update author list in license for (JAL-826)
[jalview.git] / help / html / colourSchemes / hydrophobic.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
11  * 
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 -->
19 <head><title>Hydrophobic Colour Scheme</title>
20 <style type="text/css">
21 <!--
22 td {
23         text-align: center;
24 }
25 -->
26 </style>
27 </head>
28
29 <body>
30 <p><em>Hydrophobicity</em></p>
31 <p>According to the hydrophobicity table of Kyte, J., and Doolittle, R.F., J.
32   Mol. Biol. 1157, 105-132, 1982. The most hydrophobic residues according to this
33   table are coloured red and the most hydrophilic ones are coloured blue.</p>
34 <div align="center">
35   <table width="400" border="1">
36     <tr>
37       <td bgcolor="#ff0000">I</td>
38       <td bgcolor="#f60009">V</td>
39       <td bgcolor="#ea0015">L</td>
40       <td bgcolor="#cb0034">F</td>
41       <td bgcolor="#c2003d">C</td>
42     </tr>
43     <tr>
44       <td bgcolor="#b0004f">M</td>
45       <td bgcolor="#ad0052">A</td>
46       <td bgcolor="#6a0095">G</td>
47       <td bgcolor="#680097">X</td>
48       <td bgcolor="#61009e">T</td>
49     </tr>
50     <tr>
51       <td bgcolor="#5e00a1">S</td>
52       <td bgcolor="#5b00a4">W</td>
53       <td bgcolor="#4f00b0">Y</td>
54       <td bgcolor="#4600b9">P</td>
55       <td bgcolor="#1500ea">H</td>
56     </tr>
57     <tr>
58       <td bgcolor="#0c00f3">E</td>
59       <td bgcolor="#0c00f3">Z</td>
60       <td bgcolor="#0c00f3">Q</td>
61       <td bgcolor="#0c00f3">D</td>
62       <td bgcolor="#0c00f3">B</td>
63     </tr>
64     <tr> </td>
65       <td bgcolor="#0c00f3">N</td>
66       <td bgcolor="#0000ff">K</td>
67       <td bgcolor="#0000ff">R</td>
68     </tr>
69   </table>
70 </div>
71 </body>
72 </html>