src/ext/vamsas/JpredSoapBindingStub.java

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  17  */
  18 package ext.vamsas;
  19
  20 public class JpredSoapBindingStub extends org.apache.axis.client.Stub
  21         implements ext.vamsas.Jpred
  22 {
  23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  24
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  26
  27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  28
  29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  30
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  32
  33   static
  34   {
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[4];
  36     _initOperationDesc1();
  37   }
  38
  39   private static void _initOperationDesc1()
  40   {
  41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  43     oper.setName("predict");
  44     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "seq"),
  45             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  46                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  47             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  48     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  49             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  50     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  51     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "predictReturn"));
  52     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  53     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  54     _operations[0] = oper;
  55
  56     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  57     oper.setName("predictOnMsa");
  58     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "msf"),
  59             new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
  60                     "Msfalignment"),
  61             vamsas.objects.simple.Msfalignment.class,
  62             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  63     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  64             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  65     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  66     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  67             "predictOnMsaReturn"));
  68     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  69     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  70     _operations[1] = oper;
  71
  72     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  73     oper.setName("getpredict");
  74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  75             new javax.xml.namespace.QName(
  76                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  77             java.lang.String.class,
  78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  79     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  80             "http://simple.objects.vamsas", "Secstructpred"));
  81     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
  82     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  83             "getpredictReturn"));
  84     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  85     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  86     _operations[2] = oper;
  87
  88     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  89     oper.setName("getresult");
  90     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  91             new javax.xml.namespace.QName(
  92                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  93             java.lang.String.class,
  94             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  95     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  96             "http://simple.objects.vamsas", "JpredResult"));
  97     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
  98     oper
  99             .setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
 100                     "getresultReturn"));
 101     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 102     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 103     _operations[3] = oper;
 104
 105   }
 106
 107   public JpredSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 108   {
 109     this(null);
 110   }
 111
 112   public JpredSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 113           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 114   {
 115     this(service);
 116     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 117   }
 118
 119   public JpredSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 120           throws org.apache.axis.AxisFault
 121   {
 122     if (service == null)
 123     {
 124       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 125     }
 126     else
 127     {
 128       super.service = service;
 129     }
 130     java.lang.Class cls;
 131     javax.xml.namespace.QName qName;
 132     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 133     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 134     /*
 135      * java.lang.Class enumsf =
 136      * org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class; java.lang.Class
 137      * enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 138      * java.lang.Class arraysf =
 139      * org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 140      * java.lang.Class arraydf =
 141      * org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 142      * java.lang.Class simplesf =
 143      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 144      * java.lang.Class simpledf =
 145      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 146      * java.lang.Class simplelistsf =
 147      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 148      * java.lang.Class simplelistdf =
 149      * org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 150      */
 151     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 152             "JpredResult");
 153     cachedSerQNames.add(qName);
 154     cls = vamsas.objects.simple.JpredResult.class;
 155     cachedSerClasses.add(cls);
 156     cachedSerFactories.add(beansf);
 157     cachedDeserFactories.add(beandf);
 158
 159     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 160     cachedSerQNames.add(qName);
 161     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 162     cachedSerClasses.add(cls);
 163     cachedSerFactories.add(beansf);
 164     cachedDeserFactories.add(beandf);
 165
 166     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 167             "Secstructpred");
 168     cachedSerQNames.add(qName);
 169     cls = vamsas.objects.simple.Secstructpred.class;
 170     cachedSerClasses.add(cls);
 171     cachedSerFactories.add(beansf);
 172     cachedDeserFactories.add(beandf);
 173
 174     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 175             "Msfalignment");
 176     cachedSerQNames.add(qName);
 177     cls = vamsas.objects.simple.Msfalignment.class;
 178     cachedSerClasses.add(cls);
 179     cachedSerFactories.add(beansf);
 180     cachedDeserFactories.add(beandf);
 181
 182     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 183             "Sequence");
 184     cachedSerQNames.add(qName);
 185     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 186     cachedSerClasses.add(cls);
 187     cachedSerFactories.add(beansf);
 188     cachedDeserFactories.add(beandf);
 189
 190   }
 191
 192   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 193           throws java.rmi.RemoteException
 194   {
 195     try
 196     {
 197       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 198               .createCall();
 199       if (super.maintainSessionSet)
 200       {
 201         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 202       }
 203       if (super.cachedUsername != null)
 204       {
 205         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 206       }
 207       if (super.cachedPassword != null)
 208       {
 209         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 210       }
 211       if (super.cachedEndpoint != null)
 212       {
 213         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 214       }
 215       if (super.cachedTimeout != null)
 216       {
 217         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 218       }
 219       if (super.cachedPortName != null)
 220       {
 221         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 222       }
 223       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 224       while (keys.hasMoreElements())
 225       {
 226         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 227         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 228       }
 229       // All the type mapping information is registered
 230       // when the first call is made.
 231       // The type mapping information is actually registered in
 232       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 233       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 234       synchronized (this)
 235       {
 236         if (firstCall())
 237         {
 238           // must set encoding style before registering serializers
 239           _call
 240                   .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 241           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 242           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 243           {
 244             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 245             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 246                     .get(i);
 247             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 248                     .get(i);
 249             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 250                     .get(i);
 251             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 252           }
 253         }
 254       }
 255       return _call;
 256     } catch (java.lang.Throwable _t)
 257     {
 258       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 259               "Failure trying to get the Call object", _t);
 260     }
 261   }
 262
 263   public java.lang.String predict(vamsas.objects.simple.Sequence seq)
 264           throws java.rmi.RemoteException
 265   {
 266     if (super.cachedEndpoint == null)
 267     {
 268       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 269     }
 270     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 271     _call.setOperation(_operations[0]);
 272     _call.setUseSOAPAction(true);
 273     _call.setSOAPActionURI("");
 274     _call
 275             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 276     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 277             "predict"));
 278
 279     setRequestHeaders(_call);
 280     setAttachments(_call);
 281     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 282     { seq });
 283
 284     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 285     {
 286       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 287     }
 288     else
 289     {
 290       extractAttachments(_call);
 291       try
 292       {
 293         return (java.lang.String) _resp;
 294       } catch (java.lang.Exception _exception)
 295       {
 296         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 297                 _resp, java.lang.String.class);
 298       }
 299     }
 300   }
 301
 302   public java.lang.String predictOnMsa(
 303           vamsas.objects.simple.Msfalignment msf)
 304           throws java.rmi.RemoteException
 305   {
 306     if (super.cachedEndpoint == null)
 307     {
 308       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 309     }
 310     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 311     _call.setOperation(_operations[1]);
 312     _call.setUseSOAPAction(true);
 313     _call.setSOAPActionURI("");
 314     _call
 315             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 316     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 317             "predictOnMsa"));
 318
 319     setRequestHeaders(_call);
 320     setAttachments(_call);
 321     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 322     { msf });
 323
 324     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 325     {
 326       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 327     }
 328     else
 329     {
 330       extractAttachments(_call);
 331       try
 332       {
 333         return (java.lang.String) _resp;
 334       } catch (java.lang.Exception _exception)
 335       {
 336         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 337                 _resp, java.lang.String.class);
 338       }
 339     }
 340   }
 341
 342   public vamsas.objects.simple.Secstructpred getpredict(
 343           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 344   {
 345     if (super.cachedEndpoint == null)
 346     {
 347       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 348     }
 349     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 350     _call.setOperation(_operations[2]);
 351     _call.setUseSOAPAction(true);
 352     _call.setSOAPActionURI("");
 353     _call
 354             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 355     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 356             "getpredict"));
 357
 358     setRequestHeaders(_call);
 359     setAttachments(_call);
 360     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 361     { job_id });
 362
 363     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 364     {
 365       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 366     }
 367     else
 368     {
 369       extractAttachments(_call);
 370       try
 371       {
 372         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) _resp;
 373       } catch (java.lang.Exception _exception)
 374       {
 375         return (vamsas.objects.simple.Secstructpred) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 376                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.Secstructpred.class);
 377       }
 378     }
 379   }
 380
 381   public vamsas.objects.simple.JpredResult getresult(java.lang.String job_id)
 382           throws java.rmi.RemoteException
 383   {
 384     if (super.cachedEndpoint == null)
 385     {
 386       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 387     }
 388     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 389     _call.setOperation(_operations[3]);
 390     _call.setUseSOAPAction(true);
 391     _call.setSOAPActionURI("");
 392     _call
 393             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 394     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 395             "getresult"));
 396
 397     setRequestHeaders(_call);
 398     setAttachments(_call);
 399     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 400     { job_id });
 401
 402     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 403     {
 404       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 405     }
 406     else
 407     {
 408       extractAttachments(_call);
 409       try
 410       {
 411         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) _resp;
 412       } catch (java.lang.Exception _exception)
 413       {
 414         return (vamsas.objects.simple.JpredResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 415                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.JpredResult.class);
 416       }
 417     }
 418   }
 419
 420 }