help/markdown/releases/release-2_9_0b1.md

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   2 channel: release
   3 version: 2.9.0b1
   4 date: 2015-10-08
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   7 ## New Features
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  11 ### General
  12 - Updated Spanish translations of localized text for 2.9
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  15 ### Application
  16 - Signed OSX InstallAnywhere installer<br/>
  17 - Support for per-sequence based annotations in BioJSON
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  20 ### Applet
  21 - Split frame example added to applet examples page
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  24 ### Build and Deployment
  25 - <!--  JAL-1888 -->  New ant target for running Jalview's test suite
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  28 ## Issues Resolved
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  32 ### General
  33   - Mapping of cDNA to protein in split frames incorrect when sequence start > 1
  34   - Broken images in filter column by annotation dialog documentation
  35   - Feature colours not parsed from features file
  36   - Exceptions and incomplete link URLs recovered when loading a features file containing HTML tags in feature description
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  39 ### Application
  40   - Annotations corrupted after BioJS export and reimport
  41   - Incorrect sequence limits after Fetch DB References with 'trim retrieved sequences'
  42   - Incorrect warning about deleting all data when deleting selected columns
  43   - Patch to build system for shipping properly signed JNLP templates for webstart launch
  44   - EMBL-PDBe fetcher/viewer dialogs do not offer unreleased structures for download or viewing
  45   - Tab/space/return keystroke operation of EMBL-PDBe fetcher/viewer dialogs works correctly
  46   - Disabled 'minimise' button on Jalview windows running on OSX to workaround redraw hang bug
  47   - Split cDNA/Protein view position and geometry not recovered from jalview project
  48   - Initial enabled/disabled state of annotation menu sorter 'show autocalculated first/last' corresponds to alignment view
  49   - Restoring of Clustal, RNA Helices and T-Coffee color schemes from BioJSON
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  52 ### Applet
  53   - Reorder sequences mirrored in cDNA/Protein split frame
  54   - Applet with Jmol examples not loading correctly