src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.6)\r
   3  * Copyright (C) 2010 J Procter, AM Waterhouse, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  * \r
   5  * This file is part of Jalview.\r
   6  * \r
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or\r
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License \r
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.\r
  10  * \r
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but \r
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty \r
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR \r
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.\r
  15  * \r
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.\r
  17  */\r
  18 package ext.vamsas;\r
  19 \r
  20 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends\r
  21         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI\r
  22 {\r
  23   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();\r
  24 \r
  25   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();\r
  26 \r
  27   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();\r
  28 \r
  29   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();\r
  30 \r
  31   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;\r
  32 \r
  33   static\r
  34   {\r
  35     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];\r
  36     _initOperationDesc1();\r
  37   }\r
  38 \r
  39   private static void _initOperationDesc1()\r
  40   {\r
  41     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;\r
  42     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  43     oper.setName("getDatabase");\r
  44     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  45             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));\r
  46     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);\r
  47     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",\r
  48             "getDatabaseReturn"));\r
  49     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  50     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  51     _operations[0] = oper;\r
  52 \r
  53     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  54     oper.setName("getResult");\r
  55     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),\r
  56             new javax.xml.namespace.QName(\r
  57                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  58             java.lang.String.class,\r
  59             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  60     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  61             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));\r
  62     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);\r
  63     oper\r
  64             .setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",\r
  65                     "getResultReturn"));\r
  66     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  67     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  68     _operations[1] = oper;\r
  69 \r
  70     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  71     oper.setName("psearch");\r
  72     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),\r
  73             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
  74                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,\r
  75             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  76     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),\r
  77             new javax.xml.namespace.QName(\r
  78                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  79             java.lang.String.class,\r
  80             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  81     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
  82             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
  83     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
  84     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));\r
  85     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
  86     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
  87     _operations[2] = oper;\r
  88 \r
  89     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
  90     oper.setName("search");\r
  91     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),\r
  92             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
  93                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,\r
  94             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
  95     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),\r
  96             new javax.xml.namespace.QName(\r
  97                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
  98             java.lang.String.class,\r
  99             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 100     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 101             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 102     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 103     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));\r
 104     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 105     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 106     _operations[3] = oper;\r
 107 \r
 108     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();\r
 109     oper.setName("cancel");\r
 110     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),\r
 111             new javax.xml.namespace.QName(\r
 112                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),\r
 113             java.lang.String.class,\r
 114             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);\r
 115     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(\r
 116             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));\r
 117     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 118     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));\r
 119     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);\r
 120     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);\r
 121     _operations[4] = oper;\r
 122 \r
 123   }\r
 124 \r
 125   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault\r
 126   {\r
 127     this(null);\r
 128   }\r
 129 \r
 130   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,\r
 131           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault\r
 132   {\r
 133     this(service);\r
 134     super.cachedEndpoint = endpointURL;\r
 135   }\r
 136 \r
 137   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)\r
 138           throws org.apache.axis.AxisFault\r
 139   {\r
 140     if (service == null)\r
 141     {\r
 142       super.service = new org.apache.axis.client.Service();\r
 143     }\r
 144     else\r
 145     {\r
 146       super.service = service;\r
 147     }\r
 148     java.lang.Class cls;\r
 149     javax.xml.namespace.QName qName;\r
 150     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;\r
 151     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;\r
 152     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;\r
 153     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;\r
 154     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;\r
 155     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;\r
 156     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;\r
 157     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;\r
 158     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;\r
 159     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;\r
 160     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");\r
 161     cachedSerQNames.add(qName);\r
 162     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;\r
 163     cachedSerClasses.add(cls);\r
 164     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 165     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 166 \r
 167     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 168             "WsJobId");\r
 169     cachedSerQNames.add(qName);\r
 170     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;\r
 171     cachedSerClasses.add(cls);\r
 172     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 173     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 174 \r
 175     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",\r
 176             "Object");\r
 177     cachedSerQNames.add(qName);\r
 178     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;\r
 179     cachedSerClasses.add(cls);\r
 180     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 181     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 182 \r
 183     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");\r
 184     cachedSerQNames.add(qName);\r
 185     cls = java.lang.String[].class;\r
 186     cachedSerClasses.add(cls);\r
 187     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
 188     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
 189 \r
 190     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 191             "Alignment");\r
 192     cachedSerQNames.add(qName);\r
 193     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;\r
 194     cachedSerClasses.add(cls);\r
 195     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 196     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 197 \r
 198     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 199             "Sequence");\r
 200     cachedSerQNames.add(qName);\r
 201     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;\r
 202     cachedSerClasses.add(cls);\r
 203     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 204     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 205 \r
 206     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");\r
 207     cachedSerQNames.add(qName);\r
 208     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;\r
 209     cachedSerClasses.add(cls);\r
 210     cachedSerFactories.add(arraysf);\r
 211     cachedDeserFactories.add(arraydf);\r
 212 \r
 213     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 214             "SeqSearchResult");\r
 215     cachedSerQNames.add(qName);\r
 216     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;\r
 217     cachedSerClasses.add(cls);\r
 218     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 219     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 220 \r
 221     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",\r
 222             "SequenceSet");\r
 223     cachedSerQNames.add(qName);\r
 224     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;\r
 225     cachedSerClasses.add(cls);\r
 226     cachedSerFactories.add(beansf);\r
 227     cachedDeserFactories.add(beandf);\r
 228 \r
 229   }\r
 230 \r
 231   protected org.apache.axis.client.Call createCall()\r
 232           throws java.rmi.RemoteException\r
 233   {\r
 234     try\r
 235     {\r
 236       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service\r
 237               .createCall();\r
 238       if (super.maintainSessionSet)\r
 239       {\r
 240         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);\r
 241       }\r
 242       if (super.cachedUsername != null)\r
 243       {\r
 244         _call.setUsername(super.cachedUsername);\r
 245       }\r
 246       if (super.cachedPassword != null)\r
 247       {\r
 248         _call.setPassword(super.cachedPassword);\r
 249       }\r
 250       if (super.cachedEndpoint != null)\r
 251       {\r
 252         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);\r
 253       }\r
 254       if (super.cachedTimeout != null)\r
 255       {\r
 256         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);\r
 257       }\r
 258       if (super.cachedPortName != null)\r
 259       {\r
 260         _call.setPortName(super.cachedPortName);\r
 261       }\r
 262       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();\r
 263       while (keys.hasMoreElements())\r
 264       {\r
 265         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();\r
 266         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));\r
 267       }\r
 268       // All the type mapping information is registered\r
 269       // when the first call is made.\r
 270       // The type mapping information is actually registered in\r
 271       // the TypeMappingRegistry of the service, which\r
 272       // is the reason why registration is only needed for the first call.\r
 273       synchronized (this)\r
 274       {\r
 275         if (firstCall())\r
 276         {\r
 277           // must set encoding style before registering serializers\r
 278           _call\r
 279                   .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 280           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);\r
 281           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)\r
 282           {\r
 283             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);\r
 284             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames\r
 285                     .get(i);\r
 286             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories\r
 287                     .get(i);\r
 288             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories\r
 289                     .get(i);\r
 290             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);\r
 291           }\r
 292         }\r
 293       }\r
 294       return _call;\r
 295     } catch (java.lang.Throwable _t)\r
 296     {\r
 297       throw new org.apache.axis.AxisFault(\r
 298               "Failure trying to get the Call object", _t);\r
 299     }\r
 300   }\r
 301 \r
 302   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException\r
 303   {\r
 304     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 305     {\r
 306       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 307     }\r
 308     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 309     _call.setOperation(_operations[0]);\r
 310     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 311     _call.setSOAPActionURI("");\r
 312     _call\r
 313             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 314     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 315             "getDatabase"));\r
 316 \r
 317     setRequestHeaders(_call);\r
 318     setAttachments(_call);\r
 319     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 320     {});\r
 321 \r
 322     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 323     {\r
 324       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 325     }\r
 326     else\r
 327     {\r
 328       extractAttachments(_call);\r
 329       try\r
 330       {\r
 331         return (java.lang.String) _resp;\r
 332       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 333       {\r
 334         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(\r
 335                 _resp, java.lang.String.class);\r
 336       }\r
 337     }\r
 338   }\r
 339 \r
 340   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(\r
 341           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException\r
 342   {\r
 343     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 344     {\r
 345       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 346     }\r
 347     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 348     _call.setOperation(_operations[1]);\r
 349     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 350     _call.setSOAPActionURI("");\r
 351     _call\r
 352             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 353     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 354             "getResult"));\r
 355 \r
 356     setRequestHeaders(_call);\r
 357     setAttachments(_call);\r
 358     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 359     { job_id });\r
 360 \r
 361     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 362     {\r
 363       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 364     }\r
 365     else\r
 366     {\r
 367       extractAttachments(_call);\r
 368       try\r
 369       {\r
 370         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;\r
 371       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 372       {\r
 373         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 374                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);\r
 375       }\r
 376     }\r
 377   }\r
 378 \r
 379   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(\r
 380           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)\r
 381           throws java.rmi.RemoteException\r
 382   {\r
 383     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 384     {\r
 385       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 386     }\r
 387     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 388     _call.setOperation(_operations[2]);\r
 389     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 390     _call.setSOAPActionURI("");\r
 391     _call\r
 392             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 393     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 394             "psearch"));\r
 395 \r
 396     setRequestHeaders(_call);\r
 397     setAttachments(_call);\r
 398     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 399     { al, database });\r
 400 \r
 401     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 402     {\r
 403       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 404     }\r
 405     else\r
 406     {\r
 407       extractAttachments(_call);\r
 408       try\r
 409       {\r
 410         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 411       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 412       {\r
 413         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 414                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 415       }\r
 416     }\r
 417   }\r
 418 \r
 419   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(\r
 420           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)\r
 421           throws java.rmi.RemoteException\r
 422   {\r
 423     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 424     {\r
 425       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 426     }\r
 427     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 428     _call.setOperation(_operations[3]);\r
 429     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 430     _call.setSOAPActionURI("");\r
 431     _call\r
 432             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 433     _call\r
 434             .setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 435                     "search"));\r
 436 \r
 437     setRequestHeaders(_call);\r
 438     setAttachments(_call);\r
 439     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 440     { s, database });\r
 441 \r
 442     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 443     {\r
 444       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 445     }\r
 446     else\r
 447     {\r
 448       extractAttachments(_call);\r
 449       try\r
 450       {\r
 451         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 452       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 453       {\r
 454         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 455                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 456       }\r
 457     }\r
 458   }\r
 459 \r
 460   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)\r
 461           throws java.rmi.RemoteException\r
 462   {\r
 463     if (super.cachedEndpoint == null)\r
 464     {\r
 465       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();\r
 466     }\r
 467     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();\r
 468     _call.setOperation(_operations[4]);\r
 469     _call.setUseSOAPAction(true);\r
 470     _call.setSOAPActionURI("");\r
 471     _call\r
 472             .setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);\r
 473     _call\r
 474             .setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",\r
 475                     "cancel"));\r
 476 \r
 477     setRequestHeaders(_call);\r
 478     setAttachments(_call);\r
 479     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]\r
 480     { jobId });\r
 481 \r
 482     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)\r
 483     {\r
 484       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;\r
 485     }\r
 486     else\r
 487     {\r
 488       extractAttachments(_call);\r
 489       try\r
 490       {\r
 491         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;\r
 492       } catch (java.lang.Exception _exception)\r
 493       {\r
 494         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils\r
 495                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);\r
 496       }\r
 497     }\r
 498   }\r
 499 \r
 500 }\r