src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java

   1 /*
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  20  */
  21 package ext.vamsas;
  22
  23 public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  24         implements ext.vamsas.Jpred
  25 {
  26   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  33
  34   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  35
  36   static
  37   {
  38     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  39     _initOperationDesc1();
  40   }
  41
  42   private static void _initOperationDesc1()
  43   {
  44     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  45     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  46     oper.setName("predict");
  47     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
  48             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  49                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  50             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  51     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  52             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  53     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  54     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictReturn"));
  55     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  56     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  57     _operations[0] = oper;
  58
  59     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  60     oper.setName("predictOnMsa");
  61     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "msf"),
  62             new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
  63                     "Msfalignment"),
  64             vamsas.objects.simple.Msfalignment.class,
  65             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  66     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  67             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  68     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  69     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  70             "predictOnMsaReturn"));
  71     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  72     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  73     _operations[1] = oper;
  74
  75     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  76     oper.setName("getpredict");
  77     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  78             new javax.xml.namespace.QName(
  79                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  80             java.lang.String.class,
  81             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  82     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  83             "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
  84     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
  85     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  86             "getpredictReturn"));
  87     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  88     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  89     _operations[2] = oper;
  90
  91     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  92     oper.setName("getresult");
  93     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  94             new javax.xml.namespace.QName(
  95                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  96             java.lang.String.class,
  97             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  98     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  99             "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
 100     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 101     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getresultReturn"));
 102     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 103     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 104     _operations[3] = oper;
 105
 106   }
 107
 108   public JpredSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 109   {
 110     this(null);
 111   }
 112
 113   public JpredSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 114           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 115   {
 116     this(service);
 117     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 118   }
 119
 120   public JpredSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 121           throws org.apache.axis.AxisFault
 122   {
 123     if (service == null)
 124     {
 125       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 126     }
 127     else
 128     {
 129       super.service = service;
 130     }
 131     java.lang.Class cls;
 132     javax.xml.namespace.QName qName;
 133     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 134     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 135     /*
 136      * java.lang.Class enumsf =
 137      * org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class; java.lang.Class
 138      * enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 139      * java.lang.Class arraysf =
 140      * org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 141      * java.lang.Class arraydf =
 142      * org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 143      * java.lang.Class simplesf =
 144      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 145      * java.lang.Class simpledf =
 146      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 147      * java.lang.Class simplelistsf =
 148      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 149      * java.lang.Class simplelistdf =
 150      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 151      */
 152     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 153             "JpredResult");
 154     cachedSerQNames.add(qName);
 155     cls = vamsas.objects.simple.JpredResult.class;
 156     cachedSerClasses.add(cls);
 157     cachedSerFactories.add(beansf);
 158     cachedDeserFactories.add(beandf);
 159
 160     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 161     cachedSerQNames.add(qName);
 162     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 163     cachedSerClasses.add(cls);
 164     cachedSerFactories.add(beansf);
 165     cachedDeserFactories.add(beandf);
 166
 167     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 168             "Secstructpred");
 169     cachedSerQNames.add(qName);
 170     cls = vamsas.objects.simple.Secstructpred.class;
 171     cachedSerClasses.add(cls);
 172     cachedSerFactories.add(beansf);
 173     cachedDeserFactories.add(beandf);
 174
 175     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 176             "Msfalignment");
 177     cachedSerQNames.add(qName);
 178     cls = vamsas.objects.simple.Msfalignment.class;
 179     cachedSerClasses.add(cls);
 180     cachedSerFactories.add(beansf);
 181     cachedDeserFactories.add(beandf);
 182
 183     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 184             "Sequence");
 185     cachedSerQNames.add(qName);
 186     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 187     cachedSerClasses.add(cls);
 188     cachedSerFactories.add(beansf);
 189     cachedDeserFactories.add(beandf);
 190
 191   }
 192
 193   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 194           throws java.rmi.RemoteException
 195   {
 196     try
 197     {
 198       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 199               .createCall();
 200       if (super.maintainSessionSet)
 201       {
 202         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 203       }
 204       if (super.cachedUsername != null)
 205       {
 206         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 207       }
 208       if (super.cachedPassword != null)
 209       {
 210         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 211       }
 212       if (super.cachedEndpoint != null)
 213       {
 214         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 215       }
 216       if (super.cachedTimeout != null)
 217       {
 218         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 219       }
 220       if (super.cachedPortName != null)
 221       {
 222         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 223       }
 224       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 225       while (keys.hasMoreElements())
 226       {
 227         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 228         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 229       }
 230       // All the type mapping information is registered
 231       // when the first call is made.
 232       // The type mapping information is actually registered in
 233       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 234       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 235       synchronized (this)
 236       {
 237         if (firstCall())
 238         {
 239           // must set encoding style before registering serializers
 240           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 241           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 242           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 243           {
 244             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 245             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 246                     .get(i);
 247             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 248                     .get(i);
 249             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 250                     .get(i);
 251             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 252           }
 253         }
 254       }
 255       return _call;
 256     } catch (java.lang.Throwable _t)
 257     {
 258       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 259               "Failure trying to get the Call object", _t);
 260     }
 261   }
 262
 263   public java.lang.String predict(vamsas.objects.simple.Sequence seq)
 264           throws java.rmi.RemoteException
 265   {
 266     if (super.cachedEndpoint == null)
 267     {
 268       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 269     }
 270     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 271     _call.setOperation(_operations[0]);
 272     _call.setUseSOAPAction(true);
 273     _call.setSOAPActionURI("");
 274     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 275     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 276             "predict"));
 277
 278     setRequestHeaders(_call);
 279     setAttachments(_call);
 280     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { seq });
 281
 282     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 283     {
 284       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 285     }
 286     else
 287     {
 288       extractAttachments(_call);
 289       try
 290       {
 291         return (java.lang.String) _resp;
 292       } catch (java.lang.Exception _exception)
 293       {
 294         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 295                 _resp, java.lang.String.class);
 296       }
 297     }
 298   }
 299
 300   public java.lang.String predictOnMsa(
 301           vamsas.objects.simple.Msfalignment msf)
 302           throws java.rmi.RemoteException
 303   {
 304     if (super.cachedEndpoint == null)
 305     {
 306       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 307     }
 308     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 309     _call.setOperation(_operations[1]);
 310     _call.setUseSOAPAction(true);
 311     _call.setSOAPActionURI("");
 312     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 313     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 314             "predictOnMsa"));
 315
 316     setRequestHeaders(_call);
 317     setAttachments(_call);
 318     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { msf });
 319
 320     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 321     {
 322       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 323     }
 324     else
 325     {
 326       extractAttachments(_call);
 327       try
 328       {
 329         return (java.lang.String) _resp;
 330       } catch (java.lang.Exception _exception)
 331       {
 332         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 333                 _resp, java.lang.String.class);
 334       }
 335     }
 336   }
 337
 338   public vamsas.objects.simple.Secstructpred getpredict(
 339           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 340   {
 341     if (super.cachedEndpoint == null)
 342     {
 343       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 344     }
 345     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 346     _call.setOperation(_operations[2]);
 347     _call.setUseSOAPAction(true);
 348     _call.setSOAPActionURI("");
 349     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 350     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 351             "getpredict"));
 352
 353     setRequestHeaders(_call);
 354     setAttachments(_call);
 355     java.lang.Object _resp = _call
 356             .invoke(new java.lang.Object[] { job_id });
 357
 358     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 359     {
 360       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 361     }
 362     else
 363     {
 364       extractAttachments(_call);
 365       try
 366       {
 367         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) _resp;
 368       } catch (java.lang.Exception _exception)
 369       {
 370         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 371                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
 372       }
 373     }
 374   }
 375
 376   public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
 377           throws java.rmi.RemoteException
 378   {
 379     if (super.cachedEndpoint == null)
 380     {
 381       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 382     }
 383     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 384     _call.setOperation(_operations[3]);
 385     _call.setUseSOAPAction(true);
 386     _call.setSOAPActionURI("");
 387     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 388     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 389             "getresult"));
 390
 391     setRequestHeaders(_call);
 392     setAttachments(_call);
 393     java.lang.Object _resp = _call
 394             .invoke(new java.lang.Object[] { job_id });
 395
 396     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 397     {
 398       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 399     }
 400     else
 401     {
 402       extractAttachments(_call);
 403       try
 404       {
 405         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) _resp;
 406       } catch (java.lang.Exception _exception)
 407       {
 408         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 409                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 410       }
 411     }
 412   }
 413
 414 }