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   1 <html>
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  19 -->
  20 <head>
  21 <title>Mapping Between Different Sequences</title>
  22 </head>
  23 <body>
  24 <p><strong>Mapping Between Different Sequences</strong></p>
  25 <p>A new feature in Jalview 2.3 is the ability to map between sequences in different
  26   domains, based on alignment, or by the use of explicit mappings provided by
  27   databases. </p>
  28 <p>The most familiar mapping is the one used to identify
  29 the coordinates corresponding to a displayed sequence when
  30 viewing a PDB file associated with a sequence (see
  31 <a href="viewingpdbs.html">&quot;Viewing PDB Files&quot;</a>
  32 for more information.</p>
  33 <p>The newest form of mapping supported by Jalview is the
  34 correspondence between DNA and protein sequences. This mapping
  35 can be imported directly from EMBL and EMBLCDS database records
  36 retrieved by the <a href="seqfetch.html">Sequence Fetcher</a>,
  37 and allows sequence features to be mapped directly from Uniprot
  38 das sources to their coding region on EMBL sequence records.
  39 </body>
  40 </html>