help/html/features/codingfeatures.html

   1 <html>\r
   2 <!--\r
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)\r
   4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   5  * \r
   6  * This file is part of Jalview.\r
   7  * \r
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  11  * \r
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  16  * \r
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  18 -->\r
  19 <head>\r
  20 <title>DNA Sequence Coding Region Definition</title>\r
  21 </head>\r
  22 <body>\r
  23 <p><strong>DNA Sequence Coding Region Definition</strong></p>\r
  24 <p>Jalview includes the standard DNA codon translation table in\r
  25 order to be able to dynamically translate cDNA to its expressed\r
  26 protein sequence. DNA Sequence Coding Regions are sequence \r
  27 features that can be defined on any DNA sequence in order to\r
  28 mark stretches of cDNA that will be concatenated to form the\r
  29 series of codons that are translated by the <strong>&quot;\r
  30 Calculate&#8594;Translate cDNA&quot;</strong> menu function.    \r
  31 </p>\r
  32 </body>\r
  33 </html>\r