src/ext/vamsas/MuscleWS.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.7)
   3  * Copyright (C) 2011 J Procter, AM Waterhouse, J Engelhardt, LM Lui, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
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  17  */
  18 package ext.vamsas;
  19
  20 public interface MuscleWS extends java.rmi.Remote
  21 {
  22   public vamsas.objects.simple.WsJobId align(
  23           vamsas.objects.simple.SequenceSet seqSet)
  24           throws java.rmi.RemoteException;
  25
  26   public vamsas.objects.simple.Alignment getalign(java.lang.String job_id)
  27           throws java.rmi.RemoteException;
  28
  29   public vamsas.objects.simple.MsaResult getResult(java.lang.String job_id)
  30           throws java.rmi.RemoteException;
  31
  32   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
  33           throws java.rmi.RemoteException;
  34 }