help/html/colourSchemes/strand.html

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   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
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   5 # This file is part of Jalview.
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   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
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  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
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  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
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  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
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  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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  36 <head><title>Strand Colour Scheme</title>
  37 <style type="text/css">
  38 <!--
  39 td {
  40         text-align: center;
  41 }
  42 -->
  43 </style>
  44 </head>
  45
  46 <body>
  47 <p><em>Strand propensity</em></p>
  48 <div align="center">
  49   <table width="400" border="1">
  50     <tr>
  51       <td bgcolor="#ffff00">V</td>
  52       <td bgcolor="#ecec13">I</td>
  53       <td bgcolor="#d3d32c">Y</td>
  54       <td bgcolor="#c2c23d">F</td>
  55       <td bgcolor="#c0c03f">W</td>
  56     </tr>
  57     <tr>
  58       <td bgcolor="#b2b24d">L</td>
  59       <td bgcolor="#9d9d62">T</td>
  60       <td bgcolor="#9d9d62">C</td>
  61       <td bgcolor="#8c8c73">Q</td>
  62       <td bgcolor="#82827d">M</td>
  63     </tr>
  64     <tr>
  65       <td bgcolor="#797986">X</td>
  66       <td bgcolor="#6b6b94">R</td>
  67       <td bgcolor="#64649b">N</td>
  68       <td bgcolor="#60609f">H</td>
  69       <td bgcolor="#5858a7">A</td>
  70     </tr>
  71     <tr>
  72       <td bgcolor="#4949b6">S</td>
  73       <td bgcolor="#4949b6">G</td>
  74       <td bgcolor="#4747b8">Z</td>
  75       <td bgcolor="#4747b8">K</td>
  76       <td bgcolor="#4343bc">B</td>
  77     </tr>
  78     <tr> </td>
  79       <td bgcolor="#2323dc">P</td>
  80       <td bgcolor="#2121de">D</td>
  81       <td bgcolor="#0000ff">E</td>
  82     </tr>
  83   </table>
  84 </div>
  85 </body>
  86 </html>