help/html/colourSchemes/zappo.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 #-------------------------------------------------------------------------------
  18 <html>
  19 <!--
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This file is part of Jalview.
  24  *
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  28  *
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  33  *
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  35 -->
  36 <head><title>Zappo Colour Scheme</title>
  37 <style type="text/css">
  38 <!--
  39 td {
  40         text-align: center;
  41 }
  42 -->
  43 </style>
  44 </head>
  45
  46 <body>
  47 <p><em>Zappo Colours</em><br>
  48   <br>
  49   The residues are coloured according to their physicochemical properties as
  50   follows: </p>
  51 <div align="center">
  52   <table width="400" border="1">
  53     <tr>
  54       <td > Aliphatic/hydrophobic</td>
  55       <td bgcolor="#ffafaf">ILVAM </td>
  56     </tr>
  57     <tr>
  58       <td>Aromatic</td>
  59       <td bgcolor="#ffc800">FWY</td>
  60     </tr>
  61     <tr>
  62       <td>Positive</td>
  63       <td bgcolor="#6464ff">KRH</td>
  64     </tr>
  65     <tr>
  66       <td> Negative</td>
  67       <td bgcolor="#ff0000">DE</td>
  68     </tr>
  69     <tr>
  70       <td>Hydrophilic</td>
  71       <td bgcolor="#00ff00">STNQ</td>
  72     </tr>
  73     <tr>
  74       <td>conformationally special</td>
  75       <td bgcolor="#ff00ff">PG</td>
  76     </tr>
  77     <tr>
  78       <td>Cysteine</td>
  79       <td bgcolor="#ffff00">C</td>
  80     </tr>
  81   </table>
  82 </div>
  83 </body>
  84 </html>