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   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
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  18 -->
  19 <head>
  20 <title>Creating Sequence Features</title>
  21 </head>
  22 <body>
  23 <strong>Creating Sequence Features</strong>
  24 <p>Jalview can create sequence features from the matches of a <a
  25         href="search.html">regular expression search</a>, or from the currently
  26 selected area via the <strong>&quot;selection&#8594;Create
  27 sequence feature&quot;</strong> entry in the <a href="../menus/popupMenu.html">selection area popup menu</a>. In both
  28 cases, the <strong>Create Features</strong> dialog box will then be
  29 opened:</p>
  30 <p><img src="crnewfeature.gif"></p>
  31 <p>Select or enter the attributes for the features being created,
  32 and then press OK to create the new features.</p>
  33 <p>Each attribute is described below:
  34 <ul>
  35         <li><strong>Sequence Feature Name</strong>
  36         <p>Either give the new features a new name or use the menu to
  37         re-use an existing feature name.</p>
  38         </li>
  39         <li><strong>Feature group</strong>
  40         <p>Enter a new group name, or re-use an existing group from the
  41         pull-down menu.</p>
  42         </li>
  43         <li><strong>Feature Colour</strong>
  44         <p>Keep the existing colour for this feature's name and group, or
  45         select the colour box to open a colour chooser to pick a different one.</p>
  46         </li>
  47         <li><strong>Description</strong>
  48         <p>Enter a description for all the features being created. Each
  49         feature defined on a sequence may have its own description that will be
  50         displayed in the tooltip for the feature in that region.</p>
  51         </li>
  52 </ul>
  53 </p><p><em>Sequence Feature Creation was introduced in Jalview Version 2.2</em></p>
  54 </body>
  55 </html>