Merge branch 'develop' into trialMerge
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.expand_views = Expand Views
36 action.gather_views = Gather Views
37 action.page_setup = Page Setup...
38 action.reload = Reload
39 action.load = Load
40 action.open = Open
41 action.cancel = Cancel
42 action.create = Create
43 action.update = Update
44 action.delete = Delete
45 action.clear = Clear
46 action.accept = Accept
47 action.select_ddbb = --- Select Database ---
48 action.undo = Undo
49 action.redo = Redo
50 action.reset = Reset
51 action.remove_left = Remove left
52 action.remove_right = Remove right
53 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
54 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
55 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
56 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
57 action.boxes = Boxes
58 action.text = Text
59 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
60 action.by_id = By Id
61 action.by_length = By Length
62 action.by_group = By Group
63 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
64 action.set_as_reference = Set as Reference 
65 action.remove = Remove
66 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
67 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
68 action.user_defined = User Defined...
69 action.by_conservation = By Conservation
70 action.wrap = Wrap
71 action.show_gaps = Show Gaps
72 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
73 action.find = Find
74 action.undefine_groups = Undefine Groups
75 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
76 action.copy = Copy
77 action.cut = Cut
78 action.font = Font...
79 action.scale_above = Scale Above
80 action.scale_left = Scale Left
81 action.scale_right = Scale Right
82 action.by_tree_order = By Tree Order
83 action.sort = Sort
84 action.calculate_tree = Calculate Tree...
85 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
86 action.help = Help
87 action.by_annotation = By Annotation...
88 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
89 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
90 action.show = Show
91 action.hide = Hide
92 action.ok = OK
93 action.set_defaults = Defaults
94 action.create_group = Create Group
95 action.remove_group = Remove Group
96 action.edit_group = Edit Group
97 action.border_colour = Border colour
98 action.edit_new_group = Edit New Group
99 action.hide_sequences = Hide Sequences
100 action.sequences = Sequences
101 action.ids = IDS
102 action.ids_sequences = IDS and sequences
103 action.reveal_all = Reveal All
104 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
105 action.find_all = Find all
106 action.find_next = Find next
107 action.file = File
108 action.view = View
109 action.annotations = Annotations
110 action.change_params = Change Parameters
111 action.apply = Apply
112 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
113 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
114 action.by_chain = By Chain
115 action.by_sequence = By Sequence
116 action.paste_annotations = Paste Annotations
117 action.format = Format
118 action.select = Select
119 action.new_view = New View
120 action.close = Close
121 action.add = Add
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.change_font = Change Font
125 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
126 action.colour = Colour
127 action.calculate = Calculate
128 action.select_all = Select all
129 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
130 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
131 action.deselect_all = Deselect all
132 action.invert_selection = Invert selection
133 action.using_jmol = Using Jmol
134 action.link = Link
135 action.group_link = Group Link
136 action.show_chain = Show Chain
137 action.show_group = Show Group
138 action.fetch_db_references = Fetch DB References
139 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
140 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
141 label.structures_manager = Structures Manager
142 label.url = URL
143 label.url\: = URL:
144 label.input_file_url = Enter URL or Input File
145 label.select_feature = Select feature
146 label.name = Name
147 label.name\: = Name:
148 label.name_param = Name: {0}
149 label.group = Group
150 label.group\: = Group:
151 label.group_name = Group Name
152 label.group_description = Group Description
153 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
154 label.colour = Colour:
155 label.description = Description
156 label.description\: = Description:
157 label.start = Start:
158 label.end = End:
159 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
160 label.service_action = Service Action:
161 label.post_url = POST URL:
162 label.url_suffix = URL Suffix
163 label.per_seq = per Sequence
164 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
165 label.amend = Amend
166 label.undo_command = Undo {0}
167 label.redo_command = Redo {0}
168 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
169 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
170 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
171 label.choose_calculation = Choose Calculation
172 label.calc_title = {0} Using {1}
173 label.tree_calc_av = Average Distance
174 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
175 label.score_model_pid = % Identity
176 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
177 label.score_model_pam250 = PAM 250
178 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
179 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
180 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
181 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
182 label.status_bar = Status bar
183 label.out_to_textbox = Output to Textbox
184 label.occupancy = Occupancy
185 # delete Clustal - use FileFormat name instead
186 label.clustal = Clustal
187 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
188 label.colourScheme_clustal = Clustalx
189 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
190 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
191 label.colourScheme_zappo = Zappo
192 label.colourScheme_taylor = Taylor
193 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
194 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
195 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
196 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
197 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
198 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
199 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
200 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
201 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
202 label.colourScheme_sequence_id = Sequence ID Colour
203 label.blc = BLC
204 label.fasta = Fasta
205 label.msf = MSF
206 label.pfam = PFAM
207 label.pileup = Pileup
208 label.pir = PIR
209 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
210 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
211 label.show_annotations = Show annotations
212 label.hide_annotations = Hide annotations
213 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
214 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
215 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
216 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
217 label.hide_all = Hide all
218 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
219 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
220 label.colour_text = Colour Text
221 label.show_non_conserved = Show nonconserved
222 label.overview_window = Overview Window
223 label.none = None
224 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
225 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
226 label.nucleotide = Nucleotide
227 label.protein = Protein
228 label.nucleotides = Nucleotides
229 label.proteins = Proteins
230 label.to_new_alignment = To New Alignment
231 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
232 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
233 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
234 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
235 label.input_from_textbox = Input from textbox
236 label.centre_column_labels = Centre column labels
237 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
238 label.documentation = Documentation
239 label.about = About...
240 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
241 action.feature_settings = Feature Settings...
242 label.all_columns = All Columns
243 label.all_sequences = All Sequences
244 label.selected_columns = Selected Columns 
245 label.selected_sequences = Selected Sequences
246 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
247 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
248 label.selected_region = Selected Region
249 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
250 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
251 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
252 label.group_consensus = Group Consensus
253 label.group_conservation = Group Conservation
254 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
255 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
256 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
257 label.apply_all_groups = Apply to all groups
258 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
259 label.show_first = Show first
260 label.show_last = Show last
261 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
262 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
263 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
264 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
265 label.structure_viewer = Default structure viewer
266 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
267 label.chimera_path = Path to Chimera program
268 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
269 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
270 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
271 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
272 label.min_colour = Minimum Colour
273 label.max_colour = Maximum Colour
274 label.no_colour = No Colour
275 label.use_original_colours = Use Original Colours
276 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
277 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
278 label.selection = Selection
279 label.group_colour = Group Colour
280 label.sequence = Sequence
281 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
282 label.min_value = Min value
283 label.max_value = Max value
284 label.no_value = No value
285 label.new_feature = New Feature
286 label.match_case = Match Case
287 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
288 label.labels = Labels
289 label.output_values = Output Values...
290 label.output_points = Output points...
291 label.output_transformed_points = Output transformed points
292 label.input_data = Input Data...
293 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
294 label.protein_matrix = Protein matrix
295 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
296 label.show_distances = Show distances
297 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
298 label.fit_to_window = Fit To Window
299 label.newick_format = Newick Format
300 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
301 label.colours = Colours
302 label.view_mapping = View Mapping
303 label.wireframe = Wireframe
304 label.depthcue = Depthcue
305 label.z_buffering = Z Buffering
306 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
307 label.all_chains_visible = All Chains Visible
308 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
309 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
310 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
311 label.removed_columns = Removed {0} columns.
312 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
313 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
314 label.order_by_params = Order by {0}
315 label.html_content = <html>{0}</html>
316 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
317 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
318 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
319 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
320 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
321 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
322 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
323 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
324 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
325 label.paste_your = Paste your
326 label.finished_searching = Finished searching
327 label.search_results= Search results {0} : {1}
328 label.found_match_for = Found match for {0}
329 label.font = Font:
330 label.size = Size:
331 label.style = Style:
332 label.calculating = Calculating....
333 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
334 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
335 label.set_this_label_text = set this label text
336 label.sequences_from = Sequences from {0}
337 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
338 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
339 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
340 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
341 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
342 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
343 label.source_to_target = {0} ... {1}
344 label.per_sequence_only= Per-sequence only
345 label.to_file = to File
346 label.to_textbox = to Textbox
347 label.jalview = Jalview
348 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
349 label.status = Status
350 label.channels = Channels
351 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
352 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
353 label.session_update = Session Update
354 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
355 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
356 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
357 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
358 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
359 label.groovy_console = Groovy Console...
360 label.lineart = Lineart
361 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
362 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
363 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
364 label.invert_selection = Invert Selection
365 label.optimise_order = Optimise Order
366 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
367 label.load_colours = Load Colours
368 label.save_colours = Save Colours
369 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
370 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
371 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
372 label.database_param = Database: {0}
373 label.example = Example
374 label.example_param = Example: {0}
375 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
376 label.file_format_not_specified = File format not specified
377 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
378 label.error_saving_file = Error Saving File
379 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
380 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
381 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
382 label.invalid_selection = Invalid Selection
383 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
384 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
385 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
386 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
387 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
388 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
389 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
390 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
391 label.translation_failed = Translation Failed
392 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
393 label.implementation_error  = Implementation error:
394 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
395 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
396 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
397 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
398 label.view_name_original = Original
399 label.enter_view_name = Enter View Name
400 label.enter_label = Enter label
401 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
402 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
403 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
404 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
405 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
406 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
407 label.error_parsing_text = Error parsing text
408 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
409 label.input_alignment = Input Alignment
410 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
411 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
412 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
413 label.url_not_found = URL not found
414 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
415 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
416 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
417 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
418 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
419 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
420 label.invalid_url = Invalid URL !
421 label.error_loading_file = Error loading file
422 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
423 label.file_open_error = File open error
424 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
425 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
426 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
427 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
428 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
429 label.alignment_props = Alignment Properties
430 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
431 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
432 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
433 label.annotations = Annotations
434 label.structure_options = Structure Options
435 label.features = Features
436 label.overview_params = Overview {0}
437 label.paste_newick_file = Paste Newick file
438 label.load_tree_from_file = From File - 
439 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
440 label.selection_output_command = Selection output - {0}
441 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
442 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
443 label.pca_details = PCA details
444 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
445 label.user_defined_colours = User defined colours
446 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
447 label.jaview_build_date = Build date: {0}
448 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
449 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
450 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
451 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
452 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
453 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
454 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
455 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
456 label.right_click = Right click
457 label.to_add_annotation = to add annotation
458 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
459 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
460 label.label = Label
461 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
462 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
463 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
464 label.calculating_pca= Calculating PCA
465 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
466 label.jalview_applet = Jalview applet
467 label.loading_data = Loading data
468 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
469 label.calculating_tree = Calculating tree
470 label.state_queueing = queuing
471 label.state_running = running
472 label.state_completed = finished
473 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
474 label.state_job_error = job error!
475 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
476 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
477 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
478 label.structure_type = Structure type
479 label.settings_for_type = Settings for {0}
480 label.view_full_application = View in Full Application
481 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
482 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
483 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
484 label.load_vcf_file = Load VCF File
485 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
486 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
487 label.export_features = Export Features...
488 label.export_annotations = Export Annotations...
489 label.to_upper_case = To Upper Case
490 label.to_lower_case = To Lower Case
491 label.toggle_case = Toggle Case
492 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
493 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
494 label.edit_sequence = Edit Sequence
495 label.edit_sequences = Edit Sequences
496 label.insert_gap = Insert 1 gap
497 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
498 label.delete_gap = Delete 1 gap
499 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
500 label.sequence_details = Sequence Details
501 label.jmol_help = Jmol Help
502 label.chimera_help = Chimera Help
503 label.close_viewer = Close Viewer
504 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
505 label.all = All
506 label.sort_by = Sort alignment by
507 label.sort_by_score = Sort by Score
508 label.sort_by_density = Sort by Density
509 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
510 label.sort_ann_by = Sort annotations by
511 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
512 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
513 label.reveal = Reveal
514 label.hide_columns = Hide Columns
515 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
516 label.load_tree_file = Load a tree file
517 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
518 label.standard_databases = Standard Databases
519 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
520 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
521 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
522 label.connect_to_session = Connect to session {0}
523 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
524 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
525 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
526 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
527 label.adjust_threshold = Adjust threshold
528 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
529 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
530 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
531 label.open_url_param = Open URL {0}
532 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
533 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
534 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
535 label.dark_colour = Dark Colour
536 label.light_colour = Light Colour
537 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
538 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
539 label.copy_format_from = Copy format from
540 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
541 label.select_all_views = Select all views
542 label.select_many_views = Select many views
543 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
544 label.open_local_file = Open local file
545 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
546 label.listen_for_selections = Listen for selections
547 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
548 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
549 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
550 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
551 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
552 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
553 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
554 label.no_services = <No Services>
555 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
556 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
557 label.connect_to = Connect to
558 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
559 label.from_url = from URL
560 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
561 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
562 label.from_textbox = from Textbox
563 label.window = Window
564 label.preferences = Preferences
565 label.tools = Tools
566 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
567 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
568 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
569 label.collect_garbage = Collect Garbage
570 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
571 label.show_java_console = Show Java Console
572 label.show_jalview_news = Show Jalview News
573 label.take_snapshot = Take snapshot
574 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
575 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
576 label.monospaced_font= Monospaced
577 label.quality = Quality
578 label.maximize_window = Maximize Window
579 label.conservation = Conservation
580 label.consensus = Consensus
581 label.histogram = Histogram
582 label.logo = Logo
583 label.non_positional_features = List Non-positional Features
584 label.database_references = List Database References
585 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
586 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
587 label.gap_symbol = Gap Symbol
588 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
589 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
590 label.address = Address
591 label.port = Port
592 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
593 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
594 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
595 label.check_for_latest_version = Check for latest version
596 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
597 label.use_proxy_server = Use a proxy server
598 label.rendering_style = {0} rendering style
599 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
600 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
601 label.smooth_font = Smooth Font
602 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
603 label.pad_gaps = Pad Gaps
604 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
605 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
606 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
607 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
608 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
609 label.right_align_ids = Right Align Ids
610 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
611 label.open_overview = Open Overview
612 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
613 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
614 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
615 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
616 label.visual = Visual
617 label.connections = Connections
618 label.output = Output
619 label.editing = Editing
620 label.web_services = Web Services
621 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
622 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
623 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
624 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
625 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
626 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
627 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
628 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
629 label.new_service_url = New Service URL
630 label.edit_service_url = Edit Service URL
631 label.delete_service_url = Delete Service URL
632 label.details = Details
633 label.options = Options
634 label.parameters = Parameters
635 label.proxy_server = Proxy Server
636 label.file_output = File Output
637 label.select_input_type = Select input type
638 label.set_options_for_type = Set options for type
639 label.data_input_parameters = Data input parameters
640 label.data_returned_by_service = Data returned by service
641 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
642 label.parsing_errors = Parsing errors
643 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
644 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
645 label.input_parameter_name = Input Parameter name
646 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
647 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
648 label.brief_description_service = Brief description of service
649 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
650 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
651 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
652 label.gap_character = Gap character
653 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
654 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
655 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
656 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
657 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
658 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
659 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
660 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
661 label.input_output = Input/Output
662 label.cut_paste = Cut'n'Paste
663 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
664 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
665 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
666 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
667 label.from_file = From File
668 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
669 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
670 label.text_colour = Text Colour...
671 label.structure = Structure
672 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
673 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
674 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
675 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
676 label.sequence_name = Sequence Name
677 label.sequence_description = Sequence Description
678 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
679 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
680 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
681 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
682 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
683 label.web_browser_not_found = Web browser not found
684 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
685 label.html = HTML
686 label.wrap = Wrap
687 label.show_database_refs = Show Database Refs
688 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
689 label.save_png_image = Save As PNG Image
690 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
691 label.export_image = Export Image
692 label.vamsas_store = VAMSAS store
693 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
694 label.reverse = Reverse
695 label.reverse_complement = Reverse Complement
696 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
697 label.extract_scores = Extract Scores
698 label.get_cross_refs = Get Cross-References
699 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
700 label.add_sequences = Add Sequences
701 label.new_window = New Window
702 label.split_window = Split Window
703 label.set_as_default = Set as Default
704 label.show_labels = Show labels
705 action.background_colour = Background Colour...
706 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
707 label.link_name = Link Name
708 label.pdb_file = PDB file
709 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
710 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
711 label.superpose_structures = Superpose Structures
712 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
713 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
714 label.jmol = Jmol
715 label.chimera = Chimera
716 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
717 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
718 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
719 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
720 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
721 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
722 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
723 label.case_sensitive = Case Sensitive
724 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
725 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
726 label.index_by_host = Index by Host
727 label.index_by_type = Index by Type
728 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
729 label.display_warnings = Display Warnings
730 label.move_url_up = Move URL Up
731 label.move_url_down = Move URL Down
732 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
733 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
734 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
735 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
736 label.sequences_updated = Sequences updated
737 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
738 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
739 label.paste_new_window = Paste To New Window
740 label.settings_for_param = Settings for {0}
741 label.view_params = View {0}
742 label.aacon_calculations = AACon Calculations
743 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
744 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
745 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
746 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
747 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
748 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
749 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
750 label.all_views = All Views
751 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
752 label.realign_with_params = Realign with {0}
753 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
754 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
755 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
756 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
757 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
758 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
759 label.view_documentation = View documentation
760 label.select_return_type = Select return type
761 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
762 label.features_for_params = Features for - {0}
763 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
764 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
765 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
766 label.varna_params = VARNA - {0}
767 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
768 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
769 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
770 label.points_for_params = Points for {0}
771 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
772 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
773 label.select_background_colour = Select Background Colour
774 label.invalid_font = Invalid Font
775 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
776 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
777 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
778 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
779 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
780 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
781 label.example_query_param = Example query: {0}
782 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
783 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
784 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
785 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
786 label.select_columns_containing = Select columns containing
787 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
788 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
789 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
790 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
791 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
792 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
793 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
794 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
795 label.use_sequence_id_4 = 
796 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
797 label.switch_server = Switch server
798 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
799 label.services_at = Services at {0}
800 label.rest_client_submit = {0} using {1}
801 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
802 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
803 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
804 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
805 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
806 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
807 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
808 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
809 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
810 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
811 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
812 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
813 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
814 label.user_preset = User Preset
815 label.service_preset = Service Preset
816 label.run_with_preset = Run {0} with preset
817 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
818 action.by_title_param = By {0}
819 label.source_from_db_source = Sources from {0}
820 label.from_msname = from {0}
821 label.superpose_with = Superpose with
822 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
823 label.add_new_row = Add New Row
824 label.edit_label_description = Edit Label/Description
825 label.hide_row = Hide This Row
826 label.delete_row = Delete This Row
827 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
828 label.export_annotation = Export Annotation
829 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
830 label.helix = Helix
831 label.sheet = Sheet
832 label.rna_helix = RNA Helix
833 label.remove_annotation = Remove Annotation
834 label.colour_by = Colour by...
835 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
836 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
837 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
838 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
839 label.multiharmony = Multi-Harmony
840 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
841 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
842 label.prompt_each_time = Prompt each time
843 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
844 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
845 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
846 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
847 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
848 label.invalid_name = Invalid name
849 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
850 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
851 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
852 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
853 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
854 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
855 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
856 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
857 label.feature_type = Feature Type
858 label.show = Show
859 label.service_url = Service URL
860 label.copied_sequences = Copied sequences
861 label.cut_sequences = Cut Sequences
862 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
863 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
864 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
865 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
866 label.save_features_to_file = Save Features to File
867 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
868 label.save_pdb_file = Save PDB File
869 label.save_text_to_file = Save Text to File
870 label.save_state = Save State
871 label.restore_state = Restore State
872 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
873 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
874 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
875 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
876 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
877 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
878 label.select_startup_file = Select startup file
879 label.select_default_browser = Select default web browser
880 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
881 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
882 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
883 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
884 label.save_as_html = Save as HTML
885 label.recently_opened = Recently Opened
886 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
887 label.tree = Tree
888 label.tree_from = Tree from {0}
889 label.webservice_job_title = {0} using {1}
890 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
891 label.visible = Visible
892 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
893 label.visible_region_of = visible region of
894 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
895 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
896 label.loading_file = Loading File: {0}
897 label.edit_params = Edit {0}
898 label.as_percentage = As Percentage
899 error.not_implemented = Not implemented
900 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
901 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
902 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
903 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
904 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
905 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
906 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
907 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
908 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
909 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
910 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
911 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
912 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
913 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
914 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
915 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
916 error.implementation_error = Implementation error
917 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
918 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
919 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
920 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
921 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
922 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
923 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
924 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
925 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
926 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
927 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
928 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
929 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
930 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
931 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
932 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
933 label.cancelled_params = Cancelled {0}
934 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
935 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
936 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
937 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
938 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
939 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
940 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
941 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
942 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
943 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
944 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
945 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
946 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
947 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
948 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
949 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
950 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
951 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
952 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
953 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
954 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
955 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
956 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
957 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
958 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
959 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
960 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
961 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
962 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
963 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
964 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
965 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
966 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
967 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
968 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
969 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
970 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
971 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
972 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
973 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
974 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
975 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
976 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
977 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
978 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
979 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
980 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
981 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
982 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
983 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
984 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
985 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
986 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
987 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
988 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
989 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
990 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
991 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
992 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
993 label.toggled = Toggled
994 label.marked = Marked
995 label.containing = containing
996 label.not_containing = not containing
997 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
998 label.submission_params = Submission {0}
999 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1000 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1001 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1002 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1003 label.pca_calculating = Calculating PCA
1004 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1005 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1006 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1007 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1008 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1009 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1010 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1011 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1012 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1013 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1014 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1015 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1016 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1017 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1018 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1019 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1020 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1021 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1022 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1023 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1024 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1025 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1026 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1027 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1028 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1029 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1030 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1031 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1032 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1033 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1034 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1035 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1036 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1037 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1038 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1039 label.mapped = mapped
1040 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1041 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1042 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1043 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1044 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1045 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1046 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1047 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1048 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1049 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1050 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1051 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1052 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1053 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1054 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1055 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1056 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1057 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1058 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1059 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1060 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1061 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1062 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1063 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1064 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1065 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1066 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1067 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1068 label.remove_gaps = Remove Gaps
1069 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1070 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1071 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1072 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1073 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1074 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1075 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1076 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1077 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1078 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1079 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1080 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1081 warn.service_not_supported = Service not supported!
1082 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1083 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1084 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1085 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1086 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1087 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1088 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1089 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1090 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1091 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1092 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1093 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1094 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1095 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1096 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1097 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1098 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1099 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1100 label.eps_file = EPS file
1101 label.png_image = PNG image
1102 status.export_complete = {0} Export completed
1103 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1104 status.refreshing_news = Refreshing news
1105 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1106 status.opening_params = Opening {0}
1107 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1108 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1109 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1110 status.finshed_querying = Finished querying
1111 status.parsing_results = Parsing results.
1112 status.processing = Processing...
1113 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1114 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1115 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1116 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1117 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1118 status.opening_file_for = opening file for
1119 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1120 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1121 label.font_too_small = Font size is too small
1122 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1123 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1124 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1125 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1126 label.out_of_memory = Out of memory
1127 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1128 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1129 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1130 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1131 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1132 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1133 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1134 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1135 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1136 label.test_server = Test Server?
1137 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1138 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1139 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1140 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1141 label.file_already_exists = File exists
1142 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1143 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1144 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1145 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1146 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1147 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1148 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1149 label.delete_all = Delete all sequences
1150 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1151 label.add_annotations_for = Add annotations for
1152 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1153 label.choose_annotations = Choose Annotations
1154 label.find = Find
1155 label.invalid_search = Search string invalid
1156 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1157 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1158 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1159 label.show_group_logo = Show Group Logo
1160 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1161 label.show_histogram = Show Histogram
1162 label.show_logo = Show Logo
1163 label.normalise_logo = Normalise Logo
1164 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1165 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1166 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1167 label.open_split_window = Open split window
1168 action.no = No
1169 action.yes = Yes
1170 label.for = for
1171 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1172 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1173 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1174 label.alpha_helix = Alpha Helix
1175 label.beta_strand = Beta Strand
1176 label.turn = Turn
1177 label.select_all = Select All
1178 label.structures_filter = Structures Filter
1179 label.search_filter = Search Filter
1180 label.include_description= Include Description
1181 action.back = Back
1182 label.hide_insertions = Hide Insertions
1183 label.mark_as_representative = Mark as representative
1184 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1185 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1186 label.result = result
1187 label.results = results
1188 label.structure_chooser = Structure Chooser
1189 label.invert = Invert 
1190 label.select_pdb_file = Select PDB File
1191 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1192 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1193 label.search_result = Search Result
1194 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1195 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1196 label.start_jalview = Start Jalview
1197 label.biojs_html_export = BioJS
1198 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1199 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1200 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1201 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1202 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1203 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1204 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1205 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1206 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1207 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1208 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1209 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1210 action.export_groups = Export Groups
1211 action.export_annotations = Export Annotations
1212 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1213 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1214 action.export_features = Export Features
1215 label.export_settings = Export Settings
1216 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1217 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1218 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1219 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1220 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1221 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1222 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1223 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1224 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1225 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1226 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1227 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1228 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1229 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1230 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1231 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1232 label.run_groovy = Run Groovy console script
1233 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1234 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1235 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1236 action.next_page= >> 
1237 action.prev_page= << 
1238 label.next_page_tooltip=Next Page
1239 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1240 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1241 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1242 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1243 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1244 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1245 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1246 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1247 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1248 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1249 label.column = Column
1250 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1251 label.operation_failed = Operation failed
1252 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1253 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1254 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1255 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1256 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1257 action.customfilter = Custom only
1258 action.showall = Show All
1259 label.insert = Insert:
1260 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1261 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1262 label.primary = Double Click
1263 label.inmenu = In Menu
1264 label.id = ID
1265 label.database = Database
1266 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1267 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1268 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1269 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1270 label.urllinks = Links
1271 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1272 label.togglehidden = Show hidden regions
1273 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1274 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1275 label.consensus_descr = PID
1276 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1277 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1278 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1279 label.show_experimental = Enable experimental features
1280 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1281 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1282 label.overview_settings = Overview settings
1283 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1284 label.gap_colour = Gap colour:
1285 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1286 label.hidden_colour = Hidden colour:
1287 label.select_gap_colour = Select gap colour
1288 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1289 label.overview = Overview
1290 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1291 label.oview_calc = Recalculating overview...
1292 label.feature_details = Feature details
1293 label.matchCondition_contains = Contains
1294 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1295 label.matchCondition_matches = Matches
1296 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1297 label.matchCondition_present = Is present
1298 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1299 label.matchCondition_eq = =
1300 label.matchCondition_ne = not =
1301 label.matchCondition_lt = <
1302 label.matchCondition_le = <=
1303 label.matchCondition_gt = >
1304 label.matchCondition_ge = >=
1305 label.numeric_required = The value should be numeric
1306 label.filter = Filter
1307 label.filters = Filters
1308 label.join_conditions = Join conditions with
1309 label.score = Score
1310 label.colour_by_label = Colour by label
1311 label.variable_colour = Variable colour...
1312 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1313 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1314 option.autosearch = Autosearch
1315 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1316 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1317 label.simple = Simple
1318 label.simple_colour = Simple Colour
1319 label.colour_by_text = Colour by text
1320 label.graduated_colour = Graduated Colour
1321 label.by_text_of = By text of
1322 label.by_range_of = By range of
1323 label.or = Or
1324 label.and = And
1325 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1326 label.best_quality = Best Quality
1327 label.best_resolution = Best Resolution
1328 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1329 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1330 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1331 label.cached_structures = Cached Structures
1332 label.free_text_search = Free Text Search
1333 label.annotation_name = Annotation Name
1334 label.annotation_description = Annotation Description 
1335 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1336 label.alignment = alignment
1337 label.pca = PCA
1338 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1339 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1340 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1341 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1342 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1343 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1344 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1345 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1346 label.backups = Backups
1347 label.backup = Backup
1348 label.backup_files = Backup Files
1349 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1350 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1351 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1352 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1353 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1354 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1355 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1356 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1357 label.keep_files = Deleting old backup files
1358 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1359 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1360 label.autodelete_old_backup_files = Autodelete old backup files:
1361 label.always_ask = Always ask
1362 label.auto_delete = Automatically delete
1363 label.filename = filename
1364 label.braced_oldest = (oldest)
1365 label.braced_newest = (most recent)
1366 label.configuration = Configuration
1367 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1368 label.schemes = Schemes
1369 label.customise = Customise
1370 label.default = Default
1371 label.single_file = Single backup
1372 label.keep_all_versions = Keep all versions
1373 label.rolled_backups = Rolled backup files
1374 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1375 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1376 label.include_backup_files = Include backup files
1377 label.cancel_changes = Cancel changes
1378 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1379 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1380 label.was_previous = was {0}
1381 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1382 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1383 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1384 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1385 label.delete = Delete
1386 label.rename = Rename
1387 label.keep = Keep
1388 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1389 label.annotation_name = Annotation Name
1390 label.annotation_description = Annotation Description 
1391 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1392 label.alignment = alignment
1393 label.pca = PCA
1394 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1395 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1396 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu