src/jalview/api/AlignCalcManagerI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
   5  * This file is part of Jalview.
   6  *
   7  * Jalview is free software: you can redistribute it and/or
   8  * modify it under the terms of the GNU General Public License
   9  * as published by the Free Software Foundation, either version 3
  10  * of the License, or (at your option) any later version.
  11  *
  12  * Jalview is distributed in the hope that it will be useful, but
  13  * WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty
  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.api;
  22
  23 import jalview.datamodel.AlignmentAnnotation;
  24
  25 import java.util.List;
  26
  27 public interface AlignCalcManagerI
  28 {
  29
  30   /**
  31    * tell manager that a worker is initialised and has started to run
  32    *
  33    * @param worker
  34    */
  35   void notifyStart(AlignCalcWorkerI worker);
  36
  37   /**
  38    * tell manager that worker is now processing data
  39    *
  40    * @param worker
  41    */
  42   boolean notifyWorking(AlignCalcWorkerI worker);
  43
  44   /**
  45    * notify manager that the worker has completed, and results may be ready to
  46    * collect
  47    *
  48    * @param worker
  49    */
  50   void workerComplete(AlignCalcWorkerI worker);
  51
  52   /**
  53    * indicate that a worker like this cannot run on the platform and shouldn't
  54    * be started again
  55    *
  56    * @param worker
  57    */
  58   void disableWorker(AlignCalcWorkerI worker);
  59
  60   /**
  61    * indicate that a worker like this may be run on the platform.
  62    *
  63    * @param worker
  64    *          of class to be removed from the execution blacklist
  65    */
  66   void enableWorker(AlignCalcWorkerI worker);
  67
  68   /**
  69    * Answers true if the worker is disabled from running
  70    *
  71    * @param worker
  72    * @return
  73    */
  74   boolean isDisabled(AlignCalcWorkerI worker);
  75
  76   /**
  77    * launch a new worker
  78    *
  79    * @param worker
  80    */
  81   void startWorker(AlignCalcWorkerI worker);
  82
  83   /**
  84    *
  85    * @param worker
  86    * @return
  87    */
  88   boolean isWorking(AlignCalcWorkerI worker);
  89
  90   /**
  91    * if any worker thread is operational, return true!
  92    *
  93    * @return
  94    */
  95   boolean isWorking();
  96
  97   /**
  98    * register a restartable worker
  99    *
 100    * @param worker
 101    */
 102   void registerWorker(AlignCalcWorkerI worker);
 103
 104   /**
 105    * restart any registered workers
 106    */
 107   void restartWorkers();
 108
 109   /**
 110    *
 111    * @param alignmentAnnotation
 112    * @return true if a currently registered and working worker indicates its
 113    *         involvement with the given alignmentAnnotation
 114    */
 115   boolean workingInvolvedWith(AlignmentAnnotation alignmentAnnotation);
 116
 117   /**
 118    * kick any known instances of the given worker class to update their
 119    * annotation
 120    *
 121    * @param workerClass
 122    */
 123   void updateAnnotationFor(Class<? extends AlignCalcWorkerI> workerClass);
 124
 125   /**
 126    * return any registered workers of the given class
 127    *
 128    * @param workerClass
 129    * @return null or one or more workers of the given class
 130    */
 131   List<AlignCalcWorkerI> getRegisteredWorkersOfClass(
 132           Class<? extends AlignCalcWorkerI> workerClass);
 133
 134   /**
 135    * work out if there is an instance of a worker that is *waiting* to start
 136    * calculating
 137    *
 138    * @param workingClass
 139    * @return true if workingClass is already waiting to calculate. false if it
 140    *         is calculating, or not queued.
 141    */
 142   boolean isPending(AlignCalcWorkerI workingClass);
 143
 144   /**
 145    * deregister and otherwise remove any registered and working instances of the
 146    * given worker type
 147    *
 148    * @param typeToRemove
 149    */
 150   void removeRegisteredWorkersOfClass(
 151           Class<? extends AlignCalcWorkerI> typeToRemove);
 152
 153   /**
 154    * Removes the worker that produces the given annotation, provided it is
 155    * marked as 'deletable'. Some workers may need to continue to run as the
 156    * results of their calculations are needed, e.g. for colour schemes.
 157    *
 158    * @param ann
 159    */
 160   void removeWorkerForAnnotation(AlignmentAnnotation ann);
 161 }