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   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
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  19  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
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  21  -->
  22 <head>
  23 <title>Structure Chooser</title>
  24 </head>
  25
  26 <body>
  27         <p>
  28                 <strong>Structure Chooser</strong>
  29         </p>
  30
  31         The Structure Chooser panel was added in Jalview 2.8.3. It
  32         introduced a smarter technique for selecting PDB structures to view in
  33         Jalview by quering readily available meta-data of the structures. Some of the main features it provides are listed below:
  34         <ul>
  35                 <li>Automatic discovery, retrieval and association of PDB entries
  36                         for an alignment's sequences</li>
  37                 <li>Visualisation of discovered structures' meta-data</li>
  38                 <li>Ability to configure the meta-data entries to visualise</li>
  39                 <li>Auto-selection  of the best structure via filtering by
  40                         the available metric parameters in the meta-data (i.e. resolution,
  41                         quality etc).</li>
  42                 <li>Selection of multiple structures in a single operation</li>
  43         </ul>
  44         Additionally, the Structure Chooser retains the following contemporary
  45         feature of Jalview:
  46         <ul>
  47                 <li>Manual association of PDB entries via entering the PDB Id or
  48                         From File</li>
  49                 <li>Ability to view cached PDB entries</li>
  50         </ul>
  51
  52         <p><img src="schooser_main.png" style="width: 464px; height: 369px; ">
  53         <!-- <p><img src="schooser_config.png" style="width: 463px; height: 369px; ">
  54         <p><img src="schooser_drop-down.png" style="width: 464px; height: 368px; ">
  55         <p><img src="schooser_enter-id.png" style="width: 467px; height: 373px; ">
  56         <p><img src="schooser_from-file.png" style="width: 468px; height: 370px; ">
  57         <p><img src="schooser_cached.png"> -->
  58         <br>
  59
  60         <strong>Auto-Selection of Structures</strong>
  61
  62 </body>
  63 </html>