help/html/io/export.html

   1 <html>
   2 <!--
   3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   4  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   5  *
   6  * This file is part of Jalview.
   7  *
   8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   9  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  18 -->
  19 <head>
  20 <title>Exporting alignments as artwork</title>
  21 </head>
  22 <body>
  23 <p><strong>Exporting alignments as graphics and lineart<a name="export"></a></strong></p>
  24 <p>The alignment view can be printed using
  25 <strong>File&#8594;Print</strong>, or exported in a number of ways via the
  26 <strong>File&#8594;Export</strong> menu:
  27 <ul>
  28 <li>HTML<br><em>for viewing in a web browser</em>
  29 </li>
  30 <li>PNG - a Portable Networks Graphics image<br><em>For low quality
  31 diagrams and powerpoint presentations</em>
  32 </li>
  33 <li>EPS - an Encapsulated Postscript Document<br><em>For high quality
  34 diagrams and publications.</em>
  35 </li></ul>
  36
  37 <p><em>Tips for working with EPS Files</em></p>
  38 <li>The EPS file generated by jalview contains vector graphics which are directly
  39   editable in graphics applications such as Adobe Illustrator.</li>
  40 <li>EPS files can be produced as &quot;Text&quot; or &quot;Lineart&quot;. Use
  41   &quot;Text&quot; if you want the final document to be MUCH smaller in diskspace
  42   and be able to search, edit and select text. Use &quot;Lineart&quot; if you
  43   want an exact image of the alignment as displayed in Jalview. This is useful
  44   if a 3rd Party EPS viewer does not have the same Font which the EPS file was
  45   created with.</li>
  46 <li>When importing an EPS into to a Microsoft office document, a snapshot image of the
  47   file will be displayed which often looks blurred. Right-click the
  48   image and choose &quot;Edit image.&quot; to convert it to word
  49   drawing objects which give a truer WYSIWIG representation.
  50   </li>
  51   <li>
  52   Mac OSX users will find that eps files are automatically converted into
  53   PDF files.
  54   </li>
  55 </p>
  56 </body>
  57 </html>