help/html/features/editingFeatures.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 #-------------------------------------------------------------------------------
  18 <html>
  19 <!--
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This file is part of Jalview.
  24  *
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  28  *
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  33  *
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  35 -->
  36 <head>
  37 <title>Amending or Deleting Sequence Features</title>
  38 </head>
  39 <body>
  40 <strong>Amending or Deleting Sequence Features</strong>
  41 <p>Double clicking a position in the alignment with one or more
  42 displayed sequence features opens the <strong>&quot;Amend/Delete
  43 Features&quot;</strong> dialog box.</p>
  44 <p><img src="amendfeature.gif"></p>
  45 <p>The dialog box only allows one of the features at the
  46 double-clicked position to be edited or deleted at a time, and it will
  47 also be highlighted in black in the alignment window.</p>
  48 <p>Choose which feature is to be modified by selecting it from the <strong>Sequence
  49 Feature Name</strong> <!-- and <strong>Feature Group</strong>  --> pull down
  50 menu. In addition to the Name, group, colour and description attributes
  51 described for the <a href="creatinFeatures.html">new feature dialog
  52 box</a>, a feature's start and end position can be changed either by
  53 entering a new position directly or by using the adjacent up and down
  54 buttons.</p>
  55 <p>Select <strong>Amend</strong> to update the feature, <strong>Delete</strong>
  56 to remove the selected feature, or <strong>Cancel</strong> to leave the
  57 feature unchanged.</p>
  58 <p><em>Sequence feature editing was implemented in Jalview 2.2</em></p>
  59 </body>
  60 </html>