JAL-2115 updated web link for MAFFT (and one typo)
authorgmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Fri, 20 May 2016 17:18:57 +0000 (18:18 +0100)
committergmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Fri, 20 May 2016 17:18:57 +0000 (18:18 +0100)
help/html/webServices/msaclient.html

index b685576..6266036 100644 (file)
       from the input</li>
     <li><em>realignment</em> - where any aligned sequences will be
       used by the service to construct a profile based alignment of the
-      remaining unaligned sequences.</li>
+      remaining unaligned sequences</li>
   </ul>
   <strong>JABAWS Alignment services</strong>
   <br> Most alignment services are provided by the
   <a href="JABAWS.html">JABAWS framework</a>, which allows you to
   customise the precise parameters used when running each alignment
-  prgoram. In addition to the 'Default settings', you may choose from a
+  program. In addition to the 'Default settings', you may choose from a
   range of alignment preset settings, or create your own using the
   <a href="webServicesParams.html">'Edit Settings And Run ..' dialog
     box</a>.
@@ -58,7 +58,7 @@
   <ul>
     <li><a href="http://www.clustal.org/">Clustal Omega and
         Clustal W</a> (version 2.0.12)</li>
-    <li><a href="http://align.bmr.kyushu-u.ac.jp/mafft/software/">Mafft</a>
+    <li><a href="http://mafft.cbrc.jp/alignment/software/">Mafft</a>
       (version 6.8.57b)</li>
     <li><a href="http://www.drive5.com/muscle">Muscle</a> (version
       3.8.31)</li>