1f5709649cabb3609c270b649ce633fb48070a0e
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.force_quit = Force Quit
36 label.quit_jalview = Are you sure you want to quit Jalview?
37 label.unsaved_changes = There are unsaved changes.
38 label.save_in_progress = Some files are still saving:
39 label.unknown = Unknown
40 label.all_saved = All files saved.
41 label.quitting_bye = Quitting, bye!
42 action.wait = Wait
43 action.cancel_quit = Cancel quit
44 action.expand_views = Expand Views
45 action.gather_views = Gather Views
46 action.page_setup = Page Setup...
47 action.reload = Reload
48 action.load = Load
49 action.open = Open
50 action.cancel = Cancel
51 action.create = Create
52 action.update = Update
53 action.delete = Delete
54 action.clear = Clear
55 action.accept = Accept
56 action.select_ddbb = --- Select Database ---
57 action.undo = Undo
58 action.redo = Redo
59 action.reset = Reset
60 action.remove_left = Remove left
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63 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
64 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
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66 action.boxes = Boxes
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74 action.remove = Remove
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76 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
77 action.user_defined = User Defined...
78 action.by_conservation = By Conservation
79 action.wrap = Wrap
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81 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
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95 action.help = Help
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97 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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112 action.reveal_all = Reveal All
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114 action.find_all = Find all
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120 action.apply = Apply
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122 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
123 action.by_chain = By Chain
124 action.by_sequence = By Sequence
125 action.paste_annotations = Paste Annotations
126 action.format = Format
127 action.select = Select
128 action.new_view = New View
129 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
130 action.close = Close
131 action.add = Add
132 action.save_as = Save as...
133 action.save = Save
134 action.change_font = Change Font
135 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
136 action.colour = Colour
137 action.calculate = Calculate
138 action.select_all = Select all
139 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
140 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
141 action.deselect_all = Deselect all
142 action.invert_selection = Invert selection
143 action.using_jmol = Using Jmol
144 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
145 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
146 action.link = Link
147 action.group_link = Group Link
148 action.show_chain = Show Chain
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150 action.fetch_db_references = Fetch DB References
151 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
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153 label.structures_manager = Structures Manager
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155 label.url\: = URL:
156 label.input_file_url = Enter URL or Input File
157 label.select_feature = Select feature
158 label.name = Name
159 label.name\: = Name:
160 label.name_param = Name: {0}
161 label.group = Group
162 label.group\: = Group:
163 label.group_name = Group Name
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165 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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167 label.description = Description
168 label.description\: = Description:
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170 label.end = End:
171 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
172 label.service_action = Service Action:
173 label.post_url = POST URL:
174 label.url_suffix = URL Suffix
175 label.per_seq = per Sequence
176 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
177 label.amend = Amend
178 label.undo_command = Undo {0}
179 label.redo_command = Redo {0}
180 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
181 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
182 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
183 label.choose_calculation = Choose Calculation
184 label.calc_title = {0} Using {1}
185 label.tree_calc_av = Average Distance
186 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
187 label.score_model_pid = % Identity
188 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
189 label.score_model_pam250 = PAM 250
190 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
191 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
192 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
193 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
194 label.status_bar = Status bar
195 label.out_to_textbox = Output to Textbox
196 label.occupancy = Occupancy
197 # delete Clustal - use FileFormat name instead
198 label.clustal = Clustal
199 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
200 label.colourScheme_clustal = Clustal
201 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
202 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
203 label.colourScheme_zappo = Zappo
204 label.colourScheme_taylor = Taylor
205 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
206 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
207 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
208 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
209 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
210 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
211 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
212 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
213 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
214 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
215 label.colourScheme_gecos\:flower = gecos Flower
216 label.colourScheme_gecos\:blossom = gecos Blossom
217 label.colourScheme_gecos\:sunset = gecos Sunset
218 label.colourScheme_gecos\:ocean = gecos Ocean
219 label.blc = BLC
220 label.fasta = Fasta
221 label.msf = MSF
222 label.pfam = PFAM
223 label.pileup = Pileup
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225 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
226 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
227 label.show_annotations = Show annotations
228 label.hide_annotations = Hide annotations
229 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
230 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
231 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
232 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
233 label.hide_all = Hide all
234 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
235 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
236 label.colour_text = Colour Text
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250 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
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279 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
280 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
281 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
282 label.structure_viewer = Default structure viewer
283 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
284 label.viewer_path = Path to {0} program
285 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
286 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
287 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
288 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
289 label.min_colour = Minimum Colour
290 label.max_colour = Maximum Colour
291 label.no_colour = No Colour
292 label.use_original_colours = Use Original Colours
293 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
294 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
295 label.selection = Selection
296 label.group_colour = Group Colour
297 label.sequence = Sequence
298 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
299 label.min_value = Min value
300 label.max_value = Max value
301 label.no_value = No value
302 label.new_feature = New Feature
303 label.match_case = Match Case
304 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
305 label.labels = Labels
306 label.output_values = Output Values...
307 label.output_points = Output points...
308 label.output_transformed_points = Output transformed points
309 label.input_data = Input Data...
310 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
311 label.protein_matrix = Protein matrix
312 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
313 label.show_distances = Show distances
314 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
315 label.fit_to_window = Fit To Window
316 label.newick_format = Newick Format
317 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
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320 label.wireframe = Wireframe
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322 label.z_buffering = Z Buffering
323 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
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325 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
326 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
327 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
328 label.removed_columns = Removed {0} columns.
329 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
330 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
331 label.order_by_params = Order by {0}
332 label.html_content = <html>{0}</html>
333 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
334 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
335 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
336 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
337 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
338 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
339 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
340 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
341 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
342 label.paste_your = Paste your
343 label.finished_searching = Finished searching
344 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
345 label.search_results= Search results {0} : {1}
346 label.found_match_for = Found match for {0}
347 label.font = Font:
348 label.size = Size:
349 label.style = Style:
350 label.calculating = Calculating....
351 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
352 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
353 label.set_this_label_text = set this label text
354 label.sequences_from = Sequences from {0}
355 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
356 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
357 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
358 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
359 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
360 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
361 label.source_to_target = {0} ... {1}
362 label.per_sequence_only= Per-sequence only
363 label.to_file = to File
364 label.to_textbox = to Textbox
365 label.jalview = Jalview
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367 label.status = Status
368 label.channels = Channels
369 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
370 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
371 label.groovy_console = Groovy Console...
372 label.lineart = Lineart
373 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
374 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
375 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
376 label.invert_selection = Invert Selection
377 label.optimise_order = Optimise Order
378 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
379 label.load_colours = Load Colours
380 label.save_colours = Save Colours
381 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
382 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
383 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
384 label.database_param = Database: {0}
385 label.example = Example
386 label.example_param = Example: {0}
387 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
388 label.file_format_not_specified = File format not specified
389 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
390 label.error_saving_file = Error Saving File
391 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
392 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
393 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
394 label.invalid_selection = Invalid Selection
395 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
396 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
397 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
398 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
399 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
400 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
401 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
402 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
403 label.translation_failed = Translation Failed
404 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
405 label.implementation_error  = Implementation error:
406 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
407 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
408 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
409 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
410 label.view_name_original = Original
411 label.enter_view_name = Enter View Name
412 label.enter_label = Enter label
413 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
414 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
415 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
416 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
417 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
418 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
419 label.error_parsing_text = Error parsing text
420 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
421 label.input_alignment = Input Alignment
422 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
423 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
424 label.url_not_found = URL not found
425 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
426 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
427 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
428 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
429 label.invalid_url = Invalid URL !
430 label.error_loading_file = Error loading file
431 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
432 label.file_open_error = File open error
433 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
434 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
435 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
436 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
437 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
438 label.alignment_props = Alignment Properties
439 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
440 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
441 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
442 label.annotations = Annotations
443 label.structure_options = Structure Options
444 label.features = Features
445 label.overview_params = Overview {0}
446 label.paste_newick_file = Paste Newick file
447 label.load_tree_from_file = From File - 
448 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
449 label.selection_output_command = Selection output - {0}
450 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
451 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
452 label.pca_details = PCA details
453 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
454 label.user_defined_colours = User defined colours
455 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
456 label.jaview_build_date = Build date: {0}
457 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
458 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
459 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
460 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
461 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
462 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
463 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
464 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
465 label.right_click = Right click
466 label.to_add_annotation = to add annotation
467 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
468 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
469 label.label = Label
470 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
471 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
472 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
473 label.calculating_pca= Calculating PCA
474 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
475 label.jalview_applet = Jalview applet
476 label.loading_data = Loading data
477 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
478 label.calculating_tree = Calculating tree
479 label.state_queueing = queuing
480 label.state_running = running
481 label.state_completed = finished
482 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
483 label.state_job_error = job error!
484 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
485 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
486 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
487 label.structure_type = Structure type
488 label.settings_for_type = Settings for {0}
489 label.view_full_application = View in Full Application
490 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
491 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
492 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
493 label.load_vcf_file = Load VCF File
494 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
495 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
496 label.export_features = Export Features...
497 label.export_annotations = Export Annotations...
498 label.to_upper_case = To Upper Case
499 label.to_lower_case = To Lower Case
500 label.toggle_case = Toggle Case
501 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
502 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
503 label.edit_sequence = Edit Sequence
504 label.edit_sequences = Edit Sequences
505 label.insert_gap = Insert 1 gap
506 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
507 label.delete_gap = Delete 1 gap
508 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
509 label.sequence_details = Sequence Details
510 label.viewer_help = {0} Help
511 label.close_viewer = Close Viewer
512 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
513 label.all = All
514 label.sort_by = Sort alignment by
515 label.sort_by_score = Sort by Score
516 label.sort_by_density = Sort by Density
517 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
518 label.sort_ann_by = Sort annotations by
519 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
520 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
521 label.reveal = Reveal
522 label.hide_columns = Hide Columns
523 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
524 label.load_tree_file = Load a tree file
525 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
526 label.standard_databases = Standard Databases
527 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
528 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
529 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
530 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
531 label.3dbeacons = 3D-Beacons
532 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
533 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
534 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
535 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
536 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
537 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
538 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
539 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
540 label.adjust_threshold = Adjust threshold
541 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
542 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
543 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
544 label.open_url_param = Open URL {0}
545 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
546 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
547 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
548 label.dark_colour = Dark Colour
549 label.light_colour = Light Colour
550 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
551 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
552 label.copy_format_from = Copy format from
553 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
554 label.select_all_views = Select all views
555 label.select_many_views = Select many views
556 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
557 label.open_local_file = Open local file
558 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
559 label.listen_for_selections = Listen for selections
560 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
561 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
562 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
563 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
564 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
565 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
566 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
567 label.no_services = <No Services>
568 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
569 label.from_url = from URL
570 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
571 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
572 label.from_textbox = from Textbox
573 label.window = Window
574 label.preferences = Preferences
575 label.tools = Tools
576 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
577 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
578 label.collect_garbage = Collect Garbage
579 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
580 label.show_java_console = Show Java Console
581 label.show_jalview_news = Show Jalview News
582 label.take_snapshot = Take snapshot
583 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
584 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
585 label.monospaced_font= Monospaced
586 label.quality = Quality
587 label.maximize_window = Maximize Window
588 label.conservation = Conservation
589 label.consensus = Consensus
590 label.histogram = Histogram
591 label.logo = Logo
592 label.non_positional_features = List Non-positional Features
593 label.database_references = List Database References
594 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
595 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
596 label.gap_symbol = Gap Symbol
597 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
598 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
599 label.address = Address
600 label.host = Host
601 label.port = Port
602 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
603 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
604 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
605 label.check_for_latest_version = Check for latest version
606 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
607 label.no_proxy = No proxy servers
608 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
609 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
610 label.auth_required = Authentication required
611 label.username = Username
612 label.password = Password
613 label.proxy_password_required = Proxy password required
614 label.not_stored = not stored in Preferences file
615 label.rendering_style = {0} rendering style
616 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
617 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
618 label.smooth_font = Smooth Font
619 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
620 label.pad_gaps = Pad Gaps
621 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
622 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
623 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
624 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
625 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
626 label.right_align_ids = Right Align Ids
627 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
628 label.open_overview = Open Overview
629 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
630 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
631 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
632 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
633 label.visual = Visual
634 label.connections = Connections
635 label.output = Output
636 label.editing = Editing
637 label.web_services = Web Services
638 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
639 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
640 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
641 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
642 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
643 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
644 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
645 label.new_service_url = New Service URL
646 label.edit_service_url = Edit Service URL
647 label.delete_service_url = Delete Service URL
648 label.details = Details
649 label.options = Options
650 label.parameters = Parameters
651 label.proxy_servers = Proxy Servers
652 label.file_output = File Output
653 label.select_input_type = Select input type
654 label.set_options_for_type = Set options for type
655 label.data_input_parameters = Data input parameters
656 label.data_returned_by_service = Data returned by service
657 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
658 label.parsing_errors = Parsing errors
659 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
660 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
661 label.input_parameter_name = Input Parameter name
662 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
663 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
664 label.brief_description_service = Brief description of service
665 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
666 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
667 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
668 label.gap_character = Gap character
669 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
670 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
671 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
672 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
673 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
674 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
675 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
676 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
677 label.input_output = Input/Output
678 label.cut_paste = Cut'n'Paste
679 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
680 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
681 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
682 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
683 label.from_file = From File
684 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
685 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
686 label.text_colour = Text Colour...
687 label.structure = Structure
688 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
689 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
690 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
691 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
692 label.sequence_name = Sequence Name
693 label.sequence_description = Sequence Description
694 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
695 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
696 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
697 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
698 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
699 label.web_browser_not_found = Web browser not found
700 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
701 label.html = HTML
702 label.wrap = Wrap
703 label.show_database_refs = Show Database Refs
704 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
705 label.save_png_image = Save As PNG Image
706 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
707 label.export_image = Export Image
708 label.vamsas_store = VAMSAS store
709 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
710 label.reverse = Reverse
711 label.reverse_complement = Reverse Complement
712 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
713 label.extract_scores = Extract Scores
714 label.get_cross_refs = Get Cross-References
715 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
716 label.add_sequences = Add Sequences
717 label.new_window = New Window
718 label.split_window = Split Window
719 label.set_as_default = Set as Default
720 label.show_labels = Show labels
721 action.background_colour = Background Colour...
722 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
723 label.link_name = Link Name
724 label.pdb_file = PDB file
725 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
726 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
727 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
728 label.superpose_structures = Superpose Structures
729 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
730 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
731 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
732 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
733 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
734 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
735 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
736 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
737 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
738 label.case_sensitive = Case Sensitive
739 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
740 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
741 label.index_by_host = Index by Host
742 label.index_by_type = Index by Type
743 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
744 label.display_warnings = Display Warnings
745 label.move_url_up = Move URL Up
746 label.move_url_down = Move URL Down
747 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
748 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
749 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
750 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
751 label.sequences_updated = Sequences updated
752 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
753 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
754 label.paste_new_window = Paste To New Window
755 label.settings_for_param = Settings for {0}
756 label.view_params = View {0}
757 label.aacon_calculations = AACon Calculations
758 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
759 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
760 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
761 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
762 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
763 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
764 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
765 label.all_views = All Views
766 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
767 label.realign_with_params = Realign with {0}
768 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
769 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
770 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
771 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
772 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
773 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
774 label.view_documentation = View documentation
775 label.select_return_type = Select return type
776 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
777 label.features_for_params = Features for - {0}
778 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
779 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
780 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
781 label.varna_params = VARNA - {0}
782 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
783 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
784 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
785 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
786 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
787 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
788 label.points_for_params = Points for {0}
789 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
790 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
791 label.select_background_colour = Select Background Colour
792 label.invalid_font = Invalid Font
793 label.search_db_all = Search all of {0}
794 label.search_db_index = Search {0} index {1}
795 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
796 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
797 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
798 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
799 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
800 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
801 label.example_query_param = Example query: {0}
802 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
803 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
804 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
805 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
806 label.select_columns_containing = Select columns containing
807 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
808 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
809 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
810 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
811 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
812 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
813 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
814 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
815 label.use_sequence_id_4 = 
816 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
817 label.switch_server = Switch server
818 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
819 label.services_at = Services at {0}
820 label.rest_client_submit = {0} using {1}
821 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
822 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
823 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
824 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
825 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
826 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
827 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
828 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
829 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
830 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
831 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
832 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
833 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
834 label.user_preset = User Preset
835 label.service_preset = Service Preset
836 label.run_with_preset = Run {0} with preset
837 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
838 action.by_title_param = By {0}
839 label.source_from_db_source = Sources from {0}
840 label.from_msname = from {0}
841 label.superpose_with = Superpose with
842 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
843 label.add_new_row = Add New Row
844 label.edit_label_description = Edit Label/Description
845 label.hide_row = Hide This Row
846 label.delete_row = Delete This Row
847 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
848 label.export_annotation = Export Annotation
849 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
850 label.helix = Helix
851 label.sheet = Sheet
852 label.rna_helix = RNA Helix
853 label.remove_annotation = Remove Annotation
854 label.colour_by = Colour by...
855 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
856 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
857 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
858 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
859 label.multiharmony = Multi-Harmony
860 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
861 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
862 label.prompt_each_time = Prompt each time
863 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
864 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
865 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
866 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
867 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
868 label.invalid_name = Invalid name
869 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
870 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
871 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
872 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
873 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
874 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
875 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
876 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
877 label.feature_type = Feature Type
878 label.show = Show
879 label.service_url = Service URL
880 label.copied_sequences = Copied sequences
881 label.cut_sequences = Cut Sequences
882 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
883 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
884 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
885 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
886 label.save_features_to_file = Save Features to File
887 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
888 label.save_pdb_file = Save PDB File
889 label.save_text_to_file = Save Text to File
890 label.save_state = Save State
891 label.restore_state = Restore State
892 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
893 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
894 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
895 label.select_startup_file = Select startup file
896 label.select_default_browser = Select default web browser
897 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
898 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
899 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
900 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
901 label.save_as_html = Save as HTML
902 label.recently_opened = Recently Opened
903 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
904 label.tree = Tree
905 label.tree_from = Tree from {0}
906 label.webservice_job_title = {0} using {1}
907 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
908 label.visible = Visible
909 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
910 label.visible_region_of = visible region of
911 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
912 label.loading_file = Loading File: {0}
913 label.edit_params = Edit {0}
914 label.as_percentage = As Percentage
915 error.not_implemented = Not implemented
916 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
917 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
918 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
919 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
920 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
921 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
922 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
923 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
924 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
925 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
926 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
927 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
928 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
929 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
930 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
931 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
932 error.implementation_error = Implementation error
933 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
934 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
935 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
936 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
937 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
938 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
939 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
940 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
941 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
942 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
943 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
944 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
945 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
946 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
947 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
948 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
949 label.cancelled_params = Cancelled {0}
950 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
951 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
952 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
953 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
954 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
955 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
956 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
957 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
958 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
959 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
960 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
961 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
962 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
963 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
964 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
965 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
966 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
967 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
968 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
969 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
970 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
971 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
972 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
973 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
974 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
975 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
976 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
977 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
978 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
979 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
980 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
981 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
982 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
983 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
984 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
985 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
986 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
987 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
988 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
989 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
990 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
991 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
992 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
993 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
994 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
995 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
996 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
997 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
998 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
999 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1000 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1001 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
1002 label.toggled = Toggled
1003 label.marked = Marked
1004 label.containing = containing
1005 label.not_containing = not containing
1006 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1007 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1008 label.submission_params = Submission {0}
1009 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1010 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1011 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1012 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1013 label.pca_calculating = Calculating PCA
1014 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1015 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1016 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1017 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1018 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1019 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1020 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1021 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1022 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1023 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1024 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1025 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1026 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1027 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1028 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1029 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1030 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1031 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1032 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1033 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1034 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1035 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1036 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1037 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1038 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1039 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1040 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1041 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1042 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1043 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1044 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1045 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1046 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1047 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1048 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1049 label.mapped = mapped
1050 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1051 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1052 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1053 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1054 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1055 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1056 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1057 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1058 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1059 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1060 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1061 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1062 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1063 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1064 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1065 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1066 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1067 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1068 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1069 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1070 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1071 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1072 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1073 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1074 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1075 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1076 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1077 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1078 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1079 label.remove_gaps = Remove Gaps
1080 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1081 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1082 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1083 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1084 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1085 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1086 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1087 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1088 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1089 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1090 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1091 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1092 warn.service_not_supported = Service not supported!
1093 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1094 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1095 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1096 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1097 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1098 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1099 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1100 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1101 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1102 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1103 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1104 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1105 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1106 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1107 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1108 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1109 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1110 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1111 label.eps_file = EPS file
1112 label.png_image = PNG image
1113 status.export_complete = {0} Export completed
1114 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1115 status.refreshing_news = Refreshing news
1116 status.opening_params = Opening {0}
1117 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1118 status.finshed_querying = Finished querying
1119 status.parsing_results = Parsing results.
1120 status.processing = Processing...
1121 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1122 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1123 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1124 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1125 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1126 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1127 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1128 status.opening_file_for = opening file for
1129 status.colouring_structures = Colouring structures
1130 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1131 label.font_too_small = Font size is too small
1132 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1133 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1134 label.out_of_memory = Out of memory
1135 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1136 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1137 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1138 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1139 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1140 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1141 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1142 label.test_server = Test Server?
1143 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1144 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1145 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1146 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1147 label.file_already_exists = File exists
1148 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1149 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1150 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1151 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1152 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1153 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1154 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1155 label.delete_all = Delete all sequences
1156 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1157 label.add_annotations_for = Add annotations for
1158 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1159 label.choose_annotations = Choose Annotations
1160 label.find = Find
1161 label.in = in
1162 label.invalid_search = Search string invalid
1163 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1164 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1165 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1166 label.show_group_logo = Show Group Logo
1167 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1168 label.show_histogram = Show Histogram
1169 label.show_logo = Show Logo
1170 label.normalise_logo = Normalise Logo
1171 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1172 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1173 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1174 label.open_split_window = Open split window
1175 action.no = No
1176 action.yes = Yes
1177 label.for = for
1178 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1179 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1180 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1181 label.alpha_helix = Alpha Helix
1182 label.beta_strand = Beta Strand
1183 label.turn = Turn
1184 label.select_all = Select All
1185 label.structures_filter = Structures Filter
1186 label.search_filter = Search Filter
1187 label.include_description= Include Description
1188 action.back = Back
1189 label.hide_insertions = Hide Insertions
1190 label.mark_as_representative = Mark as representative
1191 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1192 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1193 label.result = result
1194 label.results = results
1195 label.structure_chooser = Structure Chooser
1196 label.invert = Invert 
1197 label.select_pdb_file = Select PDB File
1198 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1199 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1200 label.search_result = Search Result
1201 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1202 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1203 label.start_jalview = Start Jalview
1204 label.biojs_html_export = BioJS
1205 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1206 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1207 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1208 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1209 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1210 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1211 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1212 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1213 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1214 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1215 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1216 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1217 action.export_groups = Export Groups
1218 action.export_annotations = Export Annotations
1219 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1220 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1221 action.export_features = Export Features
1222 label.export_settings = Export Settings
1223 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1224 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1225 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1226 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1227 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1228 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1229 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1230 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1231 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1232 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1233 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1234 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1235 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1236 label.run_groovy = Run Groovy console script
1237 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1238 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1239 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1240 action.next_page= >> 
1241 action.prev_page= << 
1242 label.next_page_tooltip=Next Page
1243 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1244 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1245 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1246 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1247 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1248 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1249 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1250 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1251 label.column = Column
1252 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1253 label.operation_failed = Operation failed
1254 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1255 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1256 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1257 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1258 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1259 action.customfilter = Custom only
1260 action.showall = Show All
1261 label.insert = Insert:
1262 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1263 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1264 label.primary = Double Click
1265 label.inmenu = In Menu
1266 label.id = ID
1267 label.database = Database
1268 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1269 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1270 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1271 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1272 label.urllinks = Links
1273 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1274 label.togglehidden = Show hidden regions
1275 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1276 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1277 label.consensus_descr = PID
1278 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1279 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1280 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1281 label.show_experimental = Enable experimental features
1282 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1283 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1284 label.overview_settings = Overview settings
1285 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1286 label.gap_colour = Gap colour:
1287 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1288 label.hidden_colour = Hidden colour:
1289 label.select_gap_colour = Select gap colour
1290 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1291 label.overview = Overview
1292 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1293 label.oview_calc = Recalculating overview...
1294 label.feature_details = Feature details
1295 label.matchCondition_contains = Contains
1296 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1297 label.matchCondition_matches = Matches
1298 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1299 label.matchCondition_present = Is present
1300 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1301 label.matchCondition_eq = =
1302 label.matchCondition_ne = not =
1303 label.matchCondition_lt = <
1304 label.matchCondition_le = <=
1305 label.matchCondition_gt = >
1306 label.matchCondition_ge = >=
1307 label.numeric_required = The value should be numeric
1308 label.filter = Filter
1309 label.filters = Filters
1310 label.join_conditions = Join conditions with
1311 label.delete_condition = Delete this condition
1312 label.score = Score
1313 label.colour_by_label = Colour by label
1314 label.variable_colour = Variable colour...
1315 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1316 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1317 option.autosearch = Autosearch
1318 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1319 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1320 label.simple_colour = Simple Colour
1321 label.colour_by_text = Colour by text
1322 label.graduated_colour = Graduated Colour
1323 label.by_text_of = By text of
1324 label.by_range_of = By range of
1325 label.or = Or
1326 label.and = And
1327 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1328 label.best_quality = Best Quality
1329 label.best_resolution = Best Resolution
1330 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1331 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1332 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1333 label.cached_structures = Cached Structures
1334 label.free_text_search = Free Text Search
1335 label.annotation_name = Annotation Name
1336 label.annotation_description = Annotation Description 
1337 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1338 label.alignment = alignment
1339 label.pca = PCA
1340 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1341 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1342 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1343 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1344 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1345 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1346 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1347 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1348 label.continue_operation = Continue operation?
1349 label.continue = Continue
1350 label.backups = Backups
1351 label.backup = Backup
1352 label.backup_files = Backup Files
1353 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1354 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1355 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1356 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1357 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1358 label.scheme_examples = Scheme examples
1359 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1360 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1361 label.keep_files = Deleting old backup files
1362 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1363 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1364 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1365 label.always_ask = Always ask
1366 label.auto_delete = Automatically delete
1367 label.filename = filename
1368 label.braced_oldest = (oldest)
1369 label.braced_newest = (most recent)
1370 label.configuration = Configuration
1371 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1372 label.schemes = Schemes
1373 label.customise = Customise
1374 label.custom = Custom
1375 label.default = Default
1376 label.single_file = Single backup
1377 label.keep_all_versions = Keep all versions
1378 label.rolled_backups = Rolled backup files
1379 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1380 label.custom_description = Your own saved scheme
1381 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1382 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1383 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1384 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1385 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1386 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1387 label.include_backup_files = Include backup files
1388 label.cancel_changes = Cancel changes
1389 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1390 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1391 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1392 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1393 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1394 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1395 label.delete = Delete
1396 label.rename = Rename
1397 label.keep = Keep
1398 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1399 label.annotation_name = Annotation Name
1400 label.annotation_description = Annotation Description 
1401 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1402 label.alignment = alignment
1403 label.pca = PCA
1404 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1405 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1406 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1407 label.show_linked_features = Show {0} features
1408 label.on_top = on top
1409 label.include_linked_features = Include {0} features
1410 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1411 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1412 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1413 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1414 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1415 label.log_level = Log level
1416 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1417 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1418 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1419 label.startup = Startup
1420 label.memory = Memory
1421 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1422 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1423 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1424 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1425 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1426 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1427 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1428 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1429 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.
1430 warning.wrong_jvm_version_title = Wrong Java Version
1431 warning.wrong_jvm_version_message = The Java version being used (Java {0}) may lead to problems.\nThis installation of Jalview should be used with Java {1}.