Merge branch 'feature/JAL-1244stretchStatusMsg' into merge/JAL-1244
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.expand_views = Expand Views
36 action.gather_views = Gather Views
37 action.page_setup = Page Setup...
38 action.reload = Reload
39 action.load = Load
40 action.open = Open
41 action.cancel = Cancel
42 action.create = Create
43 action.update = Update
44 action.delete = Delete
45 action.clear = Clear
46 action.accept = Accept
47 action.select_ddbb = --- Select Database ---
48 action.undo = Undo
49 action.redo = Redo
50 action.reset = Reset
51 action.remove_left = Remove left
52 action.remove_right = Remove right
53 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
54 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
55 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
56 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
57 action.boxes = Boxes
58 action.text = Text
59 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
60 action.by_id = By Id
61 action.by_length = By Length
62 action.by_group = By Group
63 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
64 action.set_as_reference = Set as Reference 
65 action.remove = Remove
66 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
67 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
68 action.user_defined = User Defined...
69 action.by_conservation = By Conservation
70 action.wrap = Wrap
71 action.show_gaps = Show Gaps
72 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
73 action.find = Find
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75 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
76 action.copy = Copy
77 action.cut = Cut
78 action.font = Font...
79 action.scale_above = Scale Above
80 action.scale_left = Scale Left
81 action.scale_right = Scale Right
82 action.by_tree_order = By Tree Order
83 action.sort = Sort
84 action.calculate_tree = Calculate Tree...
85 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
86 action.help = Help
87 action.by_annotation = By Annotation...
88 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
89 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
90 action.show = Show
91 action.hide = Hide
92 action.ok = OK
93 action.set_defaults = Defaults
94 action.create_group = Create Group
95 action.remove_group = Remove Group
96 action.edit_group = Edit Group
97 action.border_colour = Border colour
98 action.edit_new_group = Edit New Group
99 action.hide_sequences = Hide Sequences
100 action.sequences = Sequences
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103 action.reveal_all = Reveal All
104 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
105 action.find_all = Find all
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107 action.file = File
108 action.view = View
109 action.annotations = Annotations
110 action.change_params = Change Parameters
111 action.apply = Apply
112 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
113 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
114 action.by_chain = By Chain
115 action.by_sequence = By Sequence
116 action.paste_annotations = Paste Annotations
117 action.format = Format
118 action.select = Select
119 action.new_view = New View
120 action.close = Close
121 action.add = Add
122 action.save_as_default = Save as default
123 action.save_as = Save as...
124 action.save = Save
125 action.cancel_fetch = Cancel Fetch
126 action.change_font = Change Font
127 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
128 action.colour = Colour
129 action.calculate = Calculate
130 action.select_all = Select all
131 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
132 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
133 action.deselect_all = Deselect all
134 action.invert_selection = Invert selection
135 action.using_jmol = Using Jmol
136 action.link = Link
137 action.group_link = Group Link
138 action.show_chain = Show Chain
139 action.show_group = Show Group
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141 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
142 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
143 label.structures_manager = Structures Manager
144 label.nickname = Nickname:
145 label.url = URL
146 label.url\: = URL:
147 label.input_file_url = Enter URL or Input File
148 label.select_feature = Select feature
149 label.name = Name
150 label.name\: = Name:
151 label.name_param = Name: {0}
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153 label.group\: = Group:
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156 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
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158 label.description = Description
159 label.description\: = Description:
160 label.start = Start:
161 label.end = End:
162 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
163 label.service_action = Service Action:
164 label.post_url = POST URL:
165 label.url_suffix = URL Suffix
166 label.sequence_source = Sequence Source
167 label.per_seq = per Sequence
168 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
169 label.amend = Amend
170 label.undo_command = Undo {0}
171 label.redo_command = Redo {0}
172 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
173 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
174 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
175 label.choose_calculation = Choose Calculation
176 label.calc_title = {0} Using {1}
177 label.tree_calc_av = Average Distance
178 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
179 label.score_model_pid = % Identity
180 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
181 label.score_model_pam250 = PAM 250
182 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
183 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
184 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
185 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
186 label.status_bar = Status bar
187 label.out_to_textbox = Output to Textbox
188 label.occupancy = Occupancy
189 # delete Clustal - use FileFormat name instead
190 label.clustal = Clustal
191 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme
192 label.colourScheme_clustal = Clustalx
193 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
194 label.colourScheme_%_identity = Percentage Identity
195 label.colourScheme_zappo = Zappo
196 label.colourScheme_taylor = Taylor
197 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
198 label.colourScheme_helix_propensity = Helix Propensity
199 label.colourScheme_strand_propensity = Strand Propensity
200 label.colourScheme_turn_propensity = Turn Propensity
201 label.colourScheme_buried_index = Buried Index
202 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
203 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
204 label.colourScheme_t-coffee_scores = T-Coffee Scores
205 label.colourScheme_rna_helices = By RNA Helices
206 label.blc = BLC
207 label.fasta = Fasta
208 label.msf = MSF
209 label.pfam = PFAM
210 label.pileup = Pileup
211 label.pir = PIR
212 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
213 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
214 label.show_annotations = Show annotations
215 label.hide_annotations = Hide annotations
216 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
217 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
218 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
219 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
220 label.hide_all = Hide all
221 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
222 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
223 label.colour_text = Colour Text
224 label.show_non_conserved = Show nonconserved
225 label.overview_window = Overview Window
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229 label.nucleotide = Nucleotide
230 label.protein = Protein
231 label.nucleotides = Nucleotides
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233 label.to_new_alignment = To New Alignment
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237 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
238 label.input_from_textbox = Input from textbox
239 label.centre_column_labels = Centre column labels
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241 label.documentation = Documentation
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243 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
244 action.feature_settings = Feature Settings...
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248 label.selected_sequences = Selected Sequences
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250 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
251 label.selected_region = Selected Region
252 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
253 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
254 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
255 label.group_consensus = Group Consensus
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257 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
258 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
259 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
260 label.apply_all_groups = Apply to all groups
261 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
262 label.show_first = Show first
263 label.show_last = Show last
264 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
265 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
266 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
267 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
268 label.structure_viewer = Default structure viewer
269 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
270 label.chimera_path = Path to Chimera program
271 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
272 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
273 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
274 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
275 label.min_colour = Minimum Colour
276 label.max_colour = Maximum Colour
277 label.no_colour = No Colour
278 label.use_original_colours = Use Original Colours
279 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
280 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
281 label.selection = Selection
282 label.group_colour = Group Colour
283 label.sequence = Sequence
284 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
285 label.min_value = Min value
286 label.max_value = Max value
287 label.no_value = No value
288 label.new_feature = New Feature
289 label.match_case = Match Case
290 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
291 label.labels = Labels
292 label.output_values = Output Values...
293 label.output_points = Output points...
294 label.output_transformed_points = Output transformed points
295 label.input_data = Input Data...
296 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
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298 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
299 label.show_distances = Show distances
300 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
301 label.fit_to_window = Fit To Window
302 label.newick_format = Newick Format
303 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
304 label.colours = Colours
305 label.view_mapping = View Mapping
306 label.wireframe = Wireframe
307 label.depthcue = Depthcue
308 label.z_buffering = Z Buffering
309 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
310 label.all_chains_visible = All Chains Visible
311 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
312 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
313 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
314 label.removed_columns = Removed {0} columns.
315 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
316 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
317 label.order_by_params = Order by {0}
318 label.html_content = <html>{0}</html>
319 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
320 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
321 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
322 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
323 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
324 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
325 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
326 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
327 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
328 label.paste_your = Paste your
329 label.finished_searching = Finished searching
330 label.search_results= Search results {0} : {1}
331 label.found_match_for = Found match for {0}
332 label.font = Font:
333 label.size = Size:
334 label.style = Style:
335 label.calculating = Calculating....
336 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
337 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
338 label.set_this_label_text = set this label text
339 label.sequences_from = Sequences from {0}
340 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
341 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
342 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
343 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
344 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
345 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
346 label.source_to_target = {0} ... {1}
347 label.per_sequence_only= Per-sequence only
348 label.to_file = to File
349 label.to_textbox = to Textbox
350 label.jalview = Jalview
351 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
352 label.status = Status
353 label.channels = Channels
354 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
355 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
356 label.select_das_service_from_table = Select a DAS service from the table to read a full description here.</font></html>
357 label.session_update = Session Update
358 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
359 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
360 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
361 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
362 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
363 label.groovy_console = Groovy Console...
364 label.lineart = Lineart
365 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
366 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
367 label.invert_selection = Invert Selection
368 label.optimise_order = Optimise Order
369 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
370 label.load_colours = Load Colours
371 label.save_colours = Save Colours
372 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
373 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
374 label.fetch_das_features = Fetch DAS Features
375 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
376 label.database_param = Database: {0}
377 label.example = Example
378 label.example_param = Example: {0}
379 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
380 label.file_format_not_specified = File format not specified
381 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
382 label.error_saving_file = Error Saving File
383 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
384 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
385 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
386 label.invalid_selection = Invalid Selection
387 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
388 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
389 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
390 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
391 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
392 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
393 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
394 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
395 label.translation_failed = Translation Failed
396 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
397 label.implementation_error  = Implementation error:
398 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
399 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
400 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
401 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
402 label.view_name_original = Original
403 label.enter_view_name = Enter View Name
404 label.enter_label = Enter label
405 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
406 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
407 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
408 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
409 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
410 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
411 label.error_parsing_text = Error parsing text
412 label.enter_local_das_source = Enter Nickname & URL of Local DAS Source
413 label.you_can_only_edit_or_remove_local_das_sources = You can only edit or remove local DAS Sources!
414 label.public_das_source = Public DAS source - not editable
415 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
416 label.input_alignment = Input Alignment
417 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
418 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
419 label.couldnt_locate = Could not locate {0}
420 label.url_not_found = URL not found
421 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
422 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
423 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
424 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
425 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
426 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
427 label.invalid_url = Invalid URL !
428 label.error_loading_file = Error loading file
429 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
430 label.file_open_error = File open error
431 label.no_das_sources_selected_warn = No das sources were selected.\nPlease select some sources and\ntry again.
432 label.no_das_sources_selected_title = No DAS Sources Selected
433 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
434 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
435 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
436 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
437 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
438 label.alignment_props = Alignment Properties
439 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
440 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
441 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
442 label.annotations = Annotations
443 label.structure_options = Structure Options
444 label.features = Features
445 label.overview_params = Overview {0}
446 label.paste_newick_file = Paste Newick file
447 label.load_tree_from_file = From File - 
448 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
449 label.selection_output_command = Selection output - {0}
450 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
451 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
452 label.pca_details = PCA details
453 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
454 label.user_defined_colours = User defined colours
455 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
456 label.jaview_build_date = Build date: {0}
457 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
458 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
459 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
460 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
461 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
462 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
463 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
464 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
465 label.right_click = Right click
466 label.to_add_annotation = to add annotation
467 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
468 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
469 label.label = Label
470 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
471 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
472 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
473 label.calculating_pca= Calculating PCA
474 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
475 label.jalview_applet = Jalview applet
476 label.loading_data = Loading data
477 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
478 label.calculating_tree = Calculating tree
479 label.state_queueing = queuing
480 label.state_running = running
481 label.state_completed = finished
482 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
483 label.state_job_error = job error!
484 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
485 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
486 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
487 label.structure_type = Structure type
488 label.settings_for_type = Settings for {0}
489 label.view_full_application = View in Full Application
490 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
491 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
492 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
493 label.load_vcf_file = Load VCF File
494 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
495 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
496 label.export_features = Export Features...
497 label.export_annotations = Export Annotations...
498 label.to_upper_case = To Upper Case
499 label.to_lower_case = To Lower Case
500 label.toggle_case = Toggle Case
501 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
502 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
503 label.edit_sequence = Edit Sequence
504 label.edit_sequences = Edit Sequences
505 label.insert_gap = Insert 1 gap
506 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
507 label.delete_gap = Delete 1 gap
508 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
509 label.sequence_details = Sequence Details
510 label.jmol_help = Jmol Help
511 label.chimera_help = Chimera Help
512 label.close_viewer = Close Viewer
513 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
514 label.all = All
515 label.sort_by = Sort alignment by
516 label.sort_by_score = Sort by Score
517 label.sort_by_density = Sort by Density
518 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
519 label.sort_ann_by = Sort annotations by
520 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
521 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
522 label.reveal = Reveal
523 label.hide_columns = Hide Columns
524 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
525 label.load_tree_file = Load a tree file
526 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
527 label.standard_databases = Standard Databases
528 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
529 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
530 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
531 label.connect_to_session = Connect to session {0}
532 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
533 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
534 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
535 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
536 label.adjust_threshold = Adjust threshold
537 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
538 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
539 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
540 label.open_url_param = Open URL {0}
541 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
542 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
543 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
544 label.dark_colour = Dark Colour
545 label.light_colour = Light Colour
546 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
547 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
548 label.copy_format_from = Copy format from
549 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
550 label.select_all_views = Select all views
551 label.select_many_views = Select many views
552 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
553 label.open_local_file = Open local file
554 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
555 label.listen_for_selections = Listen for selections
556 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
557 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
558 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
559 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
560 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
561 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
562 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
563 label.no_services = <No Services>
564 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
565 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
566 label.connect_to = Connect to
567 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
568 label.from_url = from URL
569 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
570 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
571 label.from_textbox = from Textbox
572 label.window = Window
573 label.preferences = Preferences
574 label.tools = Tools
575 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
576 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
577 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
578 label.collect_garbage = Collect Garbage
579 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
580 label.show_java_console = Show Java Console
581 label.show_jalview_news = Show Jalview News
582 label.take_snapshot = Take snapshot
583 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
584 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
585 label.monospaced_font= Monospaced
586 label.quality = Quality
587 label.maximize_window = Maximize Window
588 label.conservation = Conservation
589 label.consensus = Consensus
590 label.histogram = Histogram
591 label.logo = Logo
592 label.non_positional_features = List Non-positional Features
593 label.database_references = List Database References
594 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
595 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
596 label.gap_symbol = Gap Symbol
597 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
598 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
599 label.address = Address
600 label.port = Port
601 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
602 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
603 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
604 label.check_for_latest_version = Check for latest version
605 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
606 label.use_proxy_server = Use a proxy server
607 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
608 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
609 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
610 label.smooth_font = Smooth Font
611 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
612 label.pad_gaps = Pad Gaps
613 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
614 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
615 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
616 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
617 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
618 label.right_align_ids = Right Align Ids
619 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
620 label.open_overview = Open Overview
621 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
622 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
623 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
624 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
625 label.visual = Visual
626 label.connections = Connections
627 label.output = Output
628 label.editing = Editing
629 label.das_settings = DAS Settings
630 label.web_services = Web Services
631 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
632 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
633 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
634 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
635 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
636 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
637 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
638 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
639 label.new_service_url = New Service URL
640 label.edit_service_url = Edit Service URL
641 label.delete_service_url = Delete Service URL
642 label.details = Details
643 label.options = Options
644 label.parameters = Parameters
645 label.available_das_sources = Available DAS Sources
646 label.full_details = Full Details
647 label.authority = Authority
648 label.type = Type
649 label.proxy_server = Proxy Server
650 label.file_output = File Output
651 label.select_input_type = Select input type
652 label.set_options_for_type = Set options for type
653 label.data_input_parameters = Data input parameters
654 label.data_returned_by_service = Data returned by service
655 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
656 label.parsing_errors = Parsing errors
657 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
658 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
659 label.input_parameter_name = Input Parameter name
660 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
661 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
662 label.brief_description_service = Brief description of service
663 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
664 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
665 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
666 label.gap_character = Gap character
667 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
668 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
669 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
670 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
671 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
672 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
673 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
674 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
675 label.input_output = Input/Output
676 label.cut_paste = Cut'n'Paste
677 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
678 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
679 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
680 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
681 label.from_file = From File
682 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
683 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
684 label.text_colour = Text Colour...
685 label.structure = Structure
686 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
687 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
688 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
689 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
690 label.sequence_name = Sequence Name
691 label.sequence_description = Sequence Description
692 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
693 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
694 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
695 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
696 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
697 label.web_browser_not_found = Web browser not found
698 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
699 label.html = HTML
700 label.wrap = Wrap
701 label.show_database_refs = Show Database Refs
702 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
703 label.save_png_image = Save As PNG Image
704 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
705 label.export_image = Export Image
706 label.vamsas_store = VAMSAS store
707 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
708 label.reverse = Reverse
709 label.reverse_complement = Reverse Complement
710 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
711 label.extract_scores = Extract Scores
712 label.get_cross_refs = Get Cross-References
713 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
714 label.add_sequences = Add Sequences
715 label.new_window = New Window
716 label.split_window = Split Window
717 label.refresh_available_sources = Refresh Available Sources
718 label.use_registry = Use Registry
719 label.add_local_source = Add Local Source
720 label.set_as_default = Set as Default
721 label.show_labels = Show labels
722 action.background_colour = Background Colour...
723 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
724 label.link_name = Link Name
725 label.pdb_file = PDB file
726 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
727 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
728 label.superpose_structures = Superpose Structures
729 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
730 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
731 label.jmol = Jmol
732 label.chimera = Chimera
733 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
734 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
735 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
736 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
737 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
738 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
739 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
740 label.case_sensitive = Case Sensitive
741 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
742 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
743 label.index_by_host = Index by Host
744 label.index_by_type = Index by Type
745 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
746 label.display_warnings = Display Warnings
747 label.move_url_up = Move URL Up
748 label.move_url_down = Move URL Down
749 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
750 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
751 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
752 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
753 label.sequences_updated = Sequences updated
754 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
755 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
756 label.paste_new_window = Paste To New Window
757 label.settings_for_param = Settings for {0}
758 label.view_params = View {0}
759 label.aacon_calculations = AACon Calculations
760 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
761 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
762 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
763 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
764 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
765 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
766 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
767 label.all_views = All Views
768 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
769 label.realign_with_params = Realign with {0}
770 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
771 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
772 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
773 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
774 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
775 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
776 label.view_documentation = View documentation
777 label.select_return_type = Select return type
778 label.translation_of_params = Translation of {0}
779 label.features_for_params = Features for - {0}
780 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
781 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
782 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
783 label.varna_params = VARNA - {0}
784 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
785 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
786 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
787 label.points_for_params = Points for {0}
788 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
789 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
790 label.select_background_colour = Select Background Colour
791 label.invalid_font = Invalid Font
792 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
793 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
794 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
795 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
796 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
797 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
798 label.example_query_param = Example query: {0}
799 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
800 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
801 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
802 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
803 label.select_columns_containing = Select columns containing
804 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
805 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
806 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
807 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
808 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
809 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
810 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
811 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
812 label.use_sequence_id_4 = 
813 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
814 label.switch_server = Switch server
815 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
816 label.services_at = Services at {0}
817 label.rest_client_submit = {0} using {1}
818 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
819 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
820 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
821 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
822 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
823 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
824 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
825 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
826 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
827 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
828 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
829 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
830 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
831 label.user_preset = User Preset
832 label.service_preset = Service Preset
833 label.run_with_preset = Run {0} with preset
834 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
835 action.by_title_param = By {0}
836 label.source_from_db_source = Sources from {0}
837 label.from_msname = from {0}
838 label.superpose_with = Superpose with
839 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
840 label.add_new_row = Add New Row
841 label.edit_label_description = Edit Label/Description
842 label.hide_row = Hide This Row
843 label.delete_row = Delete This Row
844 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
845 label.export_annotation = Export Annotation
846 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
847 label.helix = Helix
848 label.sheet = Sheet
849 label.rna_helix = RNA Helix
850 label.remove_annotation = Remove Annotation
851 label.colour_by = Colour by...
852 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
853 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
854 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
855 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
856 label.multiharmony = Multi-Harmony
857 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
858 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
859 label.prompt_each_time = Prompt each time
860 label.use_source = Use Source
861 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
862 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
863 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
864 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
865 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
866 label.invalid_name = Invalid name
867 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
868 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
869 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
870 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
871 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
872 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
873 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
874 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
875 label.feature_type = Feature Type
876 label.show = Show
877 label.service_url = Service URL
878 label.copied_sequences = Copied sequences
879 label.cut_sequences = Cut Sequences
880 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
881 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
882 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
883 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
884 label.save_features_to_file = Save Features to File
885 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
886 label.save_pdb_file = Save PDB File
887 label.save_text_to_file = Save Text to File
888 label.save_state = Save State
889 label.restore_state = Restore State
890 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
891 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
892 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
893 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
894 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
895 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
896 label.select_startup_file = Select startup file
897 label.select_default_browser = Select default web browser
898 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
899 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
900 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
901 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
902 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
903 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
904 label.save_as_html = Save as HTML
905 label.recently_opened = Recently Opened
906 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
907 label.tree = Tree
908 label.tree_from = Tree from {0}
909 label.webservice_job_title = {0} using {1}
910 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
911 label.visible = Visible
912 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
913 label.visible_region_of = visible region of
914 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
915 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
916 label.loading_file = Loading File: {0}
917 label.edit_params = Edit {0}
918 label.as_percentage = As Percentage
919 error.not_implemented = Not implemented
920 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
921 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
922 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
923 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
924 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
925 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
926 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
927 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
928 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
929 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
930 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
931 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
932 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
933 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
934 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
935 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
936 error.implementation_error = Implementation error
937 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
938 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
939 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
940 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
941 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
942 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
943 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
944 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
945 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
946 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
947 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
948 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
949 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
950 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
951 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
952 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
953 label.cancelled_params = Cancelled {0}
954 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
955 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
956 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
957 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
958 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
959 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
960 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
961 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
962 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
963 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
964 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
965 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
966 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
967 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
968 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
969 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
970 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
971 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
972 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
973 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
974 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
975 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
976 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
977 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
978 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
979 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
980 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
981 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
982 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
983 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
984 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
985 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
986 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
987 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
988 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
989 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
990 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
991 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
992 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
993 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
994 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
995 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
996 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
997 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
998 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
999 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
1000 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
1001 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
1002 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
1003 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
1004 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
1005 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
1006 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
1007 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
1008 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
1009 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
1010 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
1011 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
1012 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
1013 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
1014 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
1015 label.toggled = Toggled
1016 label.marked = Marked
1017 label.containing = containing
1018 label.not_containing = not containing
1019 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1020 label.submission_params = Submission {0}
1021 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1022 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1023 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1024 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1025 label.pca_calculating = Calculating PCA
1026 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1027 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1028 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1029 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1030 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1031 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1032 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1033 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1034 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1035 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1036 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1037 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1038 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1039 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1040 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1041 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1042 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1043 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1044 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1045 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1046 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1047 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1048 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1049 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1050 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1051 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1052 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1053 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1054 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1055 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1056 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1057 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1058 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1059 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1060 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1061 label.mapped = mapped
1062 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1063 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1064 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1065 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1066 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1067 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1068 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1069 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1070 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1071 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1072 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1073 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1074 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1075 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1076 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1077 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1078 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1079 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1080 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1081 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1082 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1083 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1084 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1085 exception.das_source_doesnt_support_sequence_command = Source {0} does not support the sequence command.
1086 exception.invalid_das_source = Invalid das source: {0}
1087 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1088 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1089 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1090 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1091 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1092 label.remove_gaps = Remove Gaps
1093 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1094 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1095 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1096 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1097 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1098 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1099 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1100 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1101 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1102 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1103 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1104 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1105 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1106 warn.service_not_supported = Service not supported!
1107 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1108 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1109 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1110 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1111 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1112 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1113 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1114 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1115 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1116 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1117 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1118 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1119 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1120 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1121 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1122 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1123 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1124 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1125 label.eps_file = EPS file
1126 label.png_image = PNG image
1127 status.saving_file = Saving {0}
1128 status.export_complete = {0} Export completed.
1129 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1130 status.refreshing_news = Refreshing news
1131 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1132 status.opening_params = Opening {0}
1133 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1134 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1135 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1136 status.finshed_querying = Finished querying
1137 status.parsing_results = Parsing results.
1138 status.processing = Processing...
1139 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1140 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1141 status.fetching_das_sequence_features = Fetching DAS Sequence Features
1142 status.no_das_sources_active = No DAS Sources Active
1143 status.das_feature_fetching_cancelled = DAS Feature Fetching Cancelled
1144 status.das_feature_fetching_complete = DAS Feature Fetching Complete
1145 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1146 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1147 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1148 status.opening_file_for = opening file for
1149 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1150 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1151 label.font_too_small = Font size is too small
1152 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1153 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1154 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1155 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1156 label.out_of_memory = Out of memory
1157 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1158 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1159 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1160 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1161 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1162 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1163 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1164 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1165 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1166 label.test_server = Test Server?
1167 info.you_want_jalview_to_find_uniprot_accessions = Do you want Jalview to find\nUniprot Accession ids for given sequence names?
1168 label.find_uniprot_accession_ids = Find Uniprot Accession Ids
1169 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1170 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1171 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1172 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1173 label.file_already_exists = File exists
1174 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1175 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1176 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1177 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1178 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1179 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1180 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1181 label.delete_all = Delete all sequences
1182 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1183 label.add_annotations_for = Add annotations for
1184 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1185 label.choose_annotations = Choose Annotations
1186 label.find = Find
1187 label.invalid_search = Search string invalid
1188 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1189 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1190 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1191 label.show_group_logo = Show Group Logo
1192 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1193 label.show_histogram = Show Histogram
1194 label.show_logo = Show Logo
1195 label.normalise_logo = Normalise Logo
1196 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1197 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1198 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1199 label.open_split_window = Open split window
1200 action.no = No
1201 action.yes = Yes
1202 label.for = for
1203 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1204 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1205 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1206 label.alpha_helix = Alpha Helix
1207 label.beta_strand = Beta Strand
1208 label.turn = Turn
1209 label.select_all = Select All
1210 label.structures_filter = Structures Filter
1211 label.search_filter = Search Filter
1212 label.include_description= Include Description
1213 action.back = Back
1214 label.hide_insertions = Hide Insertions
1215 label.mark_as_representative = Mark as representative
1216 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1217 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1218 label.result = result
1219 label.results = results
1220 label.structure_chooser = Structure Chooser
1221 label.invert = Invert 
1222 label.select_pdb_file = Select PDB File
1223 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1224 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1225 label.search_result = Search Result
1226 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1227 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1228 label.start_jalview = Start Jalview
1229 label.biojs_html_export = BioJS
1230 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1231 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1232 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1233 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1234 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1235 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1236 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1237 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1238 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1239 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1240 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1241 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1242 action.export_groups = Export Groups
1243 action.export_annotations = Export Annotations
1244 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1245 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1246 action.export_features = Export Features
1247 label.export_settings = Export Settings
1248 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1249 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1250 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1251 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1252 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1253 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1254 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1255 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1256 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1257 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1258 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1259 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1260 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1261 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1262 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1263 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1264 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1265 label.run_groovy = Run Groovy console script
1266 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1267 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1268 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1269 action.next_page= >> 
1270 action.prev_page= << 
1271 label.next_page_tooltip=Next Page
1272 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1273 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1274 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1275 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1276 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1277 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1278 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1279 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1280 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1281 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1282 label.column = Column
1283 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1284 label.operation_failed = Operation failed
1285 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1286 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1287 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1288 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1289 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1290 action.customfilter = Custom only
1291 action.showall = Show All
1292 label.insert = Insert:
1293 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1294 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1295 label.primary = Double Click
1296 label.inmenu = In Menu
1297 label.id = ID
1298 label.database = Database
1299 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1300 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1301 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1302 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1303 label.urllinks = Links
1304 label.default_cache_size = Default Cache Size
1305 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1306 label.togglehidden = Show hidden regions
1307 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1308 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1309 label.consensus_descr = PID
1310 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1311 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1312 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1313 label.show_experimental = Enable experimental features
1314 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1315 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1316 label.overview_settings = Overview settings
1317 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1318 label.gap_colour = Gap colour:
1319 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1320 label.hidden_colour = Hidden colour:
1321 label.select_gap_colour = Select gap colour
1322 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1323 label.overview = Overview
1324 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1325 label.oview_calc = Recalculating overview...
1326 label.feature_details = Feature details
1327 label.matchCondition_contains = Contains
1328 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1329 label.matchCondition_matches = Matches
1330 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1331 label.matchCondition_present = Is present
1332 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1333 label.matchCondition_eq = =
1334 label.matchCondition_ne = not =
1335 label.matchCondition_lt = <
1336 label.matchCondition_le = <=
1337 label.matchCondition_gt = >
1338 label.matchCondition_ge = >=
1339 label.numeric_required = The value should be numeric
1340 label.filter = Filter
1341 label.filters = Filters
1342 label.join_conditions = Join conditions with
1343 label.score = Score
1344 label.colour_by_label = Colour by label
1345 label.variable_colour = Variable colour...
1346 label.select_colour = Select colour
1347 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1348 option.autosearch = Autosearch
1349 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1350 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1351 label.simple = Simple
1352 label.simple_colour = Simple Colour
1353 label.colour_by_text = Colour by text
1354 label.graduated_colour = Graduated Colour
1355 label.by_text_of = By text of
1356 label.by_range_of = By range of
1357 label.or = Or
1358 label.and = And
1359 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1360 label.best_quality = Best Quality
1361 label.best_resolution = Best Resolution
1362 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1363 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1364 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1365 label.cached_structures = Cached Structures
1366 label.free_text_search = Free Text Search
1367 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1368 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1369 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1370 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1371 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1372 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1373 label.backups = Backups
1374 label.backup = Backup
1375 label.backup_files = Backup Files
1376 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1377 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1378 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1379 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1380 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1381 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1382 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1383 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1384 label.keep_files = Deleting old backup files
1385 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1386 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1387 label.autodelete_old_backup_files = Autodelete old backup files:
1388 label.confirm_delete = Always ask
1389 label.auto_delete = Automatically delete
1390 label.filename = filename
1391 label.braced_oldest = (oldest)
1392 label.braced_newest = (most recent)
1393 label.configuration = Configuration
1394 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1395 label.schemes = Schemes
1396 label.customise = Customise
1397 label.default = Default
1398 label.single_file = Single backup
1399 label.keep_all_versions = Keep all versions
1400 label.rolled_backups = Rolled backup files
1401 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1402 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1403 label.include_backup_files = Include backup files
1404 label.cancel_changes = Cancel changes
1405 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1406 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1407 label.was_previous = was {0}
1408 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1409 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1410 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1411 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1412 label.delete = Delete
1413 label.rename = Rename
1414 label.keep = Keep
1415 label.file_info = (modified {0}, size {1})