src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8)
   3  * Copyright (C) 2012 J Procter, AM Waterhouse, LM Lui, J Engelhardt, G Barton, M Clamp, S Searle
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  */
  18 package ext.vamsas;
  19
  20 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends
  21         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI
  22 {
  23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  24
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  26
  27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  28
  29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  30
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  32
  33   static
  34   {
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];
  36     _initOperationDesc1();
  37   }
  38
  39   private static void _initOperationDesc1()
  40   {
  41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  43     oper.setName("getDatabase");
  44     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  45             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  46     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  47     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  48             "getDatabaseReturn"));
  49     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  50     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  51     _operations[0] = oper;
  52
  53     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  54     oper.setName("getResult");
  55     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  56             new javax.xml.namespace.QName(
  57                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  58             java.lang.String.class,
  59             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  60     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  61             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));
  62     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
  63     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
  64     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  65     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  66     _operations[1] = oper;
  67
  68     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  69     oper.setName("psearch");
  70     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),
  71             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  72                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,
  73             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  74     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  75             new javax.xml.namespace.QName(
  76                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  77             java.lang.String.class,
  78             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  79     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  80             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
  81     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
  82     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));
  83     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  84     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  85     _operations[2] = oper;
  86
  87     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  88     oper.setName("search");
  89     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),
  90             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  91                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  92             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  93     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  94             new javax.xml.namespace.QName(
  95                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  96             java.lang.String.class,
  97             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  98     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  99             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 100     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 101     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));
 102     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 103     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 104     _operations[3] = oper;
 105
 106     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 107     oper.setName("cancel");
 108     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 109             new javax.xml.namespace.QName(
 110                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 111             java.lang.String.class,
 112             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 113     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 114             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 115     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 116     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 117     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 118     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 119     _operations[4] = oper;
 120
 121   }
 122
 123   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 124   {
 125     this(null);
 126   }
 127
 128   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 129           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 130   {
 131     this(service);
 132     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 133   }
 134
 135   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 136           throws org.apache.axis.AxisFault
 137   {
 138     if (service == null)
 139     {
 140       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 141     }
 142     else
 143     {
 144       super.service = service;
 145     }
 146     java.lang.Class cls;
 147     javax.xml.namespace.QName qName;
 148     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 149     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 150     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 151     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 152     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 153     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 154     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 155     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 156     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 157     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 158     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 159     cachedSerQNames.add(qName);
 160     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 161     cachedSerClasses.add(cls);
 162     cachedSerFactories.add(beansf);
 163     cachedDeserFactories.add(beandf);
 164
 165     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 166             "WsJobId");
 167     cachedSerQNames.add(qName);
 168     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 169     cachedSerClasses.add(cls);
 170     cachedSerFactories.add(beansf);
 171     cachedDeserFactories.add(beandf);
 172
 173     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 174             "Object");
 175     cachedSerQNames.add(qName);
 176     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 177     cachedSerClasses.add(cls);
 178     cachedSerFactories.add(beansf);
 179     cachedDeserFactories.add(beandf);
 180
 181     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 182     cachedSerQNames.add(qName);
 183     cls = java.lang.String[].class;
 184     cachedSerClasses.add(cls);
 185     cachedSerFactories.add(arraysf);
 186     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 187
 188     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 189             "Alignment");
 190     cachedSerQNames.add(qName);
 191     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 192     cachedSerClasses.add(cls);
 193     cachedSerFactories.add(beansf);
 194     cachedDeserFactories.add(beandf);
 195
 196     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 197             "Sequence");
 198     cachedSerQNames.add(qName);
 199     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 200     cachedSerClasses.add(cls);
 201     cachedSerFactories.add(beansf);
 202     cachedDeserFactories.add(beandf);
 203
 204     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");
 205     cachedSerQNames.add(qName);
 206     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
 207     cachedSerClasses.add(cls);
 208     cachedSerFactories.add(arraysf);
 209     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 210
 211     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 212             "SeqSearchResult");
 213     cachedSerQNames.add(qName);
 214     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;
 215     cachedSerClasses.add(cls);
 216     cachedSerFactories.add(beansf);
 217     cachedDeserFactories.add(beandf);
 218
 219     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 220             "SequenceSet");
 221     cachedSerQNames.add(qName);
 222     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 223     cachedSerClasses.add(cls);
 224     cachedSerFactories.add(beansf);
 225     cachedDeserFactories.add(beandf);
 226
 227   }
 228
 229   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 230           throws java.rmi.RemoteException
 231   {
 232     try
 233     {
 234       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 235               .createCall();
 236       if (super.maintainSessionSet)
 237       {
 238         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 239       }
 240       if (super.cachedUsername != null)
 241       {
 242         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 243       }
 244       if (super.cachedPassword != null)
 245       {
 246         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 247       }
 248       if (super.cachedEndpoint != null)
 249       {
 250         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 251       }
 252       if (super.cachedTimeout != null)
 253       {
 254         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 255       }
 256       if (super.cachedPortName != null)
 257       {
 258         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 259       }
 260       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 261       while (keys.hasMoreElements())
 262       {
 263         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 264         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 265       }
 266       // All the type mapping information is registered
 267       // when the first call is made.
 268       // The type mapping information is actually registered in
 269       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 270       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 271       synchronized (this)
 272       {
 273         if (firstCall())
 274         {
 275           // must set encoding style before registering serializers
 276           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 277           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 278           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 279           {
 280             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 281             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 282                     .get(i);
 283             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 284                     .get(i);
 285             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 286                     .get(i);
 287             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 288           }
 289         }
 290       }
 291       return _call;
 292     } catch (java.lang.Throwable _t)
 293     {
 294       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 295               "Failure trying to get the Call object", _t);
 296     }
 297   }
 298
 299   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException
 300   {
 301     if (super.cachedEndpoint == null)
 302     {
 303       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 304     }
 305     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 306     _call.setOperation(_operations[0]);
 307     _call.setUseSOAPAction(true);
 308     _call.setSOAPActionURI("");
 309     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 310     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 311             "getDatabase"));
 312
 313     setRequestHeaders(_call);
 314     setAttachments(_call);
 315     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 316     {});
 317
 318     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 319     {
 320       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 321     }
 322     else
 323     {
 324       extractAttachments(_call);
 325       try
 326       {
 327         return (java.lang.String) _resp;
 328       } catch (java.lang.Exception _exception)
 329       {
 330         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 331                 _resp, java.lang.String.class);
 332       }
 333     }
 334   }
 335
 336   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
 337           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 338   {
 339     if (super.cachedEndpoint == null)
 340     {
 341       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 342     }
 343     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 344     _call.setOperation(_operations[1]);
 345     _call.setUseSOAPAction(true);
 346     _call.setSOAPActionURI("");
 347     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 348     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 349             "getResult"));
 350
 351     setRequestHeaders(_call);
 352     setAttachments(_call);
 353     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 354     { job_id });
 355
 356     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 357     {
 358       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 359     }
 360     else
 361     {
 362       extractAttachments(_call);
 363       try
 364       {
 365         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;
 366       } catch (java.lang.Exception _exception)
 367       {
 368         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 369                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
 370       }
 371     }
 372   }
 373
 374   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
 375           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
 376           throws java.rmi.RemoteException
 377   {
 378     if (super.cachedEndpoint == null)
 379     {
 380       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 381     }
 382     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 383     _call.setOperation(_operations[2]);
 384     _call.setUseSOAPAction(true);
 385     _call.setSOAPActionURI("");
 386     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 387     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 388             "psearch"));
 389
 390     setRequestHeaders(_call);
 391     setAttachments(_call);
 392     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 393     { al, database });
 394
 395     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 396     {
 397       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 398     }
 399     else
 400     {
 401       extractAttachments(_call);
 402       try
 403       {
 404         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 405       } catch (java.lang.Exception _exception)
 406       {
 407         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 408                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 409       }
 410     }
 411   }
 412
 413   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
 414           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
 415           throws java.rmi.RemoteException
 416   {
 417     if (super.cachedEndpoint == null)
 418     {
 419       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 420     }
 421     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 422     _call.setOperation(_operations[3]);
 423     _call.setUseSOAPAction(true);
 424     _call.setSOAPActionURI("");
 425     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 426     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));
 427
 428     setRequestHeaders(_call);
 429     setAttachments(_call);
 430     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 431     { s, database });
 432
 433     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 434     {
 435       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 436     }
 437     else
 438     {
 439       extractAttachments(_call);
 440       try
 441       {
 442         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 443       } catch (java.lang.Exception _exception)
 444       {
 445         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 446                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 447       }
 448     }
 449   }
 450
 451   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 452           throws java.rmi.RemoteException
 453   {
 454     if (super.cachedEndpoint == null)
 455     {
 456       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 457     }
 458     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 459     _call.setOperation(_operations[4]);
 460     _call.setUseSOAPAction(true);
 461     _call.setSOAPActionURI("");
 462     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 463     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
 464
 465     setRequestHeaders(_call);
 466     setAttachments(_call);
 467     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 468     { jobId });
 469
 470     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 471     {
 472       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 473     }
 474     else
 475     {
 476       extractAttachments(_call);
 477       try
 478       {
 479         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 480       } catch (java.lang.Exception _exception)
 481       {
 482         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 483                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 484       }
 485     }
 486   }
 487
 488 }