a406f33aeb2176ae75938c7a624c83609d861396
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.force_quit = Force quit
36 label.quit_jalview = Are you sure you want to quit Jalview?
37 label.wait_for_save = Wait for save
38 label.unsaved_changes = There are unsaved changes.
39 label.save_in_progress = Some files are still saving:
40 label.unknown = Unknown
41 label.quit_after_saving = Jalview will quit after saving.
42 label.all_saved = All files saved.
43 label.quitting_bye = Quitting, bye!
44 action.wait = Wait
45 action.cancel_quit = Cancel quit
46 action.expand_views = Expand Views
47 action.gather_views = Gather Views
48 action.page_setup = Page Setup...
49 action.reload = Reload
50 action.load = Load
51 action.open = Open
52 action.cancel = Cancel
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56 action.clear = Clear
57 action.accept = Accept
58 action.select_ddbb = --- Select Database ---
59 action.undo = Undo
60 action.redo = Redo
61 action.reset = Reset
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75 action.set_as_reference = Set as Reference 
76 action.remove = Remove
77 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
78 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
79 action.user_defined = User Defined...
80 action.by_conservation = By Conservation
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84 action.find = Find
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90 action.scale_above = Scale Above
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99 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
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101 action.show = Show
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121 action.change_params = Change Parameters
122 action.apply = Apply
123 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
124 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
125 action.by_chain = By Chain
126 action.by_sequence = By Sequence
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128 action.format = Format
129 action.select = Select
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131 action.new_structure_view_with = Open new structure view with {0}
132 action.close = Close
133 action.add = Add
134 action.save_as = Save as...
135 action.save = Save
136 action.change_font = Change Font
137 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
138 action.colour = Colour
139 action.calculate = Calculate
140 action.select_all = Select all
141 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
142 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
143 action.deselect_all = Deselect all
144 action.invert_selection = Invert selection
145 action.using_jmol = Using Jmol
146 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
147 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
148 action.link = Link
149 action.group_link = Group Link
150 action.show_chain = Show Chain
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152 action.fetch_db_references = Fetch DB References
153 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
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155 label.structures_manager = Structures Manager
156 label.url = URL
157 label.url\: = URL:
158 label.input_file_url = Enter URL or Input File
159 label.select_feature = Select feature
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162 label.name_param = Name: {0}
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164 label.group\: = Group:
165 label.group_name = Group Name
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167 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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169 label.description = Description
170 label.description\: = Description:
171 label.start = Start:
172 label.end = End:
173 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
174 label.service_action = Service Action:
175 label.post_url = POST URL:
176 label.url_suffix = URL Suffix
177 label.per_seq = per Sequence
178 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
179 label.amend = Amend
180 label.undo_command = Undo {0}
181 label.redo_command = Redo {0}
182 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
183 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
184 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
185 label.choose_calculation = Choose Calculation
186 label.calc_title = {0} Using {1}
187 label.tree_calc_av = Average Distance
188 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
189 label.score_model_pid = % Identity
190 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
191 label.score_model_pam250 = PAM 250
192 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
193 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
194 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
195 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
196 label.status_bar = Status bar
197 label.out_to_textbox = Output to Textbox
198 label.occupancy = Occupancy
199 # delete Clustal - use FileFormat name instead
200 label.clustal = Clustal
201 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
202 label.colourScheme_clustal = Clustal
203 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
204 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
205 label.colourScheme_zappo = Zappo
206 label.colourScheme_taylor = Taylor
207 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
208 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
209 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
210 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
211 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
212 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
213 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
214 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
215 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
216 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
217 label.colourScheme_gecos\:flower = gecos Flower
218 label.colourScheme_gecos\:blossom = gecos Blossom
219 label.colourScheme_gecos\:sunset = gecos Sunset
220 label.colourScheme_gecos\:ocean = gecos Ocean
221 label.blc = BLC
222 label.fasta = Fasta
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227 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
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229 label.show_annotations = Show annotations
230 label.hide_annotations = Hide annotations
231 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
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234 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
235 label.hide_all = Hide all
236 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
237 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
238 label.colour_text = Colour Text
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280 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
281 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
282 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
283 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
284 label.structure_viewer = Default structure viewer
285 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
286 label.viewer_path = Path to {0} program
287 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
288 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
289 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
290 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck configured path in Structure tab of Jalview''s Preferences 
291 label.min_colour = Minimum Colour
292 label.max_colour = Maximum Colour
293 label.no_colour = No Colour
294 label.use_original_colours = Use Original Colours
295 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
296 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
297 label.selection = Selection
298 label.group_colour = Group Colour
299 label.sequence = Sequence
300 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
301 label.min_value = Min value
302 label.max_value = Max value
303 label.no_value = No value
304 label.new_feature = New Feature
305 label.match_case = Match Case
306 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
307 label.labels = Labels
308 label.output_values = Output Values...
309 label.output_points = Output points...
310 label.output_transformed_points = Output transformed points
311 label.input_data = Input Data...
312 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
313 label.protein_matrix = Protein matrix
314 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
315 label.show_distances = Show distances
316 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
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318 label.newick_format = Newick Format
319 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
320 label.colours = Colours
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322 label.wireframe = Wireframe
323 label.depthcue = Depthcue
324 label.z_buffering = Z Buffering
325 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
326 label.all_chains_visible = All Chains Visible
327 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
328 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
329 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
330 label.removed_columns = Removed {0} columns.
331 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
332 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
333 label.order_by_params = Order by {0}
334 label.html_content = <html>{0}</html>
335 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
336 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
337 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
338 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
339 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
340 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
341 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
342 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
343 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
344 label.paste_your = Paste your
345 label.finished_searching = Finished searching
346 label.subsequence_matches_found = {0} subsequence matches found
347 label.search_results= Search results {0} : {1}
348 label.found_match_for = Found match for {0}
349 label.font = Font:
350 label.size = Size:
351 label.style = Style:
352 label.calculating = Calculating....
353 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
354 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
355 label.set_this_label_text = set this label text
356 label.sequences_from = Sequences from {0}
357 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
358 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
359 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
360 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
361 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
362 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
363 label.source_to_target = {0} ... {1}
364 label.per_sequence_only= Per-sequence only
365 label.to_file = to File
366 label.to_textbox = to Textbox
367 label.jalview = Jalview
368 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
369 label.status = Status
370 label.channels = Channels
371 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
372 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
373 label.groovy_console = Groovy Console...
374 label.lineart = Lineart
375 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
376 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
377 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
378 label.invert_selection = Invert Selection
379 label.optimise_order = Optimise Order
380 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
381 label.load_colours = Load Colours
382 label.save_colours = Save Colours
383 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
384 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
385 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
386 label.database_param = Database: {0}
387 label.example = Example
388 label.example_param = Example: {0}
389 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
390 label.file_format_not_specified = File format not specified
391 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
392 label.error_saving_file = Error Saving File
393 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
394 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
395 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
396 label.invalid_selection = Invalid Selection
397 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
398 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
399 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
400 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
401 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
402 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
403 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
404 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
405 label.translation_failed = Translation Failed
406 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
407 label.implementation_error  = Implementation error:
408 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
409 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
410 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
411 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
412 label.view_name_original = Original
413 label.enter_view_name = Enter View Name
414 label.enter_label = Enter label
415 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
416 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
417 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
418 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
419 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
420 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn''t read the pasted text {0}
421 label.error_parsing_text = Error parsing text
422 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
423 label.input_alignment = Input Alignment
424 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
425 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
426 label.url_not_found = URL not found
427 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
428 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
429 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
430 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
431 label.invalid_url = Invalid URL !
432 label.error_loading_file = Error loading file
433 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
434 label.file_open_error = File open error
435 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
436 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
437 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
438 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
439 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
440 label.alignment_props = Alignment Properties
441 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
442 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
443 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
444 label.annotations = Annotations
445 label.structure_options = Structure Options
446 label.features = Features
447 label.overview_params = Overview {0}
448 label.paste_newick_file = Paste Newick file
449 label.load_tree_from_file = From File - 
450 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
451 label.selection_output_command = Selection output - {0}
452 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
453 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
454 label.pca_details = PCA details
455 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
456 label.user_defined_colours = User defined colours
457 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
458 label.jaview_build_date = Build date: {0}
459 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
460 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
461 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
462 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
463 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
464 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
465 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
466 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
467 label.right_click = Right click
468 label.to_add_annotation = to add annotation
469 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
470 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
471 label.label = Label
472 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
473 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
474 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
475 label.calculating_pca= Calculating PCA
476 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
477 label.jalview_applet = Jalview applet
478 label.loading_data = Loading data
479 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
480 label.calculating_tree = Calculating tree
481 label.state_queueing = queuing
482 label.state_running = running
483 label.state_completed = finished
484 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
485 label.state_job_error = job error!
486 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
487 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
488 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
489 label.structure_type = Structure type
490 label.settings_for_type = Settings for {0}
491 label.view_full_application = View in Full Application
492 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
493 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
494 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
495 label.load_vcf_file = Load VCF File
496 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
497 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
498 label.export_features = Export Features...
499 label.export_annotations = Export Annotations...
500 label.to_upper_case = To Upper Case
501 label.to_lower_case = To Lower Case
502 label.toggle_case = Toggle Case
503 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
504 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
505 label.edit_sequence = Edit Sequence
506 label.edit_sequences = Edit Sequences
507 label.insert_gap = Insert 1 gap
508 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
509 label.delete_gap = Delete 1 gap
510 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
511 label.sequence_details = Sequence Details
512 label.viewer_help = {0} Help
513 label.close_viewer = Close Viewer
514 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
515 label.all = All
516 label.sort_by = Sort alignment by
517 label.sort_by_score = Sort by Score
518 label.sort_by_density = Sort by Density
519 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
520 label.sort_ann_by = Sort annotations by
521 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
522 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
523 label.reveal = Reveal
524 label.hide_columns = Hide Columns
525 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
526 label.load_tree_file = Load a tree file
527 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
528 label.standard_databases = Standard Databases
529 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
530 label.fetch_uniprot_references = Fetch Uniprot references
531 label.search_3dbeacons = Search 3D-Beacons
532 label.find_models_from_3dbeacons = Search 3D-Beacons for 3D structures and models
533 label.3dbeacons = 3D-Beacons
534 label.fetch_references_for = Fetch database references for {0} sequences ?
535 label.fetch_references_for_3dbeacons = 3D Beacons needs to fetch Uniprot References for {0} sequences.  Do you want to continue ?
536 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
537 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
538 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
539 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
540 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
541 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
542 label.adjust_threshold = Adjust threshold
543 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
544 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
545 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
546 label.open_url_param = Open URL {0}
547 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
548 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
549 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
550 label.dark_colour = Dark Colour
551 label.light_colour = Light Colour
552 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
553 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
554 label.copy_format_from = Copy format from
555 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
556 label.select_all_views = Select all views
557 label.select_many_views = Select many views
558 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
559 label.open_local_file = Open local file
560 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
561 label.listen_for_selections = Listen for selections
562 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
563 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
564 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
565 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
566 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
567 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
568 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
569 label.no_services = <No Services>
570 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
571 label.from_url = from URL
572 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
573 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
574 label.from_textbox = from Textbox
575 label.window = Window
576 label.preferences = Preferences
577 label.tools = Tools
578 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
579 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
580 label.collect_garbage = Collect Garbage
581 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
582 label.show_java_console = Show Java Console
583 label.show_jalview_news = Show Jalview News
584 label.take_snapshot = Take snapshot
585 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
586 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
587 label.monospaced_font= Monospaced
588 label.quality = Quality
589 label.maximize_window = Maximize Window
590 label.conservation = Conservation
591 label.consensus = Consensus
592 label.histogram = Histogram
593 label.logo = Logo
594 label.non_positional_features = List Non-positional Features
595 label.database_references = List Database References
596 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
597 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
598 label.gap_symbol = Gap Symbol
599 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
600 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
601 label.address = Address
602 label.host = Host
603 label.port = Port
604 label.default_browser_unix_windows = Default Browser (Unix, Windows)
605 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
606 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
607 label.check_for_latest_version = Check for latest version
608 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
609 label.no_proxy = No proxy servers
610 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
611 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
612 label.auth_required = Authentication required
613 label.username = Username
614 label.password = Password
615 label.proxy_password_required = Proxy password required
616 label.not_stored = not stored in Preferences file
617 label.rendering_style = {0} rendering style
618 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
619 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
620 label.smooth_font = Smooth Font
621 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
622 label.pad_gaps = Pad Gaps
623 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
624 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
625 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
626 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
627 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
628 label.right_align_ids = Right Align Ids
629 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
630 label.open_overview = Open Overview
631 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
632 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
633 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
634 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
635 label.visual = Visual
636 label.connections = Connections
637 label.output = Output
638 label.editing = Editing
639 label.web_services = Web Services
640 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
641 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
642 label.fetch_viewer_attributes = Fetch {0} attributes
643 label.fetch_viewer_attributes_tip = Copy {0} attribute to Jalview feature
644 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
645 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
646 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
647 label.new_service_url = New Service URL
648 label.edit_service_url = Edit Service URL
649 label.delete_service_url = Delete Service URL
650 label.details = Details
651 label.options = Options
652 label.parameters = Parameters
653 label.proxy_servers = Proxy Servers
654 label.file_output = File Output
655 label.select_input_type = Select input type
656 label.set_options_for_type = Set options for type
657 label.data_input_parameters = Data input parameters
658 label.data_returned_by_service = Data returned by service
659 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
660 label.parsing_errors = Parsing errors
661 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
662 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
663 label.input_parameter_name = Input Parameter name
664 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
665 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
666 label.brief_description_service = Brief description of service
667 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
668 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
669 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
670 label.gap_character = Gap character
671 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
672 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
673 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
674 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
675 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
676 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
677 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
678 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
679 label.input_output = Input/Output
680 label.cut_paste = Cut'n'Paste
681 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
682 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
683 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
684 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
685 label.from_file = From File
686 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
687 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
688 label.text_colour = Text Colour...
689 label.structure = Structure
690 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
691 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
692 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
693 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
694 label.sequence_name = Sequence Name
695 label.sequence_description = Sequence Description
696 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
697 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
698 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
699 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
700 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
701 label.web_browser_not_found = Web browser not found
702 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
703 label.html = HTML
704 label.wrap = Wrap
705 label.show_database_refs = Show Database Refs
706 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
707 label.save_png_image = Save As PNG Image
708 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
709 label.export_image = Export Image
710 label.vamsas_store = VAMSAS store
711 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
712 label.reverse = Reverse
713 label.reverse_complement = Reverse Complement
714 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
715 label.extract_scores = Extract Scores
716 label.get_cross_refs = Get Cross-References
717 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
718 label.add_sequences = Add Sequences
719 label.new_window = New Window
720 label.split_window = Split Window
721 label.set_as_default = Set as Default
722 label.show_labels = Show labels
723 action.background_colour = Background Colour...
724 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
725 label.link_name = Link Name
726 label.pdb_file = PDB file
727 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
728 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
729 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
730 label.superpose_structures = Superpose Structures
731 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
732 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
733 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
734 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
735 label.attributes_set = {0} attribute values set on {1}
736 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
737 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
738 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
739 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
740 label.case_sensitive = Case Sensitive
741 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
742 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
743 label.index_by_host = Index by Host
744 label.index_by_type = Index by Type
745 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
746 label.display_warnings = Display Warnings
747 label.move_url_up = Move URL Up
748 label.move_url_down = Move URL Down
749 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
750 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
751 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
752 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
753 label.sequences_updated = Sequences updated
754 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
755 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
756 label.paste_new_window = Paste To New Window
757 label.settings_for_param = Settings for {0}
758 label.view_params = View {0}
759 label.aacon_calculations = AACon Calculations
760 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
761 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
762 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
763 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
764 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
765 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
766 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
767 label.all_views = All Views
768 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
769 label.realign_with_params = Realign with {0}
770 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
771 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
772 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
773 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
774 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
775 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
776 label.view_documentation = View documentation
777 label.select_return_type = Select return type
778 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
779 label.features_for_params = Features for - {0}
780 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
781 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
782 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
783 label.varna_params = VARNA - {0}
784 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
785 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
786 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
787 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
788 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
789 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
790 label.points_for_params = Points for {0}
791 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
792 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
793 label.select_background_colour = Select Background Colour
794 label.invalid_font = Invalid Font
795 label.search_db_all = Search all of {0}
796 label.search_db_index = Search {0} index {1}
797 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
798 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0} separated by a semi-colon ";"
799 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
800 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
801 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
802 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
803 label.example_query_param = Example query: {0}
804 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
805 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
806 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
807 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
808 label.select_columns_containing = Select columns containing
809 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
810 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
811 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
812 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
813 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
814 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
815 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
816 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
817 label.use_sequence_id_4 = 
818 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
819 label.switch_server = Switch server
820 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
821 label.services_at = Services at {0}
822 label.rest_client_submit = {0} using {1}
823 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
824 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
825 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
826 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
827 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
828 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
829 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
830 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
831 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
832 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
833 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
834 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
835 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
836 label.user_preset = User Preset
837 label.service_preset = Service Preset
838 label.run_with_preset = Run {0} with preset
839 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
840 action.by_title_param = By {0}
841 label.source_from_db_source = Sources from {0}
842 label.from_msname = from {0}
843 label.superpose_with = Superpose with
844 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
845 label.add_new_row = Add New Row
846 label.edit_label_description = Edit Label/Description
847 label.hide_row = Hide This Row
848 label.delete_row = Delete This Row
849 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
850 label.export_annotation = Export Annotation
851 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
852 label.helix = Helix
853 label.sheet = Sheet
854 label.rna_helix = RNA Helix
855 label.remove_annotation = Remove Annotation
856 label.colour_by = Colour by...
857 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
858 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
859 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
860 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
861 label.multiharmony = Multi-Harmony
862 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
863 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
864 label.prompt_each_time = Prompt each time
865 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
866 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
867 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
868 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
869 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
870 label.invalid_name = Invalid name
871 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
872 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
873 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
874 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn''t be located.
875 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
876 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
877 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
878 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
879 label.feature_type = Feature Type
880 label.show = Show
881 label.service_url = Service URL
882 label.copied_sequences = Copied sequences
883 label.cut_sequences = Cut Sequences
884 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
885 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
886 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
887 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
888 label.save_features_to_file = Save Features to File
889 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
890 label.save_pdb_file = Save PDB File
891 label.save_text_to_file = Save Text to File
892 label.save_state = Save State
893 label.restore_state = Restore State
894 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
895 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
896 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
897 label.select_startup_file = Select startup file
898 label.select_default_browser = Select default web browser
899 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
900 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
901 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
902 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
903 label.save_as_html = Save as HTML
904 label.recently_opened = Recently Opened
905 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
906 label.tree = Tree
907 label.tree_from = Tree from {0}
908 label.webservice_job_title = {0} using {1}
909 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
910 label.visible = Visible
911 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
912 label.visible_region_of = visible region of
913 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
914 label.loading_file = Loading File: {0}
915 label.edit_params = Edit {0}
916 label.as_percentage = As Percentage
917 error.not_implemented = Not implemented
918 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
919 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
920 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
921 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
922 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
923 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
924 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
925 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
926 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
927 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
928 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
929 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
930 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
931 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
932 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
933 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
934 error.implementation_error = Implementation error
935 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
936 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
937 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
938 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
939 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
940 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
941 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
942 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
943 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
944 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
945 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
946 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
947 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
948 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
949 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
950 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
951 label.cancelled_params = Cancelled {0}
952 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
953 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
954 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
955 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
956 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
957 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
958 error.invalid_value_for_option = Invalid value ''{0}'' for option ''{1}''
959 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
960 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
961 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
962 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
963 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
964 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
965 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
966 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
967 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
968 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
969 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
970 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
971 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
972 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
973 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
974 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
975 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
976 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
977 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
978 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
979 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
980 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
981 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
982 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
983 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
984 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
985 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
986 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
987 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
988 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can''t locate either oldname ({0}) or presetName ({1}) in the datastore!"
989 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
990 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
991 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
992 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
993 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
994 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
995 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
996 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn''t encode {0} as UTF-8.
997 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
998 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
999 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1000 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1001 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1002 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1003 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
1004 label.toggled = Toggled
1005 label.marked = Marked
1006 label.containing = containing
1007 label.not_containing = not containing
1008 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
1009 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1010 label.submission_params = Submission {0}
1011 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1012 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1013 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1014 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1015 label.pca_calculating = Calculating PCA
1016 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1017 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1018 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1019 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1020 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1021 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1022 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1023 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1024 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1025 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1026 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1027 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1028 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1029 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1030 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1031 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1032 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1033 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1034 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1035 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1036 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1037 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1038 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1039 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1040 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1041 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1042 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1043 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1044 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1045 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1046 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1047 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1048 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1049 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1050 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1051 label.mapped = mapped
1052 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1053 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn''t parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1054 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1055 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1056 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn''t access datasource ({0})
1057 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn''t process data as RNAML file ({0})
1058 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1059 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1060 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1061 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1062 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1063 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1064 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn''t store sequence mappings for {0}
1065 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1066 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1067 exception.browser_unable_to_launch = Unable to launch browser: {0}
1068 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1069 exception.browser_os_not_supported = Launching browser on this operating system not supported.  Use URL\n{0}
1070 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1071 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1072 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1073 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1074 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1075 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1076 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1077 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1078 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1079 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1080 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1081 label.remove_gaps = Remove Gaps
1082 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1083 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1084 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1085 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1086 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1087 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1088 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1089 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1090 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1091 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1092 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1093 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1094 warn.service_not_supported = Service not supported!
1095 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1096 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1097 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1098 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn''t support this program.\n{0}
1099 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1100 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1101 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1102 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1103 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1104 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1105 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1106 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1107 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1108 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1109 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1110 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1111 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1112 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1113 label.eps_file = EPS file
1114 label.png_image = PNG image
1115 status.export_complete = {0} Export completed
1116 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1117 status.refreshing_news = Refreshing news
1118 status.opening_params = Opening {0}
1119 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1120 status.finshed_querying = Finished querying
1121 status.parsing_results = Parsing results.
1122 status.processing = Processing...
1123 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1124 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1125 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1126 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1127 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1128 status.searching_3d_beacons = Searching 3D Beacons
1129 status.no_structures_discovered_from_3d_beacons = No models discovered from 3D Beacons
1130 status.opening_file_for = opening file for
1131 status.colouring_structures = Colouring structures
1132 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1133 label.font_too_small = Font size is too small
1134 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1135 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1136 label.out_of_memory = Out of memory
1137 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1138 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1139 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1140 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1141 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1142 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1143 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1144 label.test_server = Test Server?
1145 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1146 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1147 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1148 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1149 label.file_already_exists = File exists
1150 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1151 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1152 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1153 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1154 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1155 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1156 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1157 label.delete_all = Delete all sequences
1158 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1159 label.add_annotations_for = Add annotations for
1160 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1161 label.choose_annotations = Choose Annotations
1162 label.find = Find
1163 label.in = in
1164 label.invalid_search = Search string invalid
1165 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1166 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1167 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1168 label.show_group_logo = Show Group Logo
1169 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1170 label.show_histogram = Show Histogram
1171 label.show_logo = Show Logo
1172 label.normalise_logo = Normalise Logo
1173 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1174 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1175 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1176 label.open_split_window = Open split window
1177 action.no = No
1178 action.yes = Yes
1179 label.for = for
1180 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1181 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1182 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1183 label.alpha_helix = Alpha Helix
1184 label.beta_strand = Beta Strand
1185 label.turn = Turn
1186 label.select_all = Select All
1187 label.structures_filter = Structures Filter
1188 label.search_filter = Search Filter
1189 label.include_description= Include Description
1190 action.back = Back
1191 label.hide_insertions = Hide Insertions
1192 label.mark_as_representative = Mark as representative
1193 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1194 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1195 label.result = result
1196 label.results = results
1197 label.structure_chooser = Structure Chooser
1198 label.invert = Invert 
1199 label.select_pdb_file = Select PDB File
1200 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1201 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1202 label.search_result = Search Result
1203 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1204 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1205 label.start_jalview = Start Jalview
1206 label.biojs_html_export = BioJS
1207 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1208 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1209 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1210 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1211 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1212 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1213 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1214 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1215 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1216 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1217 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1218 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1219 action.export_groups = Export Groups
1220 action.export_annotations = Export Annotations
1221 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1222 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1223 action.export_features = Export Features
1224 label.export_settings = Export Settings
1225 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1226 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1227 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1228 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1229 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1230 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1231 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1232 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1233 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1234 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1235 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1236 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1237 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1238 label.run_groovy = Run Groovy console script
1239 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1240 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1241 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1242 action.next_page= >> 
1243 action.prev_page= << 
1244 label.next_page_tooltip=Next Page
1245 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1246 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1247 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1248 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1249 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1250 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1251 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1252 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1253 label.column = Column
1254 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1255 label.operation_failed = Operation failed
1256 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1257 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1258 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1259 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1260 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1261 action.customfilter = Custom only
1262 action.showall = Show All
1263 label.insert = Insert:
1264 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1265 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1266 label.primary = Double Click
1267 label.inmenu = In Menu
1268 label.id = ID
1269 label.database = Database
1270 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1271 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1272 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1273 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1274 label.urllinks = Links
1275 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1276 label.togglehidden = Show hidden regions
1277 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1278 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1279 label.consensus_descr = PID
1280 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1281 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1282 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1283 label.show_experimental = Enable experimental features
1284 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1285 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1286 label.overview_settings = Overview settings
1287 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1288 label.gap_colour = Gap colour:
1289 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1290 label.hidden_colour = Hidden colour:
1291 label.select_gap_colour = Select gap colour
1292 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1293 label.overview = Overview
1294 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1295 label.oview_calc = Recalculating overview...
1296 label.feature_details = Feature details
1297 label.matchCondition_contains = Contains
1298 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1299 label.matchCondition_matches = Matches
1300 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1301 label.matchCondition_present = Is present
1302 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1303 label.matchCondition_eq = =
1304 label.matchCondition_ne = not =
1305 label.matchCondition_lt = <
1306 label.matchCondition_le = <=
1307 label.matchCondition_gt = >
1308 label.matchCondition_ge = >=
1309 label.numeric_required = The value should be numeric
1310 label.filter = Filter
1311 label.filters = Filters
1312 label.join_conditions = Join conditions with
1313 label.delete_condition = Delete this condition
1314 label.score = Score
1315 label.colour_by_label = Colour by label
1316 label.variable_colour = Variable colour...
1317 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1318 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1319 option.autosearch = Autosearch
1320 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1321 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1322 label.simple_colour = Simple Colour
1323 label.colour_by_text = Colour by text
1324 label.graduated_colour = Graduated Colour
1325 label.by_text_of = By text of
1326 label.by_range_of = By range of
1327 label.or = Or
1328 label.and = And
1329 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1330 label.best_quality = Best Quality
1331 label.best_resolution = Best Resolution
1332 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1333 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1334 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1335 label.cached_structures = Cached Structures
1336 label.free_text_search = Free Text Search
1337 label.annotation_name = Annotation Name
1338 label.annotation_description = Annotation Description 
1339 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1340 label.alignment = alignment
1341 label.pca = PCA
1342 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1343 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1344 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1345 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1346 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1347 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1348 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1349 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1350 label.continue_operation = Continue operation?
1351 label.continue = Continue
1352 label.backups = Backups
1353 label.backup = Backup
1354 label.backup_files = Backup Files
1355 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1356 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1357 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1358 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1359 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1360 label.scheme_examples = Scheme examples
1361 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1362 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1363 label.keep_files = Deleting old backup files
1364 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1365 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1366 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1367 label.always_ask = Always ask
1368 label.auto_delete = Automatically delete
1369 label.filename = filename
1370 label.braced_oldest = (oldest)
1371 label.braced_newest = (most recent)
1372 label.configuration = Configuration
1373 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1374 label.schemes = Schemes
1375 label.customise = Customise
1376 label.custom = Custom
1377 label.default = Default
1378 label.single_file = Single backup
1379 label.keep_all_versions = Keep all versions
1380 label.rolled_backups = Rolled backup files
1381 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1382 label.custom_description = Your own saved scheme
1383 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1384 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1385 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1386 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1387 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1388 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1389 label.include_backup_files = Include backup files
1390 label.cancel_changes = Cancel changes
1391 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1392 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1393 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1394 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1395 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1396 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1397 label.delete = Delete
1398 label.rename = Rename
1399 label.keep = Keep
1400 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1401 label.annotation_name = Annotation Name
1402 label.annotation_description = Annotation Description 
1403 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1404 label.alignment = alignment
1405 label.pca = PCA
1406 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1407 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1408 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1409 label.show_linked_features = Show {0} features
1410 label.on_top = on top
1411 label.include_linked_features = Include {0} features
1412 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1413 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1414 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1415 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1416 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1417 label.log_level = Log level
1418 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1419 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1420 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1421 label.startup = Startup
1422 label.memory = Memory
1423 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1424 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1425 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1426 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1427 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1428 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1429 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1430 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1431 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.
1432 warning.wrong_jvm_version_title = Wrong Java Version
1433 warning.wrong_jvm_version_message = The Java version being used (Java {0}) may lead to problems.\nThis installation of Jalview should be used with Java {1}.