help/markdown/releases/release-2_10_0b1.md

   1 ---
   2 channel: release
   3 version: 2.10.0b1
   4 date: 2016-10-25
   5 ---
   6
   7 ## New Features
   8
   9
  10
  11 ### Application
  12 - 3D Structure chooser opens with 'Cached structures' view if structures already loaded
  13 - Progress bar reports models as they are loaded to structure views
  14
  15
  16 ## Issues Resolved
  17
  18
  19
  20 ### General
  21   - Colour by conservation always enabled and no tick shown in menu when BLOSUM or PID shading applied
  22   - FER1_ARATH and FER2_ARATH labels were switched in example sequences/projects/trees
  23
  24
  25 ### Application
  26   - Jalview projects with views of local PDB structure files saved on Windows cannot be opened on OSX
  27   - Multiple structure views can be opened and superposed without timeout for structures with multiple models or multiple sequences in alignment
  28   - Cannot import or associated local PDB files without a PDB ID HEADER line
  29   - RMSD is not output in Jmol console when superposition is performed
  30   - Drag and drop of URL from Browser fails for Linux and OSX versions earlier than El Capitan
  31   - ENA client ignores invalid content from ENA server
  32   - Exceptions are not raised in console when ENA client attempts to fetch non-existent IDs via Fetch DB Refs UI option
  33   - Exceptions are not raised in console when a new view is created on the alignment
  34   - OSX right-click fixed for group selections: CMD-click to insert/remove gaps in groups and CTRL-click to open group pop-up menu
  35
  36
  37 ### Build and deployment
  38   - URL link checker now copes with multi-line anchor tags
  39
  40
  41 ### New Known Issues
  42   - Drag and drop from URL links in browsers do not work on Windows