src/jalview/api/AlignmentRowsCollectionI.java

   1 package jalview.api;
   2
   3 import jalview.datamodel.SequenceI;
   4
   5 public interface AlignmentRowsCollectionI extends Iterable<Integer>
   6 {
   7   /**
   8    * Answers if the sequence at the given position is hidden.
   9    *
  10    * @param r
  11    *          the row index to check
  12    * @return true if the sequence at r is hidden
  13    */
  14   public boolean isHidden(int r);
  15
  16   /**
  17    * Answers if any row in this collection is hidden
  18    *
  19    * @return true if there is at least 1 hidden row
  20    */
  21   public boolean hasHidden();
  22
  23   /**
  24    * Answers the sequence at the given position in the alignment
  25    *
  26    * @param r
  27    *          the row index to locate
  28    * @return the sequence
  29    */
  30   public SequenceI getSequence(int r);
  31 }