src/jalview/appletgui/UserDefinedColours.java

   1 /*\r
   2 * Jalview - A Sequence Alignment Editor and Viewer\r
   3 * Copyright (C) 2005 AM Waterhouse, J Procter, G Barton, M Clamp, S Searle\r
   4 *\r
   5 * This program is free software; you can redistribute it and/or\r
   6 * modify it under the terms of the GNU General Public License\r
   7 * as published by the Free Software Foundation; either version 2\r
   8 * of the License, or (at your option) any later version.\r
   9 *\r
  10 * This program is distributed in the hope that it will be useful,\r
  11 * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of\r
  12 * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the\r
  13 * GNU General Public License for more details.\r
  14 *\r
  15 * You should have received a copy of the GNU General Public License\r
  16 * along with this program; if not, write to the Free Software\r
  17 * Foundation, Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301, USA\r
  18 */\r
  19 \r
  20 package jalview.appletgui;\r
  21 \r
  22 import jalview.jbappletgui.GUserDefinedColours;\r
  23 import jalview.datamodel.*;\r
  24 import jalview.schemes.*;\r
  25 import jalview.io.*;\r
  26 import java.io.*;\r
  27 import java.awt.*;\r
  28 import java.awt.event.*;\r
  29 import java.util.*;\r
  30 \r
  31 \r
  32 public class UserDefinedColours extends GUserDefinedColours\r
  33 {\r
  34 \r
  35   AlignmentPanel ap;\r
  36   SequenceGroup seqGroup;\r
  37   Button selectedButton;\r
  38   Vector oldColours = new Vector();\r
  39   ColourSchemeI oldColourScheme;\r
  40   Frame frame;\r
  41 \r
  42   int R = 0, G = 0, B = 0;\r
  43 \r
  44   public ColourSchemeI loadDefaultColours()\r
  45   {\r
  46     // NOT IMPLEMENTED YET IN APPLET VERSION\r
  47     return null;\r
  48   }\r
  49 \r
  50   public UserDefinedColours(AlignmentPanel ap, SequenceGroup sg)\r
  51   {\r
  52     super();\r
  53     frame = new Frame();\r
  54     frame.add(this);\r
  55     jalview.bin.JalviewLite.addFrame(frame, "User defined colours", 420,345 );\r
  56 \r
  57     if(sg!=null)\r
  58         frame.setTitle( frame.getTitle()+ " ("+sg.getName()+")");\r
  59 \r
  60 \r
  61     this.ap = ap;\r
  62     seqGroup = sg;\r
  63 \r
  64 \r
  65       if (seqGroup != null)\r
  66         oldColourScheme = seqGroup.cs;\r
  67       else\r
  68         oldColourScheme = ap.av.getGlobalColourScheme();\r
  69 \r
  70       for (int i = 0; i < 20; i++)\r
  71         makeButton(ResidueProperties.aa2Triplet.get(ResidueProperties.aa[i]) +\r
  72                    "", ResidueProperties.aa[i]);\r
  73 \r
  74       makeButton("B", "B");\r
  75       makeButton("Z", "Z");\r
  76       makeButton("X", "X");\r
  77       makeButton("Gap", "'.','-',' '");\r
  78 \r
  79   }\r
  80 \r
  81   protected void rText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  82     try{\r
  83       int i = Integer.parseInt(rText.getText());\r
  84       rScroller.setValue(i);\r
  85     }catch(NumberFormatException ex){}\r
  86   }\r
  87 \r
  88   protected void gText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  89     try{\r
  90       int i = Integer.parseInt(gText.getText());\r
  91       gScroller.setValue(i);\r
  92     }catch(NumberFormatException ex){}\r
  93 \r
  94   }\r
  95 \r
  96   protected void bText_actionPerformed(ActionEvent e) {\r
  97     try{\r
  98       int i = Integer.parseInt(bText.getText());\r
  99       bScroller.setValue(i);\r
 100     }catch(NumberFormatException ex){}\r
 101 \r
 102   }\r
 103 \r
 104 \r
 105   protected void rScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 106     R = rScroller.getValue();\r
 107     rText.setText(R+"");\r
 108     colourChanged();\r
 109   }\r
 110 \r
 111   protected void gScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 112     G = gScroller.getValue();\r
 113     gText.setText(G+"");\r
 114     colourChanged();\r
 115   }\r
 116 \r
 117   protected void bScroller_adjustmentValueChanged(AdjustmentEvent e) {\r
 118     B = bScroller.getValue();\r
 119     bText.setText(B+"");\r
 120     colourChanged();\r
 121   }\r
 122 \r
 123  public void colourChanged()\r
 124  {\r
 125    Color col = new Color(R,G,B);\r
 126    target.setBackground( col );\r
 127 \r
 128    if(selectedButton!=null)\r
 129      selectedButton.setBackground( col );\r
 130  }\r
 131 \r
 132   public void colourButtonPressed(MouseEvent e)\r
 133   {\r
 134      selectedButton = (Button)e.getSource();\r
 135      Color col = selectedButton.getBackground();\r
 136      R = col.getRed();\r
 137      G = col.getGreen();\r
 138      B = col.getBlue();\r
 139      rScroller.setValue(R);\r
 140      gScroller.setValue(G);\r
 141      bScroller.setValue(B);\r
 142      rText.setText(R+"");\r
 143      gText.setText(G+"");\r
 144      bText.setText(B+"");\r
 145 \r
 146      colourChanged();\r
 147   }\r
 148 \r
 149   void makeButton(String label, String aa)\r
 150   {\r
 151     final Button button = new Button();\r
 152     Color col = Color.white;\r
 153 \r
 154 \r
 155     try{\r
 156       col = oldColourScheme.findColour(aa, -1);\r
 157     }catch(Exception ex){}\r
 158 \r
 159     button.setBackground(  col );\r
 160     oldColours.addElement( col );\r
 161     button.setLabel( label );\r
 162     button.setForeground( col.darker().darker().darker() );\r
 163     button.setFont(new java.awt.Font("Verdana", 1, 10));\r
 164     button.addMouseListener(new java.awt.event.MouseAdapter()\r
 165     {\r
 166       public void mouseClicked(MouseEvent e)\r
 167       {\r
 168         colourButtonPressed(e);\r
 169       }\r
 170     });\r
 171 \r
 172     buttonPanel.add(button, null);\r
 173   }\r
 174 \r
 175 \r
 176   protected void okButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 177   {\r
 178     applyButton_actionPerformed(null);\r
 179    frame.setVisible(false);\r
 180   }\r
 181 \r
 182   protected void applyButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 183   {\r
 184 \r
 185     Color [] newColours = new Color[24];\r
 186     for(int i=0; i<24; i++)\r
 187     {\r
 188           Button button = (Button)buttonPanel.getComponent(i);\r
 189           newColours[i] = button.getBackground();\r
 190     }\r
 191 \r
 192     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme( newColours );\r
 193     ucs.setThreshold(0);\r
 194 \r
 195     if(seqGroup!=null)\r
 196       seqGroup.cs = ucs;\r
 197     else\r
 198       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 199 \r
 200     ap.repaint();\r
 201   }\r
 202 \r
 203 \r
 204   public static UserColourScheme loadDefaultColours(String file)\r
 205   {\r
 206     UserColourScheme ucs = null;\r
 207     try\r
 208     {\r
 209       BufferedReader in = new BufferedReader(new FileReader(file));\r
 210       Color [] newColours = new Color[24];\r
 211       for (int i = 0; i < 24; i++)\r
 212       {\r
 213         newColours[i] = new Color(Integer.parseInt(in.readLine()));\r
 214       }\r
 215 \r
 216       ucs = new UserColourScheme(newColours);\r
 217       ucs.setThreshold(0);\r
 218 \r
 219     }\r
 220     catch (Exception ex)\r
 221     {}\r
 222 \r
 223     return ucs;\r
 224   }\r
 225 \r
 226 \r
 227   protected void cancelButton_actionPerformed(ActionEvent e)\r
 228   {\r
 229 \r
 230     Color [] newColours = new Color[24];\r
 231     for(int i=0; i<24; i++)\r
 232     {\r
 233           newColours[i] = (Color)oldColours.elementAt(i);\r
 234           buttonPanel.getComponent(i).setBackground(newColours[i]);\r
 235     }\r
 236 \r
 237     UserColourScheme ucs = new UserColourScheme( newColours );\r
 238 \r
 239     if (seqGroup != null)\r
 240       seqGroup.cs = ucs;\r
 241     else\r
 242       ap.av.setGlobalColourScheme(ucs);\r
 243 \r
 244     ap.repaint();\r
 245 \r
 246     frame.setVisible(false);\r
 247   }\r
 248 \r
 249 \r
 250 }\r