JAL-2995 tooltip on fields with double-click to browse for file
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.quit = Quit
34 action.expand_views = Expand Views
35 action.gather_views = Gather Views
36 action.page_setup = Page Setup...
37 action.reload = Reload
38 action.load = Load
39 action.open = Open
40 action.cancel = Cancel
41 action.create = Create
42 action.update = Update
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45 action.accept = Accept
46 action.select_ddbb = --- Select Database ---
47 action.undo = Undo
48 action.redo = Redo
49 action.reset = Reset
50 action.remove_left = Remove left
51 action.remove_right = Remove right
52 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
53 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
54 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
55 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
56 action.boxes = Boxes
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59 action.by_id = By Id
60 action.by_length = By Length
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63 action.set_as_reference = Set as Reference 
64 action.remove = Remove
65 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
67 action.user_defined = User Defined...
68 action.by_conservation = By Conservation
69 action.wrap = Wrap
70 action.show_gaps = Show Gaps
71 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
72 action.find = Find
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75 action.copy = Copy
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77 action.font = Font...
78 action.scale_above = Scale Above
79 action.scale_left = Scale Left
80 action.scale_right = Scale Right
81 action.by_tree_order = By Tree Order
82 action.sort = Sort
83 action.calculate_tree = Calculate Tree...
84 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
85 action.help = Help
86 action.by_annotation = By Annotation...
87 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
88 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
89 action.show = Show
90 action.hide = Hide
91 action.ok = OK
92 action.set_defaults = Defaults
93 action.create_group = Create Group
94 action.remove_group = Remove Group
95 action.edit_group = Edit Group
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99 action.sequences = Sequences
100 action.ids = IDS
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102 action.reveal_all = Reveal All
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104 action.find_all = Find all
105 action.find_next = Find next
106 action.file = File
107 action.view = View
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109 action.change_params = Change Parameters
110 action.apply = Apply
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112 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
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114 action.by_sequence = By Sequence
115 action.paste_annotations = Paste Annotations
116 action.format = Format
117 action.select = Select
118 action.new_view = New View
119 action.close = Close
120 action.add = Add
121 action.save_as_default = Save as default
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.link = Link
136 action.group_link = Group Link
137 action.show_chain = Show Chain
138 action.show_group = Show Group
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140 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
141 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
142 label.structures_manager = Structures Manager
143 label.nickname = Nickname:
144 label.url = URL
145 label.url\: = URL:
146 label.input_file_url = Enter URL or Input File
147 label.select_feature = Select feature
148 label.name = Name
149 label.name\: = Name:
150 label.name_param = Name: {0}
151 label.group = Group
152 label.group\: = Group:
153 label.group_name = Group Name
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155 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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157 label.description = Description
158 label.description\: = Description:
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160 label.end = End:
161 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
162 label.service_action = Service Action:
163 label.post_url = POST URL:
164 label.url_suffix = URL Suffix
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166 label.per_seq = per Sequence
167 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
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169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.treecalc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.select_score_model = Select score model
179 label.score_model_pid = % Identity
180 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
181 label.score_model_pam250 = PAM 250
182 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
183 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
184 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
185 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
186 label.status_bar = Status bar
187 label.out_to_textbox = Output to Textbox
188 label.occupancy = Occupancy
189 # delete Clustal - use FileFormat name instead
190 label.clustal = Clustal
191 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
192 label.colourScheme_clustal = Clustalx
193 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
194 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
195 label.colourScheme_zappo = Zappo
196 label.colourScheme_taylor = Taylor
197 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
198 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
199 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
200 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
201 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
202 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
203 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
204 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
205 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
206 label.blc = BLC
207 label.fasta = Fasta
208 label.msf = MSF
209 label.pfam = PFAM
210 label.pileup = Pileup
211 label.pir = PIR
212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
225 label.overview_window = Overview Window
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228 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
229 label.nucleotide = Nucleotide
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231 label.nucleotides = Nucleotides
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237 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
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241 label.documentation = Documentation
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243 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
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259 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
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261 label.apply_all_groups = Apply to all groups
262 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
263 label.show_first = Show first
264 label.show_last = Show last
265 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
266 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
267 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
268 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
269 label.structure_viewer = Default structure viewer
270 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
271 label.chimera_path = Path to Chimera program
272 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
273 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
274 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
275 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
276 label.min_colour = Minimum Colour
277 label.max_colour = Maximum Colour
278 label.use_original_colours = Use Original Colours
279 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
280 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
281 label.selection = Selection
282 label.group_colour = Group Colour
283 label.sequence = Sequence
284 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
285 label.min = Min:
286 label.max = Max:
287 label.colour_by_label = Colour by label
288 label.new_feature = New Feature
289 label.match_case = Match Case
290 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
291 label.labels = Labels
292 label.output_values = Output Values...
293 label.output_points = Output points...
294 label.output_transformed_points = Output transformed points
295 label.input_data = Input Data...
296 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
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298 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
299 label.show_distances = Show distances
300 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
301 label.fit_to_window = Fit To Window
302 label.newick_format = Newick Format
303 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
304 label.colours = Colours
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306 label.wireframe = Wireframe
307 label.depthcue = Depthcue
308 label.z_buffering = Z Buffering
309 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
310 label.all_chains_visible = All Chains Visible
311 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
312 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
313 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
314 label.removed_columns = Removed {0} columns.
315 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
316 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
317 label.order_by_params = Order by {0}
318 label.html_content = <html>{0}</html>
319 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
320 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
321 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
322 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
323 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
324 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
325 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
326 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
327 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
328 label.paste_your = Paste your
329 label.finished_searching = Finished searching
330 label.search_results= Search results {0} : {1}
331 label.found_match_for = Found match for {0}
332 label.font = Font:
333 label.size = Size:
334 label.style = Style:
335 label.calculating = Calculating....
336 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
337 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
338 label.set_this_label_text = set this label text
339 label.sequences_from = Sequences from {0}
340 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
341 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
342 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
343 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
344 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
345 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
346 label.source_to_target = {0} ... {1}
347 label.per_sequence_only= Per-sequence only
348 label.to_file = to File
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350 label.jalview = Jalview
351 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
352 label.status = Status
353 label.channels = Channels
354 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
355 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
356 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
357 label.session_update = Session Update
358 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
359 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
360 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
361 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
362 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
363 label.groovy_console = Groovy Console...
364 label.lineart = Lineart
365 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
366 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
367 label.invert_selection = Invert Selection
368 label.optimise_order = Optimise Order
369 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
370 label.load_colours = Load Colours
371 label.save_colours = Save Colours
372 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
373 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
374 label.database_param = Database: {0}
375 label.example = Example
376 label.example_param = Example: {0}
377 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
378 label.file_format_not_specified = File format not specified
379 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
380 label.error_saving_file = Error Saving File
381 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
382 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
383 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
384 label.invalid_selection = Invalid Selection
385 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
386 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
387 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
388 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
389 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
390 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
391 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
392 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
393 label.translation_failed = Translation Failed
394 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
395 label.implementation_error  = Implementation error:
396 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
397 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
398 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
399 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
400 label.view_name_original = Original
401 label.enter_view_name = Enter View Name
402 label.enter_label = Enter label
403 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
404 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
405 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
406 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
407 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
408 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
409 label.error_parsing_text = Error parsing text
410 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
411 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
412 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
413 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
414 label.input_alignment = Input Alignment
415 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
416 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
417 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
418 label.url_not_found = URL not found
419 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
420 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
421 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
422 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
423 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
424 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
425 label.invalid_url = Invalid URL !
426 label.error_loading_file = Error loading file
427 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
428 label.file_open_error = File open error
429 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
430 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
431 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
432 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
433 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
434 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
435 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
436 label.alignment_props = Alignment Properties
437 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
438 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
439 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
440 label.annotations = Annotations
441 label.structure_options = Structure Options
442 label.features = Features
443 label.overview_params = Overview {0}
444 label.paste_newick_file = Paste Newick file
445 label.load_tree_from_file = From File - 
446 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
447 label.selection_output_command = Selection output - {0}
448 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
449 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
450 label.pca_details = PCA details
451 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
452 label.user_defined_colours = User defined colours
453 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
454 label.jaview_build_date = Build date: {0}
455 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
456 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
457 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
458 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
459 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
460 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
461 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
462 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
463 label.right_click = Right click
464 label.to_add_annotation = to add annotation
465 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
466 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
467 label.label = Label
468 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
469 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
470 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
471 label.calculating_pca= Calculating PCA
472 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
473 label.jalview_applet = Jalview applet
474 label.loading_data = Loading data
475 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
476 label.calculating_tree = Calculating tree
477 label.state_queueing = queuing
478 label.state_running = running
479 label.state_completed = finished
480 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
481 label.state_job_error = job error!
482 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
483 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
484 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
485 label.structure_type = Structure type
486 label.settings_for_type = Settings for {0}
487 label.view_full_application = View in Full Application
488 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
489 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
490 label.export_features = Export Features...
491 label.export_annotations = Export Annotations...
492 label.to_upper_case = To Upper Case
493 label.to_lower_case = To Lower Case
494 label.toggle_case = Toggle Case
495 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
496 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
497 label.edit_sequence = Edit Sequence
498 label.edit_sequences = Edit Sequences
499 label.sequence_details = Sequence Details
500 label.jmol_help = Jmol Help
501 label.chimera_help = Chimera Help
502 label.close_viewer = Close Viewer
503 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
504 label.all = All
505 label.sort_by = Sort alignment by
506 label.sort_by_score = Sort by Score
507 label.sort_by_density = Sort by Density
508 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
509 label.sort_ann_by = Sort annotations by
510 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
511 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
512 label.reveal = Reveal
513 label.hide_columns = Hide Columns
514 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
515 label.load_tree_file = Load a tree file
516 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
517 label.standard_databases = Standard Databases
518 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
519 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
520 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
521 label.connect_to_session = Connect to session {0}
522 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
523 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
524 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
525 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
526 label.adjust_threshold = Adjust threshold
527 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
528 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
529 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
530 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
531 label.open_url_param = Open URL {0}
532 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
533 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
534 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
535 label.dark_colour = Dark Colour
536 label.light_colour = Light Colour
537 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
538 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
539 label.copy_format_from = Copy format from
540 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
541 label.select_all_views = Select all views
542 label.select_many_views = Select many views
543 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
544 label.open_local_file = Open local file
545 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
546 label.listen_for_selections = Listen for selections
547 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
548 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
549 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
550 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
551 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
552 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
553 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
554 label.no_services = <No Services>
555 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
556 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
557 label.connect_to = Connect to
558 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
559 label.from_url = from URL
560 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
561 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
562 label.from_textbox = from Textbox
563 label.window = Window
564 label.preferences = Preferences
565 label.tools = Tools
566 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
567 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
568 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
569 label.collect_garbage = Collect Garbage
570 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
571 label.show_java_console = Show Java Console
572 label.show_jalview_news = Show Jalview News
573 label.take_snapshot = Take snapshot
574 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
575 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
576 label.monospaced_font= Monospaced
577 label.quality = Quality
578 label.maximize_window = Maximize Window
579 label.conservation = Conservation
580 label.consensus = Consensus
581 label.histogram = Histogram
582 label.logo = Logo
583 label.non_positional_features = List Non-positional Features
584 label.database_references = List Database References
585 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
586 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
587 label.gap_symbol = Gap Symbol
588 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
589 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
590 label.address = Address
591 label.port = Port
592 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
593 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
594 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
595 label.check_for_latest_version = Check for latest version
596 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
597 label.use_proxy_server = Use a proxy server
598 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
599 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
600 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
601 label.smooth_font = Smooth Font
602 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
603 label.pad_gaps = Pad Gaps
604 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
605 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
606 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
607 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
608 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
609 label.right_align_ids = Right Align Ids
610 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
611 label.open_overview = Open Overview
612 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
613 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
614 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
615 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
616 label.visual = Visual
617 label.connections = Connections
618 label.output = Output
619 label.editing = Editing
620 label.das_settings = DAS Settings
621 label.web_services = Web Services
622 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
623 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
624 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
625 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
626 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
627 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
628 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
629 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
630 label.new_service_url = New Service URL
631 label.edit_service_url = Edit Service URL
632 label.delete_service_url = Delete Service URL
633 label.details = Details
634 label.options = Options
635 label.parameters = Parameters
636 label.available_das_sources = Available DAS Sources
637 label.full_details = Full Details
638 label.authority = Authority
639 label.type = Type
640 label.proxy_server = Proxy Server
641 label.file_output = File Output
642 label.select_input_type = Select input type
643 label.set_options_for_type = Set options for type
644 label.data_input_parameters = Data input parameters
645 label.data_returned_by_service = Data returned by service
646 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
647 label.parsing_errors = Parsing errors
648 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
649 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
650 label.input_parameter_name = Input Parameter name
651 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
652 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
653 label.brief_description_service = Brief description of service
654 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
655 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
656 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
657 label.gap_character = Gap character
658 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
659 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
660 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
661 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
662 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
663 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
664 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
665 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
666 label.input_output = Input/Output
667 label.cut_paste = Cut'n'Paste
668 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
669 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
670 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
671 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
672 label.from_file = From File
673 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
674 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
675 label.text_colour = Text Colour...
676 label.structure = Structure
677 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
678 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
679 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
680 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
681 label.sequence_name = Sequence Name
682 label.sequence_description = Sequence Description
683 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
684 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
685 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
686 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
687 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
688 label.web_browser_not_found = Web browser not found
689 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
690 label.html = HTML
691 label.wrap = Wrap
692 label.show_database_refs = Show Database Refs
693 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
694 label.save_png_image = Save As PNG Image
695 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
696 label.export_image = Export Image
697 label.vamsas_store = VAMSAS store
698 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
699 label.reverse = Reverse
700 label.reverse_complement = Reverse Complement
701 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
702 label.extract_scores = Extract Scores
703 label.get_cross_refs = Get Cross-References
704 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
705 label.add_sequences = Add Sequences
706 label.new_window = New Window
707 label.split_window = Split Window
708 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
709 label.use_registry = Use Registry
710 label.add_local_source = Add Local Source
711 label.set_as_default = Set as Default
712 label.show_labels = Show labels
713 action.background_colour = Background Colour...
714 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
715 label.link_name = Link Name
716 label.pdb_file = PDB file
717 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
718 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
719 label.superpose_structures = Superpose Structures
720 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
721 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
722 label.jmol = Jmol
723 label.chimera = Chimera
724 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
725 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
726 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
727 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
728 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
729 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
730 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
731 label.case_sensitive = Case Sensitive
732 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
733 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
734 label.index_by_host = Index by Host
735 label.index_by_type = Index by Type
736 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
737 label.display_warnings = Display Warnings
738 label.move_url_up = Move URL Up
739 label.move_url_down = Move URL Down
740 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
741 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
742 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
743 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
744 label.sequences_updated = Sequences updated
745 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
746 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
747 label.paste_new_window = Paste To New Window
748 label.settings_for_param = Settings for {0}
749 label.view_params = View {0}
750 label.aacon_calculations = AACon Calculations
751 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
752 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
753 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
754 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
755 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
756 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
757 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
758 label.all_views = All Views
759 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
760 label.realign_with_params = Realign with {0}
761 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
762 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
763 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
764 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
765 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
766 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
767 label.view_documentation = View documentation
768 label.select_return_type = Select return type
769 label.translation_of_params = Translation of {0}
770 label.features_for_params = Features for - {0}
771 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
772 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
773 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
774 label.varna_params = VARNA - {0}
775 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
776 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
777 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
778 label.points_for_params = Points for {0}
779 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
780 label.graduated_color_for_params = Graduated Feature Colour for {0}
781 label.select_background_colour = Select Background Colour
782 label.invalid_font = Invalid Font
783 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
784 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
785 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
786 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
787 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
788 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
789 label.example_query_param = Example query: {0}
790 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
791 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
792 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
793 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
794 label.select_columns_containing = Select columns containing
795 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
796 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
797 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
798 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
799 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
800 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
801 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
802 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
803 label.use_sequence_id_4 = 
804 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
805 label.switch_server = Switch server
806 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
807 label.services_at = Services at {0}
808 label.rest_client_submit = {0} using {1}
809 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
810 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
811 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
812 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
813 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
814 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
815 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
816 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
817 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
818 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
819 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
820 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
821 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
822 label.user_preset = User Preset
823 label.service_preset = Service Preset
824 label.run_with_preset = Run {0} with preset
825 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
826 action.by_title_param = By {0}
827 label.source_from_db_source = Sources from {0}
828 label.from_msname = from {0}
829 label.superpose_with = Superpose with
830 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
831 label.add_new_row = Add New Row
832 label.edit_label_description = Edit Label/Description
833 label.hide_row = Hide This Row
834 label.delete_row = Delete This Row
835 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
836 label.export_annotation = Export Annotation
837 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
838 label.helix = Helix
839 label.sheet = Sheet
840 label.rna_helix = RNA Helix
841 label.remove_annotation = Remove Annotation
842 label.colour_by = Colour by...
843 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
844 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
845 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
846 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
847 label.multiharmony = Multi-Harmony
848 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
849 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
850 label.prompt_each_time = Prompt each time
851 label.use_source = Use Source
852 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
853 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
854 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
855 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
856 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
857 label.invalid_name = Invalid name
858 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
859 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
860 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
861 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
862 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
863 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
864 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
865 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
866 label.feature_type = Feature Type
867 label.display = Display
868 label.service_url = Service URL
869 label.copied_sequences = Copied sequences
870 label.cut_sequences = Cut Sequences
871 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
872 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
873 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
874 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
875 label.save_features_to_file = Save Features to File
876 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
877 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
878 label.save_pdb_file = Save PDB File
879 label.save_text_to_file = Save Text to File
880 label.save_state = Save State
881 label.restore_state = Restore State
882 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
883 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
884 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
885 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
886 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
887 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
888 label.select_startup_file = Select startup file
889 label.select_default_browser = Select default web browser
890 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
891 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
892 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
893 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
894 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
895 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
896 label.save_as_html = Save as HTML
897 label.recently_opened = Recently Opened
898 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
899 label.tree = Tree
900 label.tree_from = Tree from {0}
901 label.webservice_job_title = {0} using {1}
902 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
903 label.visible = Visible
904 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
905 label.visible_region_of = visible region of
906 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
907 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
908 label.loading_file = Loading File: {0}
909 label.edit_params = Edit {0}
910 label.as_percentage = As Percentage
911 error.not_implemented = Not implemented
912 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
913 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
914 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
915 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
916 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
917 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
918 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
919 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
920 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
921 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
922 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
923 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
924 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
925 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
926 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
927 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
928 error.implementation_error = Implementation error
929 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
930 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
931 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
932 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
933 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
934 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
935 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
936 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
937 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
938 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
939 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
940 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
941 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
942 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
943 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
944 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
945 label.cancelled_params = Cancelled {0}
946 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
947 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
948 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
949 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
950 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
951 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
952 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
953 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
954 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
955 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
956 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
957 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
958 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
959 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
960 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
961 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
962 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
963 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
964 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
965 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
966 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
967 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
968 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
969 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
970 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
971 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
972 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
973 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
974 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
975 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
976 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
977 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
978 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
979 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
980 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
981 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
982 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
983 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
984 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
985 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
986 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
987 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
988 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
989 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
990 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
991 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
992 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
993 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
994 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
995 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
996 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
997 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
998 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
999 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1000 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1001 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1002 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1003 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1004 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1005 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1006 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1007 label.toggled = Toggled
1008 label.marked = Marked
1009 label.containing = containing
1010 label.not_containing = not containing
1011 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1012 label.submission_params = Submission {0}
1013 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1014 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1015 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1016 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1017 label.pca_calculating = Calculating PCA
1018 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1019 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1020 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1021 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1022 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1023 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1024 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1025 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1026 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1027 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1028 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1029 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1030 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1031 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1032 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1033 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1034 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1035 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1036 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1037 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1038 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1039 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1040 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1041 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1042 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1043 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1044 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1045 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1046 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1047 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1048 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1049 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1050 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1051 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1052 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1053 label.mapped = mapped
1054 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1055 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1056 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1057 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1058 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1059 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1060 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1061 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1062 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1063 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1064 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1065 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1066 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1067 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1068 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1069 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1070 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1071 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1072 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1073 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1074 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1075 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1076 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1077 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1078 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1079 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1080 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1081 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1082 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1083 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1084 label.remove_gaps = Remove Gaps
1085 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1086 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1087 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1088 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1089 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1090 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1091 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1092 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1093 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1094 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1095 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1096 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1097 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1098 warn.service_not_supported = Service not supported!
1099 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1100 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1101 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1102 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1103 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1104 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1105 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1106 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1107 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1108 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1109 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1110 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1111 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1112 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1113 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1114 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1115 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1116 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1117 label.eps_file = EPS file
1118 label.png_image = PNG image
1119 status.saving_file = Saving {0}
1120 status.export_complete = {0} Export completed.
1121 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1122 status.refreshing_news = Refreshing news
1123 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1124 status.opening_params = Opening {0}
1125 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1126 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1127 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1128 status.finshed_querying = Finished querying
1129 status.parsing_results = Parsing results.
1130 status.processing = Processing...
1131 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1132 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1133 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1134 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1135 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1136 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1137 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1138 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1139 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1140 status.opening_file_for = opening file for
1141 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1142 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1143 label.font_too_small = Font size is too small
1144 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1145 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1146 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1147 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1148 label.out_of_memory = Out of memory
1149 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1150 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1151 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1152 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1153 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1154 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1155 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1156 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1157 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1158 label.test_server = Test Server?
1159 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1160 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1161 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1162 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1163 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1164 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1165 label.file_already_exists = File exists
1166 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1167 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1168 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1169 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1170 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1171 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1172 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1173 label.delete_all = Delete all sequences
1174 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1175 label.add_annotations_for = Add annotations for
1176 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1177 label.choose_annotations = Choose Annotations
1178 label.find = Find
1179 label.invalid_search = Search string invalid
1180 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1181 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1182 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1183 label.show_group_logo = Show Group Logo
1184 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1185 label.show_histogram = Show Histogram
1186 label.show_logo = Show Logo
1187 label.normalise_logo = Normalise Logo
1188 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1189 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1190 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1191 label.open_split_window = Open split window
1192 action.no = No
1193 action.yes = Yes
1194 label.for = for
1195 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1196 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1197 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1198 label.alpha_helix = Alpha Helix
1199 label.beta_strand = Beta Strand
1200 label.turn = Turn
1201 label.select_all = Select All
1202 label.structures_filter = Structures Filter
1203 label.search_filter = Search Filter
1204 label.include_description= Include Description
1205 action.back = Back
1206 label.hide_insertions = Hide Insertions
1207 label.mark_as_representative = Mark as representative
1208 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1209 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1210 label.result = result
1211 label.results = results
1212 label.structure_chooser = Structure Chooser
1213 label.invert = Invert 
1214 label.select_pdb_file = Select PDB File
1215 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1216 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1217 label.search_result = Search Result
1218 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1219 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1220 label.start_jalview = Start Jalview
1221 label.biojs_html_export = BioJS
1222 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1223 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1224 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1225 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1226 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1227 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1228 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1229 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1230 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1231 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1232 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1233 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1234 action.export_groups = Export Groups
1235 action.export_annotations = Export Annotations
1236 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1237 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1238 action.export_features = Export Features
1239 label.export_settings = Export Settings
1240 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1241 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1242 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1243 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1244 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1245 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1246 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1247 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1248 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1249 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1250 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1251 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1252 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1253 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1254 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1255 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1256 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1257 label.run_groovy = Run Groovy console script
1258 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1259 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1260 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1261 action.next_page= >> 
1262 action.prev_page= << 
1263 label.next_page_tooltip=Next Page
1264 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1265 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1266 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1267 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1268 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1269 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1270 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1271 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1272 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1273 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1274 label.column = Column
1275 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1276 label.operation_failed = Operation failed
1277 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1278 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1279 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1280 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1281 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1282 label.filter = Filter text:
1283 action.customfilter = Custom only
1284 action.showall = Show All
1285 label.insert = Insert:
1286 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1287 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1288 label.primary = Double Click
1289 label.inmenu = In Menu
1290 label.id = ID
1291 label.database = Database
1292 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1293 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1294 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1295 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1296 label.urllinks = Links
1297 label.default_cache_size = Default Cache Size
1298 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1299 label.togglehidden = Show hidden regions
1300 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1301 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1302 label.consensus_descr = PID
1303 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1304 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1305 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1306 label.show_experimental = Enable experimental features
1307 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1308 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1309 label.overview_settings = Overview settings
1310 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1311 label.gap_colour = Gap colour:
1312 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1313 label.hidden_colour = Hidden colour:
1314 label.select_gap_colour = Select gap colour
1315 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1316 label.overview = Overview
1317 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1318 label.oview_calc = Recalculating overview...
1319 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1320 option.autosearch = Autosearch
1321 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1322 label.best_quality = Best Quality
1323 label.best_resolution = Best Resolution
1324 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1325 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1326 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1327 label.cached_structures = Cached Structures
1328 label.free_text_search = Free Text Search