09be7909ab84900bea84e482b8b26dcbf89515d6
[jalview.git] / help / html / features / codingfeatures.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
4  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 -->
19 <head>
20 <title>DNA Sequence Coding Region Definition</title>
21 </head>
22 <body>
23 <p><strong>DNA Sequence Coding Region Definition</strong></p>
24 <p>Jalview includes the standard DNA codon translation table in
25 order to be able to dynamically translate cDNA to its expressed
26 protein sequence. DNA Sequence Coding Regions are sequence 
27 features that can be defined on any DNA sequence in order to
28 mark stretches of cDNA that will be concatenated to form the
29 series of codons that are translated by the <strong>&quot;
30 Calculate&#8594;Translate cDNA&quot;</strong> menu function.    
31 </p>
32 </body>
33 </html>