JAL-3633 Remember system set proxy properties. Add options in Preferences for No...
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 label.quit_jalview = Quit Jalview?
36 action.expand_views = Expand Views
37 action.gather_views = Gather Views
38 action.page_setup = Page Setup...
39 action.reload = Reload
40 action.load = Load
41 action.open = Open
42 action.cancel = Cancel
43 action.create = Create
44 action.update = Update
45 action.delete = Delete
46 action.clear = Clear
47 action.accept = Accept
48 action.select_ddbb = --- Select Database ---
49 action.undo = Undo
50 action.redo = Redo
51 action.reset = Reset
52 action.remove_left = Remove left
53 action.remove_right = Remove right
54 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
55 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
56 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
57 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
58 action.boxes = Boxes
59 action.text = Text
60 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
61 action.by_id = By Id
62 action.by_length = By Length
63 action.by_group = By Group
64 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
65 action.set_as_reference = Set as Reference 
66 action.remove = Remove
67 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
68 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
69 action.user_defined = User Defined...
70 action.by_conservation = By Conservation
71 action.wrap = Wrap
72 action.show_gaps = Show Gaps
73 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
74 action.find = Find
75 action.undefine_groups = Undefine Groups
76 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
77 action.copy = Copy
78 action.cut = Cut
79 action.font = Font...
80 action.scale_above = Scale Above
81 action.scale_left = Scale Left
82 action.scale_right = Scale Right
83 action.by_tree_order = By Tree Order
84 action.sort = Sort
85 action.calculate_tree = Calculate Tree...
86 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
87 action.help = Help
88 action.by_annotation = By Annotation...
89 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
90 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
91 action.show = Show
92 action.hide = Hide
93 action.ok = OK
94 action.set_defaults = Defaults
95 action.create_group = Create Group
96 action.remove_group = Remove Group
97 action.edit_group = Edit Group
98 action.border_colour = Border colour
99 action.edit_new_group = Edit New Group
100 action.hide_sequences = Hide Sequences
101 action.sequences = Sequences
102 action.ids = IDS
103 action.ids_sequences = IDS and sequences
104 action.reveal_all = Reveal All
105 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
106 action.find_all = Find all
107 action.find_next = Find next
108 action.file = File
109 action.view = View
110 action.annotations = Annotations
111 action.change_params = Change Parameters
112 action.apply = Apply
113 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
114 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
115 action.by_chain = By Chain
116 action.by_sequence = By Sequence
117 action.paste_annotations = Paste Annotations
118 action.format = Format
119 action.select = Select
120 action.new_view = New View
121 action.close = Close
122 action.add = Add
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.change_font = Change Font
126 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
127 action.colour = Colour
128 action.calculate = Calculate
129 action.select_all = Select all
130 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
131 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
132 action.deselect_all = Deselect all
133 action.invert_selection = Invert selection
134 action.using_jmol = Using Jmol
135 action.undo_changes_to_feature_settings = Undo all unapplied changes to feature settings
136 action.undo_changes_to_feature_settings_and_close_the_dialog = Undo all pending changes and close the feature settings dialog
137 action.link = Link
138 action.group_link = Group Link
139 action.show_chain = Show Chain
140 action.show_group = Show Group
141 action.fetch_db_references = Fetch DB References
142 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
143 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
144 label.structures_manager = Structures Manager
145 label.url = URL
146 label.url\: = URL:
147 label.input_file_url = Enter URL or Input File
148 label.select_feature = Select feature
149 label.name = Name
150 label.name\: = Name:
151 label.name_param = Name: {0}
152 label.group = Group
153 label.group\: = Group:
154 label.group_name = Group Name
155 label.group_description = Group Description
156 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
157 label.colour = Colour:
158 label.description = Description
159 label.description\: = Description:
160 label.start = Start:
161 label.end = End:
162 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
163 label.service_action = Service Action:
164 label.post_url = POST URL:
165 label.url_suffix = URL Suffix
166 label.per_seq = per Sequence
167 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
168 label.amend = Amend
169 label.undo_command = Undo {0}
170 label.redo_command = Redo {0}
171 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
172 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
173 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
174 label.choose_calculation = Choose Calculation
175 label.calc_title = {0} Using {1}
176 label.tree_calc_av = Average Distance
177 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
178 label.score_model_pid = % Identity
179 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
180 label.score_model_pam250 = PAM 250
181 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
182 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
183 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
184 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
185 label.status_bar = Status bar
186 label.out_to_textbox = Output to Textbox
187 label.occupancy = Occupancy
188 # delete Clustal - use FileFormat name instead
189 label.clustal = Clustal
190 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
191 label.colourScheme_clustal = Clustalx
192 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
193 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
194 label.colourScheme_zappo = Zappo
195 label.colourScheme_taylor = Taylor
196 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
197 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
198 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
199 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
200 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
201 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
202 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
203 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
204 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
205 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
206 label.blc = BLC
207 label.fasta = Fasta
208 label.msf = MSF
209 label.pfam = PFAM
210 label.pileup = Pileup
211 label.pir = PIR
212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
225 label.overview_window = Overview Window
226 label.none = None
227 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
228 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
229 label.nucleotide = Nucleotide
230 label.protein = Protein
231 label.nucleotides = Nucleotides
232 label.proteins = Proteins
233 label.CDS = CDS
234 label.to_new_alignment = To New Alignment
235 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
236 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
237 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
238 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
239 label.input_from_textbox = Input from textbox
240 label.centre_column_labels = Centre column labels
241 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
242 label.documentation = Documentation
243 label.about = About...
244 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
245 action.feature_settings = Feature Settings...
246 label.all_columns = All Columns
247 label.all_sequences = All Sequences
248 label.selected_columns = Selected Columns 
249 label.selected_sequences = Selected Sequences
250 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
251 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
252 label.selected_region = Selected Region
253 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
254 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
255 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
256 label.group_consensus = Group Consensus
257 label.group_conservation = Group Conservation
258 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
259 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
260 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
261 label.apply_all_groups = Apply to all groups
262 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
263 label.show_first = Show first
264 label.show_last = Show last
265 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
266 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
267 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
268 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
269 label.structure_viewer = Default structure viewer
270 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
271 label.viewer_path = Path to {0} program
272 label.viewer_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
273 label.invalid_viewer_path = Path not found or not executable
274 label.viewer_missing = Structure viewer not found.<br/>Please enter the path to the executable (if installed),<br/>or download and install the program.
275 label.open_viewer_failed = Error opening {0} - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
276 label.min_colour = Minimum Colour
277 label.max_colour = Maximum Colour
278 label.no_colour = No Colour
279 label.use_original_colours = Use Original Colours
280 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
281 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
282 label.selection = Selection
283 label.group_colour = Group Colour
284 label.sequence = Sequence
285 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
286 label.min_value = Min value
287 label.max_value = Max value
288 label.no_value = No value
289 label.new_feature = New Feature
290 label.match_case = Match Case
291 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
292 label.labels = Labels
293 label.output_values = Output Values...
294 label.output_points = Output points...
295 label.output_transformed_points = Output transformed points
296 label.input_data = Input Data...
297 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
298 label.protein_matrix = Protein matrix
299 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
300 label.show_distances = Show distances
301 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
302 label.fit_to_window = Fit To Window
303 label.newick_format = Newick Format
304 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
305 label.colours = Colours
306 label.view_mapping = View Mapping
307 label.wireframe = Wireframe
308 label.depthcue = Depthcue
309 label.z_buffering = Z Buffering
310 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
311 label.all_chains_visible = All Chains Visible
312 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
313 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
314 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
315 label.removed_columns = Removed {0} columns.
316 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
317 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
318 label.order_by_params = Order by {0}
319 label.html_content = <html>{0}</html>
320 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
321 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
322 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
323 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
324 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
325 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
326 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
327 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
328 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
329 label.paste_your = Paste your
330 label.finished_searching = Finished searching
331 label.search_results= Search results {0} : {1}
332 label.found_match_for = Found match for {0}
333 label.font = Font:
334 label.size = Size:
335 label.style = Style:
336 label.calculating = Calculating....
337 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
338 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
339 label.set_this_label_text = set this label text
340 label.sequences_from = Sequences from {0}
341 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
342 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
343 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
344 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
345 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
346 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
347 label.source_to_target = {0} ... {1}
348 label.per_sequence_only= Per-sequence only
349 label.to_file = to File
350 label.to_textbox = to Textbox
351 label.jalview = Jalview
352 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
353 label.status = Status
354 label.channels = Channels
355 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
356 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
357 label.groovy_console = Groovy Console...
358 label.lineart = Lineart
359 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
360 label.select_character_rendering_style = {0} character rendering style
361 label.select_character_style_title = {0} Rendering options
362 label.invert_selection = Invert Selection
363 label.optimise_order = Optimise Order
364 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
365 label.load_colours = Load Colours
366 label.save_colours = Save Colours
367 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
368 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
369 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
370 label.database_param = Database: {0}
371 label.example = Example
372 label.example_param = Example: {0}
373 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
374 label.file_format_not_specified = File format not specified
375 label.couldnt_save_file = Couldn''t save file: {0}
376 label.error_saving_file = Error Saving File
377 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
378 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
379 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
380 label.invalid_selection = Invalid Selection
381 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
382 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
383 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
384 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
385 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
386 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
387 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
388 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
389 label.translation_failed = Translation Failed
390 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
391 label.implementation_error  = Implementation error:
392 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
393 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
394 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
395 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
396 label.view_name_original = Original
397 label.enter_view_name = Enter View Name
398 label.enter_label = Enter label
399 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
400 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
401 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
402 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
403 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
404 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
405 label.error_parsing_text = Error parsing text
406 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
407 label.input_alignment = Input Alignment
408 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
409 label.couldnt_locate = Couldn''t locate {0}
410 label.url_not_found = URL not found
411 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
412 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
413 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
414 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
415 label.invalid_url = Invalid URL !
416 label.error_loading_file = Error loading file
417 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
418 label.file_open_error = File open error
419 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
420 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
421 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
422 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
423 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
424 label.alignment_props = Alignment Properties
425 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
426 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
427 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
428 label.annotations = Annotations
429 label.structure_options = Structure Options
430 label.features = Features
431 label.overview_params = Overview {0}
432 label.paste_newick_file = Paste Newick file
433 label.load_tree_from_file = From File - 
434 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
435 label.selection_output_command = Selection output - {0}
436 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
437 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
438 label.pca_details = PCA details
439 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
440 label.user_defined_colours = User defined colours
441 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
442 label.jaview_build_date = Build date: {0}
443 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
444 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
445 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
446 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
447 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
448 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
449 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
450 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
451 label.right_click = Right click
452 label.to_add_annotation = to add annotation
453 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
454 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
455 label.label = Label
456 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
457 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
458 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
459 label.calculating_pca= Calculating PCA
460 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
461 label.jalview_applet = Jalview applet
462 label.loading_data = Loading data
463 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
464 label.calculating_tree = Calculating tree
465 label.state_queueing = queuing
466 label.state_running = running
467 label.state_completed = finished
468 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
469 label.state_job_error = job error!
470 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
471 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
472 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
473 label.structure_type = Structure type
474 label.settings_for_type = Settings for {0}
475 label.view_full_application = View in Full Application
476 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
477 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
478 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
479 label.load_vcf_file = Load VCF File
480 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
481 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
482 label.export_features = Export Features...
483 label.export_annotations = Export Annotations...
484 label.to_upper_case = To Upper Case
485 label.to_lower_case = To Lower Case
486 label.toggle_case = Toggle Case
487 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
488 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
489 label.edit_sequence = Edit Sequence
490 label.edit_sequences = Edit Sequences
491 label.insert_gap = Insert 1 gap
492 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
493 label.delete_gap = Delete 1 gap
494 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
495 label.sequence_details = Sequence Details
496 label.viewer_help = {0} Help
497 label.close_viewer = Close Viewer
498 label.confirm_close_viewer = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the {1} window as well?
499 label.all = All
500 label.sort_by = Sort alignment by
501 label.sort_by_score = Sort by Score
502 label.sort_by_density = Sort by Density
503 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
504 label.sort_ann_by = Sort annotations by
505 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
506 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
507 label.reveal = Reveal
508 label.hide_columns = Hide Columns
509 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
510 label.load_tree_file = Load a tree file
511 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
512 label.standard_databases = Standard Databases
513 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
514 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
515 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
516 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
517 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
518 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
519 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
520 label.adjust_threshold = Adjust threshold
521 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
522 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
523 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
524 label.open_url_param = Open URL {0}
525 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
526 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
527 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
528 label.dark_colour = Dark Colour
529 label.light_colour = Light Colour
530 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
531 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
532 label.copy_format_from = Copy format from
533 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
534 label.select_all_views = Select all views
535 label.select_many_views = Select many views
536 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
537 label.open_local_file = Open local file
538 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
539 label.listen_for_selections = Listen for selections
540 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
541 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
542 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
543 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
544 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
545 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
546 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
547 label.no_services = <No Services>
548 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
549 label.from_url = from URL
550 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
551 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
552 label.from_textbox = from Textbox
553 label.window = Window
554 label.preferences = Preferences
555 label.tools = Tools
556 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
557 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
558 label.collect_garbage = Collect Garbage
559 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
560 label.show_java_console = Show Java Console
561 label.show_jalview_news = Show Jalview News
562 label.take_snapshot = Take snapshot
563 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
564 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
565 label.monospaced_font= Monospaced
566 label.quality = Quality
567 label.maximize_window = Maximize Window
568 label.conservation = Conservation
569 label.consensus = Consensus
570 label.histogram = Histogram
571 label.logo = Logo
572 label.non_positional_features = List Non-positional Features
573 label.database_references = List Database References
574 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
575 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
576 label.gap_symbol = Gap Symbol
577 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
578 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
579 label.address = Address
580 label.host = Host
581 label.port = Port
582 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
583 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
584 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
585 label.check_for_latest_version = Check for latest version
586 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
587 label.no_proxy = No proxy servers
588 label.system_proxy = System proxy servers (http={0}; https={1})
589 label.use_proxy_server = Use these proxy servers
590 label.rendering_style = {0} rendering style
591 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
592 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
593 label.smooth_font = Smooth Font
594 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
595 label.pad_gaps = Pad Gaps
596 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
597 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
598 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
599 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
600 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
601 label.right_align_ids = Right Align Ids
602 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
603 label.open_overview = Open Overview
604 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
605 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
606 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
607 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
608 label.visual = Visual
609 label.connections = Connections
610 label.output = Output
611 label.editing = Editing
612 label.web_services = Web Services
613 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
614 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
615 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
616 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
617 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
618 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
619 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
620 label.new_service_url = New Service URL
621 label.edit_service_url = Edit Service URL
622 label.delete_service_url = Delete Service URL
623 label.details = Details
624 label.options = Options
625 label.parameters = Parameters
626 label.proxy_server = Proxy Server
627 label.file_output = File Output
628 label.select_input_type = Select input type
629 label.set_options_for_type = Set options for type
630 label.data_input_parameters = Data input parameters
631 label.data_returned_by_service = Data returned by service
632 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
633 label.parsing_errors = Parsing errors
634 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
635 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
636 label.input_parameter_name = Input Parameter name
637 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
638 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
639 label.brief_description_service = Brief description of service
640 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
641 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
642 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
643 label.gap_character = Gap character
644 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
645 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
646 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
647 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
648 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
649 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
650 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
651 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
652 label.input_output = Input/Output
653 label.cut_paste = Cut'n'Paste
654 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
655 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
656 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
657 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
658 label.from_file = From File
659 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
660 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
661 label.text_colour = Text Colour...
662 label.structure = Structure
663 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
664 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
665 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
666 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
667 label.sequence_name = Sequence Name
668 label.sequence_description = Sequence Description
669 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
670 label.spaces_converted_to_underscores = Spaces have been converted to _
671 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
672 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
673 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
674 label.web_browser_not_found = Web browser not found
675 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
676 label.html = HTML
677 label.wrap = Wrap
678 label.show_database_refs = Show Database Refs
679 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
680 label.save_png_image = Save As PNG Image
681 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
682 label.export_image = Export Image
683 label.vamsas_store = VAMSAS store
684 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
685 label.reverse = Reverse
686 label.reverse_complement = Reverse Complement
687 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
688 label.extract_scores = Extract Scores
689 label.get_cross_refs = Get Cross-References
690 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
691 label.add_sequences = Add Sequences
692 label.new_window = New Window
693 label.split_window = Split Window
694 label.set_as_default = Set as Default
695 label.show_labels = Show labels
696 action.background_colour = Background Colour...
697 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
698 label.link_name = Link Name
699 label.pdb_file = PDB file
700 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
701 label.let_viewer_manage_structure_colours = Let viewer manage structure colours
702 label.colour_with_viewer = Colour in structure viewer
703 label.superpose_structures = Superpose Structures
704 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
705 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
706 label.create_viewer_attributes = Write Jalview features
707 label.create_viewer_attributes_tip = Set structure residue attributes for Jalview features
708 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
709 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
710 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
711 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
712 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
713 label.case_sensitive = Case Sensitive
714 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
715 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
716 label.index_by_host = Index by Host
717 label.index_by_type = Index by Type
718 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
719 label.display_warnings = Display Warnings
720 label.move_url_up = Move URL Up
721 label.move_url_down = Move URL Down
722 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
723 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
724 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
725 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
726 label.sequences_updated = Sequences updated
727 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
728 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
729 label.paste_new_window = Paste To New Window
730 label.settings_for_param = Settings for {0}
731 label.view_params = View {0}
732 label.aacon_calculations = AACon Calculations
733 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
734 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
735 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
736 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
737 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
738 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
739 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
740 label.all_views = All Views
741 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
742 label.realign_with_params = Realign with {0}
743 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
744 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
745 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
746 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
747 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
748 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
749 label.view_documentation = View documentation
750 label.select_return_type = Select return type
751 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
752 label.features_for_params = Features for - {0}
753 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
754 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
755 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
756 label.varna_params = VARNA - {0}
757 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
758 label.sequence_feature_settings_for = Sequence Feature Settings for {0}
759 label.sequence_feature_settings_for_view = Sequence Feature Settings for view "{0}"
760 label.sequence_feature_settings_for_CDS_and_Protein = Sequence Feature Settings for CDS and Protein
761 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
762 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
763 label.points_for_params = Points for {0}
764 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
765 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
766 label.select_background_colour = Select Background Colour
767 label.invalid_font = Invalid Font
768 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
769 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
770 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
771 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
772 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
773 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
774 label.example_query_param = Example query: {0}
775 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
776 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
777 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
778 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
779 label.select_columns_containing = Select columns containing
780 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
781 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
782 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
783 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
784 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
785 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
786 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
787 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
788 label.use_sequence_id_4 = 
789 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
790 label.switch_server = Switch server
791 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
792 label.services_at = Services at {0}
793 label.rest_client_submit = {0} using {1}
794 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
795 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
796 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
797 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
798 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
799 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
800 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
801 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
802 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
803 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
804 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
805 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
806 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
807 label.user_preset = User Preset
808 label.service_preset = Service Preset
809 label.run_with_preset = Run {0} with preset
810 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
811 action.by_title_param = By {0}
812 label.source_from_db_source = Sources from {0}
813 label.from_msname = from {0}
814 label.superpose_with = Superpose with
815 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
816 label.add_new_row = Add New Row
817 label.edit_label_description = Edit Label/Description
818 label.hide_row = Hide This Row
819 label.delete_row = Delete This Row
820 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
821 label.export_annotation = Export Annotation
822 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
823 label.helix = Helix
824 label.sheet = Sheet
825 label.rna_helix = RNA Helix
826 label.remove_annotation = Remove Annotation
827 label.colour_by = Colour by...
828 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
829 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
830 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
831 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
832 label.multiharmony = Multi-Harmony
833 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
834 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
835 label.prompt_each_time = Prompt each time
836 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
837 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
838 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
839 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
840 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
841 label.invalid_name = Invalid name
842 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
843 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
844 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
845 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
846 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
847 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
848 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
849 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
850 label.feature_type = Feature Type
851 label.show = Show
852 label.service_url = Service URL
853 label.copied_sequences = Copied sequences
854 label.cut_sequences = Cut Sequences
855 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
856 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
857 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
858 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
859 label.save_features_to_file = Save Features to File
860 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
861 label.save_pdb_file = Save PDB File
862 label.save_text_to_file = Save Text to File
863 label.save_state = Save State
864 label.restore_state = Restore State
865 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
866 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
867 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
868 label.select_startup_file = Select startup file
869 label.select_default_browser = Select default web browser
870 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
871 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
872 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
873 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
874 label.save_as_html = Save as HTML
875 label.recently_opened = Recently Opened
876 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
877 label.tree = Tree
878 label.tree_from = Tree from {0}
879 label.webservice_job_title = {0} using {1}
880 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
881 label.visible = Visible
882 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
883 label.visible_region_of = visible region of
884 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
885 label.loading_file = Loading File: {0}
886 label.edit_params = Edit {0}
887 label.as_percentage = As Percentage
888 error.not_implemented = Not implemented
889 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
890 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
891 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
892 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
893 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
894 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
895 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
896 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
897 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
898 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
899 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
900 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
901 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
902 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
903 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
904 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
905 error.implementation_error = Implementation error
906 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
907 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
908 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
909 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
910 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
911 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
912 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
913 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
914 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
915 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
916 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
917 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
918 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
919 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
920 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
921 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
922 label.cancelled_params = Cancelled {0}
923 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
924 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
925 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
926 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
927 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
928 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
929 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
930 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
931 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
932 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
933 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
934 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
935 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
936 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
937 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
938 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
939 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
940 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
941 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
942 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
943 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
944 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
945 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
946 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
947 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
948 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
949 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
950 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
951 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
952 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
953 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
954 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
955 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
956 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
957 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
958 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
959 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
960 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
961 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
962 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
963 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
964 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
965 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
966 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
967 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
968 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
969 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
970 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
971 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
972 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
973 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
974 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
975 label.no_highlighted_regions_marked = No highlighted regions marked
976 label.toggled = Toggled
977 label.marked = Marked
978 label.containing = containing
979 label.not_containing = not containing
980 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found
981 label.no_feature_found_selection = No features of type {0} found in selection
982 label.submission_params = Submission {0}
983 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
984 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
985 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
986 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
987 label.pca_calculating = Calculating PCA
988 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
989 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
990 label.adjust_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
991 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
992 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
993 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
994 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
995 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
996 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
997 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
998 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
999 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1000 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1001 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1002 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1003 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1004 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1005 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1006 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1007 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1008 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1009 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1010 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1011 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1012 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1013 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1014 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1015 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1016 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1017 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1018 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1019 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1020 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1021 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1022 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1023 label.mapped = mapped
1024 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1025 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1026 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1027 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1028 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1029 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1030 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1031 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1032 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1033 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1034 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1035 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1036 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1037 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1038 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1039 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1040 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1041 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1042 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1043 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1044 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1045 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1046 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1047 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1048 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1049 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1050 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1051 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1052 label.remove_gaps = Remove Gaps
1053 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1054 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1055 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1056 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1057 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1058 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1059 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1060 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1061 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1062 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1063 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1064 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1065 warn.service_not_supported = Service not supported!
1066 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1067 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1068 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1069 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1070 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1071 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1072 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1073 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1074 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1075 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1076 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1077 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1078 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1079 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1080 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1081 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1082 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1083 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1084 label.eps_file = EPS file
1085 label.png_image = PNG image
1086 status.export_complete = {0} Export completed
1087 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1088 status.refreshing_news = Refreshing news
1089 status.opening_params = Opening {0}
1090 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1091 status.finshed_querying = Finished querying
1092 status.parsing_results = Parsing results.
1093 status.processing = Processing...
1094 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1095 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1096 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1097 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1098 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1099 status.opening_file_for = opening file for
1100 status.colouring_structures = Colouring structures
1101 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1102 label.font_too_small = Font size is too small
1103 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1104 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1105 label.out_of_memory = Out of memory
1106 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1107 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1108 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1109 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1110 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1111 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1112 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1113 label.test_server = Test Server?
1114 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1115 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1116 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1117 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1118 label.file_already_exists = File exists
1119 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1120 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1121 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1122 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1123 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1124 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1125 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1126 label.delete_all = Delete all sequences
1127 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1128 label.add_annotations_for = Add annotations for
1129 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1130 label.choose_annotations = Choose Annotations
1131 label.find = Find
1132 label.invalid_search = Search string invalid
1133 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1134 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1135 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1136 label.show_group_logo = Show Group Logo
1137 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1138 label.show_histogram = Show Histogram
1139 label.show_logo = Show Logo
1140 label.normalise_logo = Normalise Logo
1141 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1142 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1143 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1144 label.open_split_window = Open split window
1145 action.no = No
1146 action.yes = Yes
1147 label.for = for
1148 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1149 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1150 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1151 label.alpha_helix = Alpha Helix
1152 label.beta_strand = Beta Strand
1153 label.turn = Turn
1154 label.select_all = Select All
1155 label.structures_filter = Structures Filter
1156 label.search_filter = Search Filter
1157 label.include_description= Include Description
1158 action.back = Back
1159 label.hide_insertions = Hide Insertions
1160 label.mark_as_representative = Mark as representative
1161 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1162 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1163 label.result = result
1164 label.results = results
1165 label.structure_chooser = Structure Chooser
1166 label.invert = Invert 
1167 label.select_pdb_file = Select PDB File
1168 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1169 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1170 label.search_result = Search Result
1171 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1172 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1173 label.start_jalview = Start Jalview
1174 label.biojs_html_export = BioJS
1175 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1176 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1177 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1178 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1179 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1180 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1181 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1182 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1183 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1184 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1185 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1186 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1187 action.export_groups = Export Groups
1188 action.export_annotations = Export Annotations
1189 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1190 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1191 action.export_features = Export Features
1192 label.export_settings = Export Settings
1193 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1194 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1195 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1196 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1197 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1198 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1199 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1200 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1201 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1202 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1203 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1204 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1205 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1206 label.run_groovy = Run Groovy console script
1207 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1208 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1209 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1210 action.next_page= >> 
1211 action.prev_page= << 
1212 label.next_page_tooltip=Next Page
1213 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1214 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1215 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1216 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1217 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1218 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1219 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1220 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1221 label.column = Column
1222 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1223 label.operation_failed = Operation failed
1224 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1225 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1226 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1227 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1228 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1229 action.customfilter = Custom only
1230 action.showall = Show All
1231 label.insert = Insert:
1232 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1233 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1234 label.primary = Double Click
1235 label.inmenu = In Menu
1236 label.id = ID
1237 label.database = Database
1238 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1239 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1240 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1241 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1242 label.urllinks = Links
1243 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1244 label.togglehidden = Show hidden regions
1245 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1246 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1247 label.consensus_descr = PID
1248 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1249 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1250 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1251 label.show_experimental = Enable experimental features
1252 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1253 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1254 label.overview_settings = Overview settings
1255 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1256 label.gap_colour = Gap colour:
1257 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1258 label.hidden_colour = Hidden colour:
1259 label.select_gap_colour = Select gap colour
1260 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1261 label.overview = Overview
1262 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1263 label.oview_calc = Recalculating overview...
1264 label.feature_details = Feature details
1265 label.matchCondition_contains = Contains
1266 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1267 label.matchCondition_matches = Matches
1268 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1269 label.matchCondition_present = Is present
1270 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1271 label.matchCondition_eq = =
1272 label.matchCondition_ne = not =
1273 label.matchCondition_lt = <
1274 label.matchCondition_le = <=
1275 label.matchCondition_gt = >
1276 label.matchCondition_ge = >=
1277 label.numeric_required = The value should be numeric
1278 label.filter = Filter
1279 label.filters = Filters
1280 label.join_conditions = Join conditions with
1281 label.delete_condition = Delete this condition
1282 label.score = Score
1283 label.colour_by_label = Colour by label
1284 label.variable_colour = Variable colour...
1285 label.select_colour_for = Select colour for {0}
1286 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1287 option.autosearch = Autosearch
1288 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1289 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1290 label.simple_colour = Simple Colour
1291 label.colour_by_text = Colour by text
1292 label.graduated_colour = Graduated Colour
1293 label.by_text_of = By text of
1294 label.by_range_of = By range of
1295 label.or = Or
1296 label.and = And
1297 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1298 label.best_quality = Best Quality
1299 label.best_resolution = Best Resolution
1300 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1301 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1302 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1303 label.cached_structures = Cached Structures
1304 label.free_text_search = Free Text Search
1305 label.annotation_name = Annotation Name
1306 label.annotation_description = Annotation Description 
1307 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1308 label.alignment = alignment
1309 label.pca = PCA
1310 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1311 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1312 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1313 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1314 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1315 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1316 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1317 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1318 label.continue_operation = Continue operation?
1319 label.backups = Backups
1320 label.backup = Backup
1321 label.backup_files = Backup Files
1322 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1323 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1324 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1325 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1326 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1327 label.scheme_examples = Scheme examples
1328 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1329 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1330 label.keep_files = Deleting old backup files
1331 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1332 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1333 label.autodelete_old_backup_files = Auto-delete old backup files:
1334 label.always_ask = Always ask
1335 label.auto_delete = Automatically delete
1336 label.filename = filename
1337 label.braced_oldest = (oldest)
1338 label.braced_newest = (most recent)
1339 label.configuration = Configuration
1340 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1341 label.schemes = Schemes
1342 label.customise = Customise
1343 label.custom = Custom
1344 label.default = Default
1345 label.single_file = Single backup
1346 label.keep_all_versions = Keep all versions
1347 label.rolled_backups = Rolled backup files
1348 label.customise_description = Select Customise, make changes, and click on OK to save your own custom scheme
1349 label.custom_description = Your own saved scheme
1350 label.default_description = Keep the last three versions of the file
1351 label.single_file_description = Keep the last version of the file
1352 label.keep_all_versions_description = Keep all previous versions of the file
1353 label.rolled_backups_description = Keep the last nine versions of the file from _bak.1 (newest) to _bak.9 (oldest)
1354 label.cancel_changes_description = Cancel changes made to your last saved Custom scheme
1355 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1356 label.include_backup_files = Include backup files
1357 label.cancel_changes = Cancel changes
1358 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1359 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1360 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1361 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1362 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1363 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1364 label.delete = Delete
1365 label.rename = Rename
1366 label.keep = Keep
1367 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1368 label.annotation_name = Annotation Name
1369 label.annotation_description = Annotation Description 
1370 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
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