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[jalview.git] / help / html / whatsNew.html
1 <html>
2 <!--
3  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
4  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
5  * 
6  * This file is part of Jalview.
7  * 
8  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
9  * modify it under the terms of the GNU General Public License 
10  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
11  *  
12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but 
13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty 
14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR 
15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
16  * 
17  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
18 -->
19 <head>
20 <title>What's new ?</title>
21 </head>
22 <body>
23         <p>
24                 <strong>What's new ?</strong>
25         </p>
26         <p>
27         Jalview 2.8 includes a brand new logo, which you'll see in file browsers, splash screens, and also on the new look Jalview site.
28         </p>
29         <p>
30                 In addition to our new look, Jalview 2.8 includes a number of new
31                 features.. some of which have been in development since July 2010. The
32                 highlights are below, and - as usual, for a comprehensive list, take a
33                 look at the <a href="releases.html#Jalview2.8">Jalview 2.8 Release
34                         Notes</a>.
35         </p>
36         <p>
37                 <strong>Highlights in Jalview Desktop Version 2.8</strong>
38         </p>
39         <ul>
40
41         <li>New Purine/Pyrimidine colour scheme</li>
42         <li>Colouring of RNA secondary structure by helices.  See <a href="na/index.html">Nucleic Acid Support</a></li>
43         <li>Embedded <a href="http://www.varna.fr/">VARNA</a> RNA secondary structure viewer.
44         </ul>
45
46         <p>
47                 <strong>Issues Resolved (a select list - see the <a
48                         href="releases.html#Jalview2.7.1">release history</a> for full details)
49                 </strong>
50         </p>
51         <p>
52                 <strong>Issues in the Jalview Desktop</strong>
53         <ul>
54         </ul>
55         <strong>Issues specific to the JalviewLite Applet</strong>
56         <ul>
57         </ul>
58         <strong>Issues affecting both applet and application</strong>
59         <ul>
60         </ul>
61 </body>
62 </html>