help/html/releases.html

   1 <html>\r
   2 <head><title>Release History</title></head>\r
   3 <body>\r
   4 <p><strong>Release History</strong> </p>\r
   5 <table border="1">\r
   6   <tr> \r
   7     <td nowrap><div align="center"><em><strong>Release</strong></em></div></td>\r
   8     <td ><div align="center"><em><strong>New Features</strong></em></div></td>\r
   9     <td "><div align="center"><em><strong>Issues Resolved</strong></em></div></td>\r
  10   </tr>\r
  11   <tr> \r
  12     <td><div align="center"><strong>2.08</strong><br>\r
  13         6/4/06</div></td>\r
  14     <td><ul>\r
  15         <li>Editing can be locked to selection area</li>\r
  16         <li>Keyboard editing</li>\r
  17         <li>Create sequence features from Searches</li>\r
  18         <li>Precalculated annotations can be loaded onto alignments</li>\r
  19         <li>Features file allows grouping of features</li>\r
  20         <li>Annotation Colouring scheme added</li>\r
  21         <li>Smooth fonts off by default - Faster rendering</li>\r
  22         <li>Choose to toggle Autocalculate Consensus On/Off</li>\r
  23       </ul></td>\r
  24     <td><ul>\r
  25         <li>Drag &amp; Drop fixed on Linux</li>\r
  26         <li>Jalview Archive file faster to load/save, sequence descriptions saved. \r
  27         </li>\r
  28       </ul></td>\r
  29   </tr>\r
  30   <tr> \r
  31     <td><div align="center"><strong>2.07</strong><br>\r
  32         12/12/05</div></td>\r
  33     <td><ul>\r
  34         <li>PDB Structure Viewer enhanced</li>\r
  35         <li>Sequence Feature retrieval and display enhanced</li>\r
  36         <li>Choose to output sequence start-end after sequence name for file output</li>\r
  37         <li>Sequence Fetcher WSDBFetch@EBI</li>\r
  38         <li>Applet can read feature files, PDB files and can be used for HTML \r
  39           form input</li>\r
  40       </ul></td>\r
  41     <td><ul>\r
  42         <li>HTML output writes groups and features</li>\r
  43         <li>Group editing is Control and mouse click</li>\r
  44         <li>File IO bugs</li>\r
  45       </ul></td>\r
  46   </tr>\r
  47   <tr> \r
  48     <td><div align="center"><strong>2.06</strong><br>\r
  49         28/9/05</div></td>\r
  50     <td><ul>\r
  51         <li>View annotations in wrapped mode</li>\r
  52         <li>More options for PCA viewer</li>\r
  53       </ul></td>\r
  54     <td><ul>\r
  55         <li>GUI bugs resolved</li>\r
  56         <li>Runs with -nodisplay from command line</li>\r
  57       </ul></td>\r
  58   </tr>\r
  59   <tr> \r
  60     <td height="63"> <div align="center"><strong>2.05b</strong><br>\r
  61         15/9/05</div></td>\r
  62     <td><ul>\r
  63         <li>Choose EPS export as lineart or text</li>\r
  64         <li>Jar files are executable</li>\r
  65         <li>Can read in Uracil - maps to unknown residue</li>\r
  66       </ul></td>\r
  67     <td><ul>\r
  68         <li>Known OutOfMemory errors give warning message</li>\r
  69         <li>Overview window calculated more efficiently</li>\r
  70         <li>Several GUI bugs resolved</li>\r
  71       </ul></td>\r
  72   </tr>\r
  73   <tr> \r
  74     <td><div align="center"><strong>2.05</strong><br>\r
  75         30/8/05</div></td>\r
  76     <td><ul>\r
  77         <li>Edit and annotate in &quot;Wrapped&quot; view</li>\r
  78       </ul></td>\r
  79     <td><ul>\r
  80         <li>Several GUI bugs resolved</li>\r
  81       </ul></td>\r
  82   </tr>\r
  83   <tr> \r
  84     <td><div align="center"><strong>2.04</strong><br>\r
  85         24/8/05</div></td>\r
  86     <td><ul>\r
  87         <li>Hold down mouse wheel &amp; scroll to change font size</li>\r
  88       </ul></td>\r
  89     <td><ul>\r
  90         <li>Improved JPred client reliability</li>\r
  91         <li>Improved loading of Jalview files</li>\r
  92       </ul></td>\r
  93   </tr>\r
  94   <tr> \r
  95     <td> <div align="center"><strong>2.03</strong><br>\r
  96         18/8/05</div></td>\r
  97     <td><ul>\r
  98         <li>Set Proxy server name and port in preferences</li>\r
  99         <li>Multiple URL links from sequence ids</li>\r
 100         <li>User Defined Colours can have a scheme name and added to Colour Menu</li>\r
 101         <li>Choose to ignore gaps in consensus calculation</li>\r
 102         <li>Unix users can set default web browser</li>\r
 103         <li>Runs without GUI for batch processing</li>\r
 104         <li>Dynamically generated Web Service Menus</li>\r
 105       </ul></td>\r
 106     <td><ul>\r
 107         <li>InstallAnywhere download for Sparc Solaris</li>\r
 108       </ul></td>\r
 109   </tr>\r
 110   <tr> \r
 111     <td> <div align="center"><strong>2.02</strong><br>\r
 112         18/7/05</div></td>\r
 113     <td>&nbsp;</td>\r
 114     <td><ul>\r
 115         <li>Copy &amp; Paste order of sequences maintains alignment order.</li>\r
 116       </ul></td>\r
 117   </tr>\r
 118   <tr> \r
 119     <td><div align="center"><strong>2.01</strong><br>\r
 120         12/7/05</div></td>\r
 121     <td><ul>\r
 122         <li>Use delete key for deleting selection.</li>\r
 123         <li>Use Mouse wheel to scroll sequences.</li>\r
 124         <li>Help file updated to describe how to add alignment annotations.</li>\r
 125         <li>Version and build date written to build properties file.</li>\r
 126         <li>InstallAnywhere installation will check for updates at launch of Jalview.</li>\r
 127       </ul></td>\r
 128     <td><ul>\r
 129         <li>Delete gaps bug fixed.</li>\r
 130         <li>FileChooser sorts columns.</li>\r
 131         <li>Can remove groups one by one.</li>\r
 132         <li>Filechooser icons installed.</li>\r
 133         <li>Finder ignores return character when searching. Return key will initiate \r
 134           a search.<br>\r
 135         </li>\r
 136       </ul></td>\r
 137   </tr>\r
 138   <tr> \r
 139     <td> <div align="center"><strong>2.0</strong><br>\r
 140         20/6/05</div></td>\r
 141     <td ><ul>\r
 142         <li> New codebase</li>\r
 143       </ul></td>\r
 144     <td >&nbsp;</td>\r
 145   </tr>\r
 146 </table>\r
 147 <p>&nbsp;</p>\r
 148 </body>\r
 149 </html>\r