-import java.io.Writer;\r
-import org.exolab.castor.xml.MarshalException;\r
 import org.exolab.castor.xml.Marshaller;\r
 import org.exolab.castor.xml.Unmarshaller;\r
-import org.exolab.castor.xml.ValidationException;\r
-import org.xml.sax.ContentHandler;\r
 \r
 /**\r
  * Class ThresholdLine.\r
@@ -34,12 +38,12 @@ public class ThresholdLine implements java.io.Serializable {
     //--------------------------/\r
 \r
     /**\r
-     * Field _label\r
+     * Field _label.\r
      */\r
     private java.lang.String _label;\r
 \r
     /**\r
-     * Field _value\r
+     * Field _value.\r
      */\r
     private float _value;\r
 \r
@@ -49,7 +53,7 @@ public class ThresholdLine implements java.io.Serializable {
     private boolean _has_value;\r
 \r
     /**\r
-     * Field _colour\r
+     * Field _colour.\r
      */\r
     private int _colour;\r
 \r
@@ -65,7 +69,7 @@ public class ThresholdLine implements java.io.Serializable {
 \r
     public ThresholdLine() {\r
         super();\r
-    } //-- jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine()\r
+    }\r
 \r
 \r
       //-----------/\r
@@ -73,181 +77,176 @@ public class ThresholdLine implements java.io.Serializable {
     //-----------/\r
 \r
     /**\r
-     * Method deleteColour\r
-     * \r
      */\r
-    public void deleteColour()\r
-    {\r
+    public void deleteColour(\r
+    ) {\r
         this._has_colour= false;\r
-    } //-- void deleteColour() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method deleteValue\r
-     * \r
      */\r
-    public void deleteValue()\r
-    {\r
+    public void deleteValue(\r
+    ) {\r
         this._has_value= false;\r
-    } //-- void deleteValue() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'colour'.\r
      * \r
-     * @return int\r
-     * @return the value of field 'colour'.\r
+     * @return the value of field 'Colour'.\r
      */\r
-    public int getColour()\r
-    {\r
+    public int getColour(\r
+    ) {\r
         return this._colour;\r
-    } //-- int getColour() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'label'.\r
      * \r
-     * @return String\r
-     * @return the value of field 'label'.\r
+     * @return the value of field 'Label'.\r
      */\r
-    public java.lang.String getLabel()\r
-    {\r
+    public java.lang.String getLabel(\r
+    ) {\r
         return this._label;\r
-    } //-- java.lang.String getLabel() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Returns the value of field 'value'.\r
      * \r
-     * @return float\r
-     * @return the value of field 'value'.\r
+     * @return the value of field 'Value'.\r
      */\r
-    public float getValue()\r
-    {\r
+    public float getValue(\r
+    ) {\r
         return this._value;\r
-    } //-- float getValue() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method hasColour\r
+     * Method hasColour.\r
      * \r
-     * \r
-     * \r
-     * @return boolean\r
+     * @return true if at least one Colour has been added\r
      */\r
-    public boolean hasColour()\r
-    {\r
+    public boolean hasColour(\r
+    ) {\r
         return this._has_colour;\r
-    } //-- boolean hasColour() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method hasValue\r
-     * \r
+     * Method hasValue.\r
      * \r
-     * \r
-     * @return boolean\r
+     * @return true if at least one Value has been added\r
      */\r
-    public boolean hasValue()\r
-    {\r
+    public boolean hasValue(\r
+    ) {\r
         return this._has_value;\r
-    } //-- boolean hasValue() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method isValid\r
-     * \r
+     * Method isValid.\r
      * \r
-     * \r
-     * @return boolean\r
+     * @return true if this object is valid according to the schema\r
      */\r
-    public boolean isValid()\r
-    {\r
+    public boolean isValid(\r
+    ) {\r
         try {\r
             validate();\r
-        }\r
-        catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
+        } catch (org.exolab.castor.xml.ValidationException vex) {\r
             return false;\r
         }\r
         return true;\r
-    } //-- boolean isValid() \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method marshal\r
-     * \r
      * \r
      * \r
      * @param out\r
-     */\r
-    public void marshal(java.io.Writer out)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
-        \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final java.io.Writer out)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         Marshaller.marshal(this, out);\r
-    } //-- void marshal(java.io.Writer) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method marshal\r
-     * \r
      * \r
      * \r
      * @param handler\r
-     */\r
-    public void marshal(org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
-        throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
-        \r
+     * @throws java.io.IOException if an IOException occurs during\r
+     * marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     */\r
+    public void marshal(\r
+            final org.xml.sax.ContentHandler handler)\r
+    throws java.io.IOException, org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         Marshaller.marshal(this, handler);\r
-    } //-- void marshal(org.xml.sax.ContentHandler) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'colour'.\r
      * \r
      * @param colour the value of field 'colour'.\r
      */\r
-    public void setColour(int colour)\r
-    {\r
+    public void setColour(\r
+            final int colour) {\r
         this._colour = colour;\r
         this._has_colour = true;\r
-    } //-- void setColour(int) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'label'.\r
      * \r
      * @param label the value of field 'label'.\r
      */\r
-    public void setLabel(java.lang.String label)\r
-    {\r
+    public void setLabel(\r
+            final java.lang.String label) {\r
         this._label = label;\r
-    } //-- void setLabel(java.lang.String) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
      * Sets the value of field 'value'.\r
      * \r
      * @param value the value of field 'value'.\r
      */\r
-    public void setValue(float value)\r
-    {\r
+    public void setValue(\r
+            final float value) {\r
         this._value = value;\r
         this._has_value = true;\r
-    } //-- void setValue(float) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method unmarshal\r
-     * \r
-     * \r
+     * Method unmarshal.\r
      * \r
      * @param reader\r
-     * @return Object\r
-     */\r
-    public static java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader reader)\r
-        throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.MarshalException if object is\r
+     * null or if any SAXException is thrown during marshaling\r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
+     * @return the unmarshaled\r
+     * jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine\r
+     */\r
+    public static jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine unmarshal(\r
+            final java.io.Reader reader)\r
+    throws org.exolab.castor.xml.MarshalException, org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         return (jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine) Unmarshaller.unmarshal(jalview.schemabinding.version2.ThresholdLine.class, reader);\r
-    } //-- java.lang.Object unmarshal(java.io.Reader) \r
+    }\r
 \r
     /**\r
-     * Method validate\r
      * \r
+     * \r
+     * @throws org.exolab.castor.xml.ValidationException if this\r
+     * object is an invalid instance according to the schema\r
      */\r
-    public void validate()\r
-        throws org.exolab.castor.xml.ValidationException\r
-    {\r
+    public void validate(\r
+    )\r
+    throws org.exolab.castor.xml.ValidationException {\r
         org.exolab.castor.xml.Validator validator = new org.exolab.castor.xml.Validator();\r
         validator.validate(this);\r
-    } //-- void validate() \r
+    }\r
 \r
 }\r