src/jalview/api/analysis/ScoreModelI.java

   1 /*
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer ($$Version-Rel$$)
   3  * Copyright (C) $$Year-Rel$$ The Jalview Authors
   4  *
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  11  *
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  14  * of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15  * PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
  16  *
  17  * You should have received a copy of the GNU General Public License
  18  * along with Jalview.  If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
  19  * The Jalview Authors are detailed in the 'AUTHORS' file.
  20  */
  21 package jalview.api.analysis;
  22
  23 import jalview.datamodel.AlignmentView;
  24
  25 public interface ScoreModelI
  26 {
  27
  28   float[][] findDistances(AlignmentView seqData);
  29
  30   String getName();
  31
  32   boolean isDNA();
  33
  34   boolean isProtein();
  35
  36 }