JAL-3503 Added a Startup tab in Preferences, with gui for JVMMEMMAX and JVMMEMPC...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 label.quit_jalview = Quit Jalview?
36 action.expand_views = Expand Views
37 action.gather_views = Gather Views
38 action.page_setup = Page Setup...
39 action.reload = Reload
40 action.load = Load
41 action.open = Open
42 action.cancel = Cancel
43 action.create = Create
44 action.update = Update
45 action.delete = Delete
46 action.clear = Clear
47 action.accept = Accept
48 action.select_ddbb = --- Select Database ---
49 action.undo = Undo
50 action.redo = Redo
51 action.reset = Reset
52 action.remove_left = Remove left
53 action.remove_right = Remove right
54 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
55 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
56 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
57 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
58 action.boxes = Boxes
59 action.text = Text
60 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
61 action.by_id = By Id
62 action.by_length = By Length
63 action.by_group = By Group
64 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
65 action.set_as_reference = Set as Reference 
66 action.remove = Remove
67 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
68 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
69 action.user_defined = User Defined...
70 action.by_conservation = By Conservation
71 action.wrap = Wrap
72 action.show_gaps = Show Gaps
73 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
74 action.find = Find
75 action.undefine_groups = Undefine Groups
76 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
77 action.copy = Copy
78 action.cut = Cut
79 action.font = Font...
80 action.scale_above = Scale Above
81 action.scale_left = Scale Left
82 action.scale_right = Scale Right
83 action.by_tree_order = By Tree Order
84 action.sort = Sort
85 action.calculate_tree = Calculate Tree...
86 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
87 action.help = Help
88 action.by_annotation = By Annotation...
89 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
90 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
91 action.show = Show
92 action.hide = Hide
93 action.ok = OK
94 action.set_defaults = Defaults
95 action.create_group = Create Group
96 action.remove_group = Remove Group
97 action.edit_group = Edit Group
98 action.border_colour = Border colour
99 action.edit_new_group = Edit New Group
100 action.hide_sequences = Hide Sequences
101 action.sequences = Sequences
102 action.ids = IDS
103 action.ids_sequences = IDS and sequences
104 action.reveal_all = Reveal All
105 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
106 action.find_all = Find all
107 action.find_next = Find next
108 action.file = File
109 action.view = View
110 action.annotations = Annotations
111 action.change_params = Change Parameters
112 action.apply = Apply
113 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
114 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
115 action.by_chain = By Chain
116 action.by_sequence = By Sequence
117 action.paste_annotations = Paste Annotations
118 action.format = Format
119 action.select = Select
120 action.new_view = New View
121 action.close = Close
122 action.add = Add
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
136 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
137 action.link = Link
138 action.group_link = Group Link
139 action.show_chain = Show Chain
140 action.show_group = Show Group
141 action.fetch_db_references = Fetch DB References
142 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
143 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
144 label.structures_manager = Structures Manager
145 label.url = URL
146 label.url\: = URL:
147 label.input_file_url = Enter URL or Input File
148 label.select_feature = Select feature
149 label.name = Name
150 label.name\: = Name:
151 label.name_param = Name: {0}
152 label.group = Group
153 label.group\: = Group:
154 label.group_name = Group Name
155 label.group_description = Group Description
156 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
157 label.colour = Colour:
158 label.description = Description
159 label.description\: = Description:
160 label.start = Start:
161 label.end = End:
162 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
163 label.service_action = Service Action:
164 label.post_url = POST URL:
165 label.url_suffix = URL Suffix
166 label.per_seq = per Sequence
167 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
168 label.amend = Amend
169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.calc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.score_model_pid = % Identity
179 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
180 label.score_model_pam250 = PAM 250
181 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
182 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
183 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
184 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
185 label.status_bar = Status bar
186 label.out_to_textbox = Output to Textbox
187 label.occupancy = Occupancy
188 # delete Clustal - use FileFormat name instead
189 label.clustal = Clustal
190 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
191 label.colourScheme_clustal = Clustalx
192 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
193 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
194 label.colourScheme_zappo = Zappo
195 label.colourScheme_taylor = Taylor
196 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
197 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
198 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
199 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
200 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
201 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
202 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
203 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
204 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
205 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
206 label.blc = BLC
207 label.fasta = Fasta
208 label.msf = MSF
209 label.pfam = PFAM
210 label.pileup = Pileup
211 label.pir = PIR
212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
225 label.overview_window = Overview Window
226 label.none = None
227 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
228 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
229 label.nucleotide = Nucleotide
230 label.protein = Protein
231 label.nucleotides = Nucleotides
232 label.proteins = Proteins
233 label.CDS = CDS
234 label.to_new_alignment = To New Alignment
235 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
236 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
237 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
238 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
239 label.input_from_textbox = Input from textbox
240 label.centre_column_labels = Centre column labels
241 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
242 label.documentation = Documentation
243 label.about = About...
244 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
245 action.feature_settings = Feature Settings...
246 label.all_columns = All Columns
247 label.all_sequences = All Sequences
248 label.selected_columns = Selected Columns 
249 label.selected_sequences = Selected Sequences
250 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
251 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
252 label.selected_region = Selected Region
253 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
254 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
255 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
256 label.group_consensus = Group Consensus
257 label.group_conservation = Group Conservation
258 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
259 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
260 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
261 label.apply_all_groups = Apply to all groups
262 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
263 label.show_first = Show first
264 label.show_last = Show last
265 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
266 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
267 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
268 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
269 label.structure_viewer = Default structure viewer
270 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
271 label.viewer_path = Path to {0} program
272 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
273 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
274 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
275 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
276 label.min_colour = Minimum Colour
277 label.max_colour = Maximum Colour
278 label.no_colour = No Colour
279 label.use_original_colours = Use Original Colours
280 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
281 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
282 label.selection = Selection
283 label.group_colour = Group Colour
284 label.sequence = Sequence
285 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
286 label.min_value = Min value
287 label.max_value = Max value
288 label.no_value = No value
289 label.new_feature = New Feature
290 label.match_case = Match Case
291 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
292 label.labels = Labels
293 label.output_values = Output Values...
294 label.output_points = Output points...
295 label.output_transformed_points = Output transformed points
296 label.input_data = Input Data...
297 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
298 label.protein_matrix = Protein matrix
299 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
300 label.show_distances = Show distances
301 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
302 label.fit_to_window = Fit To Window
303 label.newick_format = Newick Format
304 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
305 label.colours = Colours
306 label.view_mapping = View Mapping
307 label.wireframe = Wireframe
308 label.depthcue = Depthcue
309 label.z_buffering = Z Buffering
310 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
311 label.all_chains_visible = All Chains Visible
312 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
313 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
314 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
315 label.removed_columns = Removed {0} columns.
316 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
317 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
318 label.order_by_params = Order by {0}
319 label.html_content = <html>{0}</html>
320 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
321 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
322 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
323 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
324 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
325 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
326 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
327 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
328 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
329 label.paste_your = Paste your
330 label.finished_searching = Finished searching
331 label.search_results= Search results {0} : {1}
332 label.found_match_for = Found match for {0}
333 label.font = Font:
334 label.size = Size:
335 label.style = Style:
336 label.calculating = Calculating....
337 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
338 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
339 label.set_this_label_text = set this label text
340 label.sequences_from = Sequences from {0}
341 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
342 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
343 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
344 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
345 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
346 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
347 label.source_to_target = {0} ... {1}
348 label.per_sequence_only= Per-sequence only
349 label.to_file = to File
350 label.to_textbox = to Textbox
351 label.jalview = Jalview
352 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
353 label.status = Status
354 label.channels = Channels
355 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
356 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
357 label.groovy_console = Groovy Console...
358 label.lineart = Lineart
359 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
360 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
361 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
362 label.invert_selection = Invert Selection
363 label.optimise_order = Optimise Order
364 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
365 label.load_colours = Load Colours
366 label.save_colours = Save Colours
367 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
368 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
369 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
370 label.database_param = Database: {0}
371 label.example = Example
372 label.example_param = Example: {0}
373 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
374 label.file_format_not_specified = File format not specified
375 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
376 label.error_saving_file = Error Saving File
377 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
378 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
379 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
380 label.invalid_selection = Invalid Selection
381 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
382 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
383 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
384 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
385 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
386 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
387 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
388 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
389 label.translation_failed = Translation Failed
390 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
391 label.implementation_error  = Implementation error:
392 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
393 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
394 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
395 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
396 label.view_name_original = Original
397 label.enter_view_name = Enter View Name
398 label.enter_label = Enter label
399 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
400 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
401 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
402 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
403 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
404 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
405 label.error_parsing_text = Error parsing text
406 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
407 label.input_alignment = Input Alignment
408 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
409 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
410 label.url_not_found = URL not found
411 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
412 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
413 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
414 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
415 label.invalid_url = Invalid URL !
416 label.error_loading_file = Error loading file
417 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
418 label.file_open_error = File open error
419 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
420 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
421 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
422 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
423 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
424 label.alignment_props = Alignment Properties
425 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
426 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
427 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
428 label.annotations = Annotations
429 label.structure_options = Structure Options
430 label.features = Features
431 label.overview_params = Overview {0}
432 label.paste_newick_file = Paste Newick file
433 label.load_tree_from_file = From File - 
434 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
435 label.selection_output_command = Selection output - {0}
436 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
437 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
438 label.pca_details = PCA details
439 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
440 label.user_defined_colours = User defined colours
441 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
442 label.jaview_build_date = Build date: {0}
443 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
444 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
445 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
446 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
447 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
448 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
449 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
450 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
451 label.right_click = Right click
452 label.to_add_annotation = to add annotation
453 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
454 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
455 label.label = Label
456 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
457 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
458 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
459 label.calculating_pca= Calculating PCA
460 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
461 label.jalview_applet = Jalview applet
462 label.loading_data = Loading data
463 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
464 label.calculating_tree = Calculating tree
465 label.state_queueing = queuing
466 label.state_running = running
467 label.state_completed = finished
468 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
469 label.state_job_error = job error!
470 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
471 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
472 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
473 label.structure_type = Structure type
474 label.settings_for_type = Settings for {0}
475 label.view_full_application = View in Full Application
476 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
477 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
478 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
479 label.load_vcf_file = Load VCF File
480 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
481 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
482 label.export_features = Export Features...
483 label.export_annotations = Export Annotations...
484 label.to_upper_case = To Upper Case
485 label.to_lower_case = To Lower Case
486 label.toggle_case = Toggle Case
487 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
488 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
489 label.edit_sequence = Edit Sequence
490 label.edit_sequences = Edit Sequences
491 label.insert_gap = Insert 1 gap
492 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
493 label.delete_gap = Delete 1 gap
494 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
495 label.sequence_details = Sequence Details
496 label.viewer_help = {0} Help
497 label.close_viewer = Close Viewer
498 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
499 label.all = All
500 label.sort_by = Sort alignment by
501 label.sort_by_score = Sort by Score
502 label.sort_by_density = Sort by Density
503 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
504 label.sort_ann_by = Sort annotations by
505 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
506 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
507 label.reveal = Reveal
508 label.hide_columns = Hide Columns
509 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
510 label.load_tree_file = Load a tree file
511 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
512 label.standard_databases = Standard Databases
513 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
514 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
515 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
516 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
517 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
518 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
519 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
520 label.adjust_threshold = Adjust threshold
521 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
522 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
523 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
524 label.open_url_param = Open URL {0}
525 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
526 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
527 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
528 label.dark_colour = Dark Colour
529 label.light_colour = Light Colour
530 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
531 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
532 label.copy_format_from = Copy format from
533 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
534 label.select_all_views = Select all views
535 label.select_many_views = Select many views
536 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
537 label.open_local_file = Open local file
538 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
539 label.listen_for_selections = Listen for selections
540 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
541 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
542 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
543 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
544 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
545 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
546 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
547 label.no_services = <No Services>
548 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
549 label.from_url = from URL
550 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
551 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
552 label.from_textbox = from Textbox
553 label.window = Window
554 label.preferences = Preferences
555 label.tools = Tools
556 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
557 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
558 label.collect_garbage = Collect Garbage
559 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
560 label.show_java_console = Show Java Console
561 label.show_jalview_news = Show Jalview News
562 label.take_snapshot = Take snapshot
563 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
564 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
565 label.monospaced_font= Monospaced
566 label.quality = Quality
567 label.maximize_window = Maximize Window
568 label.conservation = Conservation
569 label.consensus = Consensus
570 label.histogram = Histogram
571 label.logo = Logo
572 label.non_positional_features = List Non-positional Features
573 label.database_references = List Database References
574 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
575 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
576 label.gap_symbol = Gap Symbol
577 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
578 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
579 label.address = Address
580 label.host = Host
581 label.port = Port
582 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
583 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
584 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
585 label.check_for_latest_version = Check for latest version
586 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
587 label.no_proxy = No proxy servers
588 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
589 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
590 label.auth_required = Authentication required
591 label.username = Username
592 label.password = Password
593 label.proxy_password_required = Proxy password required
594 label.not_stored = not stored in Preferences file
595 label.rendering_style = {0} rendering style
596 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
597 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
598 label.smooth_font = Smooth Font
599 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
600 label.pad_gaps = Pad Gaps
601 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
602 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
603 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
604 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
605 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
606 label.right_align_ids = Right Align Ids
607 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
608 label.open_overview = Open Overview
609 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
610 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
611 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
612 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
613 label.visual = Visual
614 label.connections = Connections
615 label.output = Output
616 label.editing = Editing
617 label.web_services = Web Services
618 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
619 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
620 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
621 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
622 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
623 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
624 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
625 label.new_service_url = New Service URL
626 label.edit_service_url = Edit Service URL
627 label.delete_service_url = Delete Service URL
628 label.details = Details
629 label.options = Options
630 label.parameters = Parameters
631 label.proxy_servers = Proxy Servers
632 label.file_output = File Output
633 label.select_input_type = Select input type
634 label.set_options_for_type = Set options for type
635 label.data_input_parameters = Data input parameters
636 label.data_returned_by_service = Data returned by service
637 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
638 label.parsing_errors = Parsing errors
639 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
640 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
641 label.input_parameter_name = Input Parameter name
642 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
643 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
644 label.brief_description_service = Brief description of service
645 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
646 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
647 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
648 label.gap_character = Gap character
649 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
650 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
651 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
652 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
653 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
654 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
655 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
656 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
657 label.input_output = Input/Output
658 label.cut_paste = Cut'n'Paste
659 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
660 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
661 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
662 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
663 label.from_file = From File
664 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
665 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
666 label.text_colour = Text Colour...
667 label.structure = Structure
668 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
669 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
670 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
671 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
672 label.sequence_name = Sequence Name
673 label.sequence_description = Sequence Description
674 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
675 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
676 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
677 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
678 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
679 label.web_browser_not_found = Web browser not found
680 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
681 label.html = HTML
682 label.wrap = Wrap
683 label.show_database_refs = Show Database Refs
684 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
685 label.save_png_image = Save As PNG Image
686 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
687 label.export_image = Export Image
688 label.vamsas_store = VAMSAS store
689 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
690 label.reverse = Reverse
691 label.reverse_complement = Reverse Complement
692 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
693 label.extract_scores = Extract Scores
694 label.get_cross_refs = Get Cross-References
695 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
696 label.add_sequences = Add Sequences
697 label.new_window = New Window
698 label.split_window = Split Window
699 label.set_as_default = Set as Default
700 label.show_labels = Show labels
701 action.background_colour = Background Colour...
702 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
703 label.link_name = Link Name
704 label.pdb_file = PDB file
705 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
706 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
707 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
708 label.superpose_structures = Superpose Structures
709 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
710 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
711 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
712 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
713 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
714 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
715 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
716 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
717 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
718 label.case_sensitive = Case Sensitive
719 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
720 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
721 label.index_by_host = Index by Host
722 label.index_by_type = Index by Type
723 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
724 label.display_warnings = Display Warnings
725 label.move_url_up = Move URL Up
726 label.move_url_down = Move URL Down
727 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
728 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
729 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
730 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
731 label.sequences_updated = Sequences updated
732 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
733 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
734 label.paste_new_window = Paste To New Window
735 label.settings_for_param = Settings for {0}
736 label.view_params = View {0}
737 label.aacon_calculations = AACon Calculations
738 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
739 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
740 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
741 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
742 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
743 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
744 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
745 label.all_views = All Views
746 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
747 label.realign_with_params = Realign with {0}
748 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
749 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
750 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
751 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
752 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
753 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
754 label.view_documentation = View documentation
755 label.select_return_type = Select return type
756 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
757 label.features_for_params = Features for - {0}
758 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
759 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
760 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
761 label.varna_params = VARNA - {0}
762 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
763 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
764 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
765 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
766 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
767 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
768 label.points_for_params = Points for {0}
769 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
770 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
771 label.select_background_colour = Select Background Colour
772 label.invalid_font = Invalid Font
773 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
774 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
775 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
776 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
777 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
778 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
779 label.example_query_param = Example query: {0}
780 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
781 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
782 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
783 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
784 label.select_columns_containing = Select columns containing
785 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
786 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
787 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
788 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
789 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
790 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
791 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
792 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
793 label.use_sequence_id_4 = 
794 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
795 label.switch_server = Switch server
796 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
797 label.services_at = Services at {0}
798 label.rest_client_submit = {0} using {1}
799 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
800 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
801 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
802 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
803 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
804 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
805 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
806 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
807 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
808 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
809 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
810 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
811 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
812 label.user_preset = User Preset
813 label.service_preset = Service Preset
814 label.run_with_preset = Run {0} with preset
815 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
816 action.by_title_param = By {0}
817 label.source_from_db_source = Sources from {0}
818 label.from_msname = from {0}
819 label.superpose_with = Superpose with
820 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
821 label.add_new_row = Add New Row
822 label.edit_label_description = Edit Label/Description
823 label.hide_row = Hide This Row
824 label.delete_row = Delete This Row
825 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
826 label.export_annotation = Export Annotation
827 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
828 label.helix = Helix
829 label.sheet = Sheet
830 label.rna_helix = RNA Helix
831 label.remove_annotation = Remove Annotation
832 label.colour_by = Colour by...
833 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
834 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
835 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
836 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
837 label.multiharmony = Multi-Harmony
838 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
839 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
840 label.prompt_each_time = Prompt each time
841 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
842 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
843 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
844 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
845 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
846 label.invalid_name = Invalid name
847 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
848 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
849 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
850 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
851 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
852 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
853 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
854 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
855 label.feature_type = Feature Type
856 label.show = Show
857 label.service_url = Service URL
858 label.copied_sequences = Copied sequences
859 label.cut_sequences = Cut Sequences
860 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
861 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
862 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
863 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
864 label.save_features_to_file = Save Features to File
865 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
866 label.save_pdb_file = Save PDB File
867 label.save_text_to_file = Save Text to File
868 label.save_state = Save State
869 label.restore_state = Restore State
870 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
871 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
872 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
873 label.select_startup_file = Select startup file
874 label.select_default_browser = Select default web browser
875 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
876 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
877 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
878 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
879 label.save_as_html = Save as HTML
880 label.recently_opened = Recently Opened
881 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
882 label.tree = Tree
883 label.tree_from = Tree from {0}
884 label.webservice_job_title = {0} using {1}
885 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
886 label.visible = Visible
887 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
888 label.visible_region_of = visible region of
889 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
890 label.loading_file = Loading File: {0}
891 label.edit_params = Edit {0}
892 label.as_percentage = As Percentage
893 error.not_implemented = Not implemented
894 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
895 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
896 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
897 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
898 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
899 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
900 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
901 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
902 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
903 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
904 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
905 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
906 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
907 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
908 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
909 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
910 error.implementation_error = Implementation error
911 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
912 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
913 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
914 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
915 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
916 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
917 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
918 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
919 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
920 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
921 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
922 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
923 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
924 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
925 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
926 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
927 label.cancelled_params = Cancelled {0}
928 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
929 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
930 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
931 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
932 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
933 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
934 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
935 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
936 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
937 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
938 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
939 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
940 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
941 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
942 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
943 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
944 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
945 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
946 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
947 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
948 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
949 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
950 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
951 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
952 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
953 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
954 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
955 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
956 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
957 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
958 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
959 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
960 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
961 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
962 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
963 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
964 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
965 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
966 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
967 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
968 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
969 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
970 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
971 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
972 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
973 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
974 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
975 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
976 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
977 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
978 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
979 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
980 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
981 label.toggled = Toggled
982 label.marked = Marked
983 label.containing = containing
984 label.not_containing = not containing
985 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
986 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
987 label.submission_params = Submission {0}
988 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
989 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
990 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
991 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
992 label.pca_calculating = Calculating PCA
993 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
994 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
995 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
996 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
997 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
998 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
999 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1000 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1001 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1002 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1003 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1004 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1005 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1006 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1007 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1008 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1009 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1010 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1011 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1012 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1013 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1014 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1015 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1016 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1017 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1018 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1019 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1020 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1021 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1022 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1023 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1024 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1025 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1026 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1027 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1028 label.mapped = mapped
1029 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1030 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1031 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1032 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1033 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1034 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1035 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1036 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1037 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1038 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1039 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1040 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1041 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1042 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1043 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1044 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1045 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1046 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1047 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1048 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1049 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1050 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1051 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1052 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1053 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1054 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1055 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1056 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1057 label.remove_gaps = Remove Gaps
1058 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1059 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1060 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1061 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1062 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1063 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1064 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1065 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1066 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1067 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1068 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1069 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1070 warn.service_not_supported = Service not supported!
1071 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1072 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1073 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1074 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1075 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1076 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1077 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1078 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1079 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1080 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1081 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1082 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1083 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1084 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1085 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1086 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1087 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1088 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1089 label.eps_file = EPS file
1090 label.png_image = PNG image
1091 status.export_complete = {0} Export completed
1092 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1093 status.refreshing_news = Refreshing news
1094 status.opening_params = Opening {0}
1095 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1096 status.finshed_querying = Finished querying
1097 status.parsing_results = Parsing results.
1098 status.processing = Processing...
1099 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1100 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1101 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1102 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1103 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1104 status.opening_file_for = opening file for
1105 status.colouring_structures = Colouring structures
1106 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1107 label.font_too_small = Font size is too small
1108 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1109 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1110 label.out_of_memory = Out of memory
1111 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1112 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1113 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1114 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1115 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1116 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1117 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1118 label.test_server = Test Server?
1119 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1120 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1121 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1122 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1123 label.file_already_exists = File exists
1124 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1125 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1126 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1127 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1128 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1129 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1130 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1131 label.delete_all = Delete all sequences
1132 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1133 label.add_annotations_for = Add annotations for
1134 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1135 label.choose_annotations = Choose Annotations
1136 label.find = Find
1137 label.invalid_search = Search string invalid
1138 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1139 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1140 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1141 label.show_group_logo = Show Group Logo
1142 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1143 label.show_histogram = Show Histogram
1144 label.show_logo = Show Logo
1145 label.normalise_logo = Normalise Logo
1146 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1147 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1148 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1149 label.open_split_window = Open split window
1150 action.no = No
1151 action.yes = Yes
1152 label.for = for
1153 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1154 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1155 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1156 label.alpha_helix = Alpha Helix
1157 label.beta_strand = Beta Strand
1158 label.turn = Turn
1159 label.select_all = Select All
1160 label.structures_filter = Structures Filter
1161 label.search_filter = Search Filter
1162 label.include_description= Include Description
1163 action.back = Back
1164 label.hide_insertions = Hide Insertions
1165 label.mark_as_representative = Mark as representative
1166 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1167 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1168 label.result = result
1169 label.results = results
1170 label.structure_chooser = Structure Chooser
1171 label.invert = Invert 
1172 label.select_pdb_file = Select PDB File
1173 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1174 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1175 label.search_result = Search Result
1176 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1177 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1178 label.start_jalview = Start Jalview
1179 label.biojs_html_export = BioJS
1180 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1181 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1182 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1183 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1184 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1185 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1186 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1187 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1188 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1189 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1190 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1191 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1192 action.export_groups = Export Groups
1193 action.export_annotations = Export Annotations
1194 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1195 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1196 action.export_features = Export Features
1197 label.export_settings = Export Settings
1198 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1199 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1200 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1201 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1202 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1203 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1204 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1205 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1206 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1207 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1208 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1209 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1210 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1211 label.run_groovy = Run Groovy console script
1212 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1213 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1214 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1215 action.next_page= >> 
1216 action.prev_page= << 
1217 label.next_page_tooltip=Next Page
1218 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1219 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1220 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1221 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1222 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1223 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1224 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1225 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1226 label.column = Column
1227 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1228 label.operation_failed = Operation failed
1229 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1230 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1231 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1232 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1233 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1234 action.customfilter = Custom only
1235 action.showall = Show All
1236 label.insert = Insert:
1237 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1238 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1239 label.primary = Double Click
1240 label.inmenu = In Menu
1241 label.id = ID
1242 label.database = Database
1243 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1244 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1245 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1246 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1247 label.urllinks = Links
1248 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1249 label.togglehidden = Show hidden regions
1250 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1251 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1252 label.consensus_descr = PID
1253 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1254 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1255 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1256 label.show_experimental = Enable experimental features
1257 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1258 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1259 label.overview_settings = Overview settings
1260 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1261 label.gap_colour = Gap colour:
1262 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1263 label.hidden_colour = Hidden colour:
1264 label.select_gap_colour = Select gap colour
1265 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1266 label.overview = Overview
1267 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1268 label.oview_calc = Recalculating overview...
1269 label.feature_details = Feature details
1270 label.matchCondition_contains = Contains
1271 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1272 label.matchCondition_matches = Matches
1273 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1274 label.matchCondition_present = Is present
1275 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1276 label.matchCondition_eq = =
1277 label.matchCondition_ne = not =
1278 label.matchCondition_lt = <
1279 label.matchCondition_le = <=
1280 label.matchCondition_gt = >
1281 label.matchCondition_ge = >=
1282 label.numeric_required = The value should be numeric
1283 label.filter = Filter
1284 label.filters = Filters
1285 label.join_conditions = Join conditions with
1286 label.delete_condition = Delete this condition
1287 label.score = Score
1288 label.colour_by_label = Colour by label
1289 label.variable_colour = Variable colour...
1290 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1291 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1292 option.autosearch = Autosearch
1293 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1294 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1295 label.simple_colour = Simple Colour
1296 label.colour_by_text = Colour by text
1297 label.graduated_colour = Graduated Colour
1298 label.by_text_of = By text of
1299 label.by_range_of = By range of
1300 label.or = Or
1301 label.and = And
1302 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1303 label.best_quality = Best Quality
1304 label.best_resolution = Best Resolution
1305 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1306 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1307 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1308 label.cached_structures = Cached Structures
1309 label.free_text_search = Free Text Search
1310 label.annotation_name = Annotation Name
1311 label.annotation_description = Annotation Description 
1312 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1313 label.alignment = alignment
1314 label.pca = PCA
1315 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1316 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1317 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1318 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1319 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1320 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1321 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1322 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1323 label.continue_operation = Continue operation?
1324 label.backups = Backups
1325 label.backup = Backup
1326 label.backup_files = Backup Files
1327 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1328 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1329 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1330 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1331 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1332 label.scheme_examples = Scheme examples
1333 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1334 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1335 label.keep_files = Deleting old backup files
1336 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1337 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1338 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1339 label.always_ask = Always ask
1340 label.auto_delete = Automatically delete
1341 label.filename = filename
1342 label.braced_oldest = (oldest)
1343 label.braced_newest = (most recent)
1344 label.configuration = Configuration
1345 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1346 label.schemes = Schemes
1347 label.customise = Customise
1348 label.custom = Custom
1349 label.default = Default
1350 label.single_file = Single backup
1351 label.keep_all_versions = Keep all versions
1352 label.rolled_backups = Rolled backup files
1353 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1354 label.custom_description = Your own saved scheme
1355 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1356 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1357 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1358 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1359 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1360 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1361 label.include_backup_files = Include backup files
1362 label.cancel_changes = Cancel changes
1363 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1364 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1365 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1366 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1367 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1368 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1369 label.delete = Delete
1370 label.rename = Rename
1371 label.keep = Keep
1372 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1373 label.annotation_name = Annotation Name
1374 label.annotation_description = Annotation Description 
1375 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1376 label.alignment = alignment
1377 label.pca = PCA
1378 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1379 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1380 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu
1381 label.show_linked_features = Show {0} features
1382 label.on_top = on top
1383 label.include_linked_features = Include {0} features
1384 label.include_linked_tooltip = Include visible {0} features<br>converted to local sequence coordinates
1385 label.features_not_shown = {0} feature(s) not shown
1386 label.no_features_to_sort_by = No features to sort by
1387 label.ignore_hidden = Ignore hidden columns
1388 label.ignore_hidden_tooltip = Ignore any characters in hidden columns when matching
1389 label.log_level = Log level
1390 label.log_level_tooltip = Temporarily set the log level for this console. The log level will revert to {0} when this Java console is closed.
1391 label.copy_to_clipboard = Copy to clipboard
1392 label.copy_to_clipboard_tooltip = Copy all of the log text in this console to the system clipboard
1393 label.startup = Startup
1394 label.memory = Memory
1395 label.customise_memory_settings = Customise maximum memory settings
1396 label.memory_setting_text = New memory settings will only come into effect the next time you start Jalview
1397 label.maximum_memory_used = Maximum memory limited to both
1398 label.percent_of_physical_memory = Maximum percent of physical memory
1399 label.maximum_memory = Maximum absolute memory
1400 label.maximum_memory_tooltip = Enter memory as an integer number optionally followed by 'b', 'k', 'm', 'g' or 't'
1401 label.adjustments_for_this_computer = Adjustments for this computer
1402 label.memory_example_text = Maximum memory that would be used with these settings on this computer
1403 label.memory_example_tooltip = The memory allocated to Jalview is the smaller of the percentage of physical memory (default 90%) and the maximum absolute memory (default 32GB). If your computer's memory cannot be ascertained then the maximum absolute memory defaults to 8GB (if not customised).<br>Jalview will always try and reserve 512MB for the OS and at least 512MB for itself.