help/html/colourSchemes/zappo.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
   4  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18 -->
  19 </style>
  20 </head>
  21
  22 <body>
  23 <p><em>Zappo Colours</em><br>
  24   <br>
  25   The residues are coloured according to their physicochemical properties as
  26   follows: </p>
  27 <div align="center">
  28   <table width="400" border="1">
  29     <tr>
  30       <td > Aliphatic/hydrophobic</td>
  31       <td bgcolor="#ffafaf">ILVAM </td>
  32     </tr>
  33     <tr>
  34       <td>Aromatic</td>
  35       <td bgcolor="#ffc800">FWY</td>
  36     </tr>
  37     <tr>
  38       <td>Positive</td>
  39       <td bgcolor="#6464ff">KRH</td>
  40     </tr>
  41     <tr>
  42       <td> Negative</td>
  43       <td bgcolor="#ff0000">DE</td>
  44     </tr>
  45     <tr>
  46       <td>Hydrophilic</td>
  47       <td bgcolor="#00ff00">STNQ</td>
  48     </tr>
  49     <tr>
  50       <td>conformationally special</td>
  51       <td bgcolor="#ff00ff">PG</td>
  52     </tr>
  53     <tr>
  54       <td>Cysteine</td>
  55       <td bgcolor="#ffff00">C</td>
  56     </tr>
  57   </table>
  58 </div>
  59 </body>
  60 </html>