doc/developing.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------\r
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)\r
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 # \r
   5 # This file is part of Jalview.\r
   6 # \r
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10 # \r
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15 # \r
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17 #-------------------------------------------------------------------------------\r
  18 <!DOCTYPE html SYSTEM "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">\r
  19 <!--\r
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)\r
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
  22  * \r
  23  * This file is part of Jalview.\r
  24  * \r
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  28  * \r
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  33  * \r
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  35 -->\r
  36 <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">\r
  37   <head>Developing Jalview</head>\r
  38   <body>\r
  39 <p><h1>Developing Jalview</h1>\r
  40 </p>\r
  41 <ul>\r
  42 <li>Basic Source Structure Guidelines</li>\r
  43 <li>The Applet and The Application - whats the difference ?</li>\r
  44 <li>Package Architecture<br>\r
  45 </li>\r
  46 <li>Specific  Development Guidelines\r
  47 <ul>\r
  48 <li><a href="newdmobj.html">Adding new datamodel objects to Jalview</a></li>\r
  49 <li>Adding new IO capabilities to Jalview</li>\r
  50 <li>Adding new database types to Jalview</li>\r
  51 <li>Working with the Jalview DAS annotation fetcher</li>\r
  52 <li>Adding new analysis methods to jalview</li>\r
  53 <li>Adding new web service functionality to jalview</li>\r
  54 </ul>\r
  55 </li>\r
  56 </ul>\r
  57 </body>\r
  58 </html>\r