Merge branch 'develop' into features/JAL-2393customMatrices
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme {0} have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.quit = Quit
34 action.expand_views = Expand Views
35 action.gather_views = Gather Views
36 action.page_setup = Page Setup...
37 action.reload = Reload
38 action.load = Load
39 action.open = Open
40 action.cancel = Cancel
41 action.create = Create
42 action.update = Update
43 action.delete = Delete
44 action.clear = Clear
45 action.accept = Accept
46 action.select_ddbb = --- Select Database ---
47 action.undo = Undo
48 action.redo = Redo
49 action.reset = Reset
50 action.remove_left = Remove left
51 action.remove_right = Remove right
52 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
53 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
54 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
55 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
56 action.boxes = Boxes
57 action.text = Text
58 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
59 action.by_id = By Id
60 action.by_length = By Length
61 action.by_group = By Group
62 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
63 action.set_as_reference = Set as Reference 
64 action.remove = Remove
65 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
66 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
67 action.user_defined = User Defined...
68 action.by_conservation = By Conservation
69 action.wrap = Wrap
70 action.show_gaps = Show Gaps
71 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
72 action.find = Find
73 action.undefine_groups = Undefine Groups
74 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
75 action.copy = Copy
76 action.cut = Cut
77 action.font = Font...
78 action.scale_above = Scale Above
79 action.scale_left = Scale Left
80 action.scale_right = Scale Right
81 action.by_tree_order = By Tree Order
82 action.sort = Sort
83 action.calculate_tree = Calculate Tree...
84 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
85 action.help = Help
86 action.by_annotation = By Annotation...
87 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
88 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
89 action.show = Show
90 action.hide = Hide
91 action.ok = OK
92 action.set_defaults = Defaults
93 action.create_group = Create Group
94 action.remove_group = Remove Group
95 action.edit_group = Edit Group
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97 action.edit_new_group = Edit New Group
98 action.hide_sequences = Hide Sequences
99 action.sequences = Sequences
100 action.ids = IDS
101 action.ids_sequences = IDS and sequences
102 action.reveal_all = Reveal All
103 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
104 action.find_all = Find all
105 action.find_next = Find next
106 action.file = File
107 action.view = View
108 action.annotations = Annotations
109 action.change_params = Change Parameters
110 action.apply = Apply
111 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
112 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
113 action.by_chain = By Chain
114 action.by_sequence = By Sequence
115 action.paste_annotations = Paste Annotations
116 action.format = Format
117 action.select = Select
118 action.new_view = New View
119 action.close = Close
120 action.add = Add
121 action.save_as_default = Save as default
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.link = Link
136 action.group_link = Group Link
137 action.show_chain = Show Chain
138 action.show_group = Show Group
139 action.fetch_db_references = Fetch DB References
140 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
141 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
142 label.structures_manager = Structures Manager
143 label.nickname = Nickname:
144 label.url = URL
145 label.url\: = URL:
146 label.input_file_url = Enter URL or Input File
147 label.select_feature = Select feature
148 label.name = Name
149 label.name\: = Name:
150 label.name_param = Name: {0}
151 label.group = Group
152 label.group\: = Group:
153 label.group_name = Group Name
154 label.group_description = Group Description
155 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
156 label.colour = Colour:
157 label.description = Description
158 label.description\: = Description:
159 label.start = Start:
160 label.end = End:
161 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
162 label.service_action = Service Action:
163 label.post_url = POST URL:
164 label.url_suffix = URL Suffix
165 label.sequence_source = Sequence Source
166 label.per_seq = per Sequence
167 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
168 label.amend = Amend
169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.treecalc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.select_score_model = Select score model
179 label.score_model_pid = % Identity
180 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
181 label.score_model_pam250 = PAM 250
182 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
183 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
184 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
185 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
186 label.status_bar = Status bar
187 label.out_to_textbox = Output to Textbox
188 # delete Clustal - use FileFormat name instead
189 label.clustal = Clustal
190 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
191 label.colourScheme_clustal = Clustalx
192 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
193 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
194 label.colourScheme_zappo = Zappo
195 label.colourScheme_taylor = Taylor
196 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
197 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
198 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
199 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
200 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
201 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
202 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
203 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
204 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
205 label.blc = BLC
206 label.fasta = Fasta
207 label.msf = MSF
208 label.pfam = PFAM
209 label.pileup = Pileup
210 label.pir = PIR
211 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
212 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
213 label.show_annotations = Show annotations
214 label.hide_annotations = Hide annotations
215 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
216 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
217 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
218 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
219 label.hide_all = Hide all
220 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
221 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
222 label.colour_text = Colour Text
223 label.show_non_conserved = Show nonconserved
224 label.overview_window = Overview Window
225 label.none = None
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227 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
228 label.nucleotide = Nucleotide
229 label.protein = Protein
230 label.nucleotides = Nucleotides
231 label.proteins = Proteins
232 label.to_new_alignment = To New Alignment
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234 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
235 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
236 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
237 label.input_from_textbox = Input from textbox
238 label.centre_column_labels = Centre column labels
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240 label.documentation = Documentation
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242 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
243 action.feature_settings = Feature Settings...
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250 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
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253 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
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255 label.group_consensus = Group Consensus
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257 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
258 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
259 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
260 label.apply_all_groups = Apply to all groups
261 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
262 label.show_first = Show first
263 label.show_last = Show last
264 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
265 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
266 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
267 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
268 label.structure_viewer = Default structure viewer
269 label.chimera_path = Path to Chimera program
270 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
271 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
272 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
273 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
274 label.min_colour = Minimum Colour
275 label.max_colour = Maximum Colour
276 label.use_original_colours = Use Original Colours
277 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
278 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
279 label.selection = Selection
280 label.group_colour = Group Colour
281 label.sequence = Sequence
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283 label.min = Min:
284 label.max = Max:
285 label.colour_by_label = Colour by label
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287 label.match_case = Match Case
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289 label.labels = Labels
290 label.output_values = Output Values...
291 label.output_points = Output points...
292 label.output_transformed_points = Output transformed points
293 label.input_data = Input Data...
294 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
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296 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
297 label.show_distances = Show distances
298 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
299 label.fit_to_window = Fit To Window
300 label.newick_format = Newick Format
301 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
302 label.colours = Colours
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304 label.wireframe = Wireframe
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308 label.all_chains_visible = All Chains Visible
309 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
310 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
311 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
312 label.removed_columns = Removed {0} columns.
313 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
314 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
315 label.order_by_params = Order by {0}
316 label.html_content = <html>{0}</html>
317 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
318 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
319 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
320 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
321 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
322 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
323 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
324 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
325 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
326 label.paste_your = Paste your
327 label.finished_searching = Finished searching
328 label.search_results= Search results {0} : {1}
329 label.found_match_for = Found match for {0}
330 label.font = Font:
331 label.size = Size:
332 label.style = Style:
333 label.calculating = Calculating....
334 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
335 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
336 label.set_this_label_text = set this label text
337 label.sequences_from = Sequences from {0}
338 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
339 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
340 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
341 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
342 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
343 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
344 label.source_to_target = {0} ... {1}
345 label.per_sequence_only= Per-sequence only
346 label.to_file = to File
347 label.to_textbox = to Textbox
348 label.jalview = Jalview
349 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
350 label.status = Status
351 label.channels = Channels
352 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
353 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
354 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
355 label.session_update = Session Update
356 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
357 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
358 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
359 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
360 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
361 label.groovy_console = Groovy Console...
362 label.lineart = Lineart
363 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
364 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
365 label.invert_selection = Invert Selection
366 label.optimise_order = Optimise Order
367 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
368 label.load_colours = Load Colours
369 label.save_colours = Save Colours
370 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
371 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
372 label.database_param = Database: {0}
373 label.example = Example
374 label.example_param = Example: {0}
375 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
376 label.file_format_not_specified = File format not specified
377 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
378 label.error_saving_file = Error Saving File
379 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
380 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
381 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
382 label.invalid_selection = Invalid Selection
383 label.principal_component_analysis_must_take_least_four_input_sequences = Principal component analysis must take\nat least 4 input sequences.
384 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
385 label.you_need_more_two_sequences_selected_build_tree = You need to have more than two sequences selected to build a tree!
386 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
387 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
388 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
389 label.sequences_must_be_aligned_before_creating_tree = The sequences must be aligned before creating a tree.\nTry using the Pad function in the edit menu,\n or one of the multiple sequence alignment web services.
390 label.sequences_not_aligned = Sequences not aligned
391 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
392 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
393 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
394 label.translation_failed = Translation Failed
395 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
396 label.implementation_error  = Implementation error:
397 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
398 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
399 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
400 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
401 label.view_name_original = Original
402 label.enter_view_name = Enter View Name
403 label.enter_label = Enter label
404 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
405 label.pdb_entry_is_already_displayed = {0} is already displayed.\nDo you want to re-use this viewer ?
406 label.map_sequences_to_visible_window = Map Sequences to Visible Window: {0}
407 label.add_pdbentry_to_view = Do you want to add {0} to the view called\n{1}\n
408 label.align_to_existing_structure_view = Align to existing structure view
409 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
410 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
411 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
412 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
413 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
414 label.error_parsing_text = Error parsing text
415 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
416 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
417 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
418 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
419 label.input_alignment = Input Alignment
420 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
421 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
422 label.couldnt_locate = Couldn't locate {0}
423 label.url_not_found = URL not found
424 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
425 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
426 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
427 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
428 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
429 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
430 label.invalid_url = Invalid URL !
431 label.error_loading_file = Error loading file
432 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
433 label.file_open_error = File open error
434 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
435 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
436 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
437 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
438 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
439 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
440 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
441 label.alignment_props = Alignment Properties
442 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
443 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
444 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
445 label.annotations = Annotations
446 label.structure_options = Structure Options
447 label.features = Features
448 label.overview_params = Overview {0}
449 label.paste_newick_file = Paste Newick file
450 label.load_tree_from_file = From File - 
451 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
452 label.selection_output_command = Selection output - {0}
453 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
454 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
455 label.pca_details = PCA details
456 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
457 label.user_defined_colours = User defined colours
458 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
459 label.jaview_build_date = Build date: {0}
460 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
461 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
462 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
463 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
464 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
465 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
466 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
467 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
468 label.right_click = Right click
469 label.to_add_annotation = to add annotation
470 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
471 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
472 label.label = Label
473 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
474 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
475 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
476 label.calculating_pca= Calculating PCA
477 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
478 label.jalview_applet = Jalview applet
479 label.loading_data = Loading data
480 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
481 label.calculating_tree = Calculating tree
482 label.state_queueing = queuing
483 label.state_running = running
484 label.state_completed = finished
485 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
486 label.state_job_error = job error!
487 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
488 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
489 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
490 label.structure_type = Structure type
491 label.settings_for_type = Settings for {0}
492 label.view_full_application = View in Full Application
493 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
494 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
495 label.export_features = Export Features...
496 label.export_annotations = Export Annotations...
497 label.to_upper_case = To Upper Case
498 label.to_lower_case = To Lower Case
499 label.toggle_case = Toggle Case
500 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
501 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
502 label.edit_sequence = Edit Sequence
503 label.edit_sequences = Edit Sequences
504 label.sequence_details = Sequence Details
505 label.jmol_help = Jmol Help
506 label.chimera_help = Chimera Help
507 label.close_viewer = Close Viewer
508 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
509 label.all = All
510 label.sort_by = Sort alignment by
511 label.sort_by_score = Sort by Score
512 label.sort_by_density = Sort by Density
513 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
514 label.sort_ann_by = Sort annotations by
515 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
516 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
517 label.reveal = Reveal
518 label.hide_columns = Hide Columns
519 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
520 label.load_tree_file = Load a tree file
521 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
522 label.standard_databases = Standard Databases
523 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
524 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
525 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
526 label.connect_to_session = Connect to session {0}
527 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
528 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
529 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
530 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
531 label.adjust_threshold = Adjust threshold
532 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
533 label.display_features_same_type_different_label_using_different_colour = Display features of the same type with a different label using a different colour. (e.g. domain features)
534 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
535 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
536 label.open_url_param = Open URL {0}
537 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
538 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
539 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
540 label.dark_colour = Dark Colour
541 label.light_colour = Light Colour
542 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
543 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
544 label.copy_format_from = Copy format from
545 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
546 label.select_all_views = Select all views
547 label.select_many_views = Select many views
548 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
549 label.open_local_file = Open local file
550 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
551 label.listen_for_selections = Listen for selections
552 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
553 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
554 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
555 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
556 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
557 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
558 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
559 label.no_services = <No Services>
560 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
561 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
562 label.connect_to = Connect to
563 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
564 label.from_url = from URL
565 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
566 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
567 label.from_textbox = from Textbox
568 label.window = Window
569 label.preferences = Preferences
570 label.tools = Tools
571 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
572 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
573 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
574 label.collect_garbage = Collect Garbage
575 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
576 label.show_java_console = Show Java Console
577 label.show_jalview_news = Show Jalview News
578 label.take_snapshot = Take snapshot
579 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
580 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
581 label.monospaced_font= Monospaced
582 label.quality = Quality
583 label.maximize_window = Maximize Window
584 label.conservation = Conservation
585 label.consensus = Consensus
586 label.histogram = Histogram
587 label.logo = Logo
588 label.non_positional_features = List Non-positional Features
589 label.database_references = List Database References
590 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
591 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
592 label.gap_symbol = Gap Symbol
593 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
594 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
595 label.address = Address
596 label.port = Port
597 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
598 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
599 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
600 label.check_for_latest_version = Check for latest version
601 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
602 label.use_proxy_server = Use a proxy server
603 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
604 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
605 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
606 label.smooth_font = Smooth Font
607 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
608 label.pad_gaps = Pad Gaps
609 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
610 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
611 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
612 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
613 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
614 label.right_align_ids = Right Align Ids
615 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
616 label.open_overview = Open Overview
617 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
618 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
619 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
620 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
621 label.visual = Visual
622 label.connections = Connections
623 label.output = Output
624 label.editing = Editing
625 label.das_settings = DAS Settings
626 label.web_services = Web Services
627 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
628 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
629 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
630 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
631 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
632 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
633 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
634 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
635 label.new_service_url = New Service URL
636 label.edit_service_url = Edit Service URL
637 label.delete_service_url = Delete Service URL
638 label.details = Details
639 label.options = Options
640 label.parameters = Parameters
641 label.available_das_sources = Available DAS Sources
642 label.full_details = Full Details
643 label.authority = Authority
644 label.type = Type
645 label.proxy_server = Proxy Server
646 label.file_output = File Output
647 label.select_input_type = Select input type
648 label.set_options_for_type = Set options for type
649 label.data_input_parameters = Data input parameters
650 label.data_returned_by_service = Data returned by service
651 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
652 label.parsing_errors = Parsing errors
653 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
654 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
655 label.input_parameter_name = Input Parameter name
656 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
657 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
658 label.brief_description_service = Brief description of service
659 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
660 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
661 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
662 label.gap_character = Gap character
663 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
664 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
665 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
666 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
667 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
668 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
669 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
670 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
671 label.input_output = Input/Output
672 label.cut_paste = Cut'n'Paste
673 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
674 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
675 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
676 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
677 label.from_file = From File
678 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
679 label.text_colour = Text Colour...
680 label.structure = Structure
681 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
682 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
683 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
684 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
685 label.sequence_name = Sequence Name
686 label.sequence_description = Sequence Description
687 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
688 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
689 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
690 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
691 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
692 label.web_browser_not_found = Web browser not found
693 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
694 label.html = HTML
695 label.wrap = Wrap
696 label.show_database_refs = Show Database Refs
697 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
698 label.save_png_image = Save As PNG Image
699 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
700 label.export_image = Export Image
701 label.vamsas_store = VAMSAS store
702 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
703 label.reverse = Reverse
704 label.reverse_complement = Reverse Complement
705 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
706 label.extract_scores = Extract Scores
707 label.get_cross_refs = Get Cross-References
708 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
709 label.add_sequences = Add Sequences
710 label.new_window = New Window
711 label.split_window = Split Window
712 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
713 label.use_registry = Use Registry
714 label.add_local_source = Add Local Source
715 label.set_as_default = Set as Default
716 label.show_labels = Show labels
717 action.background_colour = Background Colour...
718 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
719 label.jalview_pca_calculation = Jalview PCA Calculation
720 label.link_name = Link Name
721 label.pdb_file = PDB file
722 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
723 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
724 label.superpose_structures = Superpose Structures
725 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
726 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
727 label.jmol = Jmol
728 label.chimera = Chimera
729 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
730 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
731 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
732 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
733 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
734 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
735 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
736 label.case_sensitive = Case Sensitive
737 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
738 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
739 label.index_by_host = Index by Host
740 label.index_by_type = Index by Type
741 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
742 label.display_warnings = Display Warnings
743 label.move_url_up = Move URL Up
744 label.move_url_down = Move URL Down
745 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
746 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
747 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
748 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
749 label.sequences_updated = Sequences updated
750 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
751 label.show_all_chains = Show all chains
752 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
753 label.paste_new_window = Paste To New Window
754 label.settings_for_param = Settings for {0}
755 label.view_params = View {0}
756 label.aacon_calculations = AACon Calculations
757 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
758 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
759 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
760 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
761 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
762 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
763 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
764 label.all_views = All Views
765 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
766 label.realign_with_params = Realign with {0}
767 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
768 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
769 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
770 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
771 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
772 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
773 label.view_documentation = View documentation
774 label.select_return_type = Select return type
775 label.translation_of_params = Translation of {0}
776 label.features_for_params = Features for - {0}
777 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
778 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
779 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
780 label.varna_params = VARNA - {0}
781 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
782 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
783 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
784 label.points_for_params = Points for {0}
785 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
786 label.graduated_color_for_params = Graduated Feature Colour for {0}
787 label.select_background_colour = Select Background Colour
788 label.invalid_font = Invalid Font
789 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
790 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
791 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
792 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
793 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
794 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
795 label.example_query_param = Example query: {0}
796 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
797 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
798 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
799 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
800 label.select_columns_containing = Select columns containing
801 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
802 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
803 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
804 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
805 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
806 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
807 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
808 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
809 label.use_sequence_id_4 = 
810 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
811 label.switch_server = Switch server
812 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
813 label.services_at = Services at {0}
814 label.rest_client_submit = {0} using {1}
815 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
816 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
817 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
818 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
819 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
820 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
821 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
822 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
823 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
824 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
825 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
826 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
827 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
828 label.user_preset = User Preset
829 label.service_preset = Service Preset
830 label.run_with_preset = Run {0} with preset
831 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
832 action.by_title_param = By {0}
833 label.source_from_db_source = Sources from {0}
834 label.from_msname = from {0}
835 label.superpose_with = Superpose with
836 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
837 label.add_new_row = Add New Row
838 label.edit_label_description = Edit Label/Description
839 label.hide_row = Hide This Row
840 label.delete_row = Delete This Row
841 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
842 label.export_annotation = Export Annotation
843 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
844 label.helix = Helix
845 label.sheet = Sheet
846 label.rna_helix = RNA Helix
847 label.remove_annotation = Remove Annotation
848 label.colour_by = Colour by...
849 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
850 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
851 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
852 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
853 label.multiharmony = Multi-Harmony
854 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
855 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
856 label.prompt_each_time = Prompt each time
857 label.use_source = Use Source
858 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
859 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
860 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
861 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
862 label.pca_sequences_not_aligned = The sequences must be aligned before calculating PCA.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
863 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
864 label.invalid_name = Invalid name
865 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
866 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
867 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
868 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
869 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
870 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
871 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
872 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
873 label.feature_type = Feature Type
874 label.display = Display
875 label.service_url = Service URL
876 label.copied_sequences = Copied sequences
877 label.cut_sequences = Cut Sequences
878 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
879 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
880 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
881 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
882 label.save_features_to_file = Save Features to File
883 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
884 label.no_features_on_alignment = No features found on alignment
885 label.save_pdb_file = Save PDB File
886 label.save_text_to_file = Save Text to File
887 label.save_state = Save State
888 label.restore_state = Restore State
889 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
890 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
891 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
892 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
893 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
894 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
895 label.select_startup_file = Select startup file
896 label.select_default_browser = Select default web browser
897 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
898 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
899 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
900 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
901 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
902 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
903 label.save_as_html = Save as HTML
904 label.recently_opened = Recently Opened
905 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
906 label.tree = Tree
907 label.tree_from = Tree from {0}
908 label.webservice_job_title = {0} using {1}
909 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
910 label.visible = Visible
911 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
912 label.visible_region_of = visible region of
913 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
914 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
915 label.loading_file = Loading File: {0}
916 label.edit_params = Edit {0}
917 error.not_implemented = Not implemented
918 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
919 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
920 error.implementation_error_sortbyfeature = Implementation Error - sortByFeature method must be one of FEATURE_SCORE, FEATURE_LABEL or FEATURE_DENSITY.
921 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
922 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
923 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
924 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
925 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
926 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
927 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
928 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
929 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
930 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
931 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
932 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
933 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
934 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
935 error.implementation_error = Implementation error
936 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
937 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
938 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
939 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
940 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
941 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
942 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
943 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
944 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
945 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
946 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
947 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
948 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
949 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
950 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
951 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
952 label.cancelled_params = Cancelled {0}
953 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
954 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
955 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
956 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
957 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
958 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
959 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
960 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
961 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
962 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
963 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
964 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
965 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
966 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
967 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
968 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
969 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
970 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
971 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
972 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
973 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
974 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
975 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
976 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
977 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
978 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
979 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
980 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
981 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
982 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
983 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
984 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
985 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
986 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
987 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
988 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
989 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
990 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
991 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
992 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
993 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
994 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
995 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
996 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
997 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
998 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
999 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
1000 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
1001 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
1002 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
1003 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
1004 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1005 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1006 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1007 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1008 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1009 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1010 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1011 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1012 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1013 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1014 label.toggled = Toggled
1015 label.marked = Marked
1016 label.containing = containing
1017 label.not_containing = not containing
1018 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1019 label.submission_params = Submission {0}
1020 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1021 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1022 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1023 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1024 label.pca_calculating = Calculating PCA
1025 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1026 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1027 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1028 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1029 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1030 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1031 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1032 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1033 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1034 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1035 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1036 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1037 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1038 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1039 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1040 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1041 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1042 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1043 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1044 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1045 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1046 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1047 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1048 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1049 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1050 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1051 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1052 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1053 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1054 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1055 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1056 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1057 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1058 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1059 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1060 label.mapped = mapped
1061 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1062 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1063 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1064 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1065 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1066 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1067 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1068 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1069 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1070 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1071 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1072 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1073 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1074 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1075 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1076 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1077 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1078 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1079 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1080 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1081 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1082 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1083 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1084 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1085 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1086 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1087 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1088 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1089 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1090 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1091 label.remove_gaps = Remove Gaps
1092 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1093 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1094 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1095 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1096 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1097 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1098 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1099 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1100 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1101 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1102 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1103 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1104 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1105 warn.service_not_supported = Service not supported!
1106 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1107 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1108 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1109 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1110 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1111 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1112 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1113 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1114 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1115 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1116 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1117 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1118 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1119 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1120 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1121 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1122 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1123 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1124 label.eps_file = EPS file
1125 label.png_image = PNG image
1126 status.saving_file = Saving {0}
1127 status.export_complete = {0} Export completed.
1128 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1129 status.refreshing_news = Refreshing news
1130 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1131 status.opening_params = Opening {0}
1132 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1133 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1134 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1135 status.finshed_querying = Finished querying
1136 status.parsing_results = Parsing results.
1137 status.processing = Processing...
1138 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1139 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1140 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1141 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1142 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1143 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1144 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1145 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1146 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1147 status.opening_file_for = opening file for
1148 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1149 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1150 label.font_too_small = Font size is too small
1151 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1152 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1153 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1154 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1155 label.out_of_memory = Out of memory
1156 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1157 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1158 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1159 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1160 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1161 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1162 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1163 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1164 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1165 label.test_server = Test Server?
1166 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1167 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1168 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1169 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1170 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1171 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1172 label.file_already_exists = File exists
1173 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1174 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1175 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1176 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1177 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1178 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1179 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1180 label.delete_all = Delete all sequences
1181 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1182 label.add_annotations_for = Add annotations for
1183 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1184 label.choose_annotations = Choose Annotations
1185 label.find = Find
1186 label.invalid_search = Search string invalid
1187 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1188 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1189 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1190 label.show_group_logo = Show Group Logo
1191 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1192 label.show_histogram = Show Histogram
1193 label.show_logo = Show Logo
1194 label.normalise_logo = Normalise Logo
1195 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1196 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1197 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1198 label.open_split_window = Open split window
1199 action.no = No
1200 action.yes = Yes
1201 label.for = for
1202 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1203 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1204 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1205 label.alpha_helix = Alpha Helix
1206 label.beta_strand = Beta Strand
1207 label.turn = Turn
1208 label.select_all = Select All
1209 label.structures_filter = Structures Filter
1210 label.search_filter = Search Filter
1211 label.include_description= Include Description
1212 action.back = Back
1213 label.hide_insertions = Hide Insertions
1214 label.mark_as_representative = Mark as representative
1215 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1216 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1217 label.result = result
1218 label.results = results
1219 label.structure_chooser = Structure Chooser
1220 label.select = Select : 
1221 label.invert = Invert 
1222 label.select_pdb_file = Select PDB File
1223 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1224 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1225 label.search_result = Search Result
1226 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1227 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1228 label.start_jalview = Start Jalview
1229 label.biojs_html_export = BioJS
1230 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1231 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1232 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1233 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1234 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1235 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1236 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1237 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1238 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1239 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1240 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1241 action.export_groups = Export Groups
1242 action.export_annotations = Export Annotations
1243 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1244 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1245 action.export_features = Export Features
1246 label.export_settings = Export Settings
1247 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1248 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1249 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1250 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1251 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1252 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1253 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1254 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1255 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1256 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1257 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1258 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1259 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1260 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1261 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1262 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1263 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1264 label.run_groovy = Run Groovy console script
1265 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1266 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1267 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1268 action.next_page= >> 
1269 action.prev_page= << 
1270 label.next_page_tooltip=Next Page
1271 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1272 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1273 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1274 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1275 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1276 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1277 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1278 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1279 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1280 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1281 label.column = Column
1282 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1283 label.operation_failed = Operation failed
1284 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1285 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1286 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1287 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1288 exception.url_cannot_have_miriam_id = {0} is a MIRIAM id and cannot be used as a custom url name
1289 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1290 label.filter = Filter text:
1291 action.customfilter = Custom only
1292 action.showall = Show All
1293 label.insert = Insert:
1294 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1295 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1296 label.primary = Double Click
1297 label.inmenu = In Menu
1298 label.id = ID
1299 label.database = Database
1300 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1301 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1302 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1303 label.invalid_name = Invalid Name !
1304 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1305 label.urllinks = Links