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   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18 -->
  19 <head>
  20 <title>Jalview Archives</title>
  21 </head>
  22 <body>
  23
  24 <p><strong>Jalview Project Archives</strong>
  25 </p>
  26
  27 <p>These are java archives of an XML file containing alignments, trees and Jalview
  28   display information. A data exchange standard is currently being developed,
  29   so there is no stable schema yet, but Jalview web services will soon make use
  30   of the same interchange format.</p>
  31 <p>For those who want to know...<br>
  32   Jalview uses java classes automatically created using <a href="http://www.castor.org">Castor</a>.
  33   Jalview 2.08 uses descriptor classes which significantly increase the speed
  34   of marshalling / unmarshalling java objects into XML. Files created prior to
  35   Jalview 2.08 can still be read in, but they will be saved in the new format.
  36 </p>
  37 </body>
  38 </html>