src/ext/vamsas/SeqSearchServiceSoapBindingStub.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer (Version 2.8.0b1)
   3  * Copyright (C) 2014 The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
  10  *
  11  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  12  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  13  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  14  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  15  *
  16  * You should have received a copy of the GNU General Public License along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  17  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  18  */
  19 package ext.vamsas;
  20
  21 public class SeqSearchServiceSoapBindingStub extends
  22         org.apache.axis.client.Stub implements ext.vamsas.SeqSearchI
  23 {
  24   private java.util.Vector cachedSerClasses = new java.util.Vector();
  25
  26   private java.util.Vector cachedSerQNames = new java.util.Vector();
  27
  28   private java.util.Vector cachedSerFactories = new java.util.Vector();
  29
  30   private java.util.Vector cachedDeserFactories = new java.util.Vector();
  31
  32   static org.apache.axis.description.OperationDesc[] _operations;
  33
  34   static
  35   {
  36     _operations = new org.apache.axis.description.OperationDesc[5];
  37     _initOperationDesc1();
  38   }
  39
  40   private static void _initOperationDesc1()
  41   {
  42     org.apache.axis.description.OperationDesc oper;
  43     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  44     oper.setName("getDatabase");
  45     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  46             "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"));
  47     oper.setReturnClass(java.lang.String.class);
  48     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("",
  49             "getDatabaseReturn"));
  50     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  51     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  52     _operations[0] = oper;
  53
  54     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  55     oper.setName("getResult");
  56     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "job_id"),
  57             new javax.xml.namespace.QName(
  58                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  59             java.lang.String.class,
  60             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  61     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  62             "simple.objects.vamsas", "SeqSearchResult"));
  63     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
  64     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "getResultReturn"));
  65     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  66     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  67     _operations[1] = oper;
  68
  69     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  70     oper.setName("psearch");
  71     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "al"),
  72             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  73                     "Alignment"), vamsas.objects.simple.Alignment.class,
  74             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  75     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  76             new javax.xml.namespace.QName(
  77                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  78             java.lang.String.class,
  79             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  80     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
  81             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
  82     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
  83     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "psearchReturn"));
  84     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
  85     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
  86     _operations[2] = oper;
  87
  88     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
  89     oper.setName("search");
  90     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "s"),
  91             new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
  92                     "Sequence"), vamsas.objects.simple.Sequence.class,
  93             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  94     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "database"),
  95             new javax.xml.namespace.QName(
  96                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
  97             java.lang.String.class,
  98             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
  99     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 100             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 101     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 102     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "searchReturn"));
 103     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 104     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 105     _operations[3] = oper;
 106
 107     oper = new org.apache.axis.description.OperationDesc();
 108     oper.setName("cancel");
 109     oper.addParameter(new javax.xml.namespace.QName("", "jobId"),
 110             new javax.xml.namespace.QName(
 111                     "http://www.w3.org/2001/XMLSchema", "string"),
 112             java.lang.String.class,
 113             org.apache.axis.description.ParameterDesc.IN, false, false);
 114     oper.setReturnType(new javax.xml.namespace.QName(
 115             "simple.objects.vamsas", "WsJobId"));
 116     oper.setReturnClass(vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 117     oper.setReturnQName(new javax.xml.namespace.QName("", "cancelReturn"));
 118     oper.setStyle(org.apache.axis.constants.Style.RPC);
 119     oper.setUse(org.apache.axis.constants.Use.ENCODED);
 120     _operations[4] = oper;
 121
 122   }
 123
 124   public SeqSearchServiceSoapBindingStub() throws org.apache.axis.AxisFault
 125   {
 126     this(null);
 127   }
 128
 129   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(java.net.URL endpointURL,
 130           javax.xml.rpc.Service service) throws org.apache.axis.AxisFault
 131   {
 132     this(service);
 133     super.cachedEndpoint = endpointURL;
 134   }
 135
 136   public SeqSearchServiceSoapBindingStub(javax.xml.rpc.Service service)
 137           throws org.apache.axis.AxisFault
 138   {
 139     if (service == null)
 140     {
 141       super.service = new org.apache.axis.client.Service();
 142     }
 143     else
 144     {
 145       super.service = service;
 146     }
 147     java.lang.Class cls;
 148     javax.xml.namespace.QName qName;
 149     java.lang.Class beansf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanSerializerFactory.class;
 150     java.lang.Class beandf = org.apache.axis.encoding.ser.BeanDeserializerFactory.class;
 151     java.lang.Class enumsf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumSerializerFactory.class;
 152     java.lang.Class enumdf = org.apache.axis.encoding.ser.EnumDeserializerFactory.class;
 153     java.lang.Class arraysf = org.apache.axis.encoding.ser.ArraySerializerFactory.class;
 154     java.lang.Class arraydf = org.apache.axis.encoding.ser.ArrayDeserializerFactory.class;
 155     java.lang.Class simplesf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleSerializerFactory.class;
 156     java.lang.Class simpledf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleDeserializerFactory.class;
 157     java.lang.Class simplelistsf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListSerializerFactory.class;
 158     java.lang.Class simplelistdf = org.apache.axis.encoding.ser.SimpleListDeserializerFactory.class;
 159     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas", "Result");
 160     cachedSerQNames.add(qName);
 161     cls = vamsas.objects.simple.Result.class;
 162     cachedSerClasses.add(cls);
 163     cachedSerFactories.add(beansf);
 164     cachedDeserFactories.add(beandf);
 165
 166     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 167             "WsJobId");
 168     cachedSerQNames.add(qName);
 169     cls = vamsas.objects.simple.WsJobId.class;
 170     cachedSerClasses.add(cls);
 171     cachedSerFactories.add(beansf);
 172     cachedDeserFactories.add(beandf);
 173
 174     qName = new javax.xml.namespace.QName("http://simple.objects.vamsas",
 175             "Object");
 176     cachedSerQNames.add(qName);
 177     cls = vamsas.objects.simple.Object.class;
 178     cachedSerClasses.add(cls);
 179     cachedSerFactories.add(beansf);
 180     cachedDeserFactories.add(beandf);
 181
 182     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_xsd_string");
 183     cachedSerQNames.add(qName);
 184     cls = java.lang.String[].class;
 185     cachedSerClasses.add(cls);
 186     cachedSerFactories.add(arraysf);
 187     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 188
 189     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 190             "Alignment");
 191     cachedSerQNames.add(qName);
 192     cls = vamsas.objects.simple.Alignment.class;
 193     cachedSerClasses.add(cls);
 194     cachedSerFactories.add(beansf);
 195     cachedDeserFactories.add(beandf);
 196
 197     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 198             "Sequence");
 199     cachedSerQNames.add(qName);
 200     cls = vamsas.objects.simple.Sequence.class;
 201     cachedSerClasses.add(cls);
 202     cachedSerFactories.add(beansf);
 203     cachedDeserFactories.add(beandf);
 204
 205     qName = new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "ArrayOf_tns1_Sequence");
 206     cachedSerQNames.add(qName);
 207     cls = vamsas.objects.simple.Sequence[].class;
 208     cachedSerClasses.add(cls);
 209     cachedSerFactories.add(arraysf);
 210     cachedDeserFactories.add(arraydf);
 211
 212     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 213             "SeqSearchResult");
 214     cachedSerQNames.add(qName);
 215     cls = vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class;
 216     cachedSerClasses.add(cls);
 217     cachedSerFactories.add(beansf);
 218     cachedDeserFactories.add(beandf);
 219
 220     qName = new javax.xml.namespace.QName("simple.objects.vamsas",
 221             "SequenceSet");
 222     cachedSerQNames.add(qName);
 223     cls = vamsas.objects.simple.SequenceSet.class;
 224     cachedSerClasses.add(cls);
 225     cachedSerFactories.add(beansf);
 226     cachedDeserFactories.add(beandf);
 227
 228   }
 229
 230   protected org.apache.axis.client.Call createCall()
 231           throws java.rmi.RemoteException
 232   {
 233     try
 234     {
 235       org.apache.axis.client.Call _call = (org.apache.axis.client.Call) super.service
 236               .createCall();
 237       if (super.maintainSessionSet)
 238       {
 239         _call.setMaintainSession(super.maintainSession);
 240       }
 241       if (super.cachedUsername != null)
 242       {
 243         _call.setUsername(super.cachedUsername);
 244       }
 245       if (super.cachedPassword != null)
 246       {
 247         _call.setPassword(super.cachedPassword);
 248       }
 249       if (super.cachedEndpoint != null)
 250       {
 251         _call.setTargetEndpointAddress(super.cachedEndpoint);
 252       }
 253       if (super.cachedTimeout != null)
 254       {
 255         _call.setTimeout(super.cachedTimeout);
 256       }
 257       if (super.cachedPortName != null)
 258       {
 259         _call.setPortName(super.cachedPortName);
 260       }
 261       java.util.Enumeration keys = super.cachedProperties.keys();
 262       while (keys.hasMoreElements())
 263       {
 264         java.lang.String key = (java.lang.String) keys.nextElement();
 265         _call.setProperty(key, super.cachedProperties.get(key));
 266       }
 267       // All the type mapping information is registered
 268       // when the first call is made.
 269       // The type mapping information is actually registered in
 270       // the TypeMappingRegistry of the service, which
 271       // is the reason why registration is only needed for the first call.
 272       synchronized (this)
 273       {
 274         if (firstCall())
 275         {
 276           // must set encoding style before registering serializers
 277           _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 278           _call.setEncodingStyle(org.apache.axis.Constants.URI_SOAP11_ENC);
 279           for (int i = 0; i < cachedSerFactories.size(); ++i)
 280           {
 281             java.lang.Class cls = (java.lang.Class) cachedSerClasses.get(i);
 282             javax.xml.namespace.QName qName = (javax.xml.namespace.QName) cachedSerQNames
 283                     .get(i);
 284             java.lang.Class sf = (java.lang.Class) cachedSerFactories
 285                     .get(i);
 286             java.lang.Class df = (java.lang.Class) cachedDeserFactories
 287                     .get(i);
 288             _call.registerTypeMapping(cls, qName, sf, df, false);
 289           }
 290         }
 291       }
 292       return _call;
 293     } catch (java.lang.Throwable _t)
 294     {
 295       throw new org.apache.axis.AxisFault(
 296               "Failure trying to get the Call object", _t);
 297     }
 298   }
 299
 300   public java.lang.String getDatabase() throws java.rmi.RemoteException
 301   {
 302     if (super.cachedEndpoint == null)
 303     {
 304       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 305     }
 306     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 307     _call.setOperation(_operations[0]);
 308     _call.setUseSOAPAction(true);
 309     _call.setSOAPActionURI("");
 310     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 311     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 312             "getDatabase"));
 313
 314     setRequestHeaders(_call);
 315     setAttachments(_call);
 316     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 317     {});
 318
 319     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 320     {
 321       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 322     }
 323     else
 324     {
 325       extractAttachments(_call);
 326       try
 327       {
 328         return (java.lang.String) _resp;
 329       } catch (java.lang.Exception _exception)
 330       {
 331         return (java.lang.String) org.apache.axis.utils.JavaUtils.convert(
 332                 _resp, java.lang.String.class);
 333       }
 334     }
 335   }
 336
 337   public vamsas.objects.simple.SeqSearchResult getResult(
 338           java.lang.String job_id) throws java.rmi.RemoteException
 339   {
 340     if (super.cachedEndpoint == null)
 341     {
 342       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 343     }
 344     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 345     _call.setOperation(_operations[1]);
 346     _call.setUseSOAPAction(true);
 347     _call.setSOAPActionURI("");
 348     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 349     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 350             "getResult"));
 351
 352     setRequestHeaders(_call);
 353     setAttachments(_call);
 354     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 355     { job_id });
 356
 357     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 358     {
 359       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 360     }
 361     else
 362     {
 363       extractAttachments(_call);
 364       try
 365       {
 366         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) _resp;
 367       } catch (java.lang.Exception _exception)
 368       {
 369         return (vamsas.objects.simple.SeqSearchResult) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 370                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.SeqSearchResult.class);
 371       }
 372     }
 373   }
 374
 375   public vamsas.objects.simple.WsJobId psearch(
 376           vamsas.objects.simple.Alignment al, java.lang.String database)
 377           throws java.rmi.RemoteException
 378   {
 379     if (super.cachedEndpoint == null)
 380     {
 381       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 382     }
 383     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 384     _call.setOperation(_operations[2]);
 385     _call.setUseSOAPAction(true);
 386     _call.setSOAPActionURI("");
 387     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 388     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas",
 389             "psearch"));
 390
 391     setRequestHeaders(_call);
 392     setAttachments(_call);
 393     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 394     { al, database });
 395
 396     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 397     {
 398       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 399     }
 400     else
 401     {
 402       extractAttachments(_call);
 403       try
 404       {
 405         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 406       } catch (java.lang.Exception _exception)
 407       {
 408         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 409                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 410       }
 411     }
 412   }
 413
 414   public vamsas.objects.simple.WsJobId search(
 415           vamsas.objects.simple.Sequence s, java.lang.String database)
 416           throws java.rmi.RemoteException
 417   {
 418     if (super.cachedEndpoint == null)
 419     {
 420       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 421     }
 422     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 423     _call.setOperation(_operations[3]);
 424     _call.setUseSOAPAction(true);
 425     _call.setSOAPActionURI("");
 426     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 427     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "search"));
 428
 429     setRequestHeaders(_call);
 430     setAttachments(_call);
 431     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 432     { s, database });
 433
 434     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 435     {
 436       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 437     }
 438     else
 439     {
 440       extractAttachments(_call);
 441       try
 442       {
 443         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 444       } catch (java.lang.Exception _exception)
 445       {
 446         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 447                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 448       }
 449     }
 450   }
 451
 452   public vamsas.objects.simple.WsJobId cancel(java.lang.String jobId)
 453           throws java.rmi.RemoteException
 454   {
 455     if (super.cachedEndpoint == null)
 456     {
 457       throw new org.apache.axis.NoEndPointException();
 458     }
 459     org.apache.axis.client.Call _call = createCall();
 460     _call.setOperation(_operations[4]);
 461     _call.setUseSOAPAction(true);
 462     _call.setSOAPActionURI("");
 463     _call.setSOAPVersion(org.apache.axis.soap.SOAPConstants.SOAP11_CONSTANTS);
 464     _call.setOperationName(new javax.xml.namespace.QName("vamsas", "cancel"));
 465
 466     setRequestHeaders(_call);
 467     setAttachments(_call);
 468     java.lang.Object _resp = _call.invoke(new java.lang.Object[]
 469     { jobId });
 470
 471     if (_resp instanceof java.rmi.RemoteException)
 472     {
 473       throw (java.rmi.RemoteException) _resp;
 474     }
 475     else
 476     {
 477       extractAttachments(_call);
 478       try
 479       {
 480         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) _resp;
 481       } catch (java.lang.Exception _exception)
 482       {
 483         return (vamsas.objects.simple.WsJobId) org.apache.axis.utils.JavaUtils
 484                 .convert(_resp, vamsas.objects.simple.WsJobId.class);
 485       }
 486     }
 487   }
 488
 489 }