THIRDPARTYLIBS

   1 The Jalview Desktop relies on a number of third-party libraries.
   2 These can be found in the lib directory, with additional compile
   3 time dependencies in the utils directory.
   4
   5 Licencing information for each library is given below:
   6
   7 JGoogleAnalytics_0.3.jar        APL 2.0 License - http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/
   8 Jmol-12.1.13.jar        GPL/LGPLv2 http://sourceforge.net/projects/jmol/files/
   9 activation.jar
  10 apache-mime4j-0.6.jar
  11 axis.jar
  12 castor-1.1-cycle-xml.jar
  13 commons-codec-1.3.jar
  14 commons-discovery.jar
  15 commons-logging-1.1.1.jar
  16 commons-logging.jar
  17 httpclient-4.0.3.jar
  18 httpcore-4.0.1.jar
  19 httpmime-4.0.3.jar
  20 jaxrpc.jar
  21 jdas-1.0.4.jar : Apache License - built from http://code.google.com/p/jdas/ (29th Feb 2012)
  22 jhall.jar
  23 jswingreader-0.3.jar : Apache license - built from http://jswingreader.sourceforge.net/ svn/trunk v12
  24 log4j-1.2.8.jar
  25 mail.jar
  26 miglayout-4.0-swing.jar BSD http://www.migcalendar.com/miglayout/versions/4.0/license.txt
  27 min-jaba-client.jar
  28 regex.jar
  29 saaj.jar
  30 spring-core-3.0.5.RELEASE.jar : Apache License: jdas runtime dependencies retrieved via maven
  31 spring-web-3.0.5.RELEASE.jar : Apache License: jdas runtime dependencies retrieved via maven
  32 vamsas-client.jar
  33 wsdl4j.jar
  34 xercesImpl.jar
  35 xml-apis.jar
  36
  37 Additional dependencies
  38
  39 examples/javascript/deployJava.js : http://java.com/js/deployJava.js
  40 examples/javascript/jquery*.js : BSD license
  41 examples/javascript/jshashtable-2.1.js : Apache License
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  43 Tools not bundled with Jalview source
  44 jbake (http://jbake.org MIT license) was used to build the JalviewLite examples pages found in the examples directory.
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