Merge branch 'feature/JAL-3180colourAnnotationMenu' into merge/JAL-3180
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.expand_views = Expand Views
36 action.gather_views = Gather Views
37 action.page_setup = Page Setup...
38 action.reload = Reload
39 action.load = Load
40 action.open = Open
41 action.cancel = Cancel
42 action.create = Create
43 action.update = Update
44 action.delete = Delete
45 action.clear = Clear
46 action.accept = Accept
47 action.select_ddbb = --- Select Database ---
48 action.undo = Undo
49 action.redo = Redo
50 action.reset = Reset
51 action.remove_left = Remove left
52 action.remove_right = Remove right
53 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
54 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
55 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
56 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
57 action.boxes = Boxes
58 action.text = Text
59 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
60 action.by_id = By Id
61 action.by_length = By Length
62 action.by_group = By Group
63 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
64 action.set_as_reference = Set as Reference 
65 action.remove = Remove
66 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
67 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
68 action.user_defined = User Defined...
69 action.by_conservation = By Conservation
70 action.wrap = Wrap
71 action.show_gaps = Show Gaps
72 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
73 action.find = Find
74 action.undefine_groups = Undefine Groups
75 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
76 action.copy = Copy
77 action.cut = Cut
78 action.font = Font...
79 action.scale_above = Scale Above
80 action.scale_left = Scale Left
81 action.scale_right = Scale Right
82 action.by_tree_order = By Tree Order
83 action.sort = Sort
84 action.calculate_tree = Calculate Tree...
85 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
86 action.help = Help
87 action.by_annotation = By Annotation...
88 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
89 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
90 action.show = Show
91 action.hide = Hide
92 action.ok = OK
93 action.set_defaults = Defaults
94 action.create_group = Create Group
95 action.remove_group = Remove Group
96 action.edit_group = Edit Group
97 action.border_colour = Border colour
98 action.edit_new_group = Edit New Group
99 action.hide_sequences = Hide Sequences
100 action.sequences = Sequences
101 action.ids = IDS
102 action.ids_sequences = IDS and sequences
103 action.reveal_all = Reveal All
104 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
105 action.find_all = Find all
106 action.find_next = Find next
107 action.file = File
108 action.view = View
109 action.annotations = Annotations
110 action.change_params = Change Parameters
111 action.apply = Apply
112 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
113 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
114 action.by_chain = By Chain
115 action.by_sequence = By Sequence
116 action.paste_annotations = Paste Annotations
117 action.format = Format
118 action.select = Select
119 action.new_view = New View
120 action.close = Close
121 action.add = Add
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.change_font = Change Font
125 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
126 action.colour = Colour
127 action.calculate = Calculate
128 action.select_all = Select all
129 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
130 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
131 action.deselect_all = Deselect all
132 action.invert_selection = Invert selection
133 action.using_jmol = Using Jmol
134 action.link = Link
135 action.group_link = Group Link
136 action.show_chain = Show Chain
137 action.show_group = Show Group
138 action.fetch_db_references = Fetch DB References
139 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
140 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
141 label.structures_manager = Structures Manager
142 label.url = URL
143 label.url\: = URL:
144 label.input_file_url = Enter URL or Input File
145 label.select_feature = Select feature
146 label.name = Name
147 label.name\: = Name:
148 label.name_param = Name: {0}
149 label.group = Group
150 label.group\: = Group:
151 label.group_name = Group Name
152 label.group_description = Group Description
153 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
154 label.colour = Colour:
155 label.description = Description
156 label.description\: = Description:
157 label.start = Start:
158 label.end = End:
159 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
160 label.service_action = Service Action:
161 label.post_url = POST URL:
162 label.url_suffix = URL Suffix
163 label.per_seq = per Sequence
164 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
165 label.amend = Amend
166 label.undo_command = Undo {0}
167 label.redo_command = Redo {0}
168 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
169 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
170 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
171 label.choose_calculation = Choose Calculation
172 label.calc_title = {0} Using {1}
173 label.tree_calc_av = Average Distance
174 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
175 label.score_model_pid = % Identity
176 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
177 label.score_model_pam250 = PAM 250
178 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
179 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
180 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
181 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
182 label.status_bar = Status bar
183 label.out_to_textbox = Output to Textbox
184 label.occupancy = Occupancy
185 # delete Clustal - use FileFormat name instead
186 label.clustal = Clustal
187 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
188 label.colourScheme_clustal = Clustalx
189 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
190 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
191 label.colourScheme_zappo = Zappo
192 label.colourScheme_taylor = Taylor
193 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
194 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
195 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
196 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
197 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
198 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
199 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
200 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
201 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
202 label.blc = BLC
203 label.fasta = Fasta
204 label.msf = MSF
205 label.pfam = PFAM
206 label.pileup = Pileup
207 label.pir = PIR
208 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
209 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
210 label.show_annotations = Show annotations
211 label.hide_annotations = Hide annotations
212 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
213 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
214 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
215 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
216 label.hide_all = Hide all
217 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
218 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
219 label.colour_text = Colour Text
220 label.show_non_conserved = Show nonconserved
221 label.overview_window = Overview Window
222 label.none = None
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224 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
225 label.nucleotide = Nucleotide
226 label.protein = Protein
227 label.nucleotides = Nucleotides
228 label.proteins = Proteins
229 label.to_new_alignment = To New Alignment
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231 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
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233 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
234 label.input_from_textbox = Input from textbox
235 label.centre_column_labels = Centre column labels
236 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
237 label.documentation = Documentation
238 label.about = About...
239 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
240 action.feature_settings = Feature Settings...
241 label.all_columns = All Columns
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244 label.selected_sequences = Selected Sequences
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246 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
247 label.selected_region = Selected Region
248 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
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250 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
251 label.group_consensus = Group Consensus
252 label.group_conservation = Group Conservation
253 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
254 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
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256 label.apply_all_groups = Apply to all groups
257 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
258 label.show_first = Show first
259 label.show_last = Show last
260 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
261 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
262 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
263 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
264 label.structure_viewer = Default structure viewer
265 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
266 label.chimera_path = Path to Chimera program
267 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
268 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
269 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
270 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
271 label.min_colour = Minimum Colour
272 label.max_colour = Maximum Colour
273 label.no_colour = No Colour
274 label.use_original_colours = Use Original Colours
275 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
276 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
277 label.selection = Selection
278 label.group_colour = Group Colour
279 label.sequence = Sequence
280 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
281 label.min_value = Min value
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283 label.no_value = No value
284 label.new_feature = New Feature
285 label.match_case = Match Case
286 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
287 label.labels = Labels
288 label.output_values = Output Values...
289 label.output_points = Output points...
290 label.output_transformed_points = Output transformed points
291 label.input_data = Input Data...
292 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
293 label.protein_matrix = Protein matrix
294 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
295 label.show_distances = Show distances
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297 label.fit_to_window = Fit To Window
298 label.newick_format = Newick Format
299 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
300 label.colours = Colours
301 label.view_mapping = View Mapping
302 label.wireframe = Wireframe
303 label.depthcue = Depthcue
304 label.z_buffering = Z Buffering
305 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
306 label.all_chains_visible = All Chains Visible
307 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
308 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
309 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
310 label.removed_columns = Removed {0} columns.
311 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
312 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
313 label.order_by_params = Order by {0}
314 label.html_content = <html>{0}</html>
315 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
316 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
317 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
318 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
319 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
320 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
321 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
322 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
323 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
324 label.paste_your = Paste your
325 label.finished_searching = Finished searching
326 label.search_results= Search results {0} : {1}
327 label.found_match_for = Found match for {0}
328 label.font = Font:
329 label.size = Size:
330 label.style = Style:
331 label.calculating = Calculating....
332 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
333 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
334 label.set_this_label_text = set this label text
335 label.sequences_from = Sequences from {0}
336 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
337 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
338 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
339 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
340 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
341 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
342 label.source_to_target = {0} ... {1}
343 label.per_sequence_only= Per-sequence only
344 label.to_file = to File
345 label.to_textbox = to Textbox
346 label.jalview = Jalview
347 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
348 label.status = Status
349 label.channels = Channels
350 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
351 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
352 label.session_update = Session Update
353 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
354 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
355 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
356 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
357 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
358 label.groovy_console = Groovy Console...
359 label.lineart = Lineart
360 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
361 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
362 label.invert_selection = Invert Selection
363 label.optimise_order = Optimise Order
364 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
365 label.load_colours = Load Colours
366 label.save_colours = Save Colours
367 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
368 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
369 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
370 label.database_param = Database: {0}
371 label.example = Example
372 label.example_param = Example: {0}
373 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
374 label.file_format_not_specified = File format not specified
375 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
376 label.error_saving_file = Error Saving File
377 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
378 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
379 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
380 label.invalid_selection = Invalid Selection
381 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
382 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
383 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
384 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
385 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
386 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
387 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
388 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
389 label.translation_failed = Translation Failed
390 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
391 label.implementation_error  = Implementation error:
392 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
393 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
394 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
395 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
396 label.view_name_original = Original
397 label.enter_view_name = Enter View Name
398 label.enter_label = Enter label
399 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
400 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
401 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
402 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
403 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
404 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
405 label.error_parsing_text = Error parsing text
406 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
407 label.input_alignment = Input Alignment
408 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
409 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
410 label.couldnt_locate = Could not locate {0}
411 label.url_not_found = URL not found
412 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
413 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
414 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
415 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
416 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
417 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
418 label.invalid_url = Invalid URL !
419 label.error_loading_file = Error loading file
420 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
421 label.file_open_error = File open error
422 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
423 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
424 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
425 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
426 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
427 label.alignment_props = Alignment Properties
428 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
429 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
430 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
431 label.annotations = Annotations
432 label.structure_options = Structure Options
433 label.features = Features
434 label.overview_params = Overview {0}
435 label.paste_newick_file = Paste Newick file
436 label.load_tree_from_file = From File - 
437 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
438 label.selection_output_command = Selection output - {0}
439 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
440 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
441 label.pca_details = PCA details
442 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
443 label.user_defined_colours = User defined colours
444 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
445 label.jaview_build_date = Build date: {0}
446 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
447 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
448 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
449 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
450 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
451 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
452 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
453 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
454 label.right_click = Right click
455 label.to_add_annotation = to add annotation
456 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
457 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
458 label.label = Label
459 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
460 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
461 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
462 label.calculating_pca= Calculating PCA
463 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
464 label.jalview_applet = Jalview applet
465 label.loading_data = Loading data
466 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
467 label.calculating_tree = Calculating tree
468 label.state_queueing = queuing
469 label.state_running = running
470 label.state_completed = finished
471 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
472 label.state_job_error = job error!
473 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
474 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
475 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
476 label.structure_type = Structure type
477 label.settings_for_type = Settings for {0}
478 label.view_full_application = View in Full Application
479 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
480 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
481 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
482 label.load_vcf_file = Load VCF File
483 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
484 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
485 label.export_features = Export Features...
486 label.export_annotations = Export Annotations...
487 label.to_upper_case = To Upper Case
488 label.to_lower_case = To Lower Case
489 label.toggle_case = Toggle Case
490 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
491 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
492 label.edit_sequence = Edit Sequence
493 label.edit_sequences = Edit Sequences
494 label.insert_gap = Insert 1 gap
495 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
496 label.delete_gap = Delete 1 gap
497 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
498 label.sequence_details = Sequence Details
499 label.jmol_help = Jmol Help
500 label.chimera_help = Chimera Help
501 label.close_viewer = Close Viewer
502 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
503 label.all = All
504 label.sort_by = Sort alignment by
505 label.sort_by_score = Sort by Score
506 label.sort_by_density = Sort by Density
507 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
508 label.sort_ann_by = Sort annotations by
509 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
510 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
511 label.reveal = Reveal
512 label.hide_columns = Hide Columns
513 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
514 label.load_tree_file = Load a tree file
515 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
516 label.standard_databases = Standard Databases
517 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
518 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
519 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
520 label.connect_to_session = Connect to session {0}
521 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
522 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
523 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
524 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
525 label.adjust_threshold = Adjust threshold
526 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
527 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
528 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
529 label.open_url_param = Open URL {0}
530 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
531 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
532 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
533 label.dark_colour = Dark Colour
534 label.light_colour = Light Colour
535 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
536 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
537 label.copy_format_from = Copy format from
538 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
539 label.select_all_views = Select all views
540 label.select_many_views = Select many views
541 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
542 label.open_local_file = Open local file
543 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
544 label.listen_for_selections = Listen for selections
545 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
546 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
547 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
548 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
549 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
550 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
551 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
552 label.no_services = <No Services>
553 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
554 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
555 label.connect_to = Connect to
556 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
557 label.from_url = from URL
558 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
559 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
560 label.from_textbox = from Textbox
561 label.window = Window
562 label.preferences = Preferences
563 label.tools = Tools
564 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
565 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
566 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
567 label.collect_garbage = Collect Garbage
568 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
569 label.show_java_console = Show Java Console
570 label.show_jalview_news = Show Jalview News
571 label.take_snapshot = Take snapshot
572 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
573 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
574 label.monospaced_font= Monospaced
575 label.quality = Quality
576 label.maximize_window = Maximize Window
577 label.conservation = Conservation
578 label.consensus = Consensus
579 label.histogram = Histogram
580 label.logo = Logo
581 label.non_positional_features = List Non-positional Features
582 label.database_references = List Database References
583 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
584 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
585 label.gap_symbol = Gap Symbol
586 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
587 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
588 label.address = Address
589 label.port = Port
590 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
591 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
592 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
593 label.check_for_latest_version = Check for latest version
594 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
595 label.use_proxy_server = Use a proxy server
596 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
597 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
598 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
599 label.smooth_font = Smooth Font
600 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
601 label.pad_gaps = Pad Gaps
602 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
603 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
604 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
605 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
606 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
607 label.right_align_ids = Right Align Ids
608 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
609 label.open_overview = Open Overview
610 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
611 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
612 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
613 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
614 label.visual = Visual
615 label.connections = Connections
616 label.output = Output
617 label.editing = Editing
618 label.web_services = Web Services
619 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
620 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
621 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
622 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
623 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
624 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
625 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
626 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
627 label.new_service_url = New Service URL
628 label.edit_service_url = Edit Service URL
629 label.delete_service_url = Delete Service URL
630 label.details = Details
631 label.options = Options
632 label.parameters = Parameters
633 label.proxy_server = Proxy Server
634 label.file_output = File Output
635 label.select_input_type = Select input type
636 label.set_options_for_type = Set options for type
637 label.data_input_parameters = Data input parameters
638 label.data_returned_by_service = Data returned by service
639 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
640 label.parsing_errors = Parsing errors
641 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
642 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
643 label.input_parameter_name = Input Parameter name
644 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
645 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
646 label.brief_description_service = Brief description of service
647 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
648 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
649 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
650 label.gap_character = Gap character
651 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
652 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
653 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
654 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
655 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
656 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
657 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
658 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
659 label.input_output = Input/Output
660 label.cut_paste = Cut'n'Paste
661 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
662 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
663 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
664 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
665 label.from_file = From File
666 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
667 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
668 label.text_colour = Text Colour...
669 label.structure = Structure
670 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
671 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
672 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
673 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
674 label.sequence_name = Sequence Name
675 label.sequence_description = Sequence Description
676 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
677 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
678 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
679 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
680 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
681 label.web_browser_not_found = Web browser not found
682 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
683 label.html = HTML
684 label.wrap = Wrap
685 label.show_database_refs = Show Database Refs
686 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
687 label.save_png_image = Save As PNG Image
688 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
689 label.export_image = Export Image
690 label.vamsas_store = VAMSAS store
691 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
692 label.reverse = Reverse
693 label.reverse_complement = Reverse Complement
694 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
695 label.extract_scores = Extract Scores
696 label.get_cross_refs = Get Cross-References
697 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
698 label.add_sequences = Add Sequences
699 label.new_window = New Window
700 label.split_window = Split Window
701 label.set_as_default = Set as Default
702 label.show_labels = Show labels
703 action.background_colour = Background Colour...
704 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
705 label.link_name = Link Name
706 label.pdb_file = PDB file
707 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
708 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
709 label.superpose_structures = Superpose Structures
710 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
711 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
712 label.jmol = Jmol
713 label.chimera = Chimera
714 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
715 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
716 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
717 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
718 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
719 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
720 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
721 label.case_sensitive = Case Sensitive
722 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
723 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
724 label.index_by_host = Index by Host
725 label.index_by_type = Index by Type
726 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
727 label.display_warnings = Display Warnings
728 label.move_url_up = Move URL Up
729 label.move_url_down = Move URL Down
730 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
731 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
732 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
733 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
734 label.sequences_updated = Sequences updated
735 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
736 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
737 label.paste_new_window = Paste To New Window
738 label.settings_for_param = Settings for {0}
739 label.view_params = View {0}
740 label.aacon_calculations = AACon Calculations
741 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
742 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
743 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
744 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
745 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
746 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
747 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
748 label.all_views = All Views
749 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
750 label.realign_with_params = Realign with {0}
751 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
752 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
753 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
754 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
755 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
756 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
757 label.view_documentation = View documentation
758 label.select_return_type = Select return type
759 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
760 label.features_for_params = Features for - {0}
761 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
762 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
763 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
764 label.varna_params = VARNA - {0}
765 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
766 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
767 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
768 label.points_for_params = Points for {0}
769 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
770 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
771 label.select_background_colour = Select Background Colour
772 label.invalid_font = Invalid Font
773 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
774 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
775 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
776 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
777 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
778 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
779 label.example_query_param = Example query: {0}
780 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
781 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
782 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
783 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
784 label.select_columns_containing = Select columns containing
785 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
786 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
787 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
788 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
789 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
790 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
791 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
792 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
793 label.use_sequence_id_4 = 
794 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
795 label.switch_server = Switch server
796 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
797 label.services_at = Services at {0}
798 label.rest_client_submit = {0} using {1}
799 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
800 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
801 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
802 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
803 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
804 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
805 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
806 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
807 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
808 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
809 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
810 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
811 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
812 label.user_preset = User Preset
813 label.service_preset = Service Preset
814 label.run_with_preset = Run {0} with preset
815 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
816 action.by_title_param = By {0}
817 label.source_from_db_source = Sources from {0}
818 label.from_msname = from {0}
819 label.superpose_with = Superpose with
820 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
821 label.add_new_row = Add New Row
822 label.edit_label_description = Edit Label/Description
823 label.hide_row = Hide This Row
824 label.delete_row = Delete This Row
825 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
826 label.export_annotation = Export Annotation
827 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
828 label.helix = Helix
829 label.sheet = Sheet
830 label.rna_helix = RNA Helix
831 label.remove_annotation = Remove Annotation
832 label.colour_by = Colour by...
833 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
834 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
835 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
836 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
837 label.multiharmony = Multi-Harmony
838 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
839 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
840 label.prompt_each_time = Prompt each time
841 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
842 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
843 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
844 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
845 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
846 label.invalid_name = Invalid name
847 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
848 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
849 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
850 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
851 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
852 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
853 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
854 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
855 label.feature_type = Feature Type
856 label.show = Show
857 label.service_url = Service URL
858 label.copied_sequences = Copied sequences
859 label.cut_sequences = Cut Sequences
860 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
861 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
862 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
863 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
864 label.save_features_to_file = Save Features to File
865 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
866 label.save_pdb_file = Save PDB File
867 label.save_text_to_file = Save Text to File
868 label.save_state = Save State
869 label.restore_state = Restore State
870 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
871 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
872 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
873 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
874 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
875 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
876 label.select_startup_file = Select startup file
877 label.select_default_browser = Select default web browser
878 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
879 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
880 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
881 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
882 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
883 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
884 label.save_as_html = Save as HTML
885 label.recently_opened = Recently Opened
886 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
887 label.tree = Tree
888 label.tree_from = Tree from {0}
889 label.webservice_job_title = {0} using {1}
890 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
891 label.visible = Visible
892 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
893 label.visible_region_of = visible region of
894 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
895 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
896 label.loading_file = Loading File: {0}
897 label.edit_params = Edit {0}
898 label.as_percentage = As Percentage
899 error.not_implemented = Not implemented
900 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
901 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
902 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
903 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
904 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
905 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
906 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
907 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
908 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
909 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
910 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
911 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
912 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
913 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
914 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
915 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
916 error.implementation_error = Implementation error
917 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
918 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
919 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
920 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
921 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
922 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
923 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
924 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
925 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
926 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
927 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
928 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
929 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
930 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
931 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
932 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
933 label.cancelled_params = Cancelled {0}
934 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
935 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
936 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
937 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
938 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
939 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
940 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
941 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
942 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
943 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
944 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
945 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
946 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
947 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
948 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
949 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
950 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
951 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
952 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
953 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
954 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
955 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
956 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
957 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
958 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
959 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
960 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
961 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
962 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
963 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
964 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
965 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
966 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
967 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
968 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
969 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
970 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
971 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
972 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
973 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
974 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
975 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
976 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
977 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
978 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
979 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
980 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
981 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
982 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
983 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
984 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
985 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
986 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
987 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
988 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
989 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
990 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
991 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
992 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
993 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
994 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
995 label.toggled = Toggled
996 label.marked = Marked
997 label.containing = containing
998 label.not_containing = not containing
999 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1000 label.submission_params = Submission {0}
1001 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1002 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1003 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1004 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1005 label.pca_calculating = Calculating PCA
1006 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1007 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1008 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1009 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1010 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1011 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1012 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1013 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1014 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1015 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1016 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1017 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1018 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1019 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1020 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1021 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1022 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1023 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1024 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1025 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1026 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1027 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1028 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1029 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1030 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1031 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1032 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1033 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1034 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1035 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1036 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1037 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1038 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1039 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1040 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1041 label.mapped = mapped
1042 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1043 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1044 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1045 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1046 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1047 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1048 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1049 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1050 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1051 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1052 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1053 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1054 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1055 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1056 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1057 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1058 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1059 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1060 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1061 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1062 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1063 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1064 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1065 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1066 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1067 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1068 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1069 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1070 label.remove_gaps = Remove Gaps
1071 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1072 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1073 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1074 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1075 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1076 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1077 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1078 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1079 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1080 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1081 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1082 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1083 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1084 warn.service_not_supported = Service not supported!
1085 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1086 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1087 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1088 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1089 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1090 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1091 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1092 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1093 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1094 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1095 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1096 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1097 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1098 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1099 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1100 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1101 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1102 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1103 label.eps_file = EPS file
1104 label.png_image = PNG image
1105 status.saving_file = Saving {0}
1106 status.export_complete = {0} Export completed.
1107 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1108 status.refreshing_news = Refreshing news
1109 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1110 status.opening_params = Opening {0}
1111 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1112 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1113 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1114 status.finshed_querying = Finished querying
1115 status.parsing_results = Parsing results.
1116 status.processing = Processing...
1117 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1118 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1119 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1120 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1121 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1122 status.opening_file_for = opening file for
1123 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1124 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1125 label.font_too_small = Font size is too small
1126 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1127 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1128 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1129 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1130 label.out_of_memory = Out of memory
1131 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1132 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1133 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1134 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1135 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1136 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1137 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1138 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1139 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1140 label.test_server = Test Server?
1141 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1142 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1143 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1144 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1145 label.file_already_exists = File exists
1146 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1147 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1148 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1149 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1150 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1151 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1152 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1153 label.delete_all = Delete all sequences
1154 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1155 label.add_annotations_for = Add annotations for
1156 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1157 label.choose_annotations = Choose Annotations
1158 label.find = Find
1159 label.invalid_search = Search string invalid
1160 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1161 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1162 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1163 label.show_group_logo = Show Group Logo
1164 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1165 label.show_histogram = Show Histogram
1166 label.show_logo = Show Logo
1167 label.normalise_logo = Normalise Logo
1168 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1169 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1170 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1171 label.open_split_window = Open split window
1172 action.no = No
1173 action.yes = Yes
1174 label.for = for
1175 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1176 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1177 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1178 label.alpha_helix = Alpha Helix
1179 label.beta_strand = Beta Strand
1180 label.turn = Turn
1181 label.select_all = Select All
1182 label.structures_filter = Structures Filter
1183 label.search_filter = Search Filter
1184 label.include_description= Include Description
1185 action.back = Back
1186 label.hide_insertions = Hide Insertions
1187 label.mark_as_representative = Mark as representative
1188 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1189 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1190 label.result = result
1191 label.results = results
1192 label.structure_chooser = Structure Chooser
1193 label.invert = Invert 
1194 label.select_pdb_file = Select PDB File
1195 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1196 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1197 label.search_result = Search Result
1198 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1199 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1200 label.start_jalview = Start Jalview
1201 label.biojs_html_export = BioJS
1202 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1203 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1204 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1205 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1206 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1207 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1208 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1209 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1210 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1211 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1212 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1213 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1214 action.export_groups = Export Groups
1215 action.export_annotations = Export Annotations
1216 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1217 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1218 action.export_features = Export Features
1219 label.export_settings = Export Settings
1220 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1221 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1222 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1223 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1224 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1225 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1226 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1227 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1228 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1229 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1230 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1231 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1232 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1233 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1234 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1235 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1236 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1237 label.run_groovy = Run Groovy console script
1238 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1239 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1240 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1241 action.next_page= >> 
1242 action.prev_page= << 
1243 label.next_page_tooltip=Next Page
1244 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1245 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1246 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1247 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1248 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1249 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1250 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1251 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1252 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1253 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1254 label.column = Column
1255 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1256 label.operation_failed = Operation failed
1257 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1258 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1259 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1260 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1261 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1262 action.customfilter = Custom only
1263 action.showall = Show All
1264 label.insert = Insert:
1265 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1266 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1267 label.primary = Double Click
1268 label.inmenu = In Menu
1269 label.id = ID
1270 label.database = Database
1271 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1272 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1273 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1274 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1275 label.urllinks = Links
1276 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1277 label.togglehidden = Show hidden regions
1278 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1279 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1280 label.consensus_descr = PID
1281 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1282 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1283 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1284 label.show_experimental = Enable experimental features
1285 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1286 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1287 label.overview_settings = Overview settings
1288 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1289 label.gap_colour = Gap colour:
1290 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1291 label.hidden_colour = Hidden colour:
1292 label.select_gap_colour = Select gap colour
1293 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1294 label.overview = Overview
1295 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1296 label.oview_calc = Recalculating overview...
1297 label.feature_details = Feature details
1298 label.matchCondition_contains = Contains
1299 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1300 label.matchCondition_matches = Matches
1301 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1302 label.matchCondition_present = Is present
1303 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1304 label.matchCondition_eq = =
1305 label.matchCondition_ne = not =
1306 label.matchCondition_lt = <
1307 label.matchCondition_le = <=
1308 label.matchCondition_gt = >
1309 label.matchCondition_ge = >=
1310 label.numeric_required = The value should be numeric
1311 label.filter = Filter
1312 label.filters = Filters
1313 label.join_conditions = Join conditions with
1314 label.score = Score
1315 label.colour_by_label = Colour by label
1316 label.variable_colour = Variable colour...
1317 label.select_colour = Select colour
1318 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1319 option.autosearch = Autosearch
1320 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1321 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1322 label.simple = Simple
1323 label.simple_colour = Simple Colour
1324 label.colour_by_text = Colour by text
1325 label.graduated_colour = Graduated Colour
1326 label.by_text_of = By text of
1327 label.by_range_of = By range of
1328 label.or = Or
1329 label.and = And
1330 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1331 label.best_quality = Best Quality
1332 label.best_resolution = Best Resolution
1333 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1334 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1335 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1336 label.cached_structures = Cached Structures
1337 label.free_text_search = Free Text Search
1338 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1339 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1340 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1341 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1342 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1343 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1344 label.backups = Backups
1345 label.backup = Backup
1346 label.backup_files = Backup Files
1347 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1348 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1349 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1350 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1351 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1352 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1353 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1354 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1355 label.keep_files = Deleting old backup files
1356 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1357 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1358 label.autodelete_old_backup_files = Autodelete old backup files:
1359 label.always_ask = Always ask
1360 label.auto_delete = Automatically delete
1361 label.filename = filename
1362 label.braced_oldest = (oldest)
1363 label.braced_newest = (most recent)
1364 label.configuration = Configuration
1365 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1366 label.schemes = Schemes
1367 label.customise = Customise
1368 label.default = Default
1369 label.single_file = Single backup
1370 label.keep_all_versions = Keep all versions
1371 label.rolled_backups = Rolled backup files
1372 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1373 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1374 label.include_backup_files = Include backup files
1375 label.cancel_changes = Cancel changes
1376 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1377 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1378 label.was_previous = was {0}
1379 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1380 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1381 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1382 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1383 label.delete = Delete
1384 label.rename = Rename
1385 label.keep = Keep
1386 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1387 label.annotation_name = Annotation Name
1388 label.annotation_description = Annotation Description 
1389 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1390 label.alignment = alignment
1391 label.pca = PCA
1392 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1393 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1394 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu