JAL-3210 Merge branch 'develop' into trialMerge
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 label.quit_jalview = Quit Jalview?
36 action.expand_views = Expand Views
37 action.gather_views = Gather Views
38 action.page_setup = Page Setup...
39 action.reload = Reload
40 action.load = Load
41 action.open = Open
42 action.cancel = Cancel
43 action.create = Create
44 action.update = Update
45 action.delete = Delete
46 action.clear = Clear
47 action.accept = Accept
48 action.select_ddbb = --- Select Database ---
49 action.undo = Undo
50 action.redo = Redo
51 action.reset = Reset
52 action.remove_left = Remove left
53 action.remove_right = Remove right
54 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
55 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
56 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
57 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
58 action.boxes = Boxes
59 action.text = Text
60 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
61 action.by_id = By Id
62 action.by_length = By Length
63 action.by_group = By Group
64 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
65 action.set_as_reference = Set as Reference 
66 action.remove = Remove
67 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
68 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
69 action.user_defined = User Defined...
70 action.by_conservation = By Conservation
71 action.wrap = Wrap
72 action.show_gaps = Show Gaps
73 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
74 action.find = Find
75 action.undefine_groups = Undefine Groups
76 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
77 action.copy = Copy
78 action.cut = Cut
79 action.font = Font...
80 action.scale_above = Scale Above
81 action.scale_left = Scale Left
82 action.scale_right = Scale Right
83 action.by_tree_order = By Tree Order
84 action.sort = Sort
85 action.calculate_tree = Calculate Tree...
86 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
87 action.help = Help
88 action.by_annotation = By Annotation...
89 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
90 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
91 action.show = Show
92 action.hide = Hide
93 action.ok = OK
94 action.set_defaults = Defaults
95 action.create_group = Create Group
96 action.remove_group = Remove Group
97 action.edit_group = Edit Group
98 action.border_colour = Border colour
99 action.edit_new_group = Edit New Group
100 action.hide_sequences = Hide Sequences
101 action.sequences = Sequences
102 action.ids = IDS
103 action.ids_sequences = IDS and sequences
104 action.reveal_all = Reveal All
105 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
106 action.find_all = Find all
107 action.find_next = Find next
108 action.file = File
109 action.view = View
110 action.annotations = Annotations
111 action.change_params = Change Parameters
112 action.apply = Apply
113 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
114 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
115 action.by_chain = By Chain
116 action.by_sequence = By Sequence
117 action.paste_annotations = Paste Annotations
118 action.format = Format
119 action.select = Select
120 action.new_view = New View
121 action.close = Close
122 action.add = Add
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.link = Link
136 action.group_link = Group Link
137 action.show_chain = Show Chain
138 action.show_group = Show Group
139 action.fetch_db_references = Fetch DB References
140 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
141 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
142 label.structures_manager = Structures Manager
143 label.url = URL
144 label.url\: = URL:
145 label.input_file_url = Enter URL or Input File
146 label.select_feature = Select feature
147 label.name = Name
148 label.name\: = Name:
149 label.name_param = Name: {0}
150 label.group = Group
151 label.group\: = Group:
152 label.group_name = Group Name
153 label.group_description = Group Description
154 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
155 label.colour = Colour:
156 label.description = Description
157 label.description\: = Description:
158 label.start = Start:
159 label.end = End:
160 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
161 label.service_action = Service Action:
162 label.post_url = POST URL:
163 label.url_suffix = URL Suffix
164 label.per_seq = per Sequence
165 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
166 label.amend = Amend
167 label.undo_command = Undo {0}
168 label.redo_command = Redo {0}
169 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
170 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
171 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
172 label.choose_calculation = Choose Calculation
173 label.calc_title = {0} Using {1}
174 label.tree_calc_av = Average Distance
175 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
176 label.score_model_pid = % Identity
177 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
178 label.score_model_pam250 = PAM 250
179 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
180 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
181 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
182 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
183 label.status_bar = Status bar
184 label.out_to_textbox = Output to Textbox
185 label.occupancy = Occupancy
186 # delete Clustal - use FileFormat name instead
187 label.clustal = Clustal
188 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
189 label.colourScheme_clustal = Clustalx
190 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
191 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
192 label.colourScheme_zappo = Zappo
193 label.colourScheme_taylor = Taylor
194 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
195 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
196 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
197 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
198 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
199 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
200 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
201 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
202 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
203 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
204 label.blc = BLC
205 label.fasta = Fasta
206 label.msf = MSF
207 label.pfam = PFAM
208 label.pileup = Pileup
209 label.pir = PIR
210 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
211 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
212 label.show_annotations = Show annotations
213 label.hide_annotations = Hide annotations
214 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
215 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
216 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
217 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
218 label.hide_all = Hide all
219 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
220 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
221 label.colour_text = Colour Text
222 label.show_non_conserved = Show nonconserved
223 label.overview_window = Overview Window
224 label.none = None
225 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
226 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
227 label.nucleotide = Nucleotide
228 label.protein = Protein
229 label.nucleotides = Nucleotides
230 label.proteins = Proteins
231 label.to_new_alignment = To New Alignment
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233 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
234 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
235 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
236 label.input_from_textbox = Input from textbox
237 label.centre_column_labels = Centre column labels
238 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
239 label.documentation = Documentation
240 label.about = About...
241 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
242 action.feature_settings = Feature Settings...
243 label.all_columns = All Columns
244 label.all_sequences = All Sequences
245 label.selected_columns = Selected Columns 
246 label.selected_sequences = Selected Sequences
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248 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
249 label.selected_region = Selected Region
250 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
251 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
252 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
253 label.group_consensus = Group Consensus
254 label.group_conservation = Group Conservation
255 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
256 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
257 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
258 label.apply_all_groups = Apply to all groups
259 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
260 label.show_first = Show first
261 label.show_last = Show last
262 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
263 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
264 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
265 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
266 label.structure_viewer = Default structure viewer
267 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
268 label.chimera_path = Path to Chimera program
269 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
270 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
271 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
272 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
273 label.min_colour = Minimum Colour
274 label.max_colour = Maximum Colour
275 label.no_colour = No Colour
276 label.use_original_colours = Use Original Colours
277 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
278 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
279 label.selection = Selection
280 label.group_colour = Group Colour
281 label.sequence = Sequence
282 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
283 label.min_value = Min value
284 label.max_value = Max value
285 label.no_value = No value
286 label.new_feature = New Feature
287 label.match_case = Match Case
288 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
289 label.labels = Labels
290 label.output_values = Output Values...
291 label.output_points = Output points...
292 label.output_transformed_points = Output transformed points
293 label.input_data = Input Data...
294 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
295 label.protein_matrix = Protein matrix
296 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
297 label.show_distances = Show distances
298 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
299 label.fit_to_window = Fit To Window
300 label.newick_format = Newick Format
301 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
302 label.colours = Colours
303 label.view_mapping = View Mapping
304 label.wireframe = Wireframe
305 label.depthcue = Depthcue
306 label.z_buffering = Z Buffering
307 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
308 label.all_chains_visible = All Chains Visible
309 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
310 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
311 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
312 label.removed_columns = Removed {0} columns.
313 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
314 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
315 label.order_by_params = Order by {0}
316 label.html_content = <html>{0}</html>
317 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
318 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
319 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
320 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
321 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
322 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
323 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
324 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
325 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
326 label.paste_your = Paste your
327 label.finished_searching = Finished searching
328 label.search_results= Search results {0} : {1}
329 label.found_match_for = Found match for {0}
330 label.font = Font:
331 label.size = Size:
332 label.style = Style:
333 label.calculating = Calculating....
334 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
335 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
336 label.set_this_label_text = set this label text
337 label.sequences_from = Sequences from {0}
338 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
339 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
340 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
341 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
342 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
343 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
344 label.source_to_target = {0} ... {1}
345 label.per_sequence_only= Per-sequence only
346 label.to_file = to File
347 label.to_textbox = to Textbox
348 label.jalview = Jalview
349 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
350 label.status = Status
351 label.channels = Channels
352 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
353 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
354 label.session_update = Session Update
355 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
356 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
357 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
358 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
359 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
360 label.groovy_console = Groovy Console...
361 label.lineart = Lineart
362 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
363 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
364 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
365 label.invert_selection = Invert Selection
366 label.optimise_order = Optimise Order
367 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
368 label.load_colours = Load Colours
369 label.save_colours = Save Colours
370 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
371 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
372 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
373 label.database_param = Database: {0}
374 label.example = Example
375 label.example_param = Example: {0}
376 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
377 label.file_format_not_specified = File format not specified
378 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
379 label.error_saving_file = Error Saving File
380 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
381 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
382 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
383 label.invalid_selection = Invalid Selection
384 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
385 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
386 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
387 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
388 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
389 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
390 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
391 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
392 label.translation_failed = Translation Failed
393 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
394 label.implementation_error  = Implementation error:
395 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
396 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
397 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
398 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
399 label.view_name_original = Original
400 label.enter_view_name = Enter View Name
401 label.enter_label = Enter label
402 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
403 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
404 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
405 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
406 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
407 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
408 label.error_parsing_text = Error parsing text
409 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
410 label.input_alignment = Input Alignment
411 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
412 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
413 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
414 label.url_not_found = URL not found
415 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
416 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
417 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
418 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
419 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
420 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
421 label.invalid_url = Invalid URL !
422 label.error_loading_file = Error loading file
423 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
424 label.file_open_error = File open error
425 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
426 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
427 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
428 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
429 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
430 label.alignment_props = Alignment Properties
431 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
432 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
433 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
434 label.annotations = Annotations
435 label.structure_options = Structure Options
436 label.features = Features
437 label.overview_params = Overview {0}
438 label.paste_newick_file = Paste Newick file
439 label.load_tree_from_file = From File - 
440 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
441 label.selection_output_command = Selection output - {0}
442 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
443 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
444 label.pca_details = PCA details
445 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
446 label.user_defined_colours = User defined colours
447 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
448 label.jaview_build_date = Build date: {0}
449 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
450 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
451 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
452 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
453 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
454 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
455 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
456 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
457 label.right_click = Right click
458 label.to_add_annotation = to add annotation
459 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
460 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
461 label.label = Label
462 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
463 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
464 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
465 label.calculating_pca= Calculating PCA
466 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
467 label.jalview_applet = Jalview applet
468 label.loading_data = Loading data
469 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
470 label.calculating_tree = Calculating tree
471 label.state_queueing = queuing
472 label.state_running = running
473 label.state_completed = finished
474 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
475 label.state_job_error = job error!
476 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
477 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
478 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
479 label.structure_type = Structure type
480 label.settings_for_type = Settings for {0}
481 label.view_full_application = View in Full Application
482 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
483 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
484 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
485 label.load_vcf_file = Load VCF File
486 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
487 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
488 label.export_features = Export Features...
489 label.export_annotations = Export Annotations...
490 label.to_upper_case = To Upper Case
491 label.to_lower_case = To Lower Case
492 label.toggle_case = Toggle Case
493 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
494 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
495 label.edit_sequence = Edit Sequence
496 label.edit_sequences = Edit Sequences
497 label.insert_gap = Insert 1 gap
498 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
499 label.delete_gap = Delete 1 gap
500 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
501 label.sequence_details = Sequence Details
502 label.jmol_help = Jmol Help
503 label.chimera_help = Chimera Help
504 label.close_viewer = Close Viewer
505 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
506 label.all = All
507 label.sort_by = Sort alignment by
508 label.sort_by_score = Sort by Score
509 label.sort_by_density = Sort by Density
510 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
511 label.sort_ann_by = Sort annotations by
512 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
513 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
514 label.reveal = Reveal
515 label.hide_columns = Hide Columns
516 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
517 label.load_tree_file = Load a tree file
518 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
519 label.standard_databases = Standard Databases
520 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
521 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
522 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
523 label.connect_to_session = Connect to session {0}
524 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
525 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
526 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
527 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
528 label.adjust_threshold = Adjust threshold
529 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
530 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
531 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
532 label.open_url_param = Open URL {0}
533 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
534 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
535 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
536 label.dark_colour = Dark Colour
537 label.light_colour = Light Colour
538 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
539 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
540 label.copy_format_from = Copy format from
541 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
542 label.select_all_views = Select all views
543 label.select_many_views = Select many views
544 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
545 label.open_local_file = Open local file
546 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
547 label.listen_for_selections = Listen for selections
548 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
549 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
550 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
551 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
552 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
553 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
554 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
555 label.no_services = <No Services>
556 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
557 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
558 label.connect_to = Connect to
559 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
560 label.from_url = from URL
561 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
562 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
563 label.from_textbox = from Textbox
564 label.window = Window
565 label.preferences = Preferences
566 label.tools = Tools
567 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
568 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
569 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
570 label.collect_garbage = Collect Garbage
571 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
572 label.show_java_console = Show Java Console
573 label.show_jalview_news = Show Jalview News
574 label.take_snapshot = Take snapshot
575 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
576 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
577 label.monospaced_font= Monospaced
578 label.quality = Quality
579 label.maximize_window = Maximize Window
580 label.conservation = Conservation
581 label.consensus = Consensus
582 label.histogram = Histogram
583 label.logo = Logo
584 label.non_positional_features = List Non-positional Features
585 label.database_references = List Database References
586 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
587 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
588 label.gap_symbol = Gap Symbol
589 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
590 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
591 label.address = Address
592 label.port = Port
593 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
594 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
595 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
596 label.check_for_latest_version = Check for latest version
597 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
598 label.use_proxy_server = Use a proxy server
599 label.rendering_style = {0} rendering style
600 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
601 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
602 label.smooth_font = Smooth Font
603 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
604 label.pad_gaps = Pad Gaps
605 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
606 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
607 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
608 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
609 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
610 label.right_align_ids = Right Align Ids
611 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
612 label.open_overview = Open Overview
613 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
614 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
615 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
616 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
617 label.visual = Visual
618 label.connections = Connections
619 label.output = Output
620 label.editing = Editing
621 label.web_services = Web Services
622 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
623 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
624 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
625 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
626 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
627 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
628 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
629 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
630 label.new_service_url = New Service URL
631 label.edit_service_url = Edit Service URL
632 label.delete_service_url = Delete Service URL
633 label.details = Details
634 label.options = Options
635 label.parameters = Parameters
636 label.proxy_server = Proxy Server
637 label.file_output = File Output
638 label.select_input_type = Select input type
639 label.set_options_for_type = Set options for type
640 label.data_input_parameters = Data input parameters
641 label.data_returned_by_service = Data returned by service
642 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
643 label.parsing_errors = Parsing errors
644 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
645 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
646 label.input_parameter_name = Input Parameter name
647 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
648 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
649 label.brief_description_service = Brief description of service
650 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
651 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
652 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
653 label.gap_character = Gap character
654 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
655 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
656 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
657 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
658 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
659 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
660 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
661 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
662 label.input_output = Input/Output
663 label.cut_paste = Cut'n'Paste
664 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
665 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
666 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
667 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
668 label.from_file = From File
669 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
670 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
671 label.text_colour = Text Colour...
672 label.structure = Structure
673 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
674 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
675 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
676 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
677 label.sequence_name = Sequence Name
678 label.sequence_description = Sequence Description
679 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
680 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
681 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
682 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
683 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
684 label.web_browser_not_found = Web browser not found
685 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
686 label.html = HTML
687 label.wrap = Wrap
688 label.show_database_refs = Show Database Refs
689 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
690 label.save_png_image = Save As PNG Image
691 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
692 label.export_image = Export Image
693 label.vamsas_store = VAMSAS store
694 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
695 label.reverse = Reverse
696 label.reverse_complement = Reverse Complement
697 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
698 label.extract_scores = Extract Scores
699 label.get_cross_refs = Get Cross-References
700 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
701 label.add_sequences = Add Sequences
702 label.new_window = New Window
703 label.split_window = Split Window
704 label.set_as_default = Set as Default
705 label.show_labels = Show labels
706 action.background_colour = Background Colour...
707 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
708 label.link_name = Link Name
709 label.pdb_file = PDB file
710 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
711 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
712 label.superpose_structures = Superpose Structures
713 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
714 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
715 label.jmol = Jmol
716 label.chimera = Chimera
717 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
718 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
719 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
720 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
721 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
722 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
723 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
724 label.case_sensitive = Case Sensitive
725 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
726 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
727 label.index_by_host = Index by Host
728 label.index_by_type = Index by Type
729 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
730 label.display_warnings = Display Warnings
731 label.move_url_up = Move URL Up
732 label.move_url_down = Move URL Down
733 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
734 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
735 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
736 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
737 label.sequences_updated = Sequences updated
738 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
739 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
740 label.paste_new_window = Paste To New Window
741 label.settings_for_param = Settings for {0}
742 label.view_params = View {0}
743 label.aacon_calculations = AACon Calculations
744 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
745 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
746 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
747 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
748 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
749 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
750 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
751 label.all_views = All Views
752 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
753 label.realign_with_params = Realign with {0}
754 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
755 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
756 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
757 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
758 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
759 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
760 label.view_documentation = View documentation
761 label.select_return_type = Select return type
762 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
763 label.features_for_params = Features for - {0}
764 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
765 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
766 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
767 label.varna_params = VARNA - {0}
768 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
769 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
770 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
771 label.points_for_params = Points for {0}
772 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
773 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
774 label.select_background_colour = Select Background Colour
775 label.invalid_font = Invalid Font
776 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
777 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
778 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
779 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
780 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
781 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
782 label.example_query_param = Example query: {0}
783 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
784 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
785 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
786 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
787 label.select_columns_containing = Select columns containing
788 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
789 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
790 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
791 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
792 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
793 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
794 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
795 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
796 label.use_sequence_id_4 = 
797 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
798 label.switch_server = Switch server
799 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
800 label.services_at = Services at {0}
801 label.rest_client_submit = {0} using {1}
802 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
803 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
804 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
805 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
806 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
807 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
808 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
809 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
810 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
811 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
812 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
813 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
814 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
815 label.user_preset = User Preset
816 label.service_preset = Service Preset
817 label.run_with_preset = Run {0} with preset
818 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
819 action.by_title_param = By {0}
820 label.source_from_db_source = Sources from {0}
821 label.from_msname = from {0}
822 label.superpose_with = Superpose with
823 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
824 label.add_new_row = Add New Row
825 label.edit_label_description = Edit Label/Description
826 label.hide_row = Hide This Row
827 label.delete_row = Delete This Row
828 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
829 label.export_annotation = Export Annotation
830 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
831 label.helix = Helix
832 label.sheet = Sheet
833 label.rna_helix = RNA Helix
834 label.remove_annotation = Remove Annotation
835 label.colour_by = Colour by...
836 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
837 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
838 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
839 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
840 label.multiharmony = Multi-Harmony
841 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
842 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
843 label.prompt_each_time = Prompt each time
844 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
845 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
846 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
847 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
848 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
849 label.invalid_name = Invalid name
850 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
851 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
852 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
853 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
854 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
855 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
856 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
857 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
858 label.feature_type = Feature Type
859 label.show = Show
860 label.service_url = Service URL
861 label.copied_sequences = Copied sequences
862 label.cut_sequences = Cut Sequences
863 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
864 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
865 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
866 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
867 label.save_features_to_file = Save Features to File
868 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
869 label.save_pdb_file = Save PDB File
870 label.save_text_to_file = Save Text to File
871 label.save_state = Save State
872 label.restore_state = Restore State
873 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
874 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
875 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
876 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
877 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
878 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
879 label.select_startup_file = Select startup file
880 label.select_default_browser = Select default web browser
881 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
882 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
883 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
884 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
885 label.save_as_html = Save as HTML
886 label.recently_opened = Recently Opened
887 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
888 label.tree = Tree
889 label.tree_from = Tree from {0}
890 label.webservice_job_title = {0} using {1}
891 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
892 label.visible = Visible
893 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
894 label.visible_region_of = visible region of
895 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
896 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
897 label.loading_file = Loading File: {0}
898 label.edit_params = Edit {0}
899 label.as_percentage = As Percentage
900 error.not_implemented = Not implemented
901 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
902 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
903 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
904 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
905 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
906 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
907 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
908 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
909 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
910 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
911 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
912 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
913 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
914 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
915 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
916 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
917 error.implementation_error = Implementation error
918 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
919 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
920 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
921 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
922 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
923 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
924 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
925 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
926 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
927 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
928 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
929 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
930 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
931 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
932 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
933 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
934 label.cancelled_params = Cancelled {0}
935 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
936 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
937 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
938 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
939 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
940 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
941 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
942 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
943 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
944 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
945 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
946 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
947 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
948 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
949 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
950 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
951 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
952 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
953 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
954 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
955 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
956 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
957 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
958 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
959 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
960 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
961 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
962 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
963 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
964 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
965 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
966 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
967 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
968 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
969 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
970 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
971 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
972 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
973 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
974 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
975 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
976 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
977 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
978 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
979 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
980 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
981 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
982 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
983 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
984 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
985 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
986 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
987 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
988 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
989 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
990 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
991 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
992 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
993 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
994 label.toggled = Toggled
995 label.marked = Marked
996 label.containing = containing
997 label.not_containing = not containing
998 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
999 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
1000 label.submission_params = Submission {0}
1001 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1002 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1003 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1004 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1005 label.pca_calculating = Calculating PCA
1006 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1007 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1008 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1009 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1010 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1011 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1012 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1013 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1014 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1015 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1016 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1017 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1018 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1019 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1020 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1021 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1022 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1023 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1024 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1025 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1026 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1027 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1028 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1029 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1030 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1031 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1032 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1033 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1034 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1035 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1036 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1037 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1038 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1039 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1040 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1041 label.mapped = mapped
1042 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1043 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1044 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1045 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1046 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1047 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1048 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1049 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1050 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1051 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1052 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1053 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1054 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1055 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1056 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1057 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1058 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1059 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1060 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1061 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1062 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1063 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1064 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1065 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1066 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1067 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1068 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1069 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1070 label.remove_gaps = Remove Gaps
1071 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1072 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1073 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1074 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1075 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1076 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1077 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1078 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1079 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1080 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1081 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1082 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1083 warn.service_not_supported = Service not supported!
1084 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1085 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1086 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1087 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1088 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1089 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1090 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1091 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1092 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1093 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1094 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1095 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1096 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1097 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1098 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1099 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1100 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1101 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1102 label.eps_file = EPS file
1103 label.png_image = PNG image
1104 status.export_complete = {0} Export completed
1105 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1106 status.refreshing_news = Refreshing news
1107 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1108 status.opening_params = Opening {0}
1109 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1110 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1111 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1112 status.finshed_querying = Finished querying
1113 status.parsing_results = Parsing results.
1114 status.processing = Processing...
1115 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1116 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1117 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1118 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1119 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1120 status.opening_file_for = opening file for
1121 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1122 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1123 label.font_too_small = Font size is too small
1124 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1125 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1126 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1127 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1128 label.out_of_memory = Out of memory
1129 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1130 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1131 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1132 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1133 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1134 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1135 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1136 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1137 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1138 label.test_server = Test Server?
1139 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1140 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1141 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1142 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1143 label.file_already_exists = File exists
1144 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1145 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1146 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1147 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1148 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1149 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1150 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1151 label.delete_all = Delete all sequences
1152 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1153 label.add_annotations_for = Add annotations for
1154 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1155 label.choose_annotations = Choose Annotations
1156 label.find = Find
1157 label.invalid_search = Search string invalid
1158 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1159 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1160 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1161 label.show_group_logo = Show Group Logo
1162 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1163 label.show_histogram = Show Histogram
1164 label.show_logo = Show Logo
1165 label.normalise_logo = Normalise Logo
1166 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1167 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1168 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1169 label.open_split_window = Open split window
1170 action.no = No
1171 action.yes = Yes
1172 label.for = for
1173 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1174 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1175 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1176 label.alpha_helix = Alpha Helix
1177 label.beta_strand = Beta Strand
1178 label.turn = Turn
1179 label.select_all = Select All
1180 label.structures_filter = Structures Filter
1181 label.search_filter = Search Filter
1182 label.include_description= Include Description
1183 action.back = Back
1184 label.hide_insertions = Hide Insertions
1185 label.mark_as_representative = Mark as representative
1186 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1187 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1188 label.result = result
1189 label.results = results
1190 label.structure_chooser = Structure Chooser
1191 label.invert = Invert 
1192 label.select_pdb_file = Select PDB File
1193 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1194 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1195 label.search_result = Search Result
1196 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1197 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1198 label.start_jalview = Start Jalview
1199 label.biojs_html_export = BioJS
1200 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1201 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1202 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1203 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1204 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1205 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1206 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1207 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1208 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1209 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1210 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1211 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1212 action.export_groups = Export Groups
1213 action.export_annotations = Export Annotations
1214 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1215 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1216 action.export_features = Export Features
1217 label.export_settings = Export Settings
1218 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1219 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1220 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1221 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1222 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1223 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1224 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1225 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1226 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1227 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1228 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1229 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1230 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1231 label.run_groovy = Run Groovy console script
1232 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1233 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1234 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1235 action.next_page= >> 
1236 action.prev_page= << 
1237 label.next_page_tooltip=Next Page
1238 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1239 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1240 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1241 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1242 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1243 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1244 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1245 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1246 label.column = Column
1247 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1248 label.operation_failed = Operation failed
1249 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1250 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1251 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1252 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1253 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1254 action.customfilter = Custom only
1255 action.showall = Show All
1256 label.insert = Insert:
1257 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1258 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1259 label.primary = Double Click
1260 label.inmenu = In Menu
1261 label.id = ID
1262 label.database = Database
1263 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1264 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1265 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1266 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1267 label.urllinks = Links
1268 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1269 label.togglehidden = Show hidden regions
1270 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1271 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1272 label.consensus_descr = PID
1273 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1274 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1275 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1276 label.show_experimental = Enable experimental features
1277 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1278 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1279 label.overview_settings = Overview settings
1280 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1281 label.gap_colour = Gap colour:
1282 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1283 label.hidden_colour = Hidden colour:
1284 label.select_gap_colour = Select gap colour
1285 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1286 label.overview = Overview
1287 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1288 label.oview_calc = Recalculating overview...
1289 label.feature_details = Feature details
1290 label.matchCondition_contains = Contains
1291 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1292 label.matchCondition_matches = Matches
1293 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1294 label.matchCondition_present = Is present
1295 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1296 label.matchCondition_eq = =
1297 label.matchCondition_ne = not =
1298 label.matchCondition_lt = <
1299 label.matchCondition_le = <=
1300 label.matchCondition_gt = >
1301 label.matchCondition_ge = >=
1302 label.numeric_required = The value should be numeric
1303 label.filter = Filter
1304 label.filters = Filters
1305 label.join_conditions = Join conditions with
1306 label.delete_condition = Delete this condition
1307 label.score = Score
1308 label.colour_by_label = Colour by label
1309 label.variable_colour = Variable colour...
1310 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1311 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1312 option.autosearch = Autosearch
1313 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1314 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1315 label.simple = Simple
1316 label.simple_colour = Simple Colour
1317 label.colour_by_text = Colour by text
1318 label.graduated_colour = Graduated Colour
1319 label.by_text_of = By text of
1320 label.by_range_of = By range of
1321 label.or = Or
1322 label.and = And
1323 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1324 label.best_quality = Best Quality
1325 label.best_resolution = Best Resolution
1326 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1327 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1328 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1329 label.cached_structures = Cached Structures
1330 label.free_text_search = Free Text Search
1331 label.annotation_name = Annotation Name
1332 label.annotation_description = Annotation Description 
1333 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1334 label.alignment = alignment
1335 label.pca = PCA
1336 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1337 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1338 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1339 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1340 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1341 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1342 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1343 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1344 label.backups = Backups
1345 label.backup = Backup
1346 label.backup_files = Backup Files
1347 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1348 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1349 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1350 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1351 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1352 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1353 label.scheme_examples = Scheme examples
1354 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1355 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1356 label.keep_files = Deleting old backup files
1357 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1358 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1359 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1360 label.always_ask = Always ask
1361 label.auto_delete = Automatically delete
1362 label.filename = filename
1363 label.braced_oldest = (oldest)
1364 label.braced_newest = (most recent)
1365 label.configuration = Configuration
1366 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1367 label.schemes = Schemes
1368 label.customise = Customise
1369 label.custom = Custom
1370 label.default = Default
1371 label.single_file = Single backup
1372 label.keep_all_versions = Keep all versions
1373 label.rolled_backups = Rolled backup files
1374 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1375 label.custom_description = Your own saved scheme
1376 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1377 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1378 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1379 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1380 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1381 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1382 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1383 label.include_backup_files = Include backup files
1384 label.cancel_changes = Cancel changes
1385 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1386 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1387 label.was_previous = was {0}
1388 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1389 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1390 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1391 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1392 label.delete = Delete
1393 label.rename = Rename
1394 label.keep = Keep
1395 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1396 label.annotation_name = Annotation Name
1397 label.annotation_description = Annotation Description 
1398 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1399 label.alignment = alignment
1400 label.pca = PCA
1401 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1402 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1403 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu