help/html/index.html

   1 <html>
   2 <head><title>Home Page</title></head>
   3
   4 <body>
   5 <IMG src="align.jpg"><font size="4">
   6 <br><br>
   7 <strong>Jalview Documentation</strong></font>
   8 <br><br>
   9 Jalview (2009) is a fast Java multiple alignment editor and analysis tool. It
  10 features many of the functions of <a href="http://www.compbio.dundee.ac.uk/Software/Amas/amas.html">AMAS</a>,
  11 for the analysis of sub-families and the prediction of functional sites, but is
  12 fully interactive. (View the <a href="http://www.jalview.org">Jalview homepage</a>).
  13 <p></p>
  14 <p> If you use Jalview in your work, please cite the Jalview 2 paper in Bioinformatics: </p>
  15 <p>Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M., Barton, G.J (2009), <br>
  16    &quot;Jalview version 2: A Multiple Sequence Alignment and Analysis Workbench,&quot;<br>
  17    <em>Bioinformatics</em> <strong>25</strong> (9) 1189-1191 doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
  18 </body>
  19 </html>