help/html/privacy.html

   1 #-------------------------------------------------------------------------------
   2 # Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5.1)
   3 # Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
   4 #
   5 # This file is part of Jalview.
   6 #
   7 # Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8 # modify it under the terms of the GNU General Public License
   9 # as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10 #
  11 # Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12 # WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13 # of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14 # PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15 #
  16 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17 #-------------------------------------------------------------------------------
  18 <html>
  19 <!--
  20  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.5)
  21  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle
  22  *
  23  * This file is part of Jalview.
  24  *
  25  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
  26  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  27  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  28  *
  29  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  30  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  31  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  32  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  33  *
  34  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  35 -->
  36 <head>
  37 <title>Jalview Privacy Statement</title>
  38 </head>
  39 <body>
  40 <p><strong>Privacy for Jalview Users</strong><br>
  41 <p>The Jalview Desktop application which is available from the
  42 www.jalview.org site does not contain code designed collect personal or
  43 private information without your consent. However, we do collect usage
  44 statistics to work out who is using Jalview, so we can apply for funding
  45 to support Jalview development, and make it better for our users.</p>
  46 <p>Usage data is collected from the logs of various web services that the Jalview Desktop contacts through its normal operation.
  47 These are described below:</p>
  48 <ul>
  49         <li><em>HTTP logs on the Jalview website</em><br>
  50         We record IP addresses of machines which access the web site, either
  51         via the browser when downloading the application, or when the Jalview
  52         Desktop user interface is launched.<br><br>
  53         <ul>
  54                 <li><i>The JNLP file at www.jalview.org/webstart/jalview.jnlp
  55                 is retrieved to determine if you are running the latest version of
  56                 Jalview.</i></li>
  57                 <li><i>The questionnaire web service at
  58                 www.jalview.org/cgi-bin/questionnaire.pl is checked and a unique
  59                 cookie for the current questionnaire is stored in the Jalview
  60                 properties file.</i></li>
  61                 <li><i>The Jalview web services stack is contacted to
  62                 retrieve the currently available web services. All interactions with
  63                 the public jalview web services are logged, but we delete all job data
  64                 (input data and results) after about two weeks.</i></li>
  65         </ul><br>
  66         </li>
  67         <li><em>Google Analytics</em><br>
  68         Since jalview 2.4.0b2, the Jalview Desktop records usage data with
  69         Google Analytics via the <a
  70                 href="http://code.google.com/p/jgoogleanalytics/">JGoogleAnalytics</a>
  71         class.<br>
  72         The Google Analytics logs for Jalview version 2.4 only record the fact
  73         that the application was started, but in the future, we will use this
  74         mechanism to improve the Desktop user interface, by tracking which
  75         parts of the user interface are being used most often.</li>
  76 </ul>
  77 </p>
  78 <p><strong>Stopping Jalview from calling home</strong><br>
  79 If you run Jalview in 'headless mode' via the command line, then the
  80 program shouldn't try to contact any of the web servers mentioned above
  81 (if it does, then it's a bug!). You can also specify some <a
  82         href="features/commandline.html">command line options</a> to disable
  83 the questionnaire and usage statistics check. Finally, the <a
  84         href="features/preferences.html#connections">Connections Tab</a> of the
  85 jalview preferences contains options for controlling the submission of
  86 usage statistics.
  87 <p><strong>Other Web Clients in Jalview</strong><br>
  88 The Jalview desktop is intended to make it easier to interact with
  89 web-based bioinformatics resources. However, we can't take any
  90 responsibility for the integrity of any external services you might
  91 access via the program. Sorry!</p>
  92 </body>
  93 </html>