JAL-2717 adjusted code so default correctly returned if i18n fails
[jalview.git] / resources / lang / Messages.properties
1 action.refresh_services = Refresh Services
2 action.reset_services = Reset Services
3 action.merge_results = Merge Results
4 action.load_scheme = Load scheme
5 action.save_scheme = Save scheme
6 label.scheme_changed = Changes to scheme ''{0}'' have not been saved.<br><br>Save changes, or continue without saving to make a new colour scheme.
7 label.save_changes = Save Changes
8 label.dont_save_changes = Don't Save
9 action.save_image = Save Image
10 action.paste = Paste
11 action.show_html_source = Show HTML Source
12 action.print = Print...
13 action.web_service = Web Service
14 action.cancel_job = Cancel Job
15 action.start_job = Start Job
16 action.revert = Revert
17 action.move_down = Move Down
18 action.move_up = Move Up
19 action.remove_return_datatype = Remove return datatype
20 action.add_return_datatype = Add return datatype
21 action.remove_input_parameter = Remove selected input parameter
22 action.add_input_parameter = Add input parameter
23 action.edit = Edit
24 action.new = New
25 action.open_file = Open file
26 action.show_unconserved = Show Unconserved
27 action.open_new_alignment = Open new alignment
28 action.raise_associated_windows = Raise Associated Windows
29 action.minimize_associated_windows = Minimize Associated Windows
30 action.close_all = Close all
31 action.load_project = Load Project
32 action.save_project = Save Project
33 action.save_project_as = Save Project as...
34 action.quit = Quit
35 action.expand_views = Expand Views
36 action.gather_views = Gather Views
37 action.page_setup = Page Setup...
38 action.reload = Reload
39 action.load = Load
40 action.open = Open
41 action.cancel = Cancel
42 action.create = Create
43 action.update = Update
44 action.delete = Delete
45 action.clear = Clear
46 action.accept = Accept
47 action.select_ddbb = --- Select Database ---
48 action.undo = Undo
49 action.redo = Redo
50 action.reset = Reset
51 action.remove_left = Remove left
52 action.remove_right = Remove right
53 action.remove_empty_columns = Remove Empty Columns
54 action.remove_all_gaps = Remove All Gaps
55 action.left_justify_alignment = Left Justify Alignment
56 action.right_justify_alignment = Right Justify Alignment
57 action.boxes = Boxes
58 action.text = Text
59 action.by_pairwise_id = By Pairwise Identity
60 action.by_id = By Id
61 action.by_length = By Length
62 action.by_group = By Group
63 action.unmark_as_reference = Unmark as Reference 
64 action.set_as_reference = Set as Reference 
65 action.remove = Remove
66 action.remove_redundancy = Remove Redundancy...
67 action.pairwise_alignment = Pairwise Alignment
68 action.user_defined = User Defined...
69 action.by_conservation = By Conservation
70 action.wrap = Wrap
71 action.show_gaps = Show Gaps
72 action.show_hidden_markers = Show Hidden Markers
73 action.find = Find
74 action.undefine_groups = Undefine Groups
75 action.make_groups_selection = Make Groups For Selection
76 action.copy = Copy
77 action.cut = Cut
78 action.font = Font...
79 action.scale_above = Scale Above
80 action.scale_left = Scale Left
81 action.scale_right = Scale Right
82 action.by_tree_order = By Tree Order
83 action.sort = Sort
84 action.calculate_tree = Calculate Tree...
85 action.calculate_tree_pca = Calculate Tree or PCA...
86 action.help = Help
87 action.by_annotation = By Annotation...
88 action.invert_sequence_selection = Invert Sequence Selection
89 action.invert_column_selection = Invert Column Selection
90 action.show = Show
91 action.hide = Hide
92 action.ok = OK
93 action.set_defaults = Defaults
94 action.create_group = Create Group
95 action.remove_group = Remove Group
96 action.edit_group = Edit Group
97 action.border_colour = Border colour
98 action.edit_new_group = Edit New Group
99 action.hide_sequences = Hide Sequences
100 action.sequences = Sequences
101 action.ids = IDS
102 action.ids_sequences = IDS and sequences
103 action.reveal_all = Reveal All
104 action.reveal_sequences = Reveal Sequences
105 action.find_all = Find all
106 action.find_next = Find next
107 action.file = File
108 action.view = View
109 action.annotations = Annotations
110 action.change_params = Change Parameters
111 action.apply = Apply
112 action.apply_threshold_all_groups = Apply threshold to all groups
113 action.apply_all_groups = Apply to all Groups
114 action.by_chain = By Chain
115 action.by_sequence = By Sequence
116 action.paste_annotations = Paste Annotations
117 action.format = Format
118 action.select = Select
119 action.new_view = New View
120 action.close = Close
121 action.add = Add
122 action.save_as = Save as...
123 action.save = Save
124 action.change_font = Change Font
125 action.change_font_tree_panel = Change Font (Tree Panel)
126 action.colour = Colour
127 action.calculate = Calculate
128 action.select_all = Select all
129 action.select_highlighted_columns = Select Highlighted Columns
130 tooltip.select_highlighted_columns = Press B to mark highlighted columns, Ctrl-(or Cmd)-B to toggle, and Alt-B to mark all but highlighted columns 
131 action.deselect_all = Deselect all
132 action.invert_selection = Invert selection
133 action.using_jmol = Using Jmol
134 action.link = Link
135 action.group_link = Group Link
136 action.show_chain = Show Chain
137 action.show_group = Show Group
138 action.fetch_db_references = Fetch DB References
139 action.view_flanking_regions = Show flanking regions
140 label.view_flanking_regions = Show sequence data either side of the subsequences involved in this alignment
141 label.structures_manager = Structures Manager
142 label.url = URL
143 label.url\: = URL:
144 label.input_file_url = Enter URL or Input File
145 label.select_feature = Select feature
146 label.name = Name
147 label.name\: = Name:
148 label.name_param = Name: {0}
149 label.group = Group
150 label.group\: = Group:
151 label.group_name = Group Name
152 label.group_description = Group Description
153 label.edit_group_name_description = Edit Group Name/Description
154 label.colour = Colour:
155 label.description = Description
156 label.description\: = Description:
157 label.start = Start:
158 label.end = End:
159 label.current_parameter_set_name = Current parameter set name:
160 label.service_action = Service Action:
161 label.post_url = POST URL:
162 label.url_suffix = URL Suffix
163 label.per_seq = per Sequence
164 label.result_vertically_separable = Results are vertically separable
165 label.amend = Amend
166 label.undo_command = Undo {0}
167 label.redo_command = Redo {0}
168 label.principal_component_analysis = Principal Component Analysis
169 label.average_distance_identity = Average Distance Using % Identity
170 label.neighbour_joining_identity = Neighbour Joining Using % Identity
171 label.choose_calculation = Choose Calculation
172 label.calc_title = {0} Using {1}
173 label.tree_calc_av = Average Distance
174 label.tree_calc_nj = Neighbour Joining
175 label.score_model_pid = % Identity
176 label.score_model_blosum62 = BLOSUM62
177 label.score_model_pam250 = PAM 250
178 label.score_model_smithwatermanscore = Score between two sequences aligned with Smith-Waterman with default Peptide/Nucleotide matrix
179 label.score_model_sequencefeaturesimilarity = Distance measure of average number of features not shared at sequence positions 
180 label.score_model_conservation = Physicochemical property conservation
181 label.score_model_enhconservation = Physicochemical property conservation
182 label.status_bar = Status bar
183 label.out_to_textbox = Output to Textbox
184 label.occupancy = Occupancy
185 # delete Clustal - use FileFormat name instead
186 label.clustal = Clustal
187 # label.colourScheme_<schemeName> as in JalviewColourScheme, spaces removed
188 label.colourScheme_clustal = Clustalx
189 label.colourScheme_blosum62 = BLOSUM62 Score
190 label.colourScheme_%identity = Percentage Identity
191 label.colourScheme_zappo = Zappo
192 label.colourScheme_taylor = Taylor
193 label.colourScheme_hydrophobic = Hydrophobicity
194 label.colourScheme_helixpropensity = Helix Propensity
195 label.colourScheme_strandpropensity = Strand Propensity
196 label.colourScheme_turnpropensity = Turn Propensity
197 label.colourScheme_buriedindex = Buried Index
198 label.colourScheme_purine/pyrimidine = Purine/Pyrimidine
199 label.colourScheme_nucleotide = Nucleotide
200 label.colourScheme_t-coffeescores = T-Coffee Scores
201 label.colourScheme_rnahelices = By RNA Helices
202 label.colourScheme_sequenceid = Sequence ID Colour
203 label.blc = BLC
204 label.fasta = Fasta
205 label.msf = MSF
206 label.pfam = PFAM
207 label.pileup = Pileup
208 label.pir = PIR
209 label.average_distance_blosum62 = Average Distance Using BLOSUM62
210 label.neighbour_blosum62 = Neighbour Joining Using BLOSUM62
211 label.show_annotations = Show annotations
212 label.hide_annotations = Hide annotations
213 label.show_all_seq_annotations = Show sequence related
214 label.hide_all_seq_annotations = Hide sequence related
215 label.show_all_al_annotations = Show alignment related
216 label.hide_all_al_annotations = Hide alignment related
217 label.hide_all = Hide all
218 label.add_reference_annotations = Add reference annotations
219 label.find_tip = Search alignment, selection or sequence ids for a subsequence (ignoring gaps).<br>Accepts regular expressions - search Help for 'regex' for details.
220 label.colour_text = Colour Text
221 label.show_non_conserved = Show nonconserved
222 label.overview_window = Overview Window
223 label.none = None
224 label.above_identity_threshold = Above Identity Threshold
225 label.show_sequence_features = Show Sequence Features
226 label.nucleotide = Nucleotide
227 label.protein = Protein
228 label.nucleotides = Nucleotides
229 label.proteins = Proteins
230 label.to_new_alignment = To New Alignment
231 label.to_this_alignment = Add To This Alignment
232 label.apply_colour_to_all_groups = Apply Colour To All Groups
233 label.modify_identity_threshold = Modify Identity Threshold...
234 label.modify_conservation_threshold = Modify Conservation Threshold...
235 label.input_from_textbox = Input from textbox
236 label.centre_column_labels = Centre column labels
237 label.automatic_scrolling = Automatic Scrolling
238 label.documentation = Documentation
239 label.about = About...
240 label.show_sequence_limits = Show Sequence Limits
241 action.feature_settings = Feature Settings...
242 label.all_columns = All Columns
243 label.all_sequences = All Sequences
244 label.selected_columns = Selected Columns 
245 label.selected_sequences = Selected Sequences
246 label.except_selected_sequences = All except selected sequences
247 label.all_but_selected_region = All but Selected Region (Shift+Ctrl+H)
248 label.selected_region = Selected Region
249 label.all_sequences_columns = All Sequences and Columns
250 label.hide_selected_annotations = Hide selected annotations
251 label.show_selected_annotations = Show selected annotations
252 label.group_consensus = Group Consensus
253 label.group_conservation = Group Conservation
254 label.show_consensus_histogram = Show Consensus Histogram
255 label.show_consensus_logo = Show Consensus Logo
256 label.norm_consensus_logo = Normalise Consensus Logo
257 label.apply_all_groups = Apply to all groups
258 label.autocalculated_annotation = Autocalculated Annotation
259 label.show_first = Show first
260 label.show_last = Show last
261 label.struct_from_pdb = Process secondary structure from PDB
262 label.use_rnaview = Use RNAView for secondary structure
263 label.autoadd_secstr = Add secondary structure annotation to alignment
264 label.autoadd_temp = Add Temperature Factor annotation to alignment
265 label.structure_viewer = Default structure viewer
266 label.double_click_to_browse = Double-click to browse for file
267 label.chimera_path = Path to Chimera program
268 label.chimera_path_tip = Jalview will first try any path entered here, else standard installation locations.<br>Double-click to browse for file.
269 label.invalid_chimera_path = Chimera path not found or not executable
270 label.chimera_missing = Chimera structure viewer not found.<br/>Please enter the path to Chimera (if installed),<br/>or download and install UCSF Chimera.
271 label.chimera_failed = Error opening Chimera - is it installed?\nCheck path in Preferences, Structure
272 label.min_colour = Minimum Colour
273 label.max_colour = Maximum Colour
274 label.no_colour = No Colour
275 label.use_original_colours = Use Original Colours
276 label.threshold_minmax = Threshold is min/max
277 label.represent_group_with = Represent Group with {0}
278 label.selection = Selection
279 label.group_colour = Group Colour
280 label.sequence = Sequence
281 label.view_pdb_structure = View PDB Structure
282 label.min_value = Min value
283 label.max_value = Max value
284 label.no_value = No value
285 label.new_feature = New Feature
286 label.match_case = Match Case
287 label.view_alignment_editor = View in alignment editor
288 label.labels = Labels
289 label.output_values = Output Values...
290 label.output_points = Output points...
291 label.output_transformed_points = Output transformed points
292 label.input_data = Input Data...
293 label.nucleotide_matrix = Nucleotide matrix
294 label.protein_matrix = Protein matrix
295 label.show_bootstrap_values = Show Bootstrap Values
296 label.show_distances = Show distances
297 label.mark_unassociated_leaves = Mark Unassociated Leaves
298 label.fit_to_window = Fit To Window
299 label.newick_format = Newick Format
300 label.select_newick_like_tree_file = Select a newick-like tree file
301 label.colours = Colours
302 label.view_mapping = View Mapping
303 label.wireframe = Wireframe
304 label.depthcue = Depthcue
305 label.z_buffering = Z Buffering
306 label.charge_cysteine = Charge & Cysteine
307 label.all_chains_visible = All Chains Visible
308 label.successfully_added_features_alignment = Successfully added features to alignment
309 label.keyboard_editing_mode = Keyboard editing mode is {0}
310 label.paste_features_annotations_Tcoffee_here = Paste your features / annotations / T-coffee score file here.
311 label.removed_columns = Removed {0} columns.
312 label.removed_empty_columns = Removed {0} empty columns.
313 label.paste_newick_tree_file = Paste your Newick tree file here.
314 label.order_by_params = Order by {0}
315 label.html_content = <html>{0}</html>
316 label.paste_pdb_file= Paste your PDB file here.
317 label.paste_pdb_file_for_sequence = Paste PDB file for sequence {0}
318 label.could_not_parse_newick_file  = Could not parse Newick file\!\n {0}
319 label.successfully_pasted_tcoffee_scores_to_alignment= Successfully pasted T-Coffee scores to alignment.
320 label.failed_add_tcoffee_scores = Failed to add T-Coffee scores: 
321 label.successfully_pasted_annotation_to_alignment= Successfully pasted annotation to alignment.
322 label.couldnt_parse_pasted_text_as_valid_annotation_feature_GFF_tcoffee_file = Couldn't parse pasted text as a valid annotation, feature, GFF, or T-Coffee score file
323 label.successfully_pasted_alignment_file = Successfully pasted alignment file
324 label.paste_your_alignment_file = Paste your alignment file here
325 label.paste_your = Paste your
326 label.finished_searching = Finished searching
327 label.search_results= Search results {0} : {1}
328 label.found_match_for = Found match for {0}
329 label.font = Font:
330 label.size = Size:
331 label.style = Style:
332 label.calculating = Calculating....
333 label.modify_conservation_visibility = Modify conservation visibility
334 label.colour_residues_above_occurrence = Colour residues above % occurrence
335 label.set_this_label_text = set this label text
336 label.sequences_from = Sequences from {0}
337 label.successfully_loaded_file  = Successfully loaded file {0}
338 label.successfully_loaded_matrix  = Successfully loaded score matrix {0}
339 label.successfully_saved_to_file_in_format = Successfully saved to file: {0} in {1} format.
340 label.copied_sequences_to_clipboard = Copied {0} sequences to clipboard.
341 label.check_file_matches_sequence_ids_alignment = Check that the file matches sequence IDs in the alignment.
342 label.problem_reading_tcoffee_score_file = Problem reading T-COFFEE score file
343 label.source_to_target = {0} ... {1}
344 label.per_sequence_only= Per-sequence only
345 label.to_file = to File
346 label.to_textbox = to Textbox
347 label.jalview = Jalview
348 label.csv_spreadsheet = CSV (Spreadsheet)
349 label.status = Status
350 label.channels = Channels
351 label.channel_title_item_count = {0} ({1})
352 label.blog_item_published_on_date = {0} {1} 
353 label.session_update = Session Update
354 label.new_vamsas_session = New Vamsas Session
355 action.load_vamsas_session = Load Vamsas Session...
356 action.save_vamsas_session = Save Vamsas Session
357 label.select_vamsas_session_opened_as_new_vamsas_session= Select a vamsas session to be opened as a new vamsas session.
358 label.open_saved_vamsas_session = Open a saved VAMSAS session
359 label.groovy_console = Groovy Console...
360 label.lineart = Lineart
361 label.dont_ask_me_again = Don't ask me again
362 label.select_eps_character_rendering_style = Select EPS character rendering style
363 label.invert_selection = Invert Selection
364 label.optimise_order = Optimise Order
365 label.seq_sort_by_score = Sequence sort by Score
366 label.load_colours = Load Colours
367 label.save_colours = Save Colours
368 label.load_colours_tooltip = Load feature colours and filters from file
369 label.save_colours_tooltip = Save feature colours and filters to file
370 label.selected_database_to_fetch_from = Selected {0} database {1} to fetch from {2} 
371 label.database_param = Database: {0}
372 label.example = Example
373 label.example_param = Example: {0}
374 label.select_file_format_before_saving = You must select a file format before saving!
375 label.file_format_not_specified = File format not specified
376 label.couldnt_save_file = Couldn't save file: {0}
377 label.error_saving_file = Error Saving File
378 label.remove_from_default_list = Remove from default list?
379 label.remove_user_defined_colour = Remove user defined colour
380 label.you_must_select_least_two_sequences = You must select at least 2 sequences.
381 label.invalid_selection = Invalid Selection
382 label.sequence_selection_insufficient = Sequence selection insufficient
383 label.you_need_at_least_n_sequences = You need to select at least {0} sequences
384 label.not_enough_sequences = Not enough sequences
385 label.selected_region_to_tree_may_only_contain_residues_or_gaps =  The selected region to create a tree may\nonly contain residues or gaps.\nTry using the Pad function in the edit menu,\nor one of the multiple sequence alignment web services.
386 label.sequences_selection_not_aligned = Sequences in selection are not aligned
387 label.problem_reading_tree_file =  Problem reading tree file
388 label.possible_problem_with_tree_file = Possible problem with tree file
389 label.select_at_least_three_bases_in_at_least_one_sequence_to_cDNA_translation = Please select at least three bases in at least one sequence in order to perform a cDNA translation.
390 label.translation_failed = Translation Failed
391 label.error_when_translating_sequences_submit_bug_report = Unfortunately, something went wrong when translating your sequences.\nPlease take a look in the Jalview java console\nand submit a bug report including the stacktrace.
392 label.implementation_error  = Implementation error:
393 label.automatically_associate_structure_files_with_sequences_same_name = Do you want to automatically associate the {0} structure file(s) with sequences in the alignment that have the same name?
394 label.automatically_associate_structure_files_by_name = Automatically Associate Structure files by name
395 label.ignore_unmatched_dropped_files_info = <html>Do you want to <em>ignore</em> the {0} files whose names did not match any sequence IDs ?</html>
396 label.ignore_unmatched_dropped_files = Ignore unmatched dropped files?
397 label.view_name_original = Original
398 label.enter_view_name = Enter View Name
399 label.enter_label = Enter label
400 label.enter_label_for_the_structure = Enter a label for the structure
401 label.pdb_entries_couldnt_be_retrieved = The following pdb entries could not be retrieved from the PDB\:\n{0}\nPlease retry, or try downloading them manually.
402 label.couldnt_load_file = Couldn't load file
403 label.couldnt_find_pdb_id_in_file = Couldn't find a PDB id in the file supplied. Please enter an Id to identify this structure.
404 label.no_pdb_id_in_file = No PDB Id in File
405 label.couldnt_read_pasted_text = Couldn't read the pasted text {0}
406 label.error_parsing_text = Error parsing text
407 label.input_alignment_from_url = Input Alignment From URL
408 label.input_alignment = Input Alignment
409 label.couldnt_import_as_vamsas_session = Couldn't import {0} as a new vamsas session.
410 label.vamsas_document_import_failed = Vamsas Document Import Failed
411 label.couldnt_locate = Could not locate {0}
412 label.url_not_found = URL not found
413 label.new_sequence_url_link = New sequence URL link
414 label.cannot_edit_annotations_in_wrapped_view = Cannot edit annotations in wrapped view
415 label.wrapped_view_no_edit = Wrapped view - no edit
416 label.error_retrieving_data = Error Retrieving Data
417 label.user_colour_scheme_must_have_name = User colour scheme must have a name
418 label.no_name_colour_scheme = No name for colour scheme
419 label.invalid_url = Invalid URL !
420 label.error_loading_file = Error loading file
421 label.problems_opening_file = Encountered problems opening {0}!!
422 label.file_open_error = File open error
423 label.colour_scheme_exists_overwrite = Colour scheme {0} exists.\nContinue saving colour scheme as {1}?"
424 label.duplicate_scheme_name = Duplicate scheme name
425 label.jalview_new_questionnaire = There is a new Questionnaire available. Would you like to complete it now ?\n
426 label.jalview_user_survey = Jalview User Survey
427 label.alignment_properties = Alignment Properties: {0}
428 label.alignment_props = Alignment Properties
429 label.input_cut_paste = Cut & Paste Input
430 label.input_cut_paste_params = Cut & Paste Input - {0}
431 label.alignment_output_command = Alignment output - {0}
432 label.annotations = Annotations
433 label.structure_options = Structure Options
434 label.features = Features
435 label.overview_params = Overview {0}
436 label.paste_newick_file = Paste Newick file
437 label.load_tree_from_file = From File - 
438 label.colour_by_annotation = Colour by Annotation
439 label.selection_output_command = Selection output - {0}
440 label.annotation_for_displayid = <p><h2>Annotation for {0} </h2></p><p>
441 label.pdb_sequence_mapping = PDB - Sequence Mapping
442 label.pca_details = PCA details
443 label.redundancy_threshold_selection = Redundancy threshold selection
444 label.user_defined_colours = User defined colours
445 label.jalviewLite_release = JalviewLite - Release {0}
446 label.jaview_build_date = Build date: {0}
447 label.jalview_authors_1 = Authors: Jim Procter, Andrew Waterhouse, Mungo Carstairs, Tochukwu Ofoegbu, Lauren Lui, Jan Engelhardt,
448 label.jalview_authors_2 = Natasha Sherstnev, Daniel Barton, Michele Clamp, James Cuff, Steve Searle, David Martin & Geoff Barton.
449 label.jalview_dev_managers = Development managed by The Barton Group, University of Dundee, Scotland, UK.
450 label.jalview_distribution_lists = For help, see the FAQ at www.jalview.org and/or join the jalview-discuss@jalview.org mailing list
451 label.jalview_please_cite = If  you use Jalview, please cite:
452 label.jalview_cite_1_authors = Waterhouse, A.M., Procter, J.B., Martin, D.M.A, Clamp, M. and Barton, G. J. (2009)
453 label.jalview_cite_1_title = Jalview Version 2 - a multiple sequence alignment editor and analysis workbench
454 label.jalview_cite_1_ref = Bioinformatics doi: 10.1093/bioinformatics/btp033
455 label.right_click = Right click
456 label.to_add_annotation = to add annotation
457 label.alignment_has_no_annotations = Alignment has no annotations
458 label.retrieving_pdb_data = Retrieving PDB data...
459 label.label = Label
460 label.no_features_added_to_this_alignment = No Features added to this alignment!!
461 label.features_can_be_added_from_searches_1 = (Features can be added from searches or
462 label.features_can_be_added_from_searches_2 = from Jalview / GFF features files)
463 label.calculating_pca= Calculating PCA
464 label.jalview_cannot_open_file = Jalview can't open file
465 label.jalview_applet = Jalview applet
466 label.loading_data = Loading data
467 label.memory_stats = Total Free Memory: {0} MB; Max Memory: {1} MB; {2} %
468 label.calculating_tree = Calculating tree
469 label.state_queueing = queuing
470 label.state_running = running
471 label.state_completed = finished
472 label.state_job_cancelled = job cancelled!!
473 label.state_job_error = job error!
474 label.server_error_try_later = Server Error! (try later)
475 label.error_loading_pdb_data = Error loading PDB data!!
476 label.fetching_pdb_data = Fetching PDB data...
477 label.structure_type = Structure type
478 label.settings_for_type = Settings for {0}
479 label.view_full_application = View in Full Application
480 label.load_associated_tree = Load Associated Tree...
481 label.load_features_annotations = Load Features/Annotations...
482 label.load_vcf = Load SNP variants from plain text or indexed VCF data
483 label.load_vcf_file = Load VCF File
484 label.searching_vcf = Loading VCF variants...
485 label.added_vcf = Added {0} VCF variants to {1} sequence(s)
486 label.export_features = Export Features...
487 label.export_annotations = Export Annotations...
488 label.to_upper_case = To Upper Case
489 label.to_lower_case = To Lower Case
490 label.toggle_case = Toggle Case
491 label.edit_name_description = Edit Name/Description...
492 label.create_sequence_feature = Create Sequence Feature...
493 label.edit_sequence = Edit Sequence
494 label.edit_sequences = Edit Sequences
495 label.insert_gap = Insert 1 gap
496 label.insert_gaps = Insert {0} gaps
497 label.delete_gap = Delete 1 gap
498 label.delete_gaps = Delete {0} gaps
499 label.sequence_details = Sequence Details
500 label.jmol_help = Jmol Help
501 label.chimera_help = Chimera Help
502 label.close_viewer = Close Viewer
503 label.confirm_close_chimera = This will close Jalview''s connection to {0}.<br>Do you want to close the Chimera window as well?
504 label.all = All
505 label.sort_by = Sort alignment by
506 label.sort_by_score = Sort by Score
507 label.sort_by_density = Sort by Density
508 label.sequence_sort_by_density = Sequence sort by Density
509 label.sort_ann_by = Sort annotations by
510 label.sort_annotations_by_sequence = Sort by sequence
511 label.sort_annotations_by_label = Sort by label
512 label.reveal = Reveal
513 label.hide_columns = Hide Columns
514 label.load_jalview_annotations = Load Jalview Annotations or Features File
515 label.load_tree_file = Load a tree file
516 label.retrieve_parse_sequence_database_records_alignment_or_selected_sequences = Retrieve and parse sequence database records for the alignment or the currently selected sequences
517 label.standard_databases = Standard Databases
518 label.fetch_embl_uniprot = Fetch from EMBL/EMBLCDS or Uniprot/PDB and any selected DAS sources
519 label.reset_min_max_colours_to_defaults = Reset min and max colours to defaults from user preferences.
520 label.align_structures_using_linked_alignment_views = Superpose structures using {0} selected alignment view(s)
521 label.connect_to_session = Connect to session {0}
522 label.threshold_feature_display_by_score = Threshold the feature display by score.
523 label.threshold_feature_no_threshold = No Threshold
524 label.threshold_feature_above_threshold = Above Threshold
525 label.threshold_feature_below_threshold = Below Threshold
526 label.adjust_threshold = Adjust threshold
527 label.toggle_absolute_relative_display_threshold = Toggle between absolute and relative display threshold.
528 label.select_colour_minimum_value = Select Colour for Minimum Value
529 label.select_colour_maximum_value = Select Colour for Maximum Value
530 label.open_url_param = Open URL {0}
531 label.open_url_seqs_param = Open URL ({0}..) ({1} seqs)
532 label.load_pdb_file_associate_with_sequence = Load a PDB file and associate it with sequence {0}
533 label.reveal_hidden_columns = Reveal Hidden Columns with Right Mouse Button
534 label.dark_colour = Dark Colour
535 label.light_colour = Light Colour
536 label.highlightnode = Left click to select leaves.<br>Double-click to invert leaves.<br>Right click to change colour.
537 label.load_colour_scheme = Load colour scheme
538 label.copy_format_from = Copy format from
539 label.toggle_enabled_views = When enabled, allows many views to be selected.
540 label.select_all_views = Select all views
541 label.select_many_views = Select many views
542 label.edit_notes_parameter_set = Click to edit the notes for this parameter set.
543 label.open_local_file = Open local file
544 label.enable_automatically_sort_alignment_when_open_new_tree = Enable this to automatically sort<br>the alignment when you open<br> a new tree.
545 label.listen_for_selections = Listen for selections
546 label.selections_mirror_selections_made_same_sequences_other_views = When selected, selections in this view will mirror<br>selections made on the same sequences in other views.
547 label.toggle_sequence_visibility = Shift+H toggles sequence visiblity
548 label.toggle_columns_visibility = Ctrl+H toggles column visiblity.
549 label.toggles_visibility_hidden_selected_regions = H toggles visibility of hidden or selected regions
550 label.rename_tab_eXpand_reGroup=  Right-click to rename tab <br> Press X to eXpand tabs, G to reGroup.
551 label.right_align_sequence_id = Right Align Sequence Id
552 label.sequence_id_tooltip = Sequence ID Tooltip
553 label.no_services = <No Services>
554 label.select_copy_raw_html = Select this if you want to copy raw html
555 label.share_data_vamsas_applications = Share data with other vamsas applications
556 label.connect_to = Connect to
557 label.join_existing_vamsas_session = Join an existing vamsas session
558 label.from_url = from URL
559 label.any_trees_calculated_or_loaded_alignment_automatically_sort = When selected, any trees calculated or loaded onto the alignment will automatically sort the alignment
560 label.sort_with_new_tree = Sort With New Tree
561 label.from_textbox = from Textbox
562 label.window = Window
563 label.preferences = Preferences
564 label.tools = Tools
565 label.fetch_sequences = Fetch Sequences
566 action.fetch_sequences = Fetch Sequences...
567 label.stop_vamsas_session = Stop Vamsas Session
568 label.collect_garbage = Collect Garbage
569 label.show_memory_usage = Show Memory Usage
570 label.show_java_console = Show Java Console
571 label.show_jalview_news = Show Jalview News
572 label.take_snapshot = Take snapshot
573 label.monospaced_fonts_faster_to_render = Monospaced fonts are faster to render
574 label.anti_alias_fonts = Anti-alias Fonts (Slower to render)
575 label.monospaced_font= Monospaced
576 label.quality = Quality
577 label.maximize_window = Maximize Window
578 label.conservation = Conservation
579 label.consensus = Consensus
580 label.histogram = Histogram
581 label.logo = Logo
582 label.non_positional_features = List Non-positional Features
583 label.database_references = List Database References
584 #label.share_selection_across_views = Share selection across views
585 #label.scroll_highlighted_regions = Scroll to highlighted regions
586 label.gap_symbol = Gap Symbol
587 label.prot_alignment_colour = Protein Alignment Colour
588 label.nuc_alignment_colour = Nucleotide Alignment Colour
589 label.address = Address
590 label.port = Port
591 label.default_browser_unix = Default Browser (Unix)
592 label.send_usage_statistics = Send usage statistics
593 label.check_for_questionnaires = Check for questionnaires
594 label.check_for_latest_version = Check for latest version
595 label.url_linkfrom_sequence_id = URL link from Sequence ID
596 label.use_proxy_server = Use a proxy server
597 label.eps_rendering_style = EPS rendering style
598 label.append_start_end = Append /start-end (/15-380)
599 label.full_sequence_id = Full Sequence Id
600 label.smooth_font = Smooth Font
601 label.autocalculate_consensus = AutoCalculate Consensus
602 label.pad_gaps = Pad Gaps
603 label.pad_gaps_when_editing = Pad Gaps When Editing
604 label.automatically_set_id_width = Automatically set ID width
605 label.figure_id_column_width = Figure ID column width
606 label.use_modeller_output = Use Modeller Output
607 label.wrap_alignment = Wrap Alignment
608 label.right_align_ids = Right Align Ids
609 label.sequence_name_italics = Italic Sequence Ids
610 label.open_overview = Open Overview
611 label.default_colour_scheme_for_alignment = Default Colour Scheme for alignment
612 label.annotation_shading_default = Annotation Shading Default
613 label.default_minimum_colour_annotation_shading = Default Minimum Colour for annotation shading
614 label.default_maximum_colour_annotation_shading = Default Maximum Colour for annotation shading
615 label.visual = Visual
616 label.connections = Connections
617 label.output = Output
618 label.editing = Editing
619 label.web_services = Web Services
620 label.right_click_to_edit_currently_selected_parameter = Right click to edit currently selected parameter.
621 label.let_jmol_manage_structure_colours = Let Jmol manage structure colours
622 label.let_chimera_manage_structure_colours = Let Chimera manage structure colours
623 label.fetch_chimera_attributes = Fetch Chimera attributes
624 label.fetch_chimera_attributes_tip = Copy Chimera attribute to Jalview feature
625 label.marks_leaves_tree_not_associated_with_sequence = Marks leaves of tree not associated with a sequence
626 label.index_web_services_menu_by_host_site = Index web services in menu by the host site
627 label.option_want_informed_web_service_URL_cannot_be_accessed_jalview_when_starts_up = Check this option if you want to be informed<br>when a web service URL cannot be accessed by Jalview<br>when it starts up
628 label.new_service_url = New Service URL
629 label.edit_service_url = Edit Service URL
630 label.delete_service_url = Delete Service URL
631 label.details = Details
632 label.options = Options
633 label.parameters = Parameters
634 label.proxy_server = Proxy Server
635 label.file_output = File Output
636 label.select_input_type = Select input type
637 label.set_options_for_type = Set options for type
638 label.data_input_parameters = Data input parameters
639 label.data_returned_by_service = Data returned by service
640 label.rsbs_encoded_service = RSBS Encoded Service
641 label.parsing_errors = Parsing errors
642 label.simple_bioinformatics_rest_services = Simple Bioinformatics Rest Services
643 label.web_service_discovery_urls = Web Service Discovery URLS
644 label.input_parameter_name = Input Parameter name
645 label.short_descriptive_name_for_service = Short descriptive name for service
646 label.function_service_performs = What kind of function the service performs (e.g. alignment, analysis, search, etc).
647 label.brief_description_service = Brief description of service
648 label.url_post_data_service = URL to post data to service. Include any special parameters needed here
649 label.optional_suffix = Optional suffix added to URL when retrieving results from service
650 label.preferred_gap_character = Which gap character does this service prefer?
651 label.gap_character = Gap character
652 label.move_return_type_up_order= Move return type up order
653 label.move_return_type_down_order= Move return type down order
654 label.update_user_parameter_set = Update this existing user parameter set
655 label.delete_user_parameter_set = Delete the currently selected user parameter set
656 label.create_user_parameter_set = Create a new parameter set with the current settings.
657 label.revert_changes_user_parameter_set = Undo all changes to the current parameter set
658 label.start_job_current_settings = Start Job with current settings
659 label.cancel_job_close_dialog = Close this dialog and cancel job
660 label.input_output = Input/Output
661 label.cut_paste = Cut'n'Paste
662 label.adjusting_parameters_for_calculation = Adjusting parameters for existing Calculation
663 label.2d_rna_structure_line = 2D RNA {0} (alignment)
664 label.2d_rna_sequence_name = 2D RNA - {0}
665 label.edit_name_and_description_current_group = Edit name and description of current group
666 label.from_file = From File
667 label.enter_pdb_id = Enter PDB Id
668 label.enter_pdb_id_tip = Enter PDB Id (or pdbid:chaincode)
669 label.text_colour = Text Colour...
670 label.structure = Structure
671 label.show_pdbstruct_dialog = 3D Structure Data...
672 label.view_rna_structure = VARNA 2D Structure
673 label.create_sequence_details_report_annotation_for = Annotation for {0}
674 label.sequence_details_for = Sequence Details for {0}
675 label.sequence_name = Sequence Name
676 label.sequence_description = Sequence Description
677 label.edit_sequence_name_description = Edit Sequence Name/Description
678 label.spaces_converted_to_backslashes = Spaces have been converted to _
679 label.no_spaces_allowed_sequence_name = No spaces allowed in Sequence Name
680 label.select_outline_colour = Select Outline Colour
681 label.web_browser_not_found_unix = Unixers\: Couldn't find default web browser.\nAdd the full path to your browser in Preferences."
682 label.web_browser_not_found = Web browser not found
683 label.select_pdb_file_for = Select a PDB file for {0}
684 label.html = HTML
685 label.wrap = Wrap
686 label.show_database_refs = Show Database Refs
687 label.show_non_positional_features = Show Non-Positional Features
688 label.save_png_image = Save As PNG Image
689 label.load_tree_for_sequence_set = Load a tree for this sequence set
690 label.export_image = Export Image
691 label.vamsas_store = VAMSAS store
692 label.translate_cDNA = Translate as cDNA
693 label.reverse = Reverse
694 label.reverse_complement = Reverse Complement
695 label.linked_view_title = Linked CDS and protein view
696 label.extract_scores = Extract Scores
697 label.get_cross_refs = Get Cross-References
698 label.sort_alignment_new_tree = Sort Alignment With New Tree
699 label.add_sequences = Add Sequences
700 label.new_window = New Window
701 label.split_window = Split Window
702 label.set_as_default = Set as Default
703 label.show_labels = Show labels
704 action.background_colour = Background Colour...
705 label.associate_nodes_with = Associate Nodes With
706 label.link_name = Link Name
707 label.pdb_file = PDB file
708 label.colour_with_jmol = Colour with Jmol
709 label.colour_with_chimera = Colour with Chimera
710 label.superpose_structures = Superpose Structures
711 error.superposition_failed = Superposition failed: {0}
712 label.insufficient_residues = Not enough aligned residues ({0}) to perform superposition
713 label.jmol = Jmol
714 label.chimera = Chimera
715 label.create_chimera_attributes = Write Jalview features
716 label.create_chimera_attributes_tip = Set Chimera residue attributes for visible features
717 label.attributes_set = {0} attribute values set on Chimera
718 label.sort_alignment_by_tree = Sort Alignment By Tree
719 label.mark_unlinked_leaves = Mark Unlinked Leaves
720 label.associate_leaves_with = Associate Leaves With
721 label.save_colour_scheme_with_unique_name_added_to_colour_menu = Save your colour scheme with a unique name and it will be added to the Colour menu
722 label.case_sensitive = Case Sensitive
723 label.lower_case_colour = Colour All Lower Case
724 label.lower_case_tip = Chosen colour applies to all lower case symbols
725 label.index_by_host = Index by Host
726 label.index_by_type = Index by Type
727 label.enable_jabaws_services = Enable JABAWS Services
728 label.display_warnings = Display Warnings
729 label.move_url_up = Move URL Up
730 label.move_url_down = Move URL Down
731 label.add_sbrs_definition = Add a SBRS Definition
732 label.edit_sbrs_definition = Edit SBRS Definition
733 label.delete_sbrs_definition = Delete SBRS Definition
734 label.your_sequences_have_been_verified = Your sequences have been verified against known sequence databases.\n(Use Calculate | Show flanking regions to show enclosing sequence.)\nTo preserve data changes, save your alignment.\n\n
735 label.sequences_updated = Sequences updated
736 label.dbref_search_completed = DBRef search completed
737 label.fetch_all_param = Fetch all {0}
738 label.paste_new_window = Paste To New Window
739 label.settings_for_param = Settings for {0}
740 label.view_params = View {0}
741 label.aacon_calculations = AACon Calculations
742 label.aacon_settings = Change AACon Settings...
743 tooltip.aacon_calculations = When checked, AACon calculations are updated automatically.
744 tooltip.aacon_settings = Modify settings for AACon calculations.
745 label.rnalifold_calculations = RNAAliFold Prediction
746 label.rnalifold_settings = Change RNAAliFold settings...
747 tooltip.rnalifold_calculations = When checked, RNA secondary structure predictions will be calculated for the alignment, and updated when edits are made.
748 tooltip.rnalifold_settings = Modify settings for the RNAAliFold prediction. Use this to hide or show different results of the RNA calculation, and change RNA folding parameters.
749 label.all_views = All Views
750 label.align_sequences_to_existing_alignment = Align sequences to an existing alignment
751 label.realign_with_params = Realign with {0}
752 label.calcname_with_default_settings = {0} with Defaults
753 label.action_with_default_settings = {0} with default settings
754 label.edit_settings_and_run = Edit settings and run...
755 label.view_and_change_parameters_before_alignment = View and change the parameters before alignment
756 label.run_with_preset_params = Run {0} with preset
757 label.view_and_change_parameters_before_running_calculation = View and change parameters before running calculation
758 label.view_documentation = View documentation
759 label.select_return_type = Select return type
760 label.translation_of_params = Translation of {0} (Table {1})
761 label.features_for_params = Features for - {0}
762 label.annotations_for_params = Annotations for - {0}
763 label.generating_features_for_params = Generating features for - {0}
764 label.generating_annotations_for_params = Generating annotations for - {0}
765 label.varna_params = VARNA - {0}
766 label.sequence_feature_settings = Sequence Feature Settings
767 label.pairwise_aligned_sequences = Pairwise Aligned Sequences
768 label.original_data_for_params = Original Data for {0}
769 label.points_for_params = Points for {0}
770 label.transformed_points_for_params = Transformed points for {0}
771 label.variable_color_for = Variable Feature Colour for {0}
772 label.select_background_colour = Select Background Colour
773 label.invalid_font = Invalid Font
774 label.separate_multiple_accession_ids = Enter one or more accession IDs separated by a semi-colon ";"
775 label.separate_multiple_query_values = Enter one or more {0}s separated by a semi-colon ";"
776 label.search_all = Enter one or more search values separated by a semi-colon ";" (Note: This searches the entire database)
777 label.replace_commas_semicolons = Replace commas with semi-colons
778 label.parsing_failed_syntax_errors_shown_below_param = Parsing failed. Syntax errors shown below {0}
779 label.parsing_failed_unrecoverable_exception_thrown_param = \nParsing failed. An unrecoverable exception was thrown\:\n {0}
780 label.example_query_param = Example query: {0}
781 label.enter_value_increase_conservation_visibility = Enter value to increase conservation visibility
782 label.enter_percentage_identity_above_which_colour_residues = Enter % identity above which to colour residues
783 label.wswublast_client_credits = To display sequence features an exact Uniprot id with 100% sequence identity match must be entered.\nIn order to display these features, try changing the names of your sequences to the ids suggested below.\n\nRunning WSWUBlast at EBI.\nPlease quote Pillai S., Silventoinen V., Kallio K., Senger M., Sobhany S., Tate J., Velankar S., Golovin A., Henrick K., Rice P., Stoehr P., Lopez R.\nSOAP-based services provided by the European Bioinformatics Institute.\nNucleic Acids Res. 33(1)\:W25-W28 (2005));
784 label.blasting_for_unidentified_sequence = BLASTing for unidentified sequences
785 label.select_columns_containing = Select columns containing
786 label.select_columns_not_containing = Select columns that do not contain
787 label.hide_columns_containing = Hide columns containing
788 label.hide_columns_not_containing = Hide columns that do not contain
789 option.trim_retrieved_seqs = Trim retrieved sequences
790 label.trim_retrieved_sequences = When the reference sequence is longer than the sequence that you are working with, only keep the relevant subsequences.
791 label.use_sequence_id_1 = Use $DB_ACCESSION$ or $DB_ACCESSION=/<regex>/=$
792 label.use_sequence_id_2 = to embed accession id in URL
793 label.use_sequence_id_3 = Use $SEQUENCE_ID$ similarly to embed sequence id
794 label.use_sequence_id_4 = 
795 label.ws_parameters_for = Parameters for {0}
796 label.switch_server = Switch server
797 label.choose_jabaws_server = Choose a server for running this service
798 label.services_at = Services at {0}
799 label.rest_client_submit = {0} using {1}
800 label.fetch_retrieve_from =Retrieve from {0}</html>
801 label.fetch_retrieve_from_all_sources = Retrieve from all {0} sources in {1}<br>First is :{2}<html> 
802 label.feature_settings_click_drag = Drag up or down to change render order.<br/>Double click to select columns containing feature.
803 label.transparency_tip = Adjust transparency to 'see through' feature colours.
804 label.opt_and_params_further_details = see further details by right-clicking
805 label.opt_and_params_show_brief_desc_image_link = <html>Click to show brief description<br><img src="{0}"/> Right click for further information.</html> 
806 label.opt_and_params_show_brief_desc = <html>Click to show brief description<br></html>
807 label.adjusts_width_generated_eps_png = <html>Adjusts the width of the generated EPS or PNG file to ensure even the longest sequence ID or annotation label is displayed</html>
808 label.manually_specify_width_left_column = <html>Manually specify the width of the left hand column where sequence IDs and annotation labels will be rendered in exported alignment figures. This setting will be ignored if 'Automatically set ID width' is set</html>
809 label.job_created_when_checked = <html>When checked, a job is created for every sequence in the current selection.</html>
810 label.when_checked_job_visible_region_and_results = <html>When checked, a single job is created for the visible region and results mapped back onto their location in the alignment. Otherwise, a job would be created for every contiguous region visible in the alignment or current selection (e.g. a multiple alignment).</html>
811 label.flat_file_representation = <html>Flat file representation of this rest service using the Really Simple Bioinformatics Service formalism</html>
812 label.result_of_parsing_rsbs = <html>Results of parsing the RSBS representation</html>
813 label.user_preset = User Preset
814 label.service_preset = Service Preset
815 label.run_with_preset = Run {0} with preset
816 label.view_service_doc_url = <html>View <a href="{0}">{1}</a></html>
817 action.by_title_param = By {0}
818 label.source_from_db_source = Sources from {0}
819 label.from_msname = from {0}
820 label.superpose_with = Superpose with
821 label.scale_label_to_column = Scale Label to Column
822 label.add_new_row = Add New Row
823 label.edit_label_description = Edit Label/Description
824 label.hide_row = Hide This Row
825 label.delete_row = Delete This Row
826 label.show_all_hidden_rows = Show All Hidden Rows
827 label.export_annotation = Export Annotation
828 label.copy_consensus_sequence = Copy Consensus Sequence
829 label.helix = Helix
830 label.sheet = Sheet
831 label.rna_helix = RNA Helix
832 label.remove_annotation = Remove Annotation
833 label.colour_by = Colour by...
834 label.muscle_multiple_protein_sequence_alignment = Muscle Multiple Protein Sequence Alignment
835 label.mafft_multiple_sequence_alignment = MAFFT Multiple Sequence Alignment
836 label.clustalw_multiple_sequence_alignment = ClustalW Multiple Sequence Alignment
837 label.jnet_secondary_structure_prediction = JPred Secondary Structure Prediction
838 label.multiharmony = Multi-Harmony
839 label.unable_start_web_service_analysis = Unable to start web service analysis
840 label.job_couldnt_be_started_check_input = The Job couldn't be started. Please check your input, and the Jalview console for any warning messages.
841 label.prompt_each_time = Prompt each time
842 label.couldnt_save_project = Couldn't save project
843 label.error_whilst_saving_current_state_to = Error whilst saving current state to {0}
844 label.error_whilst_loading_project_from = Error whilst loading project from {0}
845 label.couldnt_load_project = Couldn't load project
846 label.invalid_name_preset_exists = Invalid name - preset already exists.
847 label.invalid_name = Invalid name
848 label.set_proxy_settings = Please set up your proxy settings in the 'Connections' tab of the Preferences window
849 label.proxy_authorization_failed = Proxy Authorization Failed
850 label.internal_jalview_error = Internal Jalview Error
851 label.secondary_structure_prediction_service_couldnt_be_located = The Secondary Structure Prediction Service named {0} at {1} couldn't be located.
852 label.service_called_is_not_msa_service = The Service called \n{0}\nis not a \nMultiple Sequence Alignment Service\!
853 label.msa_service_is_unknown = The Multiple Sequence Alignment Service named {0} is unknown
854 label.service_called_is_not_seq_search_service = The Service called \n{0}\nis not a \nSequence Search Service\!
855 label.seq_search_service_is_unknown = The Sequence Search Service named {0} is unknown
856 label.feature_type = Feature Type
857 label.show = Show
858 label.service_url = Service URL
859 label.copied_sequences = Copied sequences
860 label.cut_sequences = Cut Sequences
861 label.conservation_colour_increment = Conservation Colour Increment ({0})
862 label.percentage_identity_threshold = Percentage Identity Threshold ({0})
863 label.error_unsupported_owwner_user_colour_scheme = Unsupported owner for User Colour scheme dialog
864 label.save_alignment_to_file = Save Alignment to file
865 label.save_features_to_file = Save Features to File
866 label.save_annotation_to_file = Save Annotation to File
867 label.save_pdb_file = Save PDB File
868 label.save_text_to_file = Save Text to File
869 label.save_state = Save State
870 label.restore_state = Restore State
871 label.saving_jalview_project = Saving jalview project {0}
872 label.loading_jalview_project = Loading jalview project {0}
873 label.save_vamsas_document_archive = Save Vamsas Document Archive
874 label.saving_vamsas_doc = Saving VAMSAS Document to {0}
875 label.load_feature_colours = Load Feature Colours
876 label.save_feature_colours = Save Feature Colour Scheme
877 label.select_startup_file = Select startup file
878 label.select_default_browser = Select default web browser
879 label.save_tree_as_newick = Save tree as newick file
880 label.create_eps_from_tree = Create EPS file from tree
881 label.create_png_from_tree = Create PNG image from tree
882 label.save_colour_scheme = Save colour scheme
883 label.edit_params_for = Edit parameters for {0}
884 label.choose_filename_for_param_file = Choose a filename for this parameter file
885 label.save_as_html = Save as HTML
886 label.recently_opened = Recently Opened
887 label.blasting_for_unidentified_sequence_jobs_running = BLASTing for unidentified sequences - {0}  jobs running.
888 label.tree = Tree
889 label.tree_from = Tree from {0}
890 label.webservice_job_title = {0} using {1}
891 label.select_visible_region_of = selected {0} region of {1}
892 label.visible = Visible
893 label.select_unselect_visible_regions_from = select and unselected {0} regions from {1}
894 label.visible_region_of = visible region of
895 label.webservice_job_title_on = {0} using {1} on {2}
896 label.updating_vamsas_session = Updating vamsas session
897 label.loading_file = Loading File: {0}
898 label.edit_params = Edit {0}
899 label.as_percentage = As Percentage
900 error.not_implemented = Not implemented
901 error.no_such_method_as_clone1_for = No such method as clone1 for {0}
902 error.null_from_clone1 = Null from clone1!
903 error.not_yet_implemented = Not yet implemented
904 error.unknown_type_dna_or_pep = Unknown Type {0} - dna or pep are the only allowed values.
905 error.implementation_error_dont_know_threshold_annotationcolourgradient = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
906 error.invalid_separator_parameter = Invalid separator parameter - must be non-zero length
907 error.alignment_cigararray_not_implemented = Alignment(CigarArray) not yet implemented
908 error.empty_view_cannot_be_updated = empty view cannot be updated.
909 error.mismatch_between_number_of_sequences_in_block = Mismatch between number of sequences in block {0} ({1}) and the original view ({2})
910 error.padding_not_yet_implemented = Padding not yet implemented
911 error.mismatch_between_visible_blocks_to_update_and_number_of_contigs_in_view = Mismatch between visible blocks to update and number of contigs in view (contigs=0,blocks={0})
912 error.unknown_seq_cigar_operation = Unknown SeqCigar operation {0}
913 error.implementation_bug_parse_cigar_string = Implementation bug in parseCigarString
914 error.implementation_error_invalid_operation_string = Implementation error. Invalid operation string.
915 error.invalid_range_string = Invalid range string (must be zero or positive number)
916 error.implementation_error_delete_range_out_of_bounds = Implementation Error: deleteRange out of bounds: start must be non-negative and less than end.
917 error.implementation_error = Implementation error
918 error.implementation_error_unknown_operation = Implementation Error! Unknown operation {0}
919 error.implementation_error_unexpected_null_from_get_sequence_and_deletions = Implementation Error - unexpected null from getSequenceAndDeletions
920 error.implementation_error_set_seq_null = Implementation Error - _setSeq(null,...)
921 error.implementation_error_s = Implementation Error: _s= {0}
922 error.implementation_error_seqcigar_possible = SeqCigar: Possible implementation error: sequence is longer than dataset sequence
923 error.implmentation_bug_seq_null = Implementation Bug. Null seq
924 error.implementation_bug_cigar_operation_list_range_list = Implementation Bug. Cigar Operation list!= range list
925 error.not_yet_implemented_cigar_object_from_cigar_string = NOT YET Implemented: Constructing a Cigar object from a cigar string and a gapped sequence.
926 error.implementation_bug_cigar_operation = Implementation Bug. Cigar Operation {0} {1} not one of {2}, {3}, or {4}.
927 error.implementation_error_for_new_cigar = Implementation error for new Cigar(SequenceI)
928 error.implementation_error_cigar_seq_no_operations = Implementation error: {0}th sequence Cigar has no operations.
929 error.implementation_error_no_pdbentry_from_index = Implementation error - no corresponding pdbentry (for index {0}) to add sequences mappings to
930 error.jmol_version_not_compatible_with_jalview_version = Jmol version {0} is not compatible with this version of Jalview. Report this problem at issues.jalview.org
931 error.not_implemented_remove = Remove: Not implemented
932 error.not_implemented_clone = Clone: Not implemented
933 error.call_setprogressbar_before_registering_handler = call setProgressBar before registering the progress bar's handler.
934 label.cancelled_params = Cancelled {0}
935 error.implementation_error_cannot_show_view_alignment_frame = Implementation error: cannot show a view from another alignment in an AlignFrame.
936 error.implementation_error_dont_know_about_threshold_setting = Implementation error: don't know about threshold setting for current AnnotationColourGradient.
937 error.eps_generation_not_implemented = EPS Generation not yet implemented
938 error.png_generation_not_implemented = PNG Generation not yet implemented
939 error.try_join_vamsas_session_another = Trying to join a vamsas session when another is already connected
940 error.invalid_vamsas_session_id = Invalid vamsas session id
941 label.groovy_support_failed = Jalview Groovy Support Failed
942 label.couldnt_create_groovy_shell = Couldn't create the groovy Shell. Check the error log for the details of what went wrong.
943 error.unsupported_version_calcIdparam = Unsupported Version for calcIdparam {0}
944 error.implementation_error_cant_reorder_tree = Implementation Error: Can't reorder this tree. Not DefaultMutableTreeNode.
945 error.invalid_value_for_option = Invalid value {0} for option {1}
946 error.implementation_error_cannot_import_vamsas_doc = Implementation Error - cannot import existing vamsas document into an existing session, Yet!
947 label.vamsas_doc_couldnt_be_opened_as_new_session = VAMSAS Document could not be opened as a new session - please choose another
948 error.implementation_error_vamsas_operation_not_init = Impementation error! Vamsas Operations when client not initialised and connected
949 error.jalview_no_connected_vamsas_session = Jalview not connected to Vamsas session
950 error.implementation_error_cannot_recover_vamsas_object_mappings = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot recover vamsas object mappings - no backup was made
951 error.setstatus_called_non_existent_job_pane = setStatus called for non-existent job pane {0}
952 error.implementation_error_cannot_find_marshaller_for_param_set =Implementation error: Can't find a marshaller for the parameter set
953 error.implementation_error_old_jalview_object_not_bound =IMPLEMENTATION ERROR: old jalview object is not bound ! ({0})
954 error.implementation_error_vamsas_doc_class_should_bind_to_type = Implementation Error: Vamsas Document Class {0} should bind to a {1} (found a {2})
955 error.invalid_vamsas_rangetype_cannot_resolve_lists = Invalid vamsas RangeType - cannot resolve both lists of Pos and Seg from choice!
956 error.implementation_error_maplist_is_null = Implementation error. MapList is null for initMapType.
957 error.implementation_error_cannot_have_null_alignment = Implementation error: Cannot have null alignment property key
958 error.implementation_error_null_fileparse = Implementation error. Null FileParse in copy constructor
959 error.implementation_error_cannot_map_alignment_sequences = IMPLEMENTATION ERROR: Cannot map an alignment of sequences from different datasets into a single alignment in the vamsas document.
960 error.implementation_error_structure_selection_manager_null = Implementation error. Structure selection manager's context is 'null'
961 exception.ssm_context_is_null = SSM context is null
962 error.idstring_seqstrings_only_one_per_sequence = idstrings and seqstrings contain one string each per sequence
963 error.cannot_have_mixed_length_replacement_vectors = Cannot have mixed length replacement vectors. Replacement vector for {0} is {1} strings long, and have already seen a {2} length vector.
964 error.cannot_have_zero_length_vector_replacement_strings = Cannot have zero length vector of replacement strings - either 1 value or n values.
965 error.implementation_error_multiple_single_sequence_prediction_jobs_not_supported = Implementation Error! Multiple single sequence prediction jobs are not yet supported
966 error.implementation_error_invalid_msa_index_for_job =Implementation Error! Invalid msaIndex for JPredJob on parent MSA input object!
967 error.implementation_error_startjob_called = Implementation error - StartJob(JpredJob) called on {0}
968 error.multiple_jnet_subjob_merge_not_implemented = Multiple JPred subjob merging not yet implemented
969 label.job_never_ran = Job never ran - input returned to user.
970 error.implementation_error_minlen_must_be_greater_zero = Implementation error: minlen must be zero or more
971 error.implementation_error_msawbjob_called = Implementation error - StartJob(MsaWSJob) called on a WSJobInstance {0}
972 error.implementation_error_cannot_attach_ws_menu_entry = IMPLEMENTATION ERROR: cannot attach WS Menu Entry without service handle reference!
973 error.parameter_migration_not_implemented_yet = Parameter migration not implemented yet
974 error.implementation_error_cannot_set_jaba_option = Implementation error: cannot set Jaba Option to a value outside its allowed value range!
975 error.implementation_error_valuetype_doesnt_support_jabaws_type = IMPLEMENTATION ERROR: jalview.ws.params.ValueConstrainI.ValueType does not support the JABAWS type : {0}
976 error.cannot_create_jabaws_param_set = Cannot create a JabaWSParamSet from non-JabaWS parameters
977 error.cannot_set_arguments_to_jabaws_param_set = Cannot set arguments to a JabaWSParamSet that are not JabaWS arguments
978 error.implementation_error_runner_config_not_available = Implementation Error: Runner Config not available for a JABAWS service of type {0} ({1})
979 error.implementation_error_cannot_handle_jaba_param = Implementation Error: Cannot handle Jaba parameter object {0}
980 error.implementation_error_attempt_to_delete_service_preset = Implementation error: Attempt to delete a service preset!
981 error.implementation_error_cannot_locate_oldname_presetname = Implementation error: Can't locate either oldname ({0}) or presetName ({1}in the datastore!"
982 error.implementation_error_jabaws_param_set_only_handled_by = Implementation error: JabaWsParamSets can only be handled by JabaParamStore
983 error.cannot_set_source_file_for = Cannot set source file for {0}
984 error.mismatch_service_instance_preset = Probable mismatch between service instance and preset!
985 error.cannot_set_params_for_ws_preset = Cannot set Parameters for a Jaba Web service's preset
986 error.implementation_error_can_only_instantiate_jaba_param_sets = Implementation error: Can only instantiate Jaba parameter sets
987 error.no_aacon_service_found = No AACon service found
988 error.implementation_error_couldnt_copy_value_constraint = Implementation error: could not copy ValueConstrain!
989 error.couldnt_encode_as_utf8 = Couldn't encode {0} as UTF-8.
990 error.tree_inputtype_not_yet_implemented = Tree InputType not yet implemented
991 error.implementation_error_need_to_have_httpresponse = Implementation Error: need to have an HttpResponse to process
992 error.dbrefsource_implementation_exception =DBRefSource Implementation Exception
993 error.implementation_error_dbinstance_must_implement_interface = Implmentation Error - getDbInstances must be given a class that implements jalview.ws.seqfetcher.DbSourceProxy (was given{0})
994 error.implementation_error_must_init_dbsources =Implementation error. Must initialise dbSources
995 label.view_controller_toggled_marked = {0} {1} columns {2} features of type {3}  across {4} sequence(s)
996 label.toggled = Toggled
997 label.marked = Marked
998 label.containing = containing
999 label.not_containing = not containing
1000 label.no_feature_of_type_found = No features of type {0} found.
1001 label.submission_params = Submission {0}
1002 label.empty_alignment_job = Empty Alignment Job
1003 label.add_new_sbrs_service = Add a new Simple Bioinformatics Rest Service
1004 label.edit_sbrs_entry = Edit Simple Bioinformatics Rest Service entry
1005 label.pca_recalculating = Recalculating PCA
1006 label.pca_calculating = Calculating PCA
1007 label.select_foreground_colour = Choose foreground colour
1008 label.select_colour_for_text = Select Colour for Text
1009 label.adjunst_foreground_text_colour_threshold = Adjust Foreground Text Colour Threshold
1010 label.select_subtree_colour = Select Sub-Tree Colour
1011 label.create_new_sequence_features = Create New Sequence Feature(s)
1012 label.amend_delete_features = Amend/Delete Features for {0}
1013 exception.out_of_bounds_for_file = Out of bounds for file: i={0}, Final Buffer: i0={1} iend={2}
1014 exception.null_string_given_to_regex_search = Null String Given to Regex.search
1015 exception.null_string_like_given_to_regex_search = Null StringLike Given to Regex.search
1016 exception.null_string_given_to_regex_reverse_search = Null String Given to Regex.reverseSearch
1017 exception.null_string_like_given_to_regex_reverse_search = Null StringLike Given to Regex.reverseSearch
1018 exception.null_string_like_given_to_regex_search_from = Null String Given to Regex.searchFrom
1019 exception.null_string_like_given_to_regex_search_region = Null String Given to Regex.searchRegion
1020 exception.replace_null_regex_pointer = Replacer has null Regex pointer
1021 exception.bad_pattern_to_regex_perl_code = bad pattern to Regex.perlCode: {0}
1022 exception.no_stub_implementation_for_interface = There is no stub implementation for the interface: {0}
1023 exception.cannot_set_endpoint_address_unknown_port = Cannot set Endpoint Address for Unknown Port {0}
1024 exception.mismatched_unseen_closing_char = Mismatched (unseen) closing character {0}
1025 exception.mismatched_closing_char = Mismatched closing character {0}
1026 exception.mismatched_opening_char = Mismatched opening character {0} at {1}
1027 exception.invalid_datasource_couldnt_obtain_reader = Invalid datasource. Could not obtain Reader
1028 exception.unterminated_cigar_string = Unterminated cigar string
1029 exception.unexpected_operation_cigar_string_pos = Unexpected operation {0} in cigar string (position {1} in {2}
1030 exception.couldnt_parse_responde_from_annotated3d_server = Couldn't parse response from Annotate3d server
1031 exception.application_test_npe = Application test: throwing an NullPointerException It should arrive at the console
1032 exception.overwriting_vamsas_id_binding = Overwriting vamsas id binding
1033 exception.overwriting_jalview_id_binding = Overwriting jalview id binding
1034 exception.failed_to_resolve_gzip_stream = Failed to resolve GZIP stream
1035 exception.problem_opening_file_also_tried = Problem opening {0} (also tried {1}) : {2}
1036 exception.problem_opening_file = Problem opening {0} : {1}
1037 exception.failed_to_read_data_from_source = Failed to read data from source: {0}
1038 exception.no_init_source_stream = Unitialised Source Stream
1039 exception.invalid_source_stream = Invalid Source Stream: {0}
1040 error.implementation_error_reset_called_for_invalid_source = Implementation Error: Reset called for invalid source.
1041 exception.number_of_residues_in_query_sequence_differ_from_prediction = Number of residues in {0} supposed query sequence ({1}\n{2})\ndiffer from number of prediction sites in prediction ({3})
1042 label.mapped = mapped
1043 exception.jpredconcide_entry_has_unexpected_number_of_columns = JPredConcise: Entry ({0}) has an unexpected number of columns
1044 exception.couldnt_parse_concise_annotation_for_prediction = Couldn't parse concise annotation for prediction profile.\n{0}
1045 exception.newfile = NewickFile\: {0}\n
1046 label.no_tree_read_in = No Tree read in
1047 exception.rnaml_couldnt_access_datasource = Couldn't access datasource ({0})
1048 exception.ranml_couldnt_process_data = Couldn't process data as RNAML file ({0})
1049 exception.ranml_invalid_file = Invalid RNAML file ({0})
1050 exception.ranml_problem_parsing_data = Problem parsing data as RNAML ({0})
1051 exception.pfam_no_sequences_found = No sequences found (PFAM input)
1052 exception.stockholm_invalid_format = This file is not in valid STOCKHOLM format: First line does not contain '# STOCKHOLM'
1053 exception.couldnt_parse_sequence_line = Could not parse sequence line: {0}
1054 exception.unknown_annotation_detected = Unknown annotation detected: {0} {1}
1055 exception.couldnt_store_sequence_mappings = Couldn't store sequence mappings for {0}
1056 exception.matrix_too_many_iteration = Too many iterations in {0} (max is {1})
1057 exception.browser_not_found = Exception in finding browser: {0}
1058 exception.browser_unable_to_locate = Unable to locate browser: {0}
1059 exception.invocation_target_exception_creating_aedesc = InvocationTargetException while creating AEDesc: {0}
1060 exception.illegal_access_building_apple_evt= IllegalAccessException while building AppleEvent: {0}
1061 exception.unable_to_launch_url = Unable to launch URL: {0}
1062 exception.unable_to_create_internet_config = Unable to create an Internet Config instance: {0}
1063 exception.invocation_target_calling_url = InvocationTargetException while calling openURL: {0}
1064 exception.illegal_access_calling_url = IllegalAccessException while calling openURL: {0}
1065 exception.interrupted_launching_browser = InterruptedException while launching browser: {0}
1066 exception.ebiembl_retrieval_failed_on = EBI EMBL XML retrieval failed on {0}:{1}
1067 exception.no_pdb_records_for_chain = No PDB Records for {0} chain {1}
1068 exception.unexpected_handling_rnaml_translation_for_pdb = Unexpected exception when handling RNAML translation of PDB data
1069 exception.couldnt_recover_sequence_properties_for_alignment = Couldn't recover sequence properties for alignment
1070 exception.unknown_format_for_file = Unknown format {0} for file \: \n{1}
1071 label.remove_gaps = Remove Gaps
1072 exception.couldnt_recover_sequence_props_for_jnet_query = Couldn't recover sequence properties for JPred Query sequence!
1073 exception.server_timeout_try_later = Server timed out - try again later\n
1074 exception.web_service_returned_null_try_later= Server at {0} returned null object, it probably cannot be contacted. Try again later.
1075 exception.cannot_contact_service_endpoint_at = Cannot contact service endpoint at {0}
1076 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set = Implementation error: Cannot find service url in the given url set!
1077 error.implementation_error_cannot_find_service_url_in_given_set_param_store = Implementation error: Cannot find service url in the given url set for this service parameter store ({0}}
1078 exception.jobsubmission_invalid_params_set = Invalid parameter set. Check Jalview implementation
1079 exception.notvaliddata_group_contains_less_than_min_seqs = Group contains less than {0} sequences.
1080 exception.outofmemory_loading_pdb_file = Out of memory loading PDB File
1081 exception.eps_coudnt_write_output_file = Could not write to the output file: {0}
1082 exception.eps_method_not_supported = Method not currently supported by EpsGraphics2D version {0}
1083 exception.eps_unable_to_get_inverse_matrix = Unable to get inverse of matrix: {0}
1084 warn.job_cannot_be_cancelled_close_window = This job cannot be cancelled.\nJust close the window.
1085 warn.service_not_supported = Service not supported!
1086 warn.input_is_too_big = Input is too big!
1087 warn.invalid_job_param_set = Invalid job parameter set!
1088 warn.oneseq_msainput_selection = The current selection only contains a single sequence. Do you want to submit all sequences for alignment instead ?   
1089 info.job_couldnt_be_run_server_doesnt_support_program = Job could not be run because the server doesn't support this program.\n{0}
1090 info.job_couldnt_be_run_exceeded_hard_limit = Job could not be run because it exceeded a hard limit on the server.\n{0}
1091 info.job_couldnt_be_run_incorrect_param_setting = Job could not be run because some of the parameter settings are not supported by the server.\n{0}\nPlease check to make sure you have used the correct parameter set for this service\!\n
1092 info.no_jobs_ran = No jobs ran
1093 info.failed_to_submit_prediction = Failed to submit the prediction\:\n{0} {1}
1094 info.invalid_jnet_job_result_data ={0}\n{1}\nInvalid JPred job result data\!\n{2}
1095 info.failed_to_submit_sequences_for_alignment = Failed to submit sequences for alignment.\nIt is most likely that there is a problem with the server.\nJust close the window\n
1096 info.alignment_object_method_notes = \nAlignment Object Method Notes\n
1097 info.server_exception = \n{0} Server exception\!\n{1}
1098 info.invalid_msa_input_mininfo = Need at least two sequences with at least 3 residues each, with no hidden regions between them.  
1099 info.invalid_msa_notenough = Not enough sequence data to align
1100 status.processing_commandline_args = Processing commandline arguments...
1101 status.das_features_being_retrived = DAS features being retrieved...
1102 status.searching_for_sequences_from = Searching for sequences from {0}
1103 status.finished_searching_for_sequences_from = Finished searching for sequences from {0}
1104 label.eps_file = EPS file
1105 label.png_image = PNG image
1106 status.saving_file = Saving {0}
1107 status.export_complete = {0} Export completed.
1108 status.fetching_pdb = Fetching PDB {0}
1109 status.refreshing_news = Refreshing news
1110 status.importing_vamsas_session_from = Importing VAMSAS session from {0}
1111 status.opening_params = Opening {0}
1112 status.waiting_sequence_database_fetchers_init = Waiting for Sequence Database Fetchers to initialise
1113 status.init_sequence_database_fetchers = Initialising Sequence Database Fetchers
1114 status.fetching_sequence_queries_from = Fetching {0} sequence queries from {1}
1115 status.finshed_querying = Finished querying
1116 status.parsing_results = Parsing results.
1117 status.processing = Processing...
1118 status.refreshing_web_service_menus = Refreshing Web Service Menus
1119 status.collecting_job_results = Collecting job results.
1120 status.fetching_db_refs = Fetching db refs
1121 status.loading_cached_pdb_entries = Loading Cached PDB Entries
1122 status.searching_for_pdb_structures = Searching for PDB Structures
1123 status.opening_file_for = opening file for
1124 status.colouring_chimera = Colouring Chimera
1125 label.font_doesnt_have_letters_defined = Font doesn't have letters defined\nso cannot be used\nwith alignment data
1126 label.font_too_small = Font size is too small
1127 label.error_loading_file_params = Error loading file {0}
1128 label.error_loading_jalview_file = Error loading Jalview file
1129 warn.out_of_memory_when_action = Out of memory when {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1130 warn.out_of_memory_loading_file = Out of memory loading file {0}\!\!\nSee help files for increasing Java Virtual Machine memory.
1131 label.out_of_memory = Out of memory
1132 label.invalid_id_column_width = Invalid ID Column width
1133 warn.user_defined_width_requirements = The user defined width for the\nannotation and sequence ID columns\nin exported figures must be\nat least 12 pixels wide.
1134 label.couldnt_create_sequence_fetcher = Couldn't create SequenceFetcher
1135 warn.couldnt_create_sequence_fetcher_client = Could not create the sequence fetcher client. Check error logs for details.
1136 warn.server_didnt_pass_validation = Service did not pass validation.\nCheck the Jalview Console for more details.
1137 warn.url_must_contain = Sequence URL must contain $SEQUENCE_ID$, $DB_ACCESSION$, or a regex
1138 warn.urls_not_contacted = URLs that could not be contacted
1139 warn.urls_no_jaba = URLs without any JABA Services
1140 info.validate_jabaws_server = Validate JabaWS Server ?\n(Look in console output for results)
1141 label.test_server = Test Server?
1142 label.new_sequence_fetcher = New Sequence Fetcher
1143 label.additional_sequence_fetcher = Additional Sequence Fetcher
1144 label.select_database_retrieval_source = Select Database Retrieval Source
1145 label.overwrite_existing_file = Overwrite existing file?
1146 label.file_already_exists = File exists
1147 label.edit_jabaws_url = Edit JABAWS URL
1148 label.add_jabaws_url = Add new JABAWS URL
1149 label.news_from_jalview = News from http://www.jalview.org
1150 label.cut_paste_alignmen_file = Cut & Paste Alignment File
1151 label.enter_redundancy_threshold = Enter the redundancy threshold
1152 label.select_dark_light_set_threshold = <html><i>Select a dark and light text colour, then set the threshold to<br>switch between colours, based on background colour</i></html>
1153 label.select_feature_colour = Select Feature Colour
1154 label.delete_all = Delete all sequences
1155 warn.delete_all = <html>Deleting all sequences will close the alignment window.<br>Confirm deletion or Cancel.
1156 label.add_annotations_for = Add annotations for
1157 action.choose_annotations = Choose Annotations...
1158 label.choose_annotations = Choose Annotations
1159 label.find = Find
1160 label.invalid_search = Search string invalid
1161 error.invalid_regex = Invalid regular expression
1162 label.ignore_gaps_consensus = Ignore Gaps In Consensus
1163 label.show_group_histogram = Show Group Histogram
1164 label.show_group_logo = Show Group Logo
1165 label.normalise_group_logo = Normalise Group Logo
1166 label.show_histogram = Show Histogram
1167 label.show_logo = Show Logo
1168 label.normalise_logo = Normalise Logo
1169 label.no_colour_selection_in_scheme = Please make a colour selection before applying colour scheme
1170 label.no_colour_selection_warn = Error saving colour scheme
1171 label.open_split_window? = Would you like to open as a split window, with cDNA and protein linked?
1172 label.open_split_window = Open split window
1173 action.no = No
1174 action.yes = Yes
1175 label.for = for
1176 label.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation
1177 action.select_by_annotation = Select/Hide Columns by Annotation...
1178 label.threshold_filter =  Threshold Filter
1179 label.alpha_helix = Alpha Helix
1180 label.beta_strand = Beta Strand
1181 label.turn = Turn
1182 label.select_all = Select All
1183 label.structures_filter = Structures Filter
1184 label.search_filter = Search Filter
1185 label.include_description= Include Description
1186 action.back = Back
1187 label.hide_insertions = Hide Insertions
1188 label.mark_as_representative = Mark as representative
1189 label.open_jabaws_web_page = Open JABAWS web page
1190 label.pdb_sequence_fetcher = PDB Sequence Fetcher
1191 label.result = result
1192 label.results = results
1193 label.structure_chooser = Structure Chooser
1194 label.invert = Invert 
1195 label.select_pdb_file = Select PDB File
1196 info.select_filter_option = Select Filter Option/Manual Entry
1197 info.associate_wit_sequence = Associate with Sequence
1198 label.search_result = Search Result
1199 label.found_structures_summary = Found Structures Summary
1200 label.configure_displayed_columns = Customise Displayed Options
1201 label.start_jalview = Start Jalview
1202 label.biojs_html_export = BioJS
1203 label.scale_as_cdna = Scale protein residues to codons
1204 label.font_as_cdna = Use same font for cDNA and peptide
1205 label.scale_protein_to_cdna = Scale Protein to cDNA
1206 label.scale_protein_to_cdna_tip = Make protein residues same width as codons in split frame views
1207 info.select_annotation_row = Select Annotation Row
1208 info.enter_search_text_here = Enter Search Text Here
1209 info.enter_search_text_to_enable = Enter Search Text to Enable
1210 info.search_in_annotation_label = Search in {0} Label
1211 info.search_in_annotation_description = Search in {0} Description
1212 info.change_threshold_mode_to_enable = Change Threshold Mode to Enable
1213 label.couldnt_read_data = Couldn't read data
1214 label.embbed_biojson = Embed BioJSON to HTML export
1215 action.export_groups = Export Groups
1216 action.export_annotations = Export Annotations
1217 action.export_hidden_columns = Export Hidden Columns
1218 action.export_hidden_sequences = Export Hidden Sequences
1219 action.export_features = Export Features
1220 label.export_settings = Export Settings
1221 label.pdb_web-service_error = PDB Web-service Error
1222 label.structure_chooser_manual_association = Structure Chooser - Manual association
1223 label.structure_chooser_filter_time = Structure Chooser - Filter time ({0})
1224 label.structure_chooser_no_of_structures = Structure Chooser - {0} Found ({1})
1225 info.no_pdb_entry_found_for = No PDB entry found for {0}
1226 exception.unable_to_detect_internet_connection = Jalview is unable to detect an internet connection
1227 exception.fts_rest_service_no_longer_available = {0} rest services no longer available!
1228 exception.resource_not_be_found = The requested resource could not be found
1229 exception.fts_server_error = There seems to be an error from the {0} server
1230 exception.fts_server_unreachable = Jalview is unable to reach the {0} server. \nPlease ensure that you are connected to the internet and try again.
1231 label.nw_mapping = Needleman & Wunsch Alignment
1232 label.sifts_mapping = SIFTs Mapping
1233 label.mapping_method = Sequence \u27f7 Structure mapping method
1234 status.waiting_for_user_to_select_output_file = Waiting for user to select {0} file
1235 status.cancelled_image_export_operation = Cancelled {0} export operation
1236 info.error_creating_file = Error creating {0} file
1237 exception.outofmemory_loading_mmcif_file = Out of memory loading mmCIF File
1238 label.run_groovy = Run Groovy console script
1239 label.run_groovy_tip = Run the script in the Groovy console over this alignment
1240 label.couldnt_run_groovy_script = Failed to run Groovy script
1241 label.uniprot_sequence_fetcher = UniProt Sequence Fetcher
1242 action.next_page= >> 
1243 action.prev_page= << 
1244 label.next_page_tooltip=Next Page
1245 label.prev_page_tooltip=Previous Page
1246 exception.bad_request=Bad request. There is a problem with your input.
1247 exception.service_not_available=Service not available. The server is being updated, try again later.
1248 status.launching_3d_structure_viewer = Launching 3D Structure viewer...
1249 status.fetching_3d_structures_for_selected_entries = Fetching 3D Structures for selected entries...
1250 status.fetching_dbrefs_for_sequences_without_valid_refs = Fetching db refs for {0} sequence(s) without valid db ref required for SIFTS mapping
1251 status.fetching_3d_structures_for = Fetching 3D Structure for {0}
1252 status.obtaining_mapping_with_sifts = Obtaining mapping with SIFTS
1253 status.obtaining_mapping_with_nw_alignment = Obtaining mapping with NW alignment
1254 status.exporting_alignment_as_x_file = Exporting alignment as {0} file
1255 label.column = Column
1256 label.cant_map_cds = Unable to map CDS to protein\nCDS missing or incomplete
1257 label.operation_failed = Operation failed
1258 label.SEQUENCE_ID_no_longer_used = $SEQUENCE_ID$ is no longer used for DB accessions
1259 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION1 = Please review your URL links in the 'Connections' tab of the Preferences window:
1260 label.SEQUENCE_ID_for_DB_ACCESSION2 = URL links using '$SEQUENCE_ID$' for DB accessions now use '$DB_ACCESSION$'.
1261 label.do_not_display_again = Do not display this message again
1262 exception.url_cannot_have_duplicate_id = {0} cannot be used as a label for more than one line
1263 action.customfilter = Custom only
1264 action.showall = Show All
1265 label.insert = Insert:
1266 action.seq_id = $SEQUENCE_ID$
1267 action.db_acc = $DB_ACCESSION$
1268 label.primary = Double Click
1269 label.inmenu = In Menu
1270 label.id = ID
1271 label.database = Database
1272 label.urltooltip = Only one url, which must use a sequence id, can be selected for the 'On Click' option
1273 label.edit_sequence_url_link = Edit sequence URL link
1274 warn.name_cannot_be_duplicate = User-defined URL names must be unique and cannot be MIRIAM ids
1275 label.output_seq_details = Output Sequence Details to list all database references
1276 label.urllinks = Links
1277 action.clear_cached_items = Clear Cached Items
1278 label.togglehidden = Show hidden regions
1279 label.quality_descr = Alignment Quality based on Blosum62 scores
1280 label.conservation_descr = Conservation of total alignment less than {0}% gaps
1281 label.consensus_descr = PID
1282 label.complement_consensus_descr = PID for cDNA
1283 label.strucconsensus_descr = PID for base pairs
1284 label.occupancy_descr = Number of aligned positions 
1285 label.show_experimental = Enable experimental features
1286 label.show_experimental_tip = Enable any new and currently 'experimental' features (see Latest Release Notes for details)
1287 label.warning_hidden = Warning: {0} {1} is currently hidden
1288 label.overview_settings = Overview settings
1289 label.ov_legacy_gap = Use legacy gap colouring (gaps are white)
1290 label.gap_colour = Gap colour:
1291 label.ov_show_hide_default = Show hidden regions when opening overview
1292 label.hidden_colour = Hidden colour:
1293 label.select_gap_colour = Select gap colour
1294 label.select_hidden_colour = Select hidden colour
1295 label.overview = Overview
1296 label.reset_to_defaults = Reset to defaults
1297 label.oview_calc = Recalculating overview...
1298 label.feature_details = Feature details
1299 label.matchCondition_contains = Contains
1300 label.matchCondition_notcontains = Does not contain
1301 label.matchCondition_matches = Matches
1302 label.matchCondition_notmatches = Does not match
1303 label.matchCondition_present = Is present
1304 label.matchCondition_notpresent = Is not present
1305 label.matchCondition_eq = =
1306 label.matchCondition_ne = not =
1307 label.matchCondition_lt = <
1308 label.matchCondition_le = <=
1309 label.matchCondition_gt = >
1310 label.matchCondition_ge = >=
1311 label.numeric_required = The value should be numeric
1312 label.filter = Filter
1313 label.filters = Filters
1314 label.join_conditions = Join conditions with
1315 label.score = Score
1316 label.colour_by_label = Colour by label
1317 label.variable_colour = Variable colour...
1318 label.select_colour = Select colour
1319 option.enable_disable_autosearch = When ticked, search is performed automatically
1320 option.autosearch = Autosearch
1321 label.retrieve_ids = Retrieve IDs
1322 label.display_settings_for = Display settings for {0} features
1323 label.simple = Simple
1324 label.simple_colour = Simple Colour
1325 label.colour_by_text = Colour by text
1326 label.graduated_colour = Graduated Colour
1327 label.by_text_of = By text of
1328 label.by_range_of = By range of
1329 label.or = Or
1330 label.and = And
1331 label.sequence_feature_colours = Sequence Feature Colours
1332 label.best_quality = Best Quality
1333 label.best_resolution = Best Resolution
1334 label.most_protein_chain = Most Protein Chain
1335 label.most_bound_molecules = Most Bound Molecules
1336 label.most_polymer_residues = Most Polymer Residues
1337 label.cached_structures = Cached Structures
1338 label.free_text_search = Free Text Search
1339 label.backupfiles_confirm_delete = Confirm delete
1340 label.backupfiles_confirm_delete_old_files = Delete the following older backup files? (see the Backups tab in Preferences for more options)
1341 label.backupfiles_confirm_save_file = Confirm save file
1342 label.backupfiles_confirm_save_file_backupfiles_roll_wrong = Something possibly went wrong with the backups of this file.
1343 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_ok = The new saved file seems okay.
1344 label.backupfiles_confirm_save_new_saved_file_not_ok = The new saved file might not be okay.
1345 label.backups = Backups
1346 label.backup = Backup
1347 label.backup_files = Backup Files
1348 label.enable_backupfiles = Enable backup files
1349 label.backup_filename_strategy = Backup filename strategy
1350 label.append_to_filename = Append to filename (%n is replaced by the backup number)
1351 label.append_to_filename_tooltip = %n in the text will be replaced by the backup number. The text will appear after the filename. See the summary box above.
1352 label.index_digits = Number of digits to use for the backup number (%n)
1353 label.summary_of_backups_scheme = Summary of backup scheme
1354 label.increment_index = Increase appended text numbers - newest file has largest number.
1355 label.reverse_roll = "Roll" appended text numbers - newest backup file is always number 1.
1356 label.keep_files = Deleting old backup files
1357 label.keep_all_backup_files = Do not delete old backup files
1358 label.keep_only_this_number_of_backup_files = Keep only this number of most recent backup files
1359 label.autodelete_old_backup_files = Autodelete old backup files:
1360 label.always_ask = Always ask
1361 label.auto_delete = Automatically delete
1362 label.filename = filename
1363 label.braced_oldest = (oldest)
1364 label.braced_newest = (most recent)
1365 label.configuration = Configuration
1366 label.configure_feature_tooltip = Click to configure variable colour or filters
1367 label.schemes = Schemes
1368 label.customise = Customise
1369 label.default = Default
1370 label.single_file = Single backup
1371 label.keep_all_versions = Keep all versions
1372 label.rolled_backups = Rolled backup files
1373 label.previously_saved_scheme = Previously saved scheme
1374 label.no_backup_files = NO BACKUP FILES
1375 label.include_backup_files = Include backup files
1376 label.cancel_changes = Cancel changes
1377 label.warning_confirm_change_reverse = Warning!\nIf you change the increment/decrement of the backup filename number, without changing the suffix or number of digits,\nthis may cause loss of backup files created with the previous backup filename scheme.\nAre you sure you wish to do this?
1378 label.change_increment_decrement = Change increment/decrement?
1379 label.was_previous = was {0}
1380 label.newerdelete_replacement_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted and replaced by apparently older file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1381 label.confirm_deletion_or_rename = Confirm deletion of ''{0}'' or rename to ''{1}''?
1382 label.newerdelete_line = Backup file\n''{0}''\t(modified {2}, size {4})\nis to be deleted but is newer than the oldest remaining backup file\n''{1}''\t(modified {3}, size {5}).
1383 label.confirm_deletion = Confirm deletion of ''{0}''?
1384 label.delete = Delete
1385 label.rename = Rename
1386 label.keep = Keep
1387 label.file_info = (modified {0}, size {1})
1388 label.annotation_name = Annotation Name
1389 label.annotation_description = Annotation Description 
1390 label.edit_annotation_name_description = Edit Annotation Name/Description
1391 label.alignment = alignment
1392 label.pca = PCA
1393 label.create_image_of = Create {0} image of {1}
1394 label.click_to_edit = Click to edit, right-click for menu
1395 label.by_annotation_tooltip = Annotation Colour is configured from the main Colour menu