help/html/misc/aaproperties.html

   1 <html>\r
   2 <head><title>Amino Acid Properties</title>\r
   3 </head>\r
   4 <body><div align="center">\r
   5 <h1>Amino Acid Properties</h1>\r
   6   <img src="properties.gif"></div>\r
   7 <p><br>\r
   8   Adapted from Livingstone, C. D. and Barton, G. J. (1993), <br>\r
   9   "Protein Sequence Alignments: A Strategy for the Hierarchical Analysis of Residue\r
  10   Conservation", Comp. Appl. Bio. Sci., 9, 745-756. </p>\r
  11 <div align="center">\r
  12   <table width="295" border="1" cellspacing="0" cellpadding="0">\r
  13     <tr>\r
  14       <td width="291"><pre><font size="4" face="Courier New, Courier, mono"><strong>ILVCAGMFYWHKREQDNSTPBZX-</strong>\r
  15 XXXXXXXXXXX&middot;·&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;XX Hydrophobic\r
  16 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXXXXXXX&middot;XXXXX Polar\r
  17 &middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXXX&middot;&middot;XX Small\r
  18 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;XX Proline\r
  19 &middot;&middot;&middot;&middot;XX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;XX Tiny\r
  20 XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aliphatic\r
  21 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Aromatic\r
  22 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXX&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Positive\r
  23 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;X&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Negative\r
  24 &middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XXXX&middot;X&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;&middot;XX Charged</font></pre></td>\r
  25     </tr>\r
  26   </table>\r
  27   <pre>&nbsp;</pre>\r
  28 </div>\r
  29 </body>\r
  30 </html>\r