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authorgmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Thu, 18 Sep 2014 12:59:17 +0000 (13:59 +0100)
committergmungoc <g.m.carstairs@dundee.ac.uk>
Thu, 18 Sep 2014 12:59:17 +0000 (13:59 +0100)
help/html/colourSchemes/user.html

index c180e85..5eacca9 100755 (executable)
@@ -21,8 +21,8 @@
  -->
 <head><title>User Defined Colours</title></head>
 <body>
-<p><em>User Defined Colours</em></p>
-<p><img src="userDefined_java6.gif" width="719" height="368"> </p>
+<p><strong>User Defined Colours</strong></p>
+<p><img src="userDefined_java6.gif" width="815" height="402"> </p>
 <p>You may define any number of new colour schemes, each with a unique name. <br>
   <br>
   Each of the residues in a colour scheme may be assigned any chosen colour. <br>
   Use Ctrl-click to select multiple residues, or click then Shift-click to select a block.<br/>
   Note that the currently selected buttons are highlighted by a lighter text colour.
   <p>
-  The 'Case Sensitive' option allows you to choose distinct colours for upper and
+  The <strong>Case Sensitive</strong> option allows you to choose distinct colours for upper and
   lower case residue codes.
   <p>
-  Click &quot;Apply&quot; or &quot;OK&quot; to set your new colours on the active 
+  Click <strong>Apply</strong> or <strong>OK</strong> to set your new colours on the active 
   alignment window.<br/>
-   Click &quot;Cancel&quot; to undo your changes if you pressed the &quot;Apply&quot; 
+   Click <strong>Cancel</strong> to undo your changes if you pressed the <strong>Apply</strong> 
   button.
   </p>
   If you save your colour scheme with a unique name, the colour scheme name will 
-  be added to the &quot;Colour&quot; menu on each new alignment window.<br>
+  be added to the <strong>Colour</strong> menu on each new alignment window.<br>
   <br>
   Any saved colour schemes will be automatically loaded the next time you use 
-  Jalview.</p>
-  Note: the screenshot shows the appearance when running Java version 6. For Java 7, only the Swatches colour chooser is
-  currently supported (for reasons of available screen space).
+  Jalview.
+  <br><br>
+  <em>Note: the screenshot shows the appearance when running Java version 6. For Java 7 (from Jalview 2.8.2) only the Swatches colour chooser is
+  currently supported (for reasons of available screen space).</em>
   <p/>
 </body>
 </html>