src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java

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  17  */
  18 package ext.vamsas;
  19
  20 public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  21         implements ext.vamsas.Jpred
  22 {
  23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  24
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  26
  27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  28
  29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  30
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  32
  33   static
  34   {
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  36     _initOperationDesc1();
  37   }
  38
  39   private static void _initOperationDesc1()
  40   {
  41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  43     oper.setName("predict");
  44     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
  45             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  46                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  47             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  48     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  49             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  50     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  51     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictReturn"));
  52     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  53     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  54     _operations[0] = oper;
  55
  56     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  57     oper.setName("predictOnMsa");
  58     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "msf"),
  59             new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
  60                     "Msfalignment"),
  61             vamsas.objects.simple.Msfalignment.class,
  62             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  63     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  64             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  65     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  66     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  67             "predictOnMsaReturn"));
  68     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  69     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  70     _operations[1] = oper;
  71
  72     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  73     oper.setName("getpredict");
  74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  75             new javax.xml.namespace.QName(
  76                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  77             java.lang.String.class,
  78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  79     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  80             "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
  81     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
  82     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  83             "getpredictReturn"));
  84     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  85     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  86     _operations[2] = oper;
  87
  88     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  89     oper.setName("getresult");
  90     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  91             new javax.xml.namespace.QName(
  92                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  93             java.lang.String.class,
  94             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  95     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  96             "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
  97     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
  98     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getresultReturn"));
  99     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 100     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 101     _operations[3] = oper;
 102
 103   }
 104
 105   public JpredSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 106   {
 107     this(null);
 108   }
 109
 110   public JpredSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 111           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 112   {
 113     this(service);
 114     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 115   }
 116
 117   public JpredSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 118           throws org.apache.axis.AxisFault
 119   {
 120     if (service == null)
 121     {
 122       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 123     }
 124     else
 125     {
 126       super.service = service;
 127     }
 128     java.lang.Class cls;
 129     javax.xml.namespace.QName qName;
 130     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 131     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 132     /*
 133      * java.lang.Class enumsf =
 134      * org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class; java.lang.Class
 135      * enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 136      * java.lang.Class arraysf =
 137      * org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 138      * java.lang.Class arraydf =
 139      * org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 140      * java.lang.Class simplesf =
 141      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 142      * java.lang.Class simpledf =
 143      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 144      * java.lang.Class simplelistsf =
 145      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 146      * java.lang.Class simplelistdf =
 147      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 148      */
 149     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 150             "JpredResult");
 151     cachedSerQNames.add(qName);
 152     cls = vamsas.objects.simple.JpredResult.class;
 153     cachedSerClasses.add(cls);
 154     cachedSerFactories.add(beansf);
 155     cachedDeserFactories.add(beandf);
 156
 157     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 158     cachedSerQNames.add(qName);
 159     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 160     cachedSerClasses.add(cls);
 161     cachedSerFactories.add(beansf);
 162     cachedDeserFactories.add(beandf);
 163
 164     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 165             "Secstructpred");
 166     cachedSerQNames.add(qName);
 167     cls = vamsas.objects.simple.Secstructpred.class;
 168     cachedSerClasses.add(cls);
 169     cachedSerFactories.add(beansf);
 170     cachedDeserFactories.add(beandf);
 171
 172     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 173             "Msfalignment");
 174     cachedSerQNames.add(qName);
 175     cls = vamsas.objects.simple.Msfalignment.class;
 176     cachedSerClasses.add(cls);
 177     cachedSerFactories.add(beansf);
 178     cachedDeserFactories.add(beandf);
 179
 180     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 181             "Sequence");
 182     cachedSerQNames.add(qName);
 183     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 184     cachedSerClasses.add(cls);
 185     cachedSerFactories.add(beansf);
 186     cachedDeserFactories.add(beandf);
 187
 188   }
 189
 190   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 191           throws java.rmi.RemoteException
 192   {
 193     try
 194     {
 195       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 196               .createCall();
 197       if (super.maintainSessionSet)
 198       {
 199         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 200       }
 201       if (super.cachedUsername != null)
 202       {
 203         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 204       }
 205       if (super.cachedPassword != null)
 206       {
 207         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 208       }
 209       if (super.cachedEndpoint != null)
 210       {
 211         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 212       }
 213       if (super.cachedTimeout != null)
 214       {
 215         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 216       }
 217       if (super.cachedPortName != null)
 218       {
 219         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 220       }
 221       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 222       while (keys.hasMoreElements())
 223       {
 224         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 225         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 226       }
 227       // All the type mapping information is registered
 228       // when the first call is made.
 229       // The type mapping information is actually registered in
 230       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 231       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 232       synchronized (this)
 233       {
 234         if (firstCall())
 235         {
 236           // must set encoding style before registering serializers
 237           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 238           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 239           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 240           {
 241             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 242             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 243                     .get(i);
 244             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 245                     .get(i);
 246             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 247                     .get(i);
 248             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 249           }
 250         }
 251       }
 252       return _call;
 253     } catch (java.lang.Throwable _t)
 254     {
 255       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 256               "Failure trying to get the Call object", _t);
 257     }
 258   }
 259
 260   public java.lang.String predict(vamsas.objects.simple.Sequence seq)
 261           throws java.rmi.RemoteException
 262   {
 263     if (super.cachedEndpoint == null)
 264     {
 265       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 266     }
 267     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 268     _call.setOperation(_operations[0]);
 269     _call.setUseSOAPAction(true);
 270     _call.setSOAPActionURI("");
 271     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 272     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 273             "predict"));
 274
 275     setRequestHeaders(_call);
 276     setAttachments(_call);
 277     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 278     { seq });
 279
 280     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 281     {
 282       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 283     }
 284     else
 285     {
 286       extractAttachments(_call);
 287       try
 288       {
 289         return (java.lang.String) _resp;
 290       } catch (java.lang.Exception _exception)
 291       {
 292         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 293                 _resp, java.lang.String.class);
 294       }
 295     }
 296   }
 297
 298   public java.lang.String predictOnMsa(
 299           vamsas.objects.simple.Msfalignment msf)
 300           throws java.rmi.RemoteException
 301   {
 302     if (super.cachedEndpoint == null)
 303     {
 304       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 305     }
 306     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 307     _call.setOperation(_operations[1]);
 308     _call.setUseSOAPAction(true);
 309     _call.setSOAPActionURI("");
 310     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 311     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 312             "predictOnMsa"));
 313
 314     setRequestHeaders(_call);
 315     setAttachments(_call);
 316     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 317     { msf });
 318
 319     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 320     {
 321       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 322     }
 323     else
 324     {
 325       extractAttachments(_call);
 326       try
 327       {
 328         return (java.lang.String) _resp;
 329       } catch (java.lang.Exception _exception)
 330       {
 331         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 332                 _resp, java.lang.String.class);
 333       }
 334     }
 335   }
 336
 337   public vamsas.objects.simple.Secstructpred getpredict(
 338           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 339   {
 340     if (super.cachedEndpoint == null)
 341     {
 342       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 343     }
 344     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 345     _call.setOperation(_operations[2]);
 346     _call.setUseSOAPAction(true);
 347     _call.setSOAPActionURI("");
 348     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 349     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 350             "getpredict"));
 351
 352     setRequestHeaders(_call);
 353     setAttachments(_call);
 354     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 355     { job_id });
 356
 357     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 358     {
 359       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 360     }
 361     else
 362     {
 363       extractAttachments(_call);
 364       try
 365       {
 366         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) _resp;
 367       } catch (java.lang.Exception _exception)
 368       {
 369         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 370                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
 371       }
 372     }
 373   }
 374
 375   public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
 376           throws java.rmi.RemoteException
 377   {
 378     if (super.cachedEndpoint == null)
 379     {
 380       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 381     }
 382     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 383     _call.setOperation(_operations[3]);
 384     _call.setUseSOAPAction(true);
 385     _call.setSOAPActionURI("");
 386     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 387     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 388             "getresult"));
 389
 390     setRequestHeaders(_call);
 391     setAttachments(_call);
 392     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 393     { job_id });
 394
 395     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 396     {
 397       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 398     }
 399     else
 400     {
 401       extractAttachments(_call);
 402       try
 403       {
 404         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) _resp;
 405       } catch (java.lang.Exception _exception)
 406       {
 407         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 408                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 409       }
 410     }
 411   }
 412
 413 }