doc/developing.html

   1 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">\r
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   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   5  * \r
   6  * This file is part of Jalview.\r
   7  * \r
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  11  * \r
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  16  * \r
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
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  19 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
  20   <head>Developing Jalview</head>\r
  21   <body>\r
  22 <p><h1>Developing Jalview</h1>\r
  23 </p>\r
  24 <ul>\r
  25 <li>Basic Source Structure Guidelines</li>\r
  26 <li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>\r
  27 <li>Package Architecture<br>\r
  28 </li>\r
  29 <li>Specific  Development Guidelines\r
  30 <ul>\r
  31 <li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>\r
  32 <li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>\r
  33 <li>Adding new database types to Jalview</li>\r
  34 <li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>\r
  35 <li>Adding new analysis methods to jalview</li>\r
  36 <li>Adding new web service functionality to jalview</li>\r
  37 </ul>\r
  38 </li>\r
  39 </ul>\r
  40 </body>\r
  41 </html>\r