src/jalview/appletgui/CutAndPasteTransfer.java

   1 /*\r
   2  * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3  * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4  *\r
   5  * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6  * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7  * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8  * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9  *\r
  10  * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13  * GNU General Public License for more details.\r
  14  *\r
  15  * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16  * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17  * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18  */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import java.awt.*;\r
  23 import java.awt.event.*;\r
  24 \r
  25 import jalview.datamodel.*;\r
  26 import jalview.io.*;\r
  27 \r
  28 public class CutAndPasteTransfer extends Panel implements ActionListener, MouseListener\r
  29 {\r
  30   jalview.bin.JalviewLite applet;\r
  31 \r
  32   boolean pdbImport = false;\r
  33   Sequence seq;\r
  34   SeqCanvas seqcanvas;\r
  35 \r
  36   public CutAndPasteTransfer(boolean forImport, jalview.bin.JalviewLite mainApplet)\r
  37   {\r
  38     try {\r
  39         jbInit();\r
  40     } catch (Exception e) {\r
  41         e.printStackTrace();\r
  42     }\r
  43 \r
  44     applet = mainApplet;\r
  45 \r
  46     if (!forImport)\r
  47     {\r
  48       buttonPanel.setVisible(false);\r
  49     }\r
  50   }\r
  51 \r
  52   public void setPDBImport(Sequence seq, SeqCanvas seqcanvas)\r
  53   {\r
  54     this.seq = seq;\r
  55     this.seqcanvas = seqcanvas;\r
  56     pdbImport = true;\r
  57   }\r
  58 \r
  59 \r
  60   public String getText()\r
  61   {\r
  62     return textarea.getText();\r
  63   }\r
  64 \r
  65   public void setText(String text)\r
  66   {\r
  67     textarea.setText(text);\r
  68   }\r
  69 \r
  70   public void actionPerformed(ActionEvent evt)\r
  71   {\r
  72     if(evt.getSource()==ok)\r
  73       ok_actionPerformed();\r
  74     else if(evt.getSource()==cancel)\r
  75       cancel_actionPerformed();\r
  76   }\r
  77 \r
  78   protected void ok_actionPerformed()\r
  79   {\r
  80     String text = getText();\r
  81     int length = text.length();\r
  82     textarea.append("\n");\r
  83     if(textarea.getText().length()==length)\r
  84     {\r
  85       String warning = "\n\n#################################################\n"\r
  86           +"WARNING!! THIS IS THE MAXIMUM SIZE OF TEXTAREA!!\n"\r
  87           +"\nCAN'T INPUT FULL ALIGNMENT"\r
  88           +"\n\nYOU MUST DELETE THIS WARNING TO CONTINUE"\r
  89           +"\n\nMAKE SURE LAST SEQUENCE PASTED IS COMPLETE"\r
  90           +"\n#################################################\n";\r
  91       textarea.setText(text.substring(0, text.length()-warning.length())\r
  92           +warning);\r
  93 \r
  94       textarea.setCaretPosition(text.length());\r
  95     }\r
  96 \r
  97     if(pdbImport)\r
  98     {\r
  99       new MCview.AppletPDBViewer(text, AppletFormatAdapter.PASTE, seq, seqcanvas);\r
 100     }\r
 101     else\r
 102     {\r
 103       SequenceI[] sequences = null;\r
 104 \r
 105       String format = new IdentifyFile().Identify(text, AppletFormatAdapter.PASTE);\r
 106       try{\r
 107         sequences = new AppletFormatAdapter().readFile(text, AppletFormatAdapter.PASTE, format);\r
 108       }catch(java.io.IOException ex)\r
 109       {\r
 110         ex.printStackTrace();\r
 111       }\r
 112       if (sequences != null)\r
 113       {\r
 114         AlignFrame af = new AlignFrame(new Alignment(sequences), applet,\r
 115                                        "Cut & Paste input - " + format);\r
 116         af.statusBar.setText("Successfully pasted alignment file");\r
 117       }\r
 118     }\r
 119 \r
 120     ((Frame)this.getParent()).setVisible(false);\r
 121   }\r
 122 \r
 123   protected void cancel_actionPerformed()\r
 124   {\r
 125     ((Frame)this.getParent()).setVisible(false);\r
 126   }\r
 127 \r
 128   protected TextArea textarea = new TextArea();\r
 129   Button ok = new Button();\r
 130   Button cancel = new Button();\r
 131   protected Panel buttonPanel = new Panel();\r
 132   BorderLayout borderLayout1 = new BorderLayout();\r
 133 \r
 134 \r
 135   private void jbInit() throws Exception {\r
 136       textarea.setFont(new java.awt.Font("Monospaced", Font.PLAIN, 10));\r
 137       textarea.setText("Paste your alignment file here");\r
 138       textarea.addMouseListener(this);\r
 139       this.setLayout(borderLayout1);\r
 140       ok.setLabel("OK");\r
 141       ok.addActionListener(this);\r
 142       cancel.setLabel("Cancel");\r
 143       cancel.addActionListener(this);\r
 144       this.add(buttonPanel, BorderLayout.SOUTH);\r
 145       buttonPanel.add(ok, null);\r
 146       buttonPanel.add(cancel, null);\r
 147       this.add(textarea, java.awt.BorderLayout.CENTER);\r
 148   }\r
 149 \r
 150   public void mousePressed(MouseEvent evt) {\r
 151       if (textarea.getText().startsWith("Paste your")) {\r
 152           textarea.setText("");\r
 153      }\r
 154   }\r
 155   public void mouseReleased(MouseEvent evt){}\r
 156   public void mouseClicked(MouseEvent evt){}\r
 157   public void mouseEntered(MouseEvent evt){}\r
 158   public void mouseExited(MouseEvent evt){}\r
 159 }\r