src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package ext.vamsas;
  22
  23 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends
  24         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI
  25 {
  26   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  33
  34   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  35
  36   static
  37   {
  38     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];
  39     _initOperationDesc1();
  40   }
  41
  42   private static void _initOperationDesc1()
  43   {
  44     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  45     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  46     oper.setName("getDatabase");
  47     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  48             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  49     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  50     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  51             "getDatabaseReturn"));
  52     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  53     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  54     _operations[0] = oper;
  55
  56     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  57     oper.setName("getResult");
  58     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  59             new javax.xml.namespace.QName(
  60                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  61             java.lang.String.class,
  62             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  63     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  64             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));
  65     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
  66     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
  67     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  68     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  69     _operations[1] = oper;
  70
  71     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  72     oper.setName("psearch");
  73     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),
  74             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  75                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,
  76             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  77     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  78             new javax.xml.namespace.QName(
  79                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  80             java.lang.String.class,
  81             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  82     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  83             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
  84     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
  85     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));
  86     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  87     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  88     _operations[2] = oper;
  89
  90     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  91     oper.setName("search");
  92     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),
  93             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  94                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  95             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  96     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  97             new javax.xml.namespace.QName(
  98                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  99             java.lang.String.class,
 100             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 101     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 102             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 103     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 104     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));
 105     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 106     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 107     _operations[3] = oper;
 108
 109     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 110     oper.setName("cancel");
 111     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 112             new javax.xml.namespace.QName(
 113                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 114             java.lang.String.class,
 115             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 116     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 117             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 118     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 119     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 120     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 121     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 122     _operations[4] = oper;
 123
 124   }
 125
 126   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 127   {
 128     this(null);
 129   }
 130
 131   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 132           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 133   {
 134     this(service);
 135     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 136   }
 137
 138   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 139           throws org.apache.axis.AxisFault
 140   {
 141     if (service == null)
 142     {
 143       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 144     }
 145     else
 146     {
 147       super.service = service;
 148     }
 149     java.lang.Class cls;
 150     javax.xml.namespace.QName qName;
 151     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 152     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 153     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 154     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 155     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 156     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 157     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 158     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 159     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 160     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 161     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 162     cachedSerQNames.add(qName);
 163     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 164     cachedSerClasses.add(cls);
 165     cachedSerFactories.add(beansf);
 166     cachedDeserFactories.add(beandf);
 167
 168     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 169             "WsJobId");
 170     cachedSerQNames.add(qName);
 171     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 172     cachedSerClasses.add(cls);
 173     cachedSerFactories.add(beansf);
 174     cachedDeserFactories.add(beandf);
 175
 176     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 177             "Object");
 178     cachedSerQNames.add(qName);
 179     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 180     cachedSerClasses.add(cls);
 181     cachedSerFactories.add(beansf);
 182     cachedDeserFactories.add(beandf);
 183
 184     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 185     cachedSerQNames.add(qName);
 186     cls = java.lang.String[].class;
 187     cachedSerClasses.add(cls);
 188     cachedSerFactories.add(arraysf);
 189     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 190
 191     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 192             "Alignment");
 193     cachedSerQNames.add(qName);
 194     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 195     cachedSerClasses.add(cls);
 196     cachedSerFactories.add(beansf);
 197     cachedDeserFactories.add(beandf);
 198
 199     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 200             "Sequence");
 201     cachedSerQNames.add(qName);
 202     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 203     cachedSerClasses.add(cls);
 204     cachedSerFactories.add(beansf);
 205     cachedDeserFactories.add(beandf);
 206
 207     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");
 208     cachedSerQNames.add(qName);
 209     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
 210     cachedSerClasses.add(cls);
 211     cachedSerFactories.add(arraysf);
 212     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 213
 214     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 215             "SeqSearchResult");
 216     cachedSerQNames.add(qName);
 217     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;
 218     cachedSerClasses.add(cls);
 219     cachedSerFactories.add(beansf);
 220     cachedDeserFactories.add(beandf);
 221
 222     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 223             "SequenceSet");
 224     cachedSerQNames.add(qName);
 225     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 226     cachedSerClasses.add(cls);
 227     cachedSerFactories.add(beansf);
 228     cachedDeserFactories.add(beandf);
 229
 230   }
 231
 232   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 233           throws java.rmi.RemoteException
 234   {
 235     try
 236     {
 237       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 238               .createCall();
 239       if (super.maintainSessionSet)
 240       {
 241         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 242       }
 243       if (super.cachedUsername != null)
 244       {
 245         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 246       }
 247       if (super.cachedPassword != null)
 248       {
 249         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 250       }
 251       if (super.cachedEndpoint != null)
 252       {
 253         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 254       }
 255       if (super.cachedTimeout != null)
 256       {
 257         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 258       }
 259       if (super.cachedPortName != null)
 260       {
 261         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 262       }
 263       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 264       while (keys.hasMoreElements())
 265       {
 266         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 267         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 268       }
 269       // All the type mapping information is registered
 270       // when the first call is made.
 271       // The type mapping information is actually registered in
 272       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 273       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 274       synchronized (this)
 275       {
 276         if (firstCall())
 277         {
 278           // must set encoding style before registering serializers
 279           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 280           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 281           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 282           {
 283             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 284             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 285                     .get(i);
 286             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 287                     .get(i);
 288             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 289                     .get(i);
 290             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 291           }
 292         }
 293       }
 294       return _call;
 295     } catch (java.lang.Throwable _t)
 296     {
 297       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 298               "Failure trying to get the Call object", _t);
 299     }
 300   }
 301
 302   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException
 303   {
 304     if (super.cachedEndpoint == null)
 305     {
 306       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 307     }
 308     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 309     _call.setOperation(_operations[0]);
 310     _call.setUseSOAPAction(true);
 311     _call.setSOAPActionURI("");
 312     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 313     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 314             "getDatabase"));
 315
 316     setRequestHeaders(_call);
 317     setAttachments(_call);
 318     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] {});
 319
 320     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 321     {
 322       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 323     }
 324     else
 325     {
 326       extractAttachments(_call);
 327       try
 328       {
 329         return (java.lang.String) _resp;
 330       } catch (java.lang.Exception _exception)
 331       {
 332         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 333                 _resp, java.lang.String.class);
 334       }
 335     }
 336   }
 337
 338   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
 339           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 340   {
 341     if (super.cachedEndpoint == null)
 342     {
 343       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 344     }
 345     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 346     _call.setOperation(_operations[1]);
 347     _call.setUseSOAPAction(true);
 348     _call.setSOAPActionURI("");
 349     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 350     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 351             "getResult"));
 352
 353     setRequestHeaders(_call);
 354     setAttachments(_call);
 355     java.lang.Object _resp = _call
 356             .invoke(new java.lang.Object[] { job_id });
 357
 358     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 359     {
 360       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 361     }
 362     else
 363     {
 364       extractAttachments(_call);
 365       try
 366       {
 367         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;
 368       } catch (java.lang.Exception _exception)
 369       {
 370         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 371                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
 372       }
 373     }
 374   }
 375
 376   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
 377           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
 378           throws java.rmi.RemoteException
 379   {
 380     if (super.cachedEndpoint == null)
 381     {
 382       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 383     }
 384     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 385     _call.setOperation(_operations[2]);
 386     _call.setUseSOAPAction(true);
 387     _call.setSOAPActionURI("");
 388     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 389     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 390             "psearch"));
 391
 392     setRequestHeaders(_call);
 393     setAttachments(_call);
 394     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { al,
 395         database });
 396
 397     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 398     {
 399       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 400     }
 401     else
 402     {
 403       extractAttachments(_call);
 404       try
 405       {
 406         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 407       } catch (java.lang.Exception _exception)
 408       {
 409         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 410                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 411       }
 412     }
 413   }
 414
 415   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
 416           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
 417           throws java.rmi.RemoteException
 418   {
 419     if (super.cachedEndpoint == null)
 420     {
 421       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 422     }
 423     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 424     _call.setOperation(_operations[3]);
 425     _call.setUseSOAPAction(true);
 426     _call.setSOAPActionURI("");
 427     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 428     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));
 429
 430     setRequestHeaders(_call);
 431     setAttachments(_call);
 432     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { s,
 433         database });
 434
 435     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 436     {
 437       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 438     }
 439     else
 440     {
 441       extractAttachments(_call);
 442       try
 443       {
 444         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 445       } catch (java.lang.Exception _exception)
 446       {
 447         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 448                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 449       }
 450     }
 451   }
 452
 453   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 454           throws java.rmi.RemoteException
 455   {
 456     if (super.cachedEndpoint == null)
 457     {
 458       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 459     }
 460     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 461     _call.setOperation(_operations[4]);
 462     _call.setUseSOAPAction(true);
 463     _call.setSOAPActionURI("");
 464     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 465     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
 466
 467     setRequestHeaders(_call);
 468     setAttachments(_call);
 469     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[] { jobId });
 470
 471     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 472     {
 473       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 474     }
 475     else
 476     {
 477       extractAttachments(_call);
 478       try
 479       {
 480         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 481       } catch (java.lang.Exception _exception)
 482       {
 483         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 484                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 485       }
 486     }
 487   }
 488
 489 }