4d260341b2114960d595b81aab4d5e1c69bf3cb1
[jalview.git] / doc / developing.html
1 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
4  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 -->
19 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
20   <head>Developing Jalview</head>
21   <body>
22 <p><h1>Developing Jalview</h1>
23 </p>
24 <ul>
25 <li>Basic Source Structure Guidelines</li>
26 <li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>
27 <li>Package Architecture<br>
28 </li>
29 <li>Specific  Development Guidelines
30 <ul>
31 <li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>
32 <li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>
33 <li>Adding new database types to Jalview</li>
34 <li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>
35 <li>Adding new analysis methods to jalview</li>
36 <li>Adding new web service functionality to jalview</li>
37 </ul>
38 </li>
39 </ul>
40 </body>
41 </html>